Immunological and biossensory techniques for detection of Salmonella spp. in food derived from fish farming- review / Técnicas imunológicas e biossensoriais para detecção de Salmonella spp. em alimentos derivados da piscicultura ­ revisão de literatura / Técnicas inmunológicas y biosensoriales para detección de Salmonella spp. en alimentos derivados de piscicultura - revisión de literatura

Salmonellosis is the world's most common foodborne illness. In Brazil, foods contaminated by salmonella lead the statistics. Therefore, the aim of this study is, through biotechnological knowledge, to compile alternative and innovative techniques for the detection of salmonella in foods, such as fish-farming derivatives, immunological and biosensorial techniques. This is a descriptive exploratory data survey of a qualitative nature, aiming at data analysis. Research and data collection were carried out in bibliographic databases: Academic Google, Scielo, CAPES journals and institutional repositories using specific descriptors - in Portuguese and English, with words and terms separated by the Boolean operators 'AND' and 'OR'. Some innovative and alternative methods are available to identify the presence of salmonella in food. Immunological and biosensory techniques, despite being less frequent in the scientific literature than molecular methods, are techniques that present high specificity and sensitivity. These techniques have been the most developed alternative methods in fish in recent years. And, they can employ both molecular and immunological techniques in biorecognition, which is characterized as an advantage of not having a requirement for pre-enrichment of the sample. According to the literature found, the techniques covered in this study are quick to respond, which speeds up decision-making by researchers and technicians, which makes the techniques very promising for industrial application.(AU)

A salmonelose é uma enfermidade de maior ocorrência no mundo veiculada por alimentos. No Brasil, alimentos contaminados por salmonelas lideram as estatísticas. Por isso, o objetivo desse estudo é através dos conhecimentos biotecnológicos compilar técnicas alternativas e inovadoras para a detecção de salmonelas em alimentos, como os derivados da piscicultura, as técnicas imunológicas e biossensoriais. Trata-se de um estudo de levantamento de dados descritivo exploratório de de caráter qualitativo, visando à análise dos dados. As pesquisas e coletas de dados foram realizadas nas bases bibliográficas: Google Acadêmico, Scielo, periódicos da CAPES e repositórios institucionais utilizando os descritores específicos - nos idiomas português e inglês, com palavras e termos separados pelos operadores booleanos 'AND' e 'OR'. São disponibilizados alguns métodos inovadores e alternativos para identificação da presença de salmonelas em alimentos. As técnicas imunológicas e biossensoriais, apesar de serem menos frequentes na literatura científica do que os métodos moleculares são técnicas que apresentaram elevada especificidade e sensibilidade. Essas técnicas têm sido os métodos alternativos mais desenvolvidos em peixes nos últimos anos. E, podem empregar tanto técnicas moleculares como imunológicas no biorreconhecimento, o que se caracteriza como vantagem de não haver requerimento de pré-enriquecimento da amostra. Conforme a literatura encontrada, as técnicas abordadas por esse estudo apresentam rapidez de resposta o que agiliza as tomadas de decisões dos pesquisadores e técnicos, o que torna as técnicas bastante promissora para aplicação industrial.(AU)

La salmonelosis es la enfermedad transmitida por alimentos más común del mundo. En Brasil, los alimentos contaminados por salmonelas lideran las estadísticas. Por tanto, el objetivo de ese estudio fue a través de conocimientos biotecnológicos recopilar técnicas alternativas e innovadoras para la detección de salmonelas en los alimentos, como los derivados de la piscicultura, las técnicas inmunológicas y biosensoriales. Se trata de una encuesta de datos exploratorio descriptivo de carácter cualitativo, cuyo objetivo es el análisis de datos. Las investigaciones y recopilaciones de datos se realizaron en bases de datos bibliográficas: Google Académico, Scielo, revistas CAPES y repositorios institucionales utilizando descriptores específicos, en portugués e inglés, con palabras y términos separados por los operadores booleanos 'AND' y 'OR'. Se encuentran disponibles algunos métodos innovadores y alternativos para identificar la presencia de salmonela en los alimentos. Las técnicas inmunológicas y biosensoriales, a pesar de ser menos frecuentes en la literatura científica que los métodos moleculares, son técnicas de alta especificidad y sensibilidad. Esas técnicas han sido los métodos alternativos más desarrollados en peces en los últimos años. Y pueden emplear técnicas tanto moleculares como inmunológicas en el biorreconocimiento, que se caracteriza por la ventaja de no tener un requisito de preenriquecimiento de la muestra. Según la literatura encontrada, las técnicas abordadas en este estudio son de rápida respuesta, lo que agiliza la toma de decisiones por parte de investigadores y técnicos, lo que hace que las técnicas sean muy prometedoras para la aplicación industrial.(AU)

Detection of Campylobacter spp. in chilled and frozen broiler carcasses comparing immunoassay, PCR and real time PCR methods / Detecção de Campylobacter spp. em carcaças de frango de corte resfriadas e congeladas pelos métodos imunoenzimático, PCR e PCR em tempo real

ABSTRACT: In order to detect and identify Campylobacter spp. in broiler chicken carcasses, and to compare detection methods, 43 chilled and 43 frozen carcasses were collected and analyzed. Three methodologies were evaluated: an automated Enzyme Linked Fluorescent Assay (ELFA) VIDAS®30, Polymerase Chain Reaction (PCR) and real-time PCR. Only four chilled carcasses (4.6%) were considered positive for Campylobacter spp. by VIDAS®30 and no sample was positive when the conventional PCR technique was used. However, real-time PCR showed a higher incidence of contamination by Campylobacter spp. in broiler carcasses, with 45 (52.3%) positive samples. C. jejuni was the species most frequently reported in the samples (88.8%). No differences in the frequencies of Campylobacter spp. were observed between the chilled and frozen broiler carcasses. In conclusion, real-time PCR was the most sensitive method for the detection of Campylobacter spp. in chilled or frozen broiler carcasses, which were mainly contaminated by C. jejuni.

RESUMO: Com o objetivo de detectar e identificar Campylobacter spp. em carcaças de frango de corte utilizando três metodologias distintas - ensaio imunoenzimático VIDAS®30, Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e PCR em tempo real - foram coletadas e analisadas 43 carcaças de frango resfriadas e 43 congeladas. Quatro carcaças refrigeradas (4,6%) foram consideradas positivas para Campylobacter spp. pelo VIDAS®30 e nenhuma amostra positiva foi identificada quando utilizada a técnica de PCR. Porém, ao analisar as carcaças pela metodologia da PCR em tempo real, foi observada uma maior incidência de Campylobacter spp., com 45 amostras (52,3%) positivas, sendo que Campylobacter jejuni foi a espécie mais frequentemente encontrada nas amostras (88,8%). Não foi observada diferença na frequência do micro-organismo entre carcaças de frangos resfriadas e congeladas. Concluiu-se que a técnica de PCR em tempo real apresentou maior sensibilidade na detecção de Campylobacter spp. em carcaças de frangos de corte e que foi encontrada elevada presença de carcaças contaminadas, especialmente por C. jejuni.

Incidência de Listeria monocytogenes em queijo minas frescal comercializado no município do Rio de Janeiro, RJ / Incidence of Listeria monocytogenes in cheese frescal commercialized in the city of Rio de Janeiro, RJ

A incidência de Listeria monocytogenes foi verificada em amostras de queijo Minas Frescal obtidas na cidade do Rio de Janeiro (RJ). Amostras de quatro marcas industriais diferentes foram coletadas em dois estabelecimentos comerciais. Dois métodos de detecção deste patógeno foram utilizados: o método “Bacterial Analytical Manual/Food and Drug Administration” – BAM/FDA e o método Canadense “Health Products and Food Branch” – HPFB. L. monocytogenes foi detectada em 58,8% do total de amostras analisadas. O Método BAM/FDA, 2003 detectou a bactéria em 35,3% das amostras de queijo, enquanto que o método HPFB detectou a presença desse micro-organismo em 41,2% das amostras. L. monocytogenes foi detectada por ambos os métodos em 17,6% das amostras analisadas. Em todas as amostras de uma mesma marca industrial (marca A) a presença de Listeria monocytogenes foi observada por ambos os métodos. A ocorrência desta bactéria nas amostras de queijos analisadas sugere a ausência ou aplicação incorreta de Boas Práticas de Manipulação durante o seu processamento, além da manipulação inadequada do produto durante ou após o processamento.

Controle de qualidade analítica dos métodos utilizados para a detecção de protozoários patogênicos em amostras de água / Control of the analytic quality of the methods used for the detection of pathogenic protozoans in water samples

As espécies de protozoários patogênicos de veiculação hídrica Giardia spp. e Cryptosporidium spp. foram responsáveis por cerca 90% dos surtos de gastroenterite ocorridos nos últimos 25 anos, em vários países. Critérios de avaliação das etapas referentes à detecção destes agentes em amostras de água, tais como: precisão inicial, inoculação nas amostras em água bruta e, diagnóstico e localização de erros estão abordados neste trabalho. Estes critérios devem ser correntemente aplicados e constantemente avaliados pelos laboratórios, a fim de assegurar a confiabilidade dos resultados obtidos durante um monitoramento e, assim, fornecer subsídios para uma avaliação do risco de surtos.

The waterborne pathogenic protozoan species Giardia spp. and Cryptosporidium spp. have been responsible for the majority (90%) of the gastroenteritis outbreaks that have occurred in the last 25 years in various countries. This paper discusses evaluation criteria pertaining to the steps involved in the detection of these microorganisms in water samples, such as: initial precision, inoculation in environmental samples, diagnosis and error localization. These criteria should be often applied and evaluated by laboratories in order to assure the reliability of the results obtained in a program of monitoring, thus aiding in the evaluation of the risks of outbreaks.

Principles and applications of polymerase chain reaction in medical diagnostic fields: a review: [revision] / Princípios e aplicações da reação em cadeia de Polimerase em áreas médicas diagnósticas: uma revisão: [revisão]

Recent developments in molecular methods have revolutionized the detection and characterization of microorganisms in a broad range of medical diagnostic fields, including virology, mycology, parasitology, microbiology and dentistry. Among these methods, Polymerase Chain Reaction (PCR) has generated great benefits and allowed scientific advancements. PCR is an excellent technique for the rapid detection of pathogens, including those difficult to culture. Along with conventional PCR techniques, Real-Time PCR has emerged as a technological innovation and is playing an ever-increasing role in clinical diagnostics and research laboratories. Due to its capacity to generate both qualitative and quantitative results, Real-Time PCR is considered a fast and accurate platform. The aim of the present literature review is to explore the clinical usefulness and potential of both conventional PCR and Real-Time PCR assays in diverse medical fields, addressing its main uses and advances.

O advento dos métodos moleculares tem, nos últimos anos, revolucionado a detecção e caracterização dos microorganismos em diversas áreas médicas diagnósticas, tais como virologia, micologia, parasitologia, microbiologia e odontologia. Dentre as técnicas baseadas em biologia molecular, a PCR (Polymerase Chain Reaction) trouxe enormes benefícios e desenvolvimentos científicos, se mostrando como um excelente caminho para a rápida detecção de patógenos, até mesmo aqueles de difícil cultivo. Derivada da PCR convencional, a PCR em Tempo Real se mostra como uma inovação tecnológica e vem conquistando espaço nos diagnósticos clínicos e nos laboratórios de pesquisa por apresentar a capacidade de gerar, além de resultados qualitativos, resultados quantitativos, se mostrando de forma mais rápida e precisa. Este trabalho de revisão tem por objetivo explorar a utilidade clínica da técnica de PCR convencional e em Tempo real nas diversas áreas médicas supracitadas, abrangendo seus principais usos e avanços, direcionando para o cotidiano profissional.