A food interaction network between psittacines and plants in an urban area in the city of São Carlos - SP, southeastern Brazil.

The Psittacidae presents a great diversity of species in the Neotropical region performing fundamental ecological functions for ecosystems. These frugivorous birds can occupy different positions in the antagonistic-mutualistic gradient of food interactions, acting as predators and/or as seed dispersers. Little is known about bird-plant ecological interaction networks focusing on psittacines in urban environments, which may compromise the management of natural areas in anthropic landscapes and hinder the planning of conservation strategies. In this context, the present study aimed to analyze the network of feeding interactions between psittacines and plants that occur in green areas in urban and periurban areas of the municipality of São Carlos, São Paulo State, southeastern Brazil. Starting with an active searching added to the application of the focal animal sampling at 36 systematized sampling points during the years 2019, 2020 and 2021, the plant species consumed by parrots in the study area were observed. Four species of birds of the Psittacidae family were recorded consuming food resources from 46 plant species. The order of relevance of the birds in structuring the ecological network was: Brotogeris chiriri (Vieillot, 1851), Psittacara leucophthalmus (Statius Muller, 1872), Forpus xanthopterygius (Spix, 1843) and Eupsittula aurea (Gmelin, 1788). The most consumed plants were Syagrus romanzoffiana, Salix babylonica, Caesalpinea pluviosa, Mangifera indica and Handroanthus heptaphyllus. The pattern of consumption by birds was significantly different among species, and overall, they had a broad diet and medium niche overlap. Network nesting was low, as was connectance, i.e., the number of interactions or connections observed between pairs of species was considerably less than the total number possible. Network asymmetry was considerably high, with the psittacine group performing interactions with a large number of plant species, while each plant received on average few psittacine species. The results point to a high plasticity in the use of food resources in anthropic landscapes, indicating that the occupation of the urban environment by psittacines has been occurring successfully and may benefit the populations of the species recorded here.

Toll-like receptor 9 polymorphisms in brazilian patients with systemic lupus erythematosus: a pilot study / Polimorfismos do receptor toll-like 9 em pacientes brasileiros com lúpus eritematoso sistêmico: um estudo piloto

Abstract Toll-like receptor 9 (TLR9) is an important component of the innate immune system and have been associated with several autoimmune diseases, such as Systemic Lupus Erythematosus (SLE). The aim of this study was to investigate polymorphisms in TLR9 gene in a Brazilian SLE patients group and their association with clinical manifestation, particularly Jaccoud's arthropathy (JA). We analyzed DNA samples from 204 SLE patients, having a subgroup of them presenting JA (n=24). A control group (n=133) from the same city was also included. TLR9 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (−1237 C>T and +2848 G>A) were identified by sequencing analysis. The TLR9 gene genotype frequency was similar both in SLE patients and the control group. In the whole SLE population, an association between the homozygosis of allele C at position −1237 with psychosis and anemia (p < 0.01) was found. Likewise, the homozygosis of allele G at position +2848 was associated with a discoid rash (p < 0.05). There was no association between JA and TLR9 polymorphisms. These data show that TLR9 polymorphisms do not seem to be a predisposing factor for SLE in the Brazilian population, and that SNPs are not associated with JA.

Resumo O receptor Toll-like 9 (TLR9) é um componente importante do sistema imunológico inato e tem sido associado a várias doenças autoimunes, como o Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES). O objetivo deste estudo foi investigar polimorfismos no gene TLR9 em um grupo de pacientes brasileiros com LES e sua associação com a manifestação clínica, particularmente a artropatia de Jaccoud (JA). Foram analisadas amostras de DNA de 204 pacientes com LES, e um subgrupo com JA (n=24). Um grupo de controle (n=133) da mesma cidade também foi incluído. Os polimorfismos de nucleotídeos únicos TLR9 (SNPs) (−1237 C>T e +2848 G>A) foram identificados pela análise de sequenciamento. A frequência do genótipo genético TLR9 foi semelhante tanto em pacientes com LES quanto no grupo controle. Em toda a população de LES, foi encontrada associação entre a homozigose do alelo C na posição −1237 com psicose e anemia (p < 0,01). Da mesma forma, a homozigose do alelo G na posição +2848 foi associada a uma erupção cutânea discoide (p < 0,05). Não houve associação entre polimorfismos JA e TLR9. Esses dados mostram que os polimorfismos TLR9 não parecem ser um fator predisponível para o LES na população brasileira, e que os SNPs não estão associados ao JA.

A food interaction network between psittacines and plants in an urban area in the city of São Carlos - SP, southeastern Brazil / Uma rede de interação alimentar entre psitacídeos e plantas em uma área urbana na cidade de São Carlos - SP, sudeste do Brasil

Abstract The Psittacidae presents a great diversity of species in the Neotropical region performing fundamental ecological functions for ecosystems. These frugivorous birds can occupy different positions in the antagonistic-mutualistic gradient of food interactions, acting as predators and/or as seed dispersers. Little is known about bird-plant ecological interaction networks focusing on psittacines in urban environments, which may compromise the management of natural areas in anthropic landscapes and hinder the planning of conservation strategies. In this context, the present study aimed to analyze the network of feeding interactions between psittacines and plants that occur in green areas in urban and periurban areas of the municipality of São Carlos, São Paulo State, southeastern Brazil. Starting with an active searching added to the application of the focal animal sampling at 36 systematized sampling points during the years 2019, 2020 and 2021, the plant species consumed by parrots in the study area were observed. Four species of birds of the Psittacidae family were recorded consuming food resources from 46 plant species. The order of relevance of the birds in structuring the ecological network was: Brotogeris chiriri (Vieillot, 1851), Psittacara leucophthalmus (Statius Muller, 1872), Forpus xanthopterygius (Spix, 1843) and Eupsittula aurea (Gmelin, 1788). The most consumed plants were Syagrus romanzoffiana, Salix babylonica, Caesalpinea pluviosa, Mangifera indica and Handroanthus heptaphyllus. The pattern of consumption by birds was significantly different among species, and overall, they had a broad diet and medium niche overlap. Network nesting was low, as was connectance, i.e., the number of interactions or connections observed between pairs of species was considerably less than the total number possible. Network asymmetry was considerably high, with the psittacine group performing interactions with a large number of plant species, while each plant received on average few psittacine species. The results point to a high plasticity in the use of food resources in anthropic landscapes, indicating that the occupation of the urban environment by psittacines has been occurring successfully and may benefit the populations of the species recorded here.

Resumo A família Psittacidae apresenta grande diversidade de espécies na região Neotropical, as quais desempenham funções ecológicas fundamentais para os ecossistemas. Essas aves frugívoras podem ocupar diferentes posições no gradiente antagonista-mutualista de interações alimentares, atuando como predadoras e/ou como dispersoras de sementes. Pouco se sabe sobre redes de interações ecológicas ave-planta com foco nos psitacídeos em ambientes urbanos, o que pode comprometer a gestão de áreas naturais em paisagens antrópicas e dificultar o planejamento de estratégias de conservação. Nesse contexto, o presente estudo objetivou analisar a rede de interações alimentares entre psitacídeos e plantas que ocorrem em áreas verdes da zona urbana e periurbana do município de São Carlos, estado de São Paulo, sudeste do Brasil. A partir de busca ativa somada à aplicação do método animal-focal em 36 pontos de amostragem sistematizada de 2019 a 2021, foram observadas as espécies de plantas consumidas por psitacídeos na área de estudo. Foram registradas 4 espécies de Psittacidae consumindo recursos alimentares de 46 espécies de plantas. A ordem de relevância das aves na estruturação da rede ecológica foi: Brotogeris chiriri (Vieillot, 1851), Psittacara leucophthalmus (Statius Muller, 1872), Forpus xanthopterygius (Spix, 1843) e Eupsittula aurea (Gmelin, 1788). As plantas mais consumidas foram Syagrus romanzoffiana, Salix babylonica, Caesalpinea pluviosa, Mangifera indica e Handroanthus heptaphyllus. O padrão de consumo pelas aves foi significativamente distinto entre as espécies, sendo que no geral apresentaram uma dieta ampla e sobreposição de nicho mediana. O aninhamento da rede foi baixo, assim como conectância, ou seja, o número de interações ou conexões observadas entre pares de espécies foi consideravelmente menor do que o número total possível. A assimetria da rede foi consideravelmente alta, com o grupo dos psitacídeos realizando interações com um grande número de espécies de plantas, ao passo que cada planta recebeu em média poucas espécies de psitacídeos. Os resultados apontam para uma alta plasticidade no uso de recursos alimentares em paisagens antrópicas, indicando que a ocupação do ambiente urbano por psitacídeos vem ocorrendo com sucesso e pode beneficiar as populações das espécies aqui registradas.

Toll-like receptor 9 polymorphisms in brazilian patients with systemic lupus erythematosus: a pilot study / Polimorfismos do receptor toll-like 9 em pacientes brasileiros com lúpus eritematoso sistêmico: um estudo piloto

Toll-like receptor 9 (TLR9) is an important component of the innate immune system and have been associated with several autoimmune diseases, such as Systemic Lupus Erythematosus (SLE). The aim of this study was to investigate polymorphisms in TLR9 gene in a Brazilian SLE patients group and their association with clinical manifestation, particularly Jaccouds arthropathy (JA). We analyzed DNA samples from 204 SLE patients, having a subgroup of them presenting JA (n=24). A control group (n=133) from the same city was also included. TLR9 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (−1237 C>T and +2848 G>A) were identified by sequencing analysis. The TLR9 gene genotype frequency was similar both in SLE patients and the control group. In the whole SLE population, an association between the homozygosis of allele C at position −1237 with psychosis and anemia (p < 0.01) was found. Likewise, the homozygosis of allele G at position +2848 was associated with a discoid rash (p < 0.05). There was no association between JA and TLR9 polymorphisms. These data show that TLR9 polymorphisms do not seem to be a predisposing factor for SLE in the Brazilian population, and that SNPs are not associated with JA.(AU)

O receptor Toll-like 9 (TLR9) é um componente importante do sistema imunológico inato e tem sido associado a várias doenças autoimunes, como o Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES). O objetivo deste estudo foi investigar polimorfismos no gene TLR9 em um grupo de pacientes brasileiros com LES e sua associação com a manifestação clínica, particularmente a artropatia de Jaccoud (JA). Foram analisadas amostras de DNA de 204 pacientes com LES, e um subgrupo com JA (n=24). Um grupo de controle (n=133) da mesma cidade também foi incluído. Os polimorfismos de nucleotídeos únicos TLR9 (SNPs) (−1237 C>T e +2848 G>A) foram identificados pela análise de sequenciamento. A frequência do genótipo genético TLR9 foi semelhante tanto em pacientes com LES quanto no grupo controle. Em toda a população de LES, foi encontrada associação entre a homozigose do alelo C na posição −1237 com psicose e anemia (p < 0,01). Da mesma forma, a homozigose do alelo G na posição +2848 foi associada a uma erupção cutânea discoide (p < 0,05). Não houve associação entre polimorfismos JA e TLR9. Esses dados mostram que os polimorfismos TLR9 não parecem ser um fator predisponível para o LES na população brasileira, e que os SNPs não estão associados ao JA.(AU)

Toll-like receptor 9 polymorphisms in brazilian patients with systemic lupus erythematosus: a pilot study / Polimorfismos do receptor toll-like 9 em pacientes brasileiros com lúpus eritematoso sistêmico: um estudo piloto

Toll-like receptor 9 (TLR9) is an important component of the innate immune system and have been associated with several autoimmune diseases, such as Systemic Lupus Erythematosus (SLE). The aim of this study was to investigate polymorphisms in TLR9 gene in a Brazilian SLE patients group and their association with clinical manifestation, particularly Jaccoud’s arthropathy (JA). We analyzed DNA samples from 204 SLE patients, having a subgroup of them presenting JA (n=24). A control group (n=133) from the same city was also included. TLR9 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (−1237 C>T and +2848 G>A) were identified by sequencing analysis. The TLR9 gene genotype frequency was similar both in SLE patients and the control group. In the whole SLE population, an association between the homozygosis of allele C at position −1237 with psychosis and anemia (p < 0.01) was found. Likewise, the homozygosis of allele G at position +2848 was associated with a discoid rash (p < 0.05). There was no association between JA and TLR9 polymorphisms. These data show that TLR9 polymorphisms do not seem to be a predisposing factor for SLE in the Brazilian population, and that SNPs are not associated with JA.

O receptor Toll-like 9 (TLR9) é um componente importante do sistema imunológico inato e tem sido associado a várias doenças autoimunes, como o Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES). O objetivo deste estudo foi investigar polimorfismos no gene TLR9 em um grupo de pacientes brasileiros com LES e sua associação com a manifestação clínica, particularmente a artropatia de Jaccoud (JA). Foram analisadas amostras de DNA de 204 pacientes com LES, e um subgrupo com JA (n=24). Um grupo de controle (n=133) da mesma cidade também foi incluído. Os polimorfismos de nucleotídeos únicos TLR9 (SNPs) (−1237 C>T e +2848 G>A) foram identificados pela análise de sequenciamento. A frequência do genótipo genético TLR9 foi semelhante tanto em pacientes com LES quanto no grupo controle. Em toda a população de LES, foi encontrada associação entre a homozigose do alelo C na posição −1237 com psicose e anemia (p < 0,01). Da mesma forma, a homozigose do alelo G na posição +2848 foi associada a uma erupção cutânea discoide (p < 0,05). Não houve associação entre polimorfismos JA e TLR9. Esses dados mostram que os polimorfismos TLR9 não parecem ser um fator predisponível para o LES na população brasileira, e que os SNPs não estão associados ao JA.

Toll-like receptor 9 polymorphisms in brazilian patients with systemic lupus erythematosus: a pilot study

Abstract Toll-like receptor 9 (TLR9) is an important component of the innate immune system and have been associated with several autoimmune diseases, such as Systemic Lupus Erythematosus (SLE). The aim of this study was to investigate polymorphisms in TLR9 gene in a Brazilian SLE patients group and their association with clinical manifestation, particularly Jaccouds arthropathy (JA). We analyzed DNA samples from 204 SLE patients, having a subgroup of them presenting JA (n=24). A control group (n=133) from the same city was also included. TLR9 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (1237 C>T and +2848 G>A) were identified by sequencing analysis. The TLR9 gene genotype frequency was similar both in SLE patients and the control group. In the whole SLE population, an association between the homozygosis of allele C at position 1237 with psychosis and anemia (p 0.01) was found. Likewise, the homozygosis of allele G at position +2848 was associated with a discoid rash (p 0.05). There was no association between JA and TLR9 polymorphisms. These data show that TLR9 polymorphisms do not seem to be a predisposing factor for SLE in the Brazilian population, and that SNPs are not associated with JA.

Resumo O receptor Toll-like 9 (TLR9) é um componente importante do sistema imunológico inato e tem sido associado a várias doenças autoimunes, como o Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES). O objetivo deste estudo foi investigar polimorfismos no gene TLR9 em um grupo de pacientes brasileiros com LES e sua associação com a manifestação clínica, particularmente a artropatia de Jaccoud (JA). Foram analisadas amostras de DNA de 204 pacientes com LES, e um subgrupo com JA (n=24). Um grupo de controle (n=133) da mesma cidade também foi incluído. Os polimorfismos de nucleotídeos únicos TLR9 (SNPs) (1237 C>T e +2848 G>A) foram identificados pela análise de sequenciamento. A frequência do genótipo genético TLR9 foi semelhante tanto em pacientes com LES quanto no grupo controle. Em toda a população de LES, foi encontrada associação entre a homozigose do alelo C na posição 1237 com psicose e anemia (p 0,01). Da mesma forma, a homozigose do alelo G na posição +2848 foi associada a uma erupção cutânea discoide (p 0,05). Não houve associação entre polimorfismos JA e TLR9. Esses dados mostram que os polimorfismos TLR9 não parecem ser um fator predisponível para o LES na população brasileira, e que os SNPs não estão associados ao JA.

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil / Rastreamento de fontes microbianas e resistência antimicrobiana em um sistema fluvial de uma comunidade rural da Bahia, Brasil

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil / Rastreamento de fontes microbianas e resistência antimicrobiana em um sistema fluvial de uma comunidade rural da Bahia, Brasil

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.(AU)

O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.(AU)

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil / Rastreamento de fontes microbianas e resistência antimicrobiana em um sistema fluvial de uma comunidade rural da Bahia, Brasil

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil

Abstract Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

Resumo O uso de antibióticos inevitavelmente leva à resistência antimicrobiana. A seleção para resistência antimicrobiana ocorre principalmente no intestino de seres humanos e animais, bem como no meio ambiente, através da resistência natural e resíduos de antibióticos nos esgotos e no solo. Avaliamos a resistência antimicrobiana em bactérias Gram-negativas de um sistema fluvial em uma comunidade rural da Bahia, Brasil. A água foi coletada nos rios Jiquiriçá e Brejões e no abastecimento de água encanada. Além disso, foram coletadas amostras randomizadas de fezes de moradores, vacas, porcos e cavalos próximos ao rio. As amostras foram triadas para bactérias resistentes à ciprofloxacina, cefotaxima e meropenem e identificadas bioquimicamente nos níveis de gênero e espécie. O rastreamento de fontes microbianas demonstrou que a contaminação fecal de ruminantes e humanos aumentou à medida que os rios se aproximavam do centro da vila e diminuía após a última residência. Bactérias resistentes a antibióticos foram identificadas em todas as amostras (n = 32). Nenhuma bactéria demonstrou ser resistente aos carbapenêmicos testados, contudo, foi encontrado enterobactérias resistentes à ciprofloxacina, ainda que essa classe de antibióticos não seja comumente usada na medicina veterinária dos animais dessa região. Considerando esses fatos, juntamente com o padrão de contaminação fecal avaliado, a fonte de contaminação humana foi considerada a mais provável na interação desses isolados resistentes.

Seed-dispersing bird assemblages in riparian environments of a partially urbanized river basin, Southeastern Brazil / Assembleias de aves dispersoras de sementes em ambientes ripários de uma bacia hidrográfica parcialmente urbanizada, no sudoeste brasileiro

Abstract Birds play a key role in ecosystem dynamics, including urban and rural areas, bringing environmental quality improvements and ecological stability. Species contribute directly to natural regeneration of vegetation and succession processes, by offering ecosystem services as seed dispersal, an important role in human-modified areas. We studied the assemblages of fruit-eating birds in riparian environments of Monjolinho basin, central São Paulo state, southeastern Brazil. Birds were recorded in 41 points distributed in riparian ecosystems alongside waterbodies, in landscapes with five types of surrounding matrices: urban, periurban, farmland, and native vegetation. We described how assemblages are structured aiming to evaluate the possible influence of seasonality and landscape type. We recorded 39 bird species that can play a role as seed-dispersers, 32 in wet season and 32 in dry season. There were no significant differences in the diversity and dominance of species between seasons considering the entire area, indicating stability of basic assemblage structure. However, total number of individuals of all species recorded in different landscapes were influenced by seasonality. Also, the composition and abundance of species significantly changed between seasons, leading to a high dissimilarity with almost 50% of the species contributing with almost 90% of the observed variation. A higher taxonomic diversity and distinctness pointed to a wider array of possible seed dispersal services in natural areas, while the lowest values of indexes were found in human-modified areas. The higher number of non-related bird species during dry season contrasted with the higher number of individuals during wet season, indicating that there is more possible ecosystem services offered by frugivorous birds in driest period of the year, while in the rainy period the carrying capacity of the riparian environments was increased.

Resumo As aves desempenham um papel chave na dinâmica dos ecossistemas, incluindo áreas urbanas e rurais, e trazem melhorias na qualidade ambiental e estabilidade ecológica. As espécies contribuem diretamente com a regeneração natural da vegetação e processos de sucessão por oferecerem serviços ecossistêmicos como a dispersão de sementes, um papel fundamental em áreas alteradas. Nós estudamos a assembleia de espécies de aves que se alimentam de frutos em ambientes ripários da bacia do rio Monjolinho, região central do estado de São Paulo, sudeste do Brasil. As aves foram registradas em 41 pontos distribuídos em ecossistemas ripários ao longo dos corpos d'água, em paisagens com quatro tipos de matrizes em seu entorno: urbana, periurbana, rural e vegetação nativa. Nós descrevemos como as assembleias estão estruturadas, objetivando avaliar a possível influência da sazonalidade e do tipo de paisagem do entorno. Foram registradas 39 espécies de aves que podem desempenhar o papel de dispersoras de sementes, sendo 32 espécies no período chuvoso e 32 no período seco. Não foi detectada diferença significativa na diversidade e dominância de espécies entre estações em toda área de estudo, indicando estabilidade da estrutura básica das assembleias. Entretanto, o número total de indivíduos de todas as espécies registrados nas diferentes paisagens foi influenciado pela sazonalidade. Além disso, a composição e abundância de espécies mudou significativamente entre as estações, levando a uma alta dissimilaridade com quase 50% das espécies contribuindo com quase 90% da variação observada. A diversidade e distinção taxonômicas mais altas apontam para maior variedade de serviços ecossistêmicos possíveis relacionados à dispersão de sementes em áreas naturais, enquanto os menores valores desses índices foram encontrados em áreas antropizadas. Um maior número de espécies distintas com menor proximidade taxonômica durante a estação seca, em contraste com um alto número de indivíduos observados na estação chuvosa, indica que existe uma maior gama de possíveis serviços ecossistêmicos oferecidos pelas aves frugívoras no período mais seco do ano, enquanto no período de maior pluviosidade os ecossistemas apresentaram maior capacidade suporte.

Seed-dispersing bird assemblages in riparian environments of a partially urbanized river basin, southeastern Brazil / Assembleias de aves dispersoras de sementes em ambientes ripários de uma bacia hidrográfica parcialmente urbanizada, no sudoeste brasileiro

Birds play a key role in ecosystem dynamics, including urban and rural areas, bringing environmental quality improvements and ecological stability. Species contribute directly to natural regeneration of vegetation and succession processes, by offering ecosystem services as seed dispersal, an important role in human-modified areas. We studied the assemblages of fruit-eating birds in riparian environments of Monjolinho basin, central São Paulo state, southeastern Brazil. Birds were recorded in 41 points distributed in riparian ecosystems alongside waterbodies, in landscapes with five types of surrounding matrices: urban, periurban, farmland, and native vegetation. We described how assemblages are structured aiming to evaluate the possible influence of seasonality and landscape type. We recorded 39 bird species that can play a role as seed-dispersers, 32 in wet season and 32 in dry season. There were no significant differences in the diversity and dominance of species between seasons considering the entire area, indicating stability of basic assemblage structure. However, total number of individuals of all species recorded in different landscapes were influenced by seasonality. Also, the composition and abundance of species significantly changed between seasons, leading to a high dissimilarity with almost 50% of the species contributing with almost 90% of the observed variation. A higher taxonomic diversity and distinctness pointed to a wider array of possible seed dispersal services in natural areas, while the lowest values of indexes were found in human-modified areas. The higher number of non-related bird species during dry season contrasted with the higher number of individuals during wet season, indicating that there is more possible ecosystem services offered by frugivorous birds in driest period of the year, while in the rainy period the carrying capacity of the riparian environments was increased.(AU)

As aves desempenham um papel chave na dinâmica dos ecossistemas, incluindo áreas urbanas e rurais, e trazem melhorias na qualidade ambiental e estabilidade ecológica. As espécies contribuem diretamente com a regeneração natural da vegetação e processos de sucessão por oferecerem serviços ecossistêmicos como a dispersão de sementes, um papel fundamental em áreas alteradas. Nós estudamos a assembleia de espécies de aves que se alimentam de frutos em ambientes ripários da bacia do rio Monjolinho, região central do estado de São Paulo, sudeste do Brasil. As aves foram registradas em 41 pontos distribuídos em ecossistemas ripários ao longo dos corpos dágua, em paisagens com quatro tipos de matrizes em seu entorno: urbana, periurbana, rural e vegetação nativa. Nós descrevemos como as assembleias estão estruturadas, objetivando avaliar a possível influência da sazonalidade e do tipo de paisagem do entorno. Foram registradas 39 espécies de aves que podem desempenhar o papel de dispersoras de sementes, sendo 32 espécies no período chuvoso e 32 no período seco. Não foi detectada diferença significativa na diversidade e dominância de espécies entre estações em toda área de estudo, indicando estabilidade da estrutura básica das assembleias. Entretanto, o número total de indivíduos de todas as espécies registrados nas diferentes paisagens foi influenciado pela sazonalidade. Além disso, a composição e abundância de espécies mudou significativamente entre as estações, levando a uma alta dissimilaridade com quase 50% das espécies contribuindo com quase 90% da variação observada. A diversidade e distinção taxonômicas mais altas apontam para maior variedade de serviços ecossistêmicos possíveis relacionados à dispersão de sementes em áreas naturais, enquanto os menores valores desses índices foram encontrados em áreas antropizadas. Um maior número de espécies distintas com menor proximidade taxonômica durante a estação seca, em contraste com um alto número de indivíduos observados na estação chuvosa, indica que existe uma maior gama de possíveis serviços ecossistêmicos oferecidos pelas aves frugívoras no período mais seco do ano, enquanto no período de maior pluviosidade os ecossistemas apresentaram maior capacidade suporte.(AU)

Achieving the best method to classify Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis: a systematic review.

BACKGROUND: Chronic Rhinosinusitis is currently classified into eosinophilic and non-eosinophilic, according to the histologic quantification of the number of eosinophils in nasal mucosa biopsy. There is a lack of unanimous histopathologic criteria and methodology for this classification and no consensus regarding a cut-off point for Eosinophils per High power field. METHODOLOGY: A systematic electronic search was performed on BVS, PUBMED, PUBMED PMC, SCOPUS, WEB OF SCIENCE, EMBASE, COCHRANE and PROQUEST databases looking for studies that reported a cut point for classification of Eosinophilic Chronic Rhinosinusitis (eCRS), and data concerning methodology of classification was extracted. RESULTS: We identified 142 studies that reported 29 different cut-off values for classification of eCRS, and different methods of histologic analysis. Out of these studies 13 reported their own methodology to establish the cut-off point, and used different reference standards as polyp recurrence, asthma and allergy, immunocytochemistry, quality of life index, standard deviation of the control population and cluster analysis. CONCLUSIONS: Further studies are needed to determine a precise cut-off point, especially international multicentered cluster analysis. Moreover, methodologic standardization of biopsy and analysis is needed to certify comparable results. Multiple biopsy sites, densest cellular infiltration area examination and oral steroids restriction at least four weeks before sampling are advisable.

Toll-like receptor 9 polymorphisms in brazilian patients with systemic lupus erythematosus: a pilot study.

Toll-like receptor 9 (TLR9) is an important component of the innate immune system and have been associated with several autoimmune diseases, such as Systemic Lupus Erythematosus (SLE). The aim of this study was to investigate polymorphisms in TLR9 gene in a Brazilian SLE patients group and their association with clinical manifestation, particularly Jaccoud's arthropathy (JA). We analyzed DNA samples from 204 SLE patients, having a subgroup of them presenting JA (n=24). A control group (n=133) from the same city was also included. TLR9 single nucleotide polymorphisms (SNPs) (-1237 C>T and +2848 G>A) were identified by sequencing analysis. The TLR9 gene genotype frequency was similar both in SLE patients and the control group. In the whole SLE population, an association between the homozygosis of allele C at position -1237 with psychosis and anemia (p < 0.01) was found. Likewise, the homozygosis of allele G at position +2848 was associated with a discoid rash (p < 0.05). There was no association between JA and TLR9 polymorphisms. These data show that TLR9 polymorphisms do not seem to be a predisposing factor for SLE in the Brazilian population, and that SNPs are not associated with JA.

Brasilia tapaculo (Scytalopus novacapitalis) seasonality and site occupancy in altitudinal riparian environments after non-natural burnings and feral pig invasion in Serra da Canastra National Park, Brazil / Sazonalidade do tapaculo-de-Brasília (Scytalopus novacapitalis) e ocupação de área em ambientes ripários de altitude após queimadas não naturais e invasão por javaporco no Parque Nacional da Serra da Canastra, Brasil

The Brasilia Tapaculo, Scytalopus novacapitalis Sick, 1958, is a rare, geographically restricted, and endangered bird species that inhabits riparian vegetation of Cerrado, mainly Gallery Forests. In Serra da Canastra National Park, southeastern Brazil, wetlands are under threat due to frequent non-natural burnings and invasion by feral pigs, Sus scrofa, Linnaeus, 1758. We aimed to evaluate the possible effects of seasonal variations on S. novacapitalis records in undisturbed habitats and answer questions about how fire and feral pigs may affect site occupancy of the species. Transects alongside riparian environments were used to survey n=21 sites, totalizing 7.5 Km, from 2014 to 2019. Results indicated the season influenced both, spontaneous records and induced encounters by playback method, which were more abundant in breeding period, from early spring to summer. The use of playback significantly increased the amount of records in all seasons. The probability of site occupancy in all studied area was higher in late spring (=0.91) and lower in autumn (=0.73). In burned sites (n=8), the first post-fire month showed the lowest probability of occupancy, but there was a rapid recovery in 2nd month and stabilization similar to control area from the 3rd month ahead. After sites (n=11) were invaded by feral pigs, the estimation of site occupancy indicated a slight drop in first two months, but after the 3rd month of invasion the decreasing pattern enhanced the discrepancy with undisturbed areas. It is important to keep monitoring S. novacapitalis population and their threats, to subsidize management actions, especially to avoid frequently unusual burnings in riparian forests, and to block the access of feral pigs to wetlands.(AU)

O tapaculo-de-Brasília, Scytalopus novacapitalis, Sick 1958, é uma espécie de ave rara, geograficamente restrita e ameaçada de extinção que habita vegetação ripária do Cerrado, principalmente matas de galeria. No Parque Nacional da Serra da Canastra, sudeste do Brasil, áreas úmidas estão ameaçadas devido a frequentes queimadas não naturais e a invasão por javaporco, Sus scrofa Linnaeus, 1758. Avaliamos os possíveis efeitos da sazonalidade na quantidade de registros de S. novacapitalis em habitats sem perturbação e buscamos responder questões sobre como o fogo e a invasão por javaporco pode afetar a ocupação de área pela ave. Transecções paralelas aos ambientes ripários foram usadas para amostrar n=21 áreas, totalizando 7,5 km, de 2014 a 2019. Os resultados indicaram que a estação do ano influenciou na quantidade de registros espontâneos e de registros induzidos por playback, os quais foram mais abundantes durante o período reprodutivo. O uso de playback aumentou significativamente a quantidade de registros em todas as estações. A probabilidade de ocupação considerando toda área de estudo foi maior no fim da primavera (=0,91) e menor no outono (=0,73). Em áreas queimadas (n=8 trechos), o primeiro mês após o fogo apresentou a menor probabilidade de ocupação, mas houve uma rápida recuperação no 2º mês, e estabilização similar na área controle a partir do 3º mês. Após n=11 trechos terem sido invadidos por javaporcos, a estimativa de ocupação de área indicou pequena queda nos dois primeiros meses, mas a partir do 3º mês, o padrão de decréscimo ampliou a discrepância com áreas não perturbadas. É importante continuar monitorando a população de S. novacapitalis e suas ameaças, para subsidiar ações de manejo, principalmente para evitar queimadas não naturais frequentes nas florestas ripárias e bloquear o acesso de javaporcos às áreas úmidas.(AU)

Microbial source tracking and antimicrobial resistance in one river system of a rural community in Bahia, Brazil.

Use of antibiotics inevitably leads to antimicrobial resistance. Selection for resistance occurs primarily within the gut of humans and animals as well as in the environment through natural resistance and residual antibiotics in streams and soil. We evaluated antimicrobial resistance in Gram negative bacteria from a river system in a rural community in Bahia, Brazil. Water was collected from the Jiquiriçá and Brejões rivers and the piped water supply. Additionally, stools were collected from a random sample of residents, cows, pigs and horses near the river. The samples were screened for bacteria resistant to ciprofloxacin, cefotaxime, and meropenem and identified biochemically at the genus and species levels. Microbial source tracking demonstrated that ruminant and human fecal contamination increased as the rivers neared the village center and decreased after the last residence. Antibiotic bacteria were identified from all samples (n = 32). No bacteria were resistant to carbapenems, but the majority of the enterobacteria were resistant to ciprofloxacin, even though this class of antibiotics is not commonly used in food animals in this region. Considering these facts, together with the pattern of human fecal contamination, a human source was considered most likely for these resistant isolates.

Hummingbird (Aves: Trochilidae) assemblage using resources from the exotic African tuliptree, Spathodea campanulata (Bignoniaceae) in a Neotropical altered environment, southeastern Brazil / Assembleia de beija-flores (Aves: Trochilidae) utilizando recursos da árvore exótica tulipa africana, Spathodea campanulata (Bignoniaceae) em um ambiente Neotropical alterado, sudeste do Brasil

The non-native African tuliptree, Spathodea campanulata (P. Beauv), is widely distributed in altered Neotropical environments, where hummingbirds are important pollinators. We investigated the assemblage of hummingbirds which fed on its nectar and described their behavior, to understand possible influences of the exotic tree on the territorial behavior in an altered environment in southeastern Brazil. Seven species fed on flower resources, mainly Eupetomena macroura (Gmelin, 1788), Amazilia lactea (Lesson, 1832), and Florisuga fusca (Vieillot, 1817). Visiting time was positive correlated with number of flowers accessed, but in most visits, hummingbirds get the nectar by pillage, instead of frontal access. Flower availability varied throughout months; however, we found no evidence of significative correlation between available flowers and number of agonistic encounters. Despite a high number of animal-plant interactions and a strong territorialism of some species observed in African tuliptree foraging site, there may be other plants at local scale influencing the behavioral patterns observed.(AU)

A tulipa africana, Spathodea campanulata (P. Beauv), é uma árvore não nativa amplamente distribuída em ambientes Neotropicais alterados, onde os beija-flores são importantes polinizadores. Investigamos a assembleia de beija-flores que se alimentam do néctar e descrevemos seus comportamentos para compreender possíveis influências da árvore exótica sobre o comportamento territorial em um ambiente alterado no sudeste do Brasil. Sete espécies se alimentaram de recursos florais, principalmente Eupetomena macroura (Gmelin, 1788), Amazilia lactea (Lesson, 1832) e Florisuga fusca (Vieillot, 1817). O tempo de visita foi correlacionado positivamente com o número de flores acessadas, mas na maioria das visitas os beija-flores obtiveram o néctar pela pilhagem, em vez do acesso frontal. A disponibilidade de flores variou ao longo dos meses; no entanto, não encontramos evidências de correlação significativa entre flores disponíveis e número de encontros agonísticos. Apesar do grande número de interações entre plantas e animais e um forte territorialismo de algumas espécies observadas no local de forrageamento, pode haver outras plantas em escala local influenciando os padrões comportamentais observados.(AU)

Hummingbird (Aves: Trochilidae) assemblage using resources from the exotic African tuliptree, Spathodea campanulata (Bignoniaceae) in a Neotropical altered environment, southeastern Brazil / Assembleia de beija-flores (Aves: Trochilidae) utilizando recursos da árvore exótica tulipa africana, Spathodea campanulata (Bignoniaceae) em um ambiente Neotropical alterado, sudeste do Brasil

Abstract The non-native African tuliptree, Spathodea campanulata (P. Beauv), is widely distributed in altered Neotropical environments, where hummingbirds are important pollinators. We investigated the assemblage of hummingbirds which fed on its nectar and described their behavior, to understand possible influences of the exotic tree on the territorial behavior in an altered environment in southeastern Brazil. Seven species fed on flower resources, mainly Eupetomena macroura (Gmelin, 1788), Amazilia lactea (Lesson, 1832), and Florisuga fusca (Vieillot, 1817). Visiting time was positive correlated with number of flowers accessed, but in most visits, hummingbirds get the nectar by pillage, instead of frontal access. Flower availability varied throughout months; however, we found no evidence of significative correlation between available flowers and number of agonistic encounters. Despite a high number of animal-plant interactions and a strong territorialism of some species observed in African tuliptree foraging site, there may be other plants at local scale influencing the behavioral patterns observed.

Resumo A tulipa africana, Spathodea campanulata (P. Beauv), é uma árvore não nativa amplamente distribuída em ambientes Neotropicais alterados, onde os beija-flores são importantes polinizadores. Investigamos a assembleia de beija-flores que se alimentam do néctar e descrevemos seus comportamentos para compreender possíveis influências da árvore exótica sobre o comportamento territorial em um ambiente alterado no sudeste do Brasil. Sete espécies se alimentaram de recursos florais, principalmente Eupetomena macroura (Gmelin, 1788), Amazilia lactea (Lesson, 1832) e Florisuga fusca (Vieillot, 1817). O tempo de visita foi correlacionado positivamente com o número de flores acessadas, mas na maioria das visitas os beija-flores obtiveram o néctar pela pilhagem, em vez do acesso frontal. A disponibilidade de flores variou ao longo dos meses; no entanto, não encontramos evidências de correlação significativa entre flores disponíveis e número de encontros agonísticos. Apesar do grande número de interações entre plantas e animais e um forte territorialismo de algumas espécies observadas no local de forrageamento, pode haver outras plantas em escala local influenciando os padrões comportamentais observados.

Brasilia tapaculo (Scytalopus novacapitalis) seasonality and site occupancy in altitudinal riparian environments after non-natural burnings and feral pig invasion in Serra da Canastra National Park, Brazil.

The Brasilia Tapaculo, Scytalopus novacapitalis Sick, 1958, is a rare, geographically restricted, and endangered bird species that inhabits riparian vegetation of Cerrado, mainly Gallery Forests. In Serra da Canastra National Park, southeastern Brazil, wetlands are under threat due to frequent non-natural burnings and invasion by feral pigs, Sus scrofa, Linnaeus, 1758. We aimed to evaluate the possible effects of seasonal variations on S. novacapitalis records in undisturbed habitats and answer questions about how fire and feral pigs may affect site occupancy of the species. Transects alongside riparian environments were used to survey n=21 sites, totalizing 7.5 Km, from 2014 to 2019. Results indicated the season influenced both, spontaneous records and induced encounters by playback method, which were more abundant in breeding period, from early spring to summer. The use of playback significantly increased the amount of records in all seasons. The probability of site occupancy in all studied area was higher in late spring (ψ=0.91) and lower in autumn (ψ=0.73). In burned sites (n=8), the first post-fire month showed the lowest probability of occupancy, but there was a rapid recovery in 2nd month and stabilization similar to control area from the 3rd month ahead. After sites (n=11) were invaded by feral pigs, the estimation of site occupancy indicated a slight drop in first two months, but after the 3rd month of invasion the decreasing pattern enhanced the discrepancy with undisturbed areas. It is important to keep monitoring S. novacapitalis population and their threats, to subsidize management actions, especially to avoid frequently unusual burnings in riparian forests, and to block the access of feral pigs to wetlands.

Hummingbird (Aves: Trochilidae) assemblage using resources from the exotic African tuliptree, Spathodea campanulata (Bignoniaceae) in a Neotropical altered environment, southeastern Brazil.

The non-native African tuliptree, Spathodea campanulata (P. Beauv), is widely distributed in altered Neotropical environments, where hummingbirds are important pollinators. We investigated the assemblage of hummingbirds which fed on its nectar and described their behavior, to understand possible influences of the exotic tree on the territorial behavior in an altered environment in southeastern Brazil. Seven species fed on flower resources, mainly Eupetomena macroura (Gmelin, 1788), Amazilia lactea (Lesson, 1832), and Florisuga fusca (Vieillot, 1817). Visiting time was positive correlated with number of flowers accessed, but in most visits, hummingbirds get the nectar by pillage, instead of frontal access. Flower availability varied throughout months; however, we found no evidence of significative correlation between available flowers and number of agonistic encounters. Despite a high number of animal-plant interactions and a strong territorialism of some species observed in African tuliptree foraging site, there may be other plants at local scale influencing the behavioral patterns observed.