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Sci Rep ; 6: 23473, 2016 Apr 01.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27032335

RESUMEN

Glycoside hydrolases (GHs) play fundamental roles in the decomposition of lignocellulosic biomaterials. Here, we report the full-length structure of a cellulase from Bacillus licheniformis (BlCel5B), a member of the GH5 subfamily 4 that is entirely dependent on its two ancillary modules (Ig-like module and CBM46) for catalytic activity. Using X-ray crystallography, small-angle X-ray scattering and molecular dynamics simulations, we propose that the C-terminal CBM46 caps the distal N-terminal catalytic domain (CD) to establish a fully functional active site via a combination of large-scale multidomain conformational selection and induced-fit mechanisms. The Ig-like module is pivoting the packing and unpacking motions of CBM46 relative to CD in the assembly of the binding subsite. This is the first example of a multidomain GH relying on large amplitude motions of the CBM46 for assembly of the catalytically competent form of the enzyme.


Asunto(s)
Bacillus licheniformis/enzimología , Proteínas Bacterianas/química , Secuencia de Aminoácidos , Sitios de Unión , Dominio Catalítico , Celulosa/análogos & derivados , Celulosa/metabolismo , Secuencia de Consenso , Cristalografía por Rayos X , Modelos Moleculares , Simulación de Dinámica Molecular , Movimiento (Física) , Mutagénesis Sitio-Dirigida , Filogenia , Conformación Proteica , Dominios Proteicos , Proteínas Recombinantes/química , Dispersión del Ángulo Pequeño , Alineación de Secuencia , Homología de Secuencia de Aminoácido , Especificidad por Sustrato , Tetrosas/metabolismo , Difracción de Rayos X
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