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1.
Brasília; Ipea; 2021. 30 p. ilus.(Nota Téccnica / IPEA. Diest, 54).
Monografía en Portugués | ECOS, LILACS | ID: biblio-1549917

RESUMEN

Esta nota técnica tem como objetivo geral fornecer subsídios para a elaboração de políticas públicas para pessoas com deficiência (PcDs), e como objetivo específico produzir um extrato de informações para compor uma seção do Atlas da violência, a partir da edição de 2021. Assim, a nota aborda, principalmente, as estatísticas disponíveis sobre violência contra PcDs no Brasil, incluindo-se as violências autoprovocadas, estatísticas estas fornecidas pelo programa de Vigilância em Violência e Acidentes do Sistema Nacional de Agravos de Notificação (Viva/Sinan). Não obstante, também são abordadas as estatísticas sobre PcDs produzidas pelo Instituto Brasileiro de Geografia e Estatísticas (IBGE), por meio do Censo Demográfico e da Pesquisa Nacional da Saúde (PNS). Para a elaboração desta nota técnica, contou-se com a colaboração de especialistas sobre o tema da deficiência, gestores da área de saúde pública e gestores do Viva/Sinan, os quais participaram de uma oficina de trabalho da Diest/Ipea, onde foram apresentados os resultados preliminares da pesquisa para a elaboração desta nota, em março de 2021.1 As críticas e sugestões apresentadas na oficina de trabalho orientaram a revisão desta nota técnica e, em alguma medida, foram incorporadas na presente versão deste trabalho. Este texto está organizado da maneira a seguir explicitada. Na seção 2, apresenta-se os conceitos médico e biopsicossocial sobre a deficiência, relacionados à produção de estatísticas sobre o tema no Brasil. Na seção 3, aborda-se os conceitos utilizados na base de dados do Viva/Sinan sobre as notificações de violência contra PcDs, e apresenta-se um indicador de violência contra pessoas com deficiência, utilizando as estatísticas disponíveis. Na seção 4, apresenta-se os resultados de uma análise exploratória dos dados do Viva/Sinan para violência contra PcDs para o ano de 2018 e, finalmente, na seção 5, faz-se algumas considerações finais. Nos anexos desta nota, reuniu-se as principais definições das bases de dados utilizadas neste trabalho para identificar as PcDs no Brasil.


Asunto(s)
Estadística , Personas con Discapacidad , Salud Pública , Violencia
2.
Bol. Anál. Político-Instit ; (25): 73-79, 2021.
Artículo en Portugués | ECOS, Coleciona SUS | ID: biblio-1152609

RESUMEN

Neste artigo, aborda-se a questão do abastecimento de água nos assentamentos urbanos precários no contexto da pandemia da Covid-19. Atualmente, estima-se que 5 milhões de domicílios no país situam-se em áreas de "aglomerados subnormais", o que, nas estatísticas do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), compreendem favelas, palafitas, loteamentos irregulares e assemelhados. As regiões metropolitanas das capitais abrigam mais de 80% destes assentamentos, o que reflete as dificuldades da população de baixa renda para morar nas áreas regularizadas das grandes cidades, devido aos altos preços de aluguel e venda de imóveis. Embora não existam dados atualizados sobre o acesso à água tratada nas favelas, o censo de 2010 mostra que, na maior parte das regiões metropolitanas, mais de 90% dos domicílios nesses assentamentos estão conectados à rede geral de água, com exceção das favelas na região Norte e algumas metrópoles do Nordeste e Centro-Oeste, onde o grau de acesso é mais baixo, conforme mostra a tabela 1. É possível afirmar que tais indicadores positivos na maioria das metrópoles refletem décadas de políticas de urbanização e implantação de redes de saneamento básico, como será visto ao longo deste texto. Porém, a despeito dos avanços no acesso à rede geral de água, duas dificuldades se sobressaem: i) a existência de localidades/setores sem conexão à rede de água dentro de favelas consolidadas, embora estas apresentem alto grau de acesso à rede geral; e ii) a intermitência no fornecimento de água em diversas favelas, inclusive em muitas daquelas com elevado grau de conexão à rede geral.


Asunto(s)
Coronavirus , Infecciones por Coronavirus , Pandemias
4.
Brasília; IPEA; 2020. 16 p. (Nota Técnica / IPEA. Diest, 39).
Monografía en Portugués | ECOS, LILACS | ID: biblio-1139912

RESUMEN

Nesta nota técnica, aborda-se a questão do abastecimento de água nas favelas brasileiras em meio à pandemia, por intermédio de dois tipos de informações: i) as estatísticas disponíveis sobre o abastecimento de água e os assentamentos precários; ii) as informações coletadas na imprensa, nas redes sociais e em sites de órgãos do governo, sobre as mobilizações populares reivindicando o direito à água, e as respostas da administração pública ­ notadamente, as empresas estaduais de saneamento básico, mediadas ou não por ações do sistema de justiça, principalmente nos estados do Rio de Janeiro e de São Paulo, entre março e junho de 2020. Foge ao escopo desta nota relacionar os problemas do abastecimento de água à incidência de casos e à mortalidade pela Covid-19. O que se pretende é discutir os problemas no abastecimento de água nos assentamentos precários do Brasil, posto em evidência na crise atual, como um componente fundamental da moradia (in)adequada.


Asunto(s)
Asentamientos Humanos , Coronavirus , Derechos Humanos , Infecciones por Coronavirus , Áreas de Pobreza
5.
J Clin Lipidol ; 10(2): 394-409, 2016.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27055971

RESUMEN

BACKGROUND: Lipoprotein lipase (LPL) deficiency is a serious lipid disorder of severe hypertriglyceridemia (SHTG) with chylomicronemia. A large number of variants in the LPL gene have been reported but their influence on LPL activity and SHTG has not been completely analyzed. Gaining insight into the deleterious effect of the mutations is clinically essential. METHODS: We used gene sequencing followed by in-vivo/in-vitro and in-silico tools for classification. We classified 125 rare LPL mutations in 33 subjects thought to have LPL deficiency and in 314 subjects selected for very SHTG. RESULTS: Of the 33 patients thought to have LPL deficiency, only 13 were homozygous or compound heterozygous for deleterious mutations in the LPL gene. Among the 314 very SHTG patients, 3 were compound heterozygous for pathogenic mutants. In a third group of 51,467 subjects, from a general population, carriers of common variants, Asp9Asn and Asn291Ser, were associated with mild increase in triglyceride levels (11%-35%). CONCLUSION: In total, 39% of patients clinically diagnosed as LPL deficient had 2 deleterious variants. Three patients selected for very SHTG had LPL deficiency. The deleterious mutations associated with LPL deficiency will assist in the diagnosis and selection of patients as candidates for the presently approved LPL gene therapy.


Asunto(s)
Hiperlipoproteinemia Tipo I/enzimología , Hiperlipoproteinemia Tipo I/genética , Lipoproteína Lipasa/genética , Mutación , Humanos , Hiperlipoproteinemia Tipo I/complicaciones , Hiperlipoproteinemia Tipo I/metabolismo , Hipertrigliceridemia/complicaciones , Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos , Triglicéridos/metabolismo
6.
Rio de Janeiro; IPEA; 2016. 231 p.
Monografía en Portugués | LILACS, ECOS | ID: biblio-1047499

RESUMEN

Apresenta estudos aprofundados sobre a sociabilidade nas favelas a partir de um ponto de vista comum, no sentido físico do termo, que é o ponto de vista da pesquisa de campo. O livro começa com um texto sobre a formação histórica do campo de atuação de agentes governamentais, pesquisadores, ativistas sociais e moradores das favelas do Rio de Janeiro. Em seguida, mostra a atuação do Estado nas favelas do Complexo do Alemão, sempre com um olhar atento sobre a participação dos moradores nos arranjos institucionais que viabilizaram as políticas públicas. Na sequência, o leitor encontra um conjunto de textos em que a sociabilidade nas favelas é tratada em primeiro plano. Por fim, Aborda com profundidade a vida social nesse meio, até o epílogo, no qual sintetiza o que é o Complexo do Alemão do ponto de vista de dois autores (texto e ilustração) que nasceram no Complexo e participam ativamente de sua vida social e política.


Asunto(s)
Áreas de Pobreza
7.
J Bacteriol ; 195(20): 4753-60, 2013 Oct.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23974026

RESUMEN

Sulfate-reducing bacteria are characterized by a high number of hydrogenases, which have been proposed to contribute to the overall energy metabolism of the cell, but exactly in what role is not clear. Desulfovibrio spp. can produce or consume H2 when growing on organic or inorganic substrates in the presence or absence of sulfate. Because of the presence of only two hydrogenases encoded in its genome, the periplasmic HynAB and cytoplasmic Ech hydrogenases, Desulfovibrio gigas is an excellent model organism for investigation of the specific function of each of these enzymes during growth. In this study, we analyzed the physiological response to the deletion of the genes that encode the two hydrogenases in D. gigas, through the generation of ΔechBC and ΔhynAB single mutant strains. These strains were analyzed for the ability to grow on different substrates, such as lactate, pyruvate, and hydrogen, under respiratory and fermentative conditions. Furthermore, the expression of both hydrogenase genes in the three strains studied was assessed through quantitative reverse transcription-PCR. The results demonstrate that neither hydrogenase is essential for growth on lactate-sulfate, indicating that hydrogen cycling is not indispensable. In addition, the periplasmic HynAB enzyme has a bifunctional activity and is required for growth on H2 or by fermentation of pyruvate. Therefore, this enzyme seems to play a dominant role in D. gigas hydrogen metabolism.


Asunto(s)
Proteínas Bacterianas/metabolismo , Desulfovibrio gigas/enzimología , Regulación Bacteriana de la Expresión Génica/fisiología , Hidrogenasas/clasificación , Hidrogenasas/metabolismo , Proteínas Bacterianas/genética , Desulfovibrio gigas/genética , Desulfovibrio gigas/metabolismo , Fermentación , Eliminación de Gen , Regulación Enzimológica de la Expresión Génica/fisiología , Hidrógeno/metabolismo , Hidrogenasas/genética , Ácido Láctico/metabolismo , Datos de Secuencia Molecular , Ácido Pirúvico/metabolismo , ARN Bacteriano/genética , ARN Bacteriano/metabolismo , ARN Mensajero/genética , ARN Mensajero/metabolismo , Transcriptoma
8.
Brasília; IPEA; 2012. 34 p. graf, map.(Texto para Discussão / IPEA).
Monografía en Portugués | LILACS, ECOS | ID: biblio-992050

RESUMEN

Apresenta os resultados do georreferenciamento dos registros de óbitos por homicídio no município do Rio de Janeiro, ocorridos entre 2002 e 2006, e um exercício de geoprocessamento destes dados com vistas a identificar as áreas de concentração das vítimas de homicídios (ACVs) na cidade de acordo com o local de residência do falecido, assim como aferir as principais características socioeconômicas de tais áreas.


Asunto(s)
Causas Externas , Condiciones Sociales , Factores Socioeconómicos , Homicidio , Mortalidad , Violencia , Áreas de Pobreza , Brasil
9.
Cad Saude Publica ; 25(1): 29-36, 2009 Jan.
Artículo en Portugués | MEDLINE | ID: mdl-19180284

RESUMEN

The Brazilian public budget for health was R$ 53 billion (approximately U$ 20 billion) in 2003. What share of this total was to treat victims of violence? It is impossible to estimate that proportion directly, due to limitations in the available data. This paper proposes a methodology to estimate the cost of violence for the public health system, using data from the Unified National Health System, the government budget, and the demand for public medical services (National Household Sample Survey). According to our estimates, in 2004 the costs of treatment for victims of external causes, aggressions, and traffic accidents were R$ 2.2 billion, R$ 119 million, and R$ 453 million, respectively. These findings were approximately four times higher than those observed in other studies.


Asunto(s)
Recolección de Datos/métodos , Financiación Gubernamental/economía , Costos de la Atención en Salud/estadística & datos numéricos , Violencia/economía , Accidentes de Tránsito/economía , Sistemas de Información en Atención Ambulatoria , Brasil , Presupuestos/métodos , Sistemas de Información en Hospital , Humanos , Heridas y Lesiones/economía
10.
Cad. saúde pública ; 25(1): 29-36, jan. 2009. tab
Artículo en Portugués | LILACS | ID: lil-505606

RESUMEN

O orçamento público em saúde era da ordem de 53 bilhões de Reais em 2003. Dentro desse orçamento, qual é a parcela referente ao tratamento de vítimas da violência? Devido às limitações dos dados disponíveis não é possível calcular diretamente essa parcela. Neste artigo propomos uma metodologia para estimar o custo da violência para o sistema público de saúde que utiliza informações do Sistema Único de Saúde, dos orçamentos estaduais e municipais e estimativas sobre a demanda por atendimento ambulatorial da Pesquisa Nacional por Amostra de Domicílios. Segundo nossos resultados, em 2004 o tratamento de vítimas de causas externas, de agressões e de acidentes de transporte teria custado ao setor público R$ 2,2 bilhões, R$ 119 milhões e R$ 453 milhões, respectivamente. Esses valores são cerca de quatro vezes maiores que aqueles verificados em trabalhos que computaram apenas os custos com internações.


The Brazilian public budget for health was R$ 53 billion (approximately U$ 20 billion) in 2003. What share of this total was to treat victims of violence? It is impossible to estimate that proportion directly, due to limitations in the available data. This paper proposes a methodology to estimate the cost of violence for the public health system, using data from the Unified National Health System, the government budget, and the demand for public medical services (National Household Sample Survey). According to our estimates, in 2004 the costs of treatment for victims of external causes, aggressions, and traffic accidents were R$ 2.2 billion, R$ 119 million, and R$ 453 million, respectively. These findings were approximately four times higher than those observed in other studies.


Asunto(s)
Humanos , Recolección de Datos/métodos , Financiación Gubernamental/economía , Costos de la Atención en Salud/estadística & datos numéricos , Violencia/economía , Sistemas de Información en Atención Ambulatoria , Accidentes de Tránsito/economía , Brasil , Presupuestos/métodos , Sistemas de Información en Hospital , Heridas y Lesiones/economía
12.
Brasília; IPEA; 2007. 42 p. graf.(Texto para Discussão / IPEA).
Monografía en Portugués | LILACS, ECOS | ID: biblio-991976

RESUMEN

A violência no Brasil é reconhecidamente um dos maiores problemas atualmente enfrentados pela sociedade. Cada vítima fatal da violência, do ponto de vista econômico, representa perda de investimentos em capital humano e, portanto, de capacidade produtiva. Qual é o custo social dessas mortes violentas no Brasil? É esta a pergunta que norteia o presente trabalho.


Asunto(s)
Adolescente , Causas Externas , Causas de Muerte , Costos y Análisis de Costo , Estadística como Asunto , Mortalidad , Violencia , Brasil
13.
Brasília; IPEA; 2007. 58 p. graf.(Texto para Discussão / IPEA).
Monografía en Portugués | LILACS, ECOS | ID: biblio-991977

RESUMEN

O crescimento da violência no Brasil, principalmente nos grandes centros urbanos, gera discussões sobre quais as conseqüências e os custos daí originados. O texto apresenta estimativas inéditas dos custos da violência e fornece uma descrição dos usos da análise econômica do custo-benefício e do custo-eficácia aplicados às políticas de prevenção à violência.


Asunto(s)
Análisis Costo-Beneficio , Costos y Análisis de Costo , Política Pública , Servicios de Salud , Sistema Único de Salud , Violencia , Brasil
14.
Brasília; IPEA; 2007. 30 p. ilus.(Texto para Discussão / IPEA).
Monografía en Portugués | LILACS, ECOS | ID: biblio-991978

RESUMEN

Objetiva responder qual a parcela do orçamnto público em saúde alocada para o tratamento de vítimas da violência. Dentre as categorias de morbidade que são objeto da análise estão as causas externas e os custos associados às agressões e aos acidentes de trânsito.


Asunto(s)
Causas Externas , Costos y Análisis de Costo , Estadística como Asunto , Hospitales , Mortalidad , Salud Pública , Sistema Único de Salud , Sistemas de Salud , Violencia , Brasil
15.
DNA Seq ; 17(1): 56-64, 2006 Feb.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16753818

RESUMEN

The chemosensory system of bacteria controls their motility and behaviour in different environments. In the present study, we report the identification of the first chemotaxis operon in Desulfovibrio gigas. Amino acid sequence analysis revealed seven coding regions for polypeptides with a high similarity to chemotaxis proteins from other organisms. D. gigas chemotaxis operon has a similar genetic organisation to chemotaxis operons found in the sequenced genomes of Desulfovibrio desulfuricans and Desulfovibrio vulgaris. Control of gene expression was assessed by real-time reverse transcription-PCR in cells grown under different conditions. mRNA levels were enhanced in the presence of thiosulfate and sulfite and decreased upon exposure to NO. No effect was observed in the presence of O2, NaNO2, pyruvate or fumarate. These results show that the expression of the chemotaxis operon is enhanced in the presence of thiosulfate and sulfite indicating that under these compounds a chemotactic response seems to be triggered in D. gigas.


Asunto(s)
Quimiotaxis/genética , Desulfovibrio gigas/genética , Genes Bacterianos , Secuencia de Aminoácidos , Desulfovibrio gigas/crecimiento & desarrollo , Regulación Bacteriana de la Expresión Génica , Datos de Secuencia Molecular , Sistemas de Lectura Abierta , Operón/genética , Filogenia , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , Análisis de Secuencia de ADN , Análisis de Secuencia de Proteína
16.
Rio de Janeiro; IPEA; maio 2006. 22 p. map.(Texto para Discussão / IPEA).
Monografía en Portugués | ECOS, LILACS | ID: biblio-991965

RESUMEN

Discute a relação entre a pobreza e a violência urbana usando como exemplo o caso do município de São Paulo. Mostra que o local de moradia, e não a renda, é a variável mais adequada para avaliar a associação entre a pobreza e a violência na cidade.


Asunto(s)
Causas Externas , Condiciones Sociales , Factores Socioeconómicos , Homicidio , Mortalidad , Pobreza , Violencia , Brasil
17.
J Bacteriol ; 188(8): 2745-51, 2006 Apr.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16585735

RESUMEN

Desulfovibrio gigas flavodiiron protein (FDP), rubredoxin:oxygen oxidoreductase (ROO), was proposed to be the terminal oxidase of a soluble electron transfer chain coupling NADH oxidation to oxygen reduction. However, several members from the FDP family, to which ROO belongs, revealed nitric oxide (NO) reductase activity. Therefore, the protection afforded by ROO against the cytotoxic effects of NO was here investigated. The NO and oxygen reductase activities of recombinant ROO in vitro were tested by amperometric methods, and the enzyme was shown to effectively reduce NO and O(2). Functional complementation studies of an Escherichia coli mutant strain lacking the ROO homologue flavorubredoxin, an NO reductase, showed that ROO restores the anaerobic growth phenotype of cultures exposed to otherwise-toxic levels of exogenous NO. Additional studies in vivo using a D. gigas roo-deleted strain confirmed an increased sensitivity to NO of the mutant strain in comparison to the wild type. This effect is more pronounced when using the nitrosating agent S-nitrosoglutathione (GSNO), which effectively impairs the growth of the D. gigas Deltaroo strain. roo is constitutively expressed in D. gigas under all conditions tested. However, real-time reverse transcription-PCR analysis revealed a twofold induction of mRNA levels upon exposure to GSNO, suggesting regulation at the transcription level by NO. The newly proposed role of D. gigas ROO as an NO reductase combined with the O(2) reductase activity reveals a versatility which appears to afford protection to D. gigas at the onset of both oxidative and nitrosative stresses.


Asunto(s)
Desulfovibrio gigas/fisiología , Óxido Nítrico/metabolismo , Estrés Oxidativo/fisiología , Oxidorreductasas/fisiología , Antibacterianos/metabolismo , Antibacterianos/farmacología , Desulfovibrio gigas/genética , Escherichia coli/efectos de los fármacos , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/crecimiento & desarrollo , Proteínas de Escherichia coli/genética , Eliminación de Gen , Regulación Bacteriana de la Expresión Génica , Prueba de Complementación Genética , Óxido Nítrico/farmacología , Oxidación-Reducción , Oxidorreductasas/genética , ARN Bacteriano/biosíntesis , ARN Mensajero/biosíntesis , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , S-Nitrosoglutatión/farmacología
18.
Curr Microbiol ; 52(4): 274-81, 2006 Apr.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16550467

RESUMEN

Although classified as anaerobic, Desulfovibrio gigas contains a functional canonical membrane respiratory chain, including a cytochrome bd quinol oxidase as its terminal element. In the present study, we report the identification of the operon cydAB encoding the two subunits of cytochrome bd from this bacterium. Two hypothetical promoter regions and sequences resembling transcriptional regulators-binding sites have been identified. Amino acid sequence analysis revealed a high similarity to cytochrome bd from other organisms, presenting the conserved residues typical from these proteins. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and Northern blot analysis confirmed the operon transcription. Gene expression was assessed by real-time RT-PCR in cells grown in different media and under exposure to oxygen and nitric oxide. mRNA levels were slightly enhanced in the presence of 150 microM: NO. However, in the presence of 10 microM: NO, a decrease was observed of the steady-state population of cydAB mRNA. No considerable effect was observed in the presence of fumarate/sulfate medium, 60 microM: O2 or 10 microM: NO.


Asunto(s)
Proteínas Bacterianas/metabolismo , Desulfovibrio gigas/enzimología , Complejo IV de Transporte de Electrones/metabolismo , Secuencia de Aminoácidos , Proteínas Bacterianas/genética , Secuencia de Bases , Grupo Citocromo d/metabolismo , Citocromos b/metabolismo , Desulfovibrio gigas/genética , Complejo IV de Transporte de Electrones/genética , Datos de Secuencia Molecular , Óxido Nítrico/fisiología , Operón , Oxígeno/fisiología , Regiones Promotoras Genéticas , Subunidades de Proteína/genética , Subunidades de Proteína/metabolismo , Análisis de Secuencia de ADN
19.
Biochem Biophys Res Commun ; 306(2): 366-75, 2003 Jun 27.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12804572

RESUMEN

In the present study, we report the identification of an operon with six coding regions for a multisubunit membrane-bound [NiFe] hydrogenase in the genome of Desulfovibrio gigas. Sequence analysis of the deduced polypeptides reveals a high similarity to subunits of proteins belonging to the family of Ech hydrogenases. The operon is organised similarly to the operon coding for the Ech hydrogenase from Methanosarcina barkeri, suggesting that both encode very similar hydrogenases. Expression of the operon was detected by Northern blot and RT-PCR analyses, and the presence of the encoded proteins was examined by Western blotting. The possible role of this hydrogenase is discussed, relating it with a potential function in the H(2) cycling as a mechanism for energy conservation in D. gigas. The present study provides therefore valuable insights into the open question of the energy conserving mechanism in D. gigas.


Asunto(s)
Membrana Celular/enzimología , Desulfovibrio/enzimología , Oxidorreductasas/química , Oxidorreductasas/metabolismo , Secuencia de Aminoácidos , Northern Blotting , Western Blotting , Clonación Molecular , ADN/metabolismo , Biblioteca de Genes , Genoma Bacteriano , Modelos Genéticos , Datos de Secuencia Molecular , Operón , Péptidos , Filogenia , ARN/metabolismo , Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa , Análisis de Secuencia de ADN , Homología de Secuencia de Aminoácido
20.
J Biol Inorg Chem ; 8(4): 475-88, 2003 Apr.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12761668

RESUMEN

The interaction and electron transfer (ET) between rubredoxin (Rd) and rubredoxin:oxygen oxidoreductase (ROO) from Desulfovibrio gigas is studied by molecular modelling techniques. Experimental kinetic assays using recombinant proteins show that the Rd reoxidation by ROO displays a bell-shaped dependence on ionic strength, suggesting a non-trivial electrostatic dependence of the interaction between these two proteins. Rigid docking studies reveal a prevalence for Rd to interact, in a very specific way, with the surface of the ROO dimer near its FMN cofactors. The optimization of the lowest energy complexes, using molecular dynamics simulation, shows a very tight interaction between the surface of the two proteins, with a high probability for Rd residues (but not the iron centre directly) to be in direct contact with the FMN cofactors of ROO. Both electrostatics and van der Waals interactions contribute to the final energy of the complex. In these complexes, the major contributions for complex formation are polar interactions between acidic residues of Rd and basic residues of ROO, plus substantial non-polar interactions between different groups. Important residues for this process are identified. ET estimates (using the Pathways model), in the optimized lowest energy complexes, suggest that these configurations are efficient for transferring electrons. The experimental bell-shaped dependence of kinetics on ionic strength is analysed in view of the molecular modelling results, and hypotheses for the molecular basis of this phenomenon are discussed.


Asunto(s)
NADH NADPH Oxidorreductasas/metabolismo , Oxígeno/metabolismo , Rubredoxinas/metabolismo , Secuencia de Aminoácidos , Transporte de Electrón , Proteínas de la Membrana/química , Proteínas de la Membrana/metabolismo , Modelos Moleculares , Datos de Secuencia Molecular , NADH NADPH Oxidorreductasas/química , Oxígeno/química , Rubredoxinas/química
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