Pesquisa de bacteriófagos em água suspeita de contaminação por vírus da hepatite A / Study of bacteriophages in water suspected of contamination by hepatitis A virus

Os vírus entéricos, quando presentes no trato gastrointestinal de indivíduos infectados, são eliminados pelas fezes em grandes quantidades podendo contaminar, direta ou indiretamente, as águas destinadas ao consumo humano. O ser humano é o único hospedeiro natural do vírus da hepatite A. A detecção de colifago e de fago de Shigella sonnei em água pode ser indicativa da presença destes vírus. No presente estudo foi realizado o diagnóstico laboratorial presuntivo de um surto de hepatite A, pela pesquisa de bacteriófagos, em uma amostra de água de poço e o estudo da sobrevivência dos fagos de S. sonnei em água. A análise revelou resultado positivo para fagos de Shigella e negativo para colifagos. Quanto aos ensaios de sobrevivência, a presença dos fagos de S. sonnei foi detectada na água do poço naturalmente contaminada até o nono dia de conservação em temperatura ambiente.

The enteric viruses are present in the gastrointestinal tract of infected individuals, being eliminated in feces in large quantities and can directly or indirectly contaminate water intended for human consumption. Humans are the only natural hosts for hepatitis A. Detection of coliphages and phage of Shigella sonnei in water may indicate the presence of these viruses. In the present study was done the presumptive laboratory diagnosis of an outbreak of hepatitis A through search of bacteriophages in a sample of well water and the study of survival of shigelafagos in water. The analysis revealed positive for phages of S. sonnei and negative for coliphages. For the tests of survival, the presence of phages of S. sonnei was detected in naturally contaminated well water until the ninth day of storage at room temperature.

Rotavirus diarrhea in children and adults in a southern city of Brazil in 2003: distribution of G/P types and finding of a rare G12 strain.

Between May and August in 2003, a total of 251 fecal samples were collected from children and adults with diarrhea (5 inpatients and 246 outpatients) at a private hospital in the city of Ponta Grossa, the state of Paraná, Brazil. Group A rotavirus was detected in 71 of 251 (28.3%) specimens: 55 (77.5%) from children under 5 years of age and 16 (22.5%) from individuals aged 6-72 years. All 71 strains exhibited a "long" RNA pattern when analyzed by PAGE. Sixty-one positive samples that yielded enough RNA were submitted to PCR genotyping. The most frequent G/P genotype combination detected was G1P[8] (86.9%; 53/61) followed by G9P[8] (3.3%; 2/61) and G12P[9] (1.6%; 1/61). Rotaviruses with G2, G3, G4, P[4], or P[6] specificity were not detected. For three strains (4.9%) bearing G1 genotype, the VP4 specificity could no be determined, and two specimens (3.3%) remained G/P non-typeable. One rotavirus strain (HC91) bearing G12P[9] genotype with a "long" electropherotype was isolated from an 11-month-old boy with diarrhea for the first time in Brazil. The cell-culture grown HC91 strain was shown to belong to serotype G12 by neutralization.

Severe acute respiratory syndrome-a global concern-influenza virus isolated from suspected cases in Brazil from April to June 2003.

Severe acute respiratory syndrome (SARS) is a condition associated with substantial morbidity and mortality. Coronavirus has been associated with this severe emerging disease, with a pattern suggesting droplet or contact transmission. From April to June 2003, Institute Adolfo Lutz received 16 respiratory secretions from hospitalized patients with recent history of travel to an area with local transmission of SARS. Rapid antigen detection for influenza A and B, parainfluenza types 1, 2 and 3, respiratory syncytial virus and adenovirus; electron microscopy, polymerase chain reaction (PCR), reverse transcription PCR (RT-PCR) and serologic assay were performed. Virus isolation attempts were performed in Hep-2, Vero, MDCK, NCI-H292, MRC-5, LLC-MK2 and FRhK-4. Influenza virus of type A/Panama/2007/99 (H3N2) and A/New Caledonia/20/99 (H1N2) were identified.

Diagnóstico rápido de vírus por microscopia eletrônica / Rapid virus diagnosis by electron microscopy

A Seçäo de Microscopia Eletrônica(ME) do Instituto Adolfo Lutz(IAL) realiza diagnósticos rápidos de: Herpesvírus, Poxvírus, Papilomavírus, Rotavírus, Adenovírus, Calcivírus, "Small Round Vírus Particles-SRVP", agente de Norwalk, Parvovírus e bacteriófagos em diversas amostras biológicas. Contribui também no controle de qualidade de antígenos virais como Sarampo, Influenza, Rocio, Dengue, Hepatite A e B, HIV e outros. A coloraçäo negativa é uma das técnicas utilizadas no diagnóstico rápido de vários vírus associados às doenças humanas. A morfologia, a subestrutura e o diâmetro säo características importantes para diferenciar esses vírus. Apesar da impossibilidade de se realizar exames em larga escala, do alto custo e da necessidade de técnicos especializados, é uma técnica de fácil execuçäo, com obtençäo rápida do resultado. É útil para detectar vírus de difícil cultivo e é o único método que permite observar mais de um agente numa mesma amostra. Embora existam vários laboratórios de ME em Universidades e em Instituiçöes de Pesquisa, cada laboratório está empenhado em sua linha de pesquisa e säo poucos os que se dedicam à área de diagnóstico rápido de vírus

Rotavírus, adenovírus, astrovírus, calicivírus e "small round virus particles" em fezes de crianças, com e sem diarréia aguda, no período de 1987 a 1988, na grande São Paulo / Rotavirus, adenovirus, astrovirus, calicivirus and small round virus particles in feces of children with and without acute diarrhea, from 1987 to 1988, in the greater São Paulo

Between 1987 and 1988, 193 faecal specimens from children, with or without diarrhea, were submitted to enzyme immunoassay, polyacrylamide-gel electrophoresis and electronmicroscopy tests for virus detection. The positivity for Rotavirus, Adenovirus, Astrovirus, Calicivirus and Small Round Virus Particles (SRVP) was 11.3, 3.1, 2.1, 1.0 and 4.1, respectively, for the 97 children with acute diarrhea. Of the 96 children without diarrhea, 4.2 were positive for Rotavirus, 1.0 for Calicivirus and 7.3 for SRVP. Of 15 positive specimens for Rotavirus, 14 showed electrophoretic patterns proper to group A and 1 specimen of group C Rotavirus. The analysis of electrophorotypes demonstrated great heterogeneity of electrophoretic patterns and predominance of subgroup 2, "long". The association of virus, bacteria and parasites was present both in children with or without acute diarrhea.

Presumptive rapid diagnosis of parvovirus infection in patients with Erythema infectiosum-like illness

In September 1987 an outbreak of exanthematous illness ressembling erythma infectiosum occurres at an elementary school of Säo Paulo city. Attempts to isolate virus from the nasofaryngeal secretion and urine and serum samples collected from the ill children in acute phase of illness resulted negative. Nevertheless, parvovirus-like particles of about 24 nm in diameter were observed by negative staining electron microscopy in concentraded urine of seven out of eight ill patients and in nasopharyngeal secretion of one out of four patients. No similar viral particle was observed in concentred urine samples collected on the same occasion from their classmates without evident signs of illness. This is a proposal of an alternative test for a rapid and sensitive presumptive diagnosis of human parvovirus infection

Diagnóstico rápido de vírus do grupo herpes por microscopia eletrônica: - observaçöes atípicas nas amostras de pacientes aidéticos / Rapid diagnostic of herpesvirus group by electron microscopy: atypical observations in the sample of patients with AIDS

A Seçäo de Microscopia Eletrônica do Instituto Adolfo Lutz recebeu no período de 1986-90, 129 amostras de materiais biológicos (líquido vesicular, raspado de lesäo genital, raspado de lesäo anal, saliva e urina) de pacientes aidéticos, com suspeita de infecçäo herpética, para diagnóstico rápido de vírus do grupo Herpes, por microscopia eletrônica. Dessas amostras, 25%(32/129) foram positivas para vírus Herpes, com algumas apresentando aspectos atípicos, tais como: a) grande quantidade de partículas virais; b) detecçäo de mais de um nucleocapsídeo num mesmo envoltório; e c) detecçäo de grandes agregados de nucleocapsídeos sem envoltórios. Estas observaçöes poderiam ser atribuídas às características de imunodepressäo desses pacientes e a sua divulgaçäo foi por nós considerada importante, pois seriam dados adicionais para o estudo de infecçöes virais, nesses pacientes imunodeprimidos

Preliminar characterization of a new virus isolated from the spinal fluid of patients with meningitis in Säo Paulo, Brazil

De dezembro de 1982 a março de 1983 um total de 138 pacientes com idade de 4 meses a 57 anos foram atendidos em diferentes hosptais de Säo Paulo com sintomas de meningite asséptica. Um agente transmissível foi isolado de 35 das 53 amostras de líquor. A replicaçäo desse novo vírus ou de um grupo de vírus relacioandos antigenicamente com características semelhantes foi detectada através do efeito citopático produzido em cultura de células de MDCK. O agente isolado demonstrou ter um diâmtro em torno de 40 nm quando examinado ao microscópio eletrônico através da coloraçäo negativa. Nenhuma atividade hemaglutinante foi detectada em pH 7,2 com hemácias humanas de cobaias ou de galinha e em pH 6,0 - 7,2 com hemácias de ganso. Esse agente näo se mostrou patogênico ao camundongo recém-nascido e adulto, era sensível ao clorofórmio e näo foi inibido pelo BuDR, o que indica conter o genoma RNA