Identificación de enterobacterias productoras de carbapenemasas en el Hospital Universitario Católico de Cuenca / Identification of carbapenemase producing enterobacteriaceae at the Catholic University Hospital of Cuenca / Identificação de enterobacteriaceae produtoras de carbapenemase no Hospital Universitário Católico de Cuenca

Las enterobacterias productoras de carbapenemasas desarrollan infecciones resistentes a los medicamentos en neumonía, infección del tracto urinario e infecciones relacionadas con dispositivos. Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli y Enterobacter cloacae son amenazas de resistencia emergentes importantes a nivel mundial, lo que representa alta mortalidad y limitadas opciones de tratamiento. Objetivo: detectar la presencia de EPC de clase A, mediante la aplicación del test fenotípico de sinergia con ácido borónico en cepas de enterobacterias aisladas de superficies inertes en el Hospital Universitario Católico de Cuenca, Ecuador. Materiales y Métodos: estudio cuali-cuantitativo de tipo experimento puro de corte transversal y alcance exploratorio - descriptivo. Las enterobacterias se identificaron mediante test bioquímicos del sistema estandarizado API 20 E. Para la detección fenotípica de carbapenamasas de clase A se utilizó el método de sinergia de discos con ácido borónico y discos imipenem, meropenem y ertapenem. Resultados: se identificaron 25 géneros de enterobacterias, el 24 % fue Pseudomonas aeruginosam, el 20 % de enterobacterias fue productoras de carpapenemasas clase Am mientras que el 32 % fue resistente para los tres carbapenémicos en estudio, el 68 % mostró sensibilidad para imipenem, el 56 % para meropenem y 44 % para ertapenem. El 48 % de enterobacterias fueron resistentes a ertapenem, el 44 % a meropenem y 32 % a imipenem. Conclusiones: Enterobacterias como P. aureginosa, E. cloacae, Cronobacter spp. y E. coli presentan mecanismos de resistencia asociados a carbapenemasas clase A tipo KPC por lo que se recomienda vigilancia continua y estrategias de manejo para abordar la resistencia a carbapenémicos en entornos hospitalarios

Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae develop drug-resistant infections in pneumonia, urinary tract infection, and device-related infections. Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, and Enterobacter cloacae are important emerging resistance threats globally, representing high mortality and limited treatment options. Objective: detect the presence of class A EPC, by applying the phenotypic synergy test with boronic acid in strains of enterobacteria isolated from inert surfaces at the Catholic University Hospital of Cuenca, Ecuador. Materials and Methods: Qualitative-quantitative study of pure cross-sectional experiment type and exploratorydescriptive scope. Enterobacteriaceae were identified using biochemical tests of the standardized API 20 E system. For the phenotypic detection of class A carbapenamases, the synergy method of disks with boronic acid and imipenem, meropenem and ertapenem disks was used. Results: 25 genera of enterobacteria were identified, 24 % were Pseudomonas aeruginosam, 20 % of enterobacteria were producers of class Am carbapenemases while 32 % were resistant to the three carbapenems under study, 68 % showed sensitivity to imipenem, 56 % for meropenem and 44 % for ertapenem. 48 % of enterobacteria were resistant to ertapenem, 44 % to meropenem and 32 % to imipenem. Conclusions: Enterobacteriaceae such as P. aureginosa, E. cloacae, Cronobacter spp. and E. coli present resistance mechanisms associated with class A carbapenemases type KPC, so continuous surveillance and management strategies are recommended to address resistance to carbapenems in hospital environments

Enterobacteriaceae produtoras de carbapenemases desenvolvem infecções resistentes a medicamentos em pneumonia, infecção do trato urinário e infecções relacionadas a dispositivos. Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli e Enterobacter cloacae são importantes ameaças emergentes de resistência em todo o mundo, representando alta mortalidade e opções de tratamento limitadas. Objetivo: detectar a presença de CPE classe A, aplicando o teste de sinergia fenotípica com ácido borônico em cepas de enterobactérias isoladas de superfícies inertes no Hospital Universitário Católico de Cuenca, Equador. Materiais e Métodos: estudo cualitativo quantitativo, do tipo experimento transversal puro e escopo exploratório-descritivo. As enterobactérias foram identificadas por meio de testes bioquímicos do sistema padronizado API 20 E. Para a detecção fenotípica das carbapenamases classe A foi utilizado o método de sinergia de discos com ácido borônico e discos de imipenem, meropenem e ertapenem. Resultados: foram identificados 25 gêneros de enterobactérias, 24 % eram Pseudomonas aeruginosam, 20 % das enterobactérias eram produtoras de carbapenemases da classe Am enquanto 32 % eram resistentes aos três carbapenêmicos em estudo, 68 % apresentaram sensibilidade ao imipenem, 56 % ao meropenem e 44. % para ertapenem. 48 % das enterobactérias eram resistentes ao ertapenem, 44 % ao meropenem e 32 % ao imipenem. Conclusões: Enterobacteriaceae como P. aureginosa, E. cloacae, Cronobacter spp. e. coli apresentam mecanismos de resistência associados às carbapenemases classe A tipo KPC, portanto estratégias contínuas de vigilância e manejo são recomendadas para abordar a resistência aos carbapenêmicos em ambientes hospitalares.

Resistencia antimicrobiana de Enterobacterias causante de infección del tracto urinario en pacientes ambulatorios / Antimicrobial resistance of Enterobacteriaceae causing urinary tract infection in ambulatory patients / Resistência antimicrobiana de Enterobacteriaceae causadora de infecção do trato urinário em pacientes ambulatoriais

Las infecciones del tracto urinario son consideradas un problema de salud a nivel hospitalario y comunitario por el aumento de bacterias resistentes a los antibióticos. Objetivo: Analizar el patrón de susceptibilidad y resistencia antimicrobiana de Enterobacterias causante de infección del tracto urinario. Métodos: Se aplicó una investigación descriptiva de diseño documental. La población fue de 672 registros de urocultivos positivos, recopilados de la base de datos del Laboratorio San Pablo en el periodo 2021-2022. Para su tabulación y análisis los datos obtenidos fueron procesados en el Software SPSS versión 25.0. Resultados: Las ITU se presentan con mayor frecuencia en el género femenino 86,5%. El grupo etario con más afección es la edad adulta 50,4%. El agente etiológico con mayor incidencia fue Escherichia coli 75,74%, Citrobacter Freundii 8,93%, Klebsiella spp 6,10%. La producción de BLEE como mecanismo de resistencia predominaron en las cepas de E.coli y Klebsiella spp. Se encontró un mayor porcentaje de resistencia para Ampicilina y SXT. Los antibióticos con mejor sensibilidad destacaron nitrofurantoína, fosfomicina. Conclusión: La especie con mayor aislamiento, implicada en la etiología de infecciones urinarias sigue siendo E.coli con una sensibilidad alta para nitrofurantoína y fosfomicina.

Urinary tract infections are considered a health problem at hospital and community level due to the increase of antibiotic resistant bacteria. Objective: To analyze the pattern of susceptibility and antimicrobial resistance of Enterobacteriaceae causing urinary tract infection. Methods: A descriptive research of documentary design was applied. The population was 672 records of positive urine cultures, collected from the San Pablo Laboratory database in the period 2021-2022. For tabulation and analysis, the data obtained were processed in SPSS software version 25.0. Results: UTIs occur more frequently in females 86.5%. The age group with the highest incidence was adulthood 50.4%. The etiological agent with the highest incidence was Escherichia coli 75.74%, Citrobacter Freundii 8.93%, Klebsiella spp 6.10%. The production of BLEE as a mechanism of resistance predominated in the strains of E.coli and Klebsiella spp. A higher percentage of resistance was found for Ampicillin and SXT. The antibiotics with the best sensitivity were nitrofurantoin and fosfomycin. Conclusion: The species with the highest isolation, implicated in the etiology of urinary tract infections, continues to be E.coli with a high sensitivity to nitrofurantoin and fosfomycin.

As infecções do trato urinário são consideradas um problema de saúde a nível hospitalar e comunitário devido ao aumento de bactérias resistentes aos antibióticos. Objetivo: Analisar o padrão de suscetibilidade e resistência antimicrobiana das Enterobacteriaceae causadoras de infecções do trato urinário. Métodos: Foi aplicada uma metodologia de investigação documental descritiva. A população foi de 672 registros de culturas de urina positivas, coletados do banco de dados do Laboratório San Pablo no período de 2021-2022. Para tabulação e análise, os dados obtidos foram processados no software SPSS versão 25.0 Resultados: As ITUs ocorreram com maior frequência no sexo feminino 86,5%. A faixa etária com maior incidência foi a adulta 50,4%. O agente etiológico com maior incidência foi a Escherichia coli 75,74%, Citrobacter Freundii 8,93%, Klebsiella spp 6,10%. A produção de BLEE como mecanismo de resistência predominou em E. coli e Klebsiella spp. Foi encontrada uma maior percentagem de resistência para a ampicilina e o SXT. Os antibióticos com melhor sensibilidade foram a nitrofurantoína e a fosfomicina. Conclusão: A espécie com maior isolamento, implicada na etiologia das infecções do trato urinário, continua a ser a E. coli com uma elevada sensibilidade à nitrofurantoína e à fosfomicina.

Estudo microbiológico da ostra invasora Saccostrea cucullata: variação sazonal de coliformes totais e termotolerantes no Complexo Estuarino de Cananéia durante a temporada de 2018-2019 / Microbiological study of the invasive oyster Saccostrea cucullata: seasonal variation of total and thermotolerant coliforms in the Cananéia Estuarine Complex during the 2018-2019 season

No complexo estuarino lagunar de Cananéia, estado de São Paulo, região sudeste, há o consumo in natura da ostra invasora Saccostrea cucullata, principalmente no verão, alta temporada. Trata-se de um molusco filtrador que apresenta riscos de graves patologias do sistema gastrointestinal devido ao risco de armazenamento de agentes microbiológicos que afetam o ser humano. A falta de monitoramento, boas práticas de fabricação, qualidade da água e medidas de controle para garantir a segurança e qualidade do consumo de ostras é necessária para a prevenção de patógenos na saúde pública. Este estudo realizou análises microbiológicas de amostras de ostras, com foco em bactérias mesófilas, bactérias psicrotróficas e fungos/leveduras. Além disso, investigou-se as concentrações sazonais de coliformes totais e termotolerantes em amostras de ostras coletadas ao longo de um ano. As contagens de bactérias mesófilas nas ostras variaram de 1,45±0,22 a 3,32±0,28 log UFC g­1, com valores médios de 2,24±0,86 log UFC g­1. Para bactérias psicrotróficas nas amostras de ostras variou entre 1,34±0,29 e 3,12±0,45 log UFC g­1. Os dados revelaram que as contagens de fungos e leveduras variaram de 2,65±0,23 a 3,57±0,22 log UFC g­1. A contagem máxima de S. aureus foi de 1,24 log UFC g­1, e 83,5% das amostras apresentaram resultado negativo para este microrganismo. Não foi detectada presença de Salmonella spp. nas amostras analisadas. Esses resultados fornecem insights importantes sobre a variação sazonal e as contagens microbiológicas em amostras de ostras, destacando a relevância da monitorização e controle microbiológico em produtos alimentícios marinhos.

In the estuarine lagoon complex of Cananéia, state of São Paulo, southeast region, there is fresh consumption of the invasive oyster Saccostrea cucullata, mainly in summer, high season. It is a filter-feeding mollusk that presents a risk of serious pathologies of the gastrointestinal system due to the risk of storing microbiological agents that affect humans. The lack of monitoring, good manufacturing practices, water quality and control measures to ensure the safety and quality of oyster consumption is necessary for the prevention of pathogens in public health. This study carried out microbiological analyzes of oyster samples, focusing on mesophilic bacteria, psychrotrophic bacteria and fungi/yeasts. Furthermore, seasonal concentrations of total and thermotolerant coliforms were investigated in oyster samples collected over a year. Counts of mesophilic bacteria in oysters ranged from 1.45±0.22 to 3.32±0.28 log CFU g­1, with average values of 2.24±0.86 log CFU g­1. For psychrotrophic bacteria in oyster samples it ranged between 1.34±0.29 and 3.12±0.45 log CFU g­1. The data revealed that fungal and yeast counts ranged from 2.65±0.23 to 3.57±0.22 log CFU g­1. The maximum S. aureus count was 1.24 log CFU g­1, and 83.5% of the samples tested negative for this microorganism. No presence of Salmonella spp. was detected in the analyzed data. These results provide important insights into seasonal variation and microbiological counts in oyster samples, highlighting the relevance of microbiological monitoring and control in marine food products.

Evolución de la resistencia a los antibióticos de los microorganismos aislados de pie diabético infectado

Objetivos: evaluar la evolución de la resistencia a los antibióticos de los microorganismos aislados de pie diabético infectado en pacientes atendidos en el Hospital Clínico Viedma, en las gestiones 2014, 2016, 2018 y 2021. Métodos: investigación observacional, descriptiva, retrospectiva, transversal con enfoque cuantitativo, 268 cultivos y antibiogramas de pacientes con diagnóstico de infección de pie diabético fue la muestra analizada con un 2,82 % de error máximo admitido. Resultados: se identificaron 312 microorganismos, con 71,5 % las bacterias Gram negativas fueron las más frecuentes, de estas la Klebsiella spp con 17,9 % y Escherichia coli con 17,6 % predominaron, cuya resistencia a la ciprofloxacina, sulfatrimetoprim y gentamicina aumentó, los bacilos Gram negativos no fermentadores más aislados fueron las Pseudomonas spp y el Acinetobacter spp cuya resistencia a las cefalosporinas, ciprofloxacina y carbapenémicos incrementó. Por otro lado, con 16,3 % el Staphylococcus aureus fue la bacteria Gram positiva más identificada, la resistencia a la meticilina de 17 % en 2014 aumentó a 25 % en 2021. Conclusiones: las enterobacterias fueron los microorganismos aislados con más frecuencia, cuya resistencia se asoció a la producción de betalactamasas de espectro extendido (BLEE).

Objectives: to evaluate the evolution of antibiotic resistance of microorganisms isolated from infected diabetic foot in patients treated at the Viedma Clinical Hospital, in the 2014, 2016, 2018 and 2021 administrations Methods: observational, descriptive, retrospective, cross-sectional research with a quantitative approach, 268 cultures and antibiograms of patients with a diagnosis of diabetic foot infection were the sample analyzec with a 2,82 % maximum admitted error. Results: 312 microorganisms were identified, with 71,5% Gram- negative bacteria were the most frequent, of these Klebsiella spp with 17,9 % and Escherichia coli with 17,6% predominated, whose resistance to ciprofloxacin, sulfa trimethoprim and gentamicin increased, the most isolated non-fermenting Gram negative bacilli were Pseudomonas spp and Acinetobacter spp whose resistance to cephalosporins, ciprofloxacin and carbapenems increased. On the other hand, with 16,3 % Staphylococcus aureus was the most identified Gram-positive bacteria, methicillin resistance from 17 % in 2014 increased to 25 % in 2021. Conclusions: enterobacteriaceae were the most frequently isolated microorganisms, whose resistance was associated with the production of extended spectrum beta-lactamases (ESBL).

Infectious etiology and indicators of malabsorption or intestinal injury in childhood diarrhea / Etiología infecciosa e indicadores de malabsorción o daño intestinal en diarrea infantil

Abstract Introduction. The multifactorial etiology of gastroenteritis emphasizes the need for different laboratory methods to identify or exclude infectious agents and evaluate the severity of diarrheal disease. Objective. To diagnose the infectious etiology in diarrheic children and to evaluate some fecal markers associated with intestinal integrity. Materials and methods. The study group comprised 45 children with diarrheal disease, tested for enteropathogens and malabsorption markers, and 76 children whose feces were used for fat evaluation by the traditional and acid steatocrit tests. Results. We observed acute diarrhea in 80% of the children and persistent diarrhea in 20%. Of the diarrheic individuals analyzed, 40% were positive for enteropathogens, with rotavirus (13.3%) and Giardia duodenalis (11.1%) the most frequently diagnosed. Among the infected patients, occult blood was more evident in those carrying pathogenic bacteria (40%) and enteroviruses (40%), while steatorrhea was observed in infections by the protozoa G. duodenalis (35.7%). Children with diarrhea excreted significantly more lipids in feces than non-diarrheic children, as determined by the traditional (p<0.0003) and acid steatocrit (p<0.0001) methods. Moreover, the acid steatocrit method detected 16.7% more fecal fat than the traditional method. Conclusions. Childhood diarrhea can lead to increasingly severe nutrient deficiencies. Steatorrhea is the hallmark of malabsorption, and a stool test, such as the acid steatocrit, can be routinely used as a laboratory tool for the semi-quantitative evaluation of fat malabsorption in diarrheic children.

Resumen Introducción. La etiología multifactorial de la gastroenteritis enfatiza la necesidad de usar diferentes métodos de laboratorio para identificar o excluir agentes infecciosos y evaluar la gravedad de la enfermedad diarreica. Objetivo. Diagnosticar la etiología infecciosa de la diarrea en niños y evaluar algunos marcadores fecales asociados con la integridad intestinal. Materiales y métodos. Se estudiaron 45 niños con enfermedad diarreica, en los cuales se evaluaron la presencia de enteropatógenos y los marcadores de malabsorción. Se analizaron las muestras fecales de 76 niños, mediante las pruebas de esteatocrito tradicional y esteatocrito ácido, para la cuantificación de la grasa. Resultados. Se observó diarrea aguda en el 80 % de los niños y diarrea persistente en el 20 %. De los individuos con diarrea, el 40 % fue positivo para enteropatógenos; los más diagnosticados fueron rotavirus (13,3 %) y Giardia duodenalis (11,1 %). Entre los pacientes infectados, la sangre oculta fue más evidente en aquellos portadores de bacterias patógenas (40 %) o enterovirus (40%), mientras que la esteatorrea se observó en infecciones por el protozoo G. duodenalis (35,7 %). Los niños con diarrea excretaron significativamente más lípidos en las heces que aquellos sin diarrea, según lo determinado por los métodos de esteatocrito tradicional (p<0,0003) y esteatocrito ácido (p<0,0001). Conclusiones. La diarrea infantil puede provocar deficiencias graves de nutrientes. La esteatorrea es distintiva de la malabsorción intestinal y puede detectarse mediante la estimación del esteatocrito ácido. Esta prueba podría utilizarse de forma rutinaria como una herramienta de laboratorio para la evaluación semicuantitativa de la malabsorción de grasas en niños con diarrea.

Prevalence of extended-spectrum ß-lactamase-producing Escherichia coll and Klebsiella pneumoniae isolates in outpatients with urinary tract infection in a Cuban municipality / Prevalência de aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de ß-lactamasas de espectro extendido en pacientes ambulatorios de un municipio de Cuba con infección del tracto urinario

Abstract Introduction: Community- acquired urinary tract infections (CA-UTI) caused by extended-spectrum ß-lactamases (ESBL) -producing Enterobacteriaceae are a growing phenomenon worldwide. Objective: To determine the prevalence of ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates obtained from urine samples of outpatients with CA-UTI in a Cuban municipality, as well as the antibiotic resistance profiles associated with the ESBL phenotype. Materials and methods: Retrospective descriptive study. A total of 304 isolates of E. coli and 34 of K. pneumoniae obtained from urine cultures of patients with CA-UTI treated between January 1, 2019, and December 31, 2020, at the Hospital Clínico-Quirúrgico Docente Aleida Fernández Chardiet, in the municipality of Güines, Mayabeque province, Cuba, were analyzed. A bivariate analysis (chi-square test) was performed to determine differences in antibiotic resistance rates between ESBL-producing and non-producing bacteria. Results: 16.77% (51/304) and 17.64% (6/34) of E. coli and K. pneumoniae isolates were classified as ESBL-producing bacteria. In the case of ESBL-producing E. coli isolates, ESBL+ciprofloxacin was the most frequent antibiotic resistance pattern (22/51; 43.13%), followed by ESBL+ciprofloxacin and amikacin (14/51; 27.45%). Moreover, 41.17% (21/51) were multidrug-resistant. In the case of ESBL-producing K. pneumoniae, ESBL+ciprofloxacin, amikacin and nitrofurantoin was the predominant antimicrobial resistance pattern (2/6; 33.33%), and 50 % (3/6) were multidrug resistant. Conclusions: The results reported confirm the presence of ESLB-producing E. coli and K. pneumoniae, with a high prevalence of multidrug resistance in patients with CA-UTI in the municipality of Güines, Cuba.

Resumen Introducción. Las infecciones del tracto urinario (ITU) adquiridas en la comunidad y causadas por enterobacterias productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) son un fenómeno creciente a nivel mundial. Objetivo. Determinar en un municipio de Cuba la prevalencia de aislamientos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae productoras de BLEE obtenidos de muestras de orina de pacientes ambulatorios con ITU adquirida en la comunidad, así como los perfiles de resistencia a antibióticos asociados al fenotipo BLEE. Materiales y métodos. Estudio descriptivo retrospectivo. Se analizaron 304 aislamientos de E. coli y 34 de K. pneumoniae obtenidos de urocultivos de pacientes con ITU adquirida en la comunidad atendidos entre enero 1 de 2019 y diciembre 31 de 2020 en el Hospital Clínico-Quirúrgico Docente Aleida Fernández Chardiet del municipio de Güines, provincia Mayabeque, Cuba. Se realizó un análisis bivariado (prueba chi-cuadra-do) para determinar diferencias en las tasas de resistencia antibiótica entre las bacterias productoras de BLEE y las no productoras. Resultados. El 16.77% (51/304) y el 17.64 % (6/34) de los aislamientos de E. coli y K. pneumoniae se clasificaron como bacterias productoras de BLEE, respectivamente. En el caso de los aislados de E. coli productoras de BLEE, BLEE+ciprofloxacina fue el patrón de resistencia más frecuente (22/51; 43.13%), seguido por BLEE+-ciprofloxacino y amikacina (14/51; 27.45%). Además, 41.17% (21/51) fueron multirresistentes. En el caso de K. pneumoniae productoras de BLEE, predominó el patrón de resistencia BLEE+ciprofloxacino, amikacina y nitrofurantoina (2/6; 33.33%), y 50% (3/6) fueron multirresistentes. Conclusiones. Los resultados confirman la presencia de E. coli y K. pneumoniae productoras de BLEE, con una alta prevalencia de multirresistencia en pacientes con ITU adquirida en la comunidad en el municipio de Güines.

Bacterial diversity and detection of resistance genes to broad-spectrum betalactams in dairy family farm soils / Diversidade bacteriana e detecção de genes de resistência a betalactâmicos de amplo espectro em solos de propriedade familiar leiteira

Bovine mastitis is a complex disease that brings great losses to the dairy producer. The microbial diversity of the soils, as well as the presence of resistance genes in the environment directly influence the maintenance of mastitis in the farm. The objective of this work was to analyze the bacterial diversity in pasture soils of a dairy family farm, detecting enterobacteria that may be involved in the etiology of bovine mastitis, and to detect genes that encode broad-spectrum betalactamases in these soils. Twelve soil samples, representative of different areas of the farm located in the municipality of Barra do Piraí, Rio de Janeiro, were collected at different times of the year. Total DNA was extracted from the samples, gene amplified by Nested-PCR and then the amplification products were separated by DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). With the DGGE it was possible to construct dendograms that effectively represented the bacterial diversity of these soils. Eight of the soil samples were used to amplify the genes encoding the betalactamase enzymes TEM (blaTEM gene), SHV (blaSHV gene) and CTX (blaCTXM gene). In three of the eight soil samples, the blaSHV gene was found to be present. The blaTEM and blaCTX-M genes were not detected in any of the samples. The detection of genes encoding broad-spectrum betalactamases in dairy cattle pasture soils is of concern, because the transfer of gene material between pathogenic and non-pathogenic bacteria in this environment is a reality

A mastite bovina é uma doença complexa que traz grandes prejuízos ao produtor de leite. A diversidade micro-biana dos solos, bem como a presença de genes de resistência no ambiente, influencia diretamente a manutenção da mastite na fazenda. O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade bacteriana em solos de pastagem de uma propriedade familiar leiteira, detectando enterobactérias que possam estar envolvidas na etiologia da mastite bovina, e detectar genes que codificam betalactamases de amplo espectro nesses solos. Doze amostras de solo, representativas de diferentes áreas da fazenda localizada no município de Barra do Piraí, Rio de Janeiro, foram coletadas em diferentes épocas do ano. O DNA total foi extraído das amostras, o gene foi amplificado por Nested-PCR e, em seguida, os produtos de amplificação foram separados por DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis). Com a DGGE, foi possível construir dendogramas que representavam efetivamente a diversidade bacteriana desses solos. Oito das amostras de solo foram usadas para amplificar os genes que codificam as enzimas betalactamase TEM (gene blaTEM), SHV (gene blaSHV) e CTX (gene blaCTXM). Em três das oito amostras de solo, foi constatada a presença do gene blaSHV. Os genes blaTEM e blaCTX-M não foram detectados em nenhuma das amostras. A detecção de genes que codificam betalactamases de amplo espectro em solos de pastagens de gado leiteiro é preocupante, pois a transferência de material genético entre bactérias patogênicas e não patogênicas nesse ambiente é uma realidade

Impact of infections and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae on graft and patient survival in a kidney transplantation program in Mexico.

INTRODUCTION: Immunosuppressive treatments have improved graft and patient survival rates, but can increase the incidence of post-transplant infections. OBJECTIVES: To analyze data from kidney transplant patients and describe the pathogens responsible for the infections they experience. METHODS: Longitudinal, analytical, observational study of 103 patients who underwent kidney transplantation. The follow-up period was 5.07 ± 1.28 years. RESULTS: Overall mortality rate was 10.68% and graft loss rate was 14.56%. Regarding recipient risk of death, the Cox regression model showed a hazard ratio (HR) of 5.66 for positive bacterial cultures and 2.22 for positive extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strains; as for graft loss, HR was 4.59 in those with positive bacterial cultures and 4.25 in those who were positive for ESBL-producing strains. CONCLUSIONS: Significant death risk was found in kidney transplant recipients with positive bacterial cultures and an increased risk of graft loss in those with positive bacterial cultures and in those who were positive for ESBL-producing Enterobacteriaceae isolates. The rate of ESBL-producing Enterobacteriaceae is high, and stricter strategies are therefore necessary to control the use of antibiotics.

INTRODUCCIÓN: Los tratamientos inmunosupresores han mejorado las tasas de supervivencia del injerto y del paciente, pero pueden incrementar las infecciones postrasplante. OBJETIVOS: Analizar los datos de pacientes con trasplante renal y describir las bacterias responsables de las infecciones que presentan. MÉTODOS: Estudio observacional, longitudinal y analítico de 103 pacientes sometidos a trasplante renal. El periodo de seguimiento fue de 5.07 ± 1.28 años. RESULTADOS: La tasa de mortalidad fue de 10.68 % y la de pérdida del injerto de 14.56 %. Respecto al riesgo de muerte del receptor, el modelo de regresión de Cox mostró un cociente de riesgo (HR, hazard ratio) de 5.66 en los pacientes con cultivo bacteriano positivo y de 2.22 en aquellos con cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE); en cuanto a la pérdida del injerto, el HR fue de 4.59 en quienes tuvieron cultivo bacteriano positivo y de 4.25 en aquellos con cepas productoras de BLEE. CONCLUSIONES: Se encontró riesgo significativo de muerte en receptores de trasplante renal con cultivo bacteriano positivo y mayor riesgo de pérdida del injerto en aquellos con cultivo bacteriano positivo y aislamiento de cepas productoras de BLEE. La tasa de enterobacterias productoras de BLEE es alta, por ello son necesarias estrategias más estrictas para controlar del uso de antibióticos.

Impacto de infecciones y enterobacterias productoras de betalactamasa de espectro extendido en la supervivencia del injerto y del paciente en un programa de trasplante renal en México / Impact of infections and extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae on graft and patient survival in a kidney transplantation program in Mexico

Resumen Introducción: Los tratamientos inmunosupresores han mejorado las tasas de supervivencia del injerto y del paciente, pero pueden incrementar las infecciones postrasplante. Objetivos: Analizar los datos de pacientes con trasplante renal y describir las bacterias responsables de las infecciones que presentan. Métodos: Estudio observacional, longitudinal y analítico de 103 pacientes sometidos a trasplante renal. El periodo de seguimiento fue de 5.07 ± 1.28 años. Resultados: La tasa de mortalidad fue de 10.68 % y la de pérdida del injerto de 14.56 %. Respecto al riesgo de muerte del receptor, el modelo de regresión de Cox mostró un cociente de riesgo (HR, hazard ratio) de 5.66 en los pacientes con cultivo bacteriano positivo y de 2.22 en aquellos con cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE); en cuanto a la pérdida del injerto, el HR fue de 4.59 en quienes tuvieron cultivo bacteriano positivo y de 4.25 en aquellos con cepas productoras de BLEE. Conclusiones: Se encontró riesgo significativo de muerte en receptores de trasplante renal con cultivo bacteriano positivo y mayor riesgo de pérdida del injerto en aquellos con cultivo bacteriano positivo y aislamiento de cepas productoras de BLEE. La tasa de enterobacterias productoras de BLEE es alta, por ello son necesarias estrategias más estrictas para controlar del uso de antibióticos.

Abstract Introduction: Immunosuppressive treatments have improved graft and patient survival rates, but can increase the incidence of post-transplant infections. Objectives: To analyze data from kidney transplant patients and describe the pathogens responsible for the infections they experience. Methods: Longitudinal, analytical, observational study of 103 patients who underwent kidney transplantation. The follow-up period was 5.07 ± 1.28 years. Results: Overall mortality rate was 10.68% and graft loss rate was 14.56%. Regarding recipient risk of death, the Cox regression model showed a hazard ratio (HR) of 5.66 for positive bacterial cultures and 2.22 for positive extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing strains; as for graft loss, HR was 4.59 in those with positive bacterial cultures and 4.25 in those who were positive for ESBL-producing strains Conclusions: Significant death risk was found in kidney transplant recipients with positive bacterial cultures and an increased risk of graft loss in those with positive bacterial cultures and in those who were positive for ESBL-producing Enterobacteriaceae isolates. The rate of ESBL-producing Enterobacteriaceae is high, and stricter strategies are therefore necessary to control the use of antibiotics.

Antibacterial potential of essential oils against planktonic and sessile cells of Escherichia coli isolated from diarrhea cases in swine / Potencial antibacteriano de aceites esenciales contra células de Escherichia coli planctónicas y sésiles aisladas de diarrea porcina

Escherichia coli is a pathogen associated with infections in piglets in the post-weaning phase, its pathogenicity is related to the animal's susceptibility to bacterial enterotoxins. The objective of the present study was to determine the EOs activity against E. colistrain, in the form planktonic and sessile. Although the Disc-Diffusion tests to determine the Minimum Inhibitory Concentration, do not fully corroborate with the other analyzes of this study, it was noticed bacteria inhibition. The EOs were prepared at 0.4%, 0.8% and 1.0% for tests. The tested EOs were effective against E. coliplanktonic cells (p<0.05). As for the sessile cells, the most significant result was inhibition and 100% sessile cells at the concentration of 1.0% of Cymbopogon citratusEO. Although there was resistance in some treatments, the tested EOs demonstrated inhibition capacity, constituting promising alternatives for the control of E. coli, especially of planktonic cells.

Escherichia coli es un patógeno asociado con infecciones en lechones en la fase posterior al destete, su patogenicidad está relacionada con la susceptibilidad del animal a las enterotoxinas bacterianas. El objetivo del presente estudio fue determinar la actividad de contra E. coli, en la forma planctónico y sésil. Aunque las pruebas de difusión de disco para determinar la concentración inhibitoria mínima, no corroboran completamente con los otros análisis de este estudio, se observó inhibición de la bacteria. Las soluciones basadas en AE se prepararon al 0.4%, 0.8% y 1.0% para pruebas. Los AEs probados fueron efectivos contra las células planctónicas (p<0.05). En cuanto a las células sésiles, el resultado más significativo fue la inhibición y el 100% de las células sésiles a la concentración de 1,0% de Cymbopogon citratus. Aunque hubo resistencia en algunos tratamientos, los AEs probados demostraron capacidad de inhibición, constituyendo alternativas prometedoras para el control de E. coli, especialmente de células planctónicas.

Use of MALDI-TOF for identification and surveillance of gramnegative bacteria in captive wild psittacines / Uso do MALDI-TOF para identificação e monitoramento de bactérias Gram negativas em psitacídeos cativos

Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.(AU)

Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.(AU)

Classification of dairy properties according to the geometric mean of the somatic cell count and its antimicrobial resistance profile / Classificação de propriedades leiteiras de acordo com a média geométrica da contagem de células somáticas e seu perfil de resistência aos antimicrobianos

Milk and its derivatives are highly consumed foods worldwide, with recognized nutritional importance. The search for the production of products with superior quality is constant. For the present work, 26 milk-producing properties were selected, with a total of 506 milk samples collected during the period from October 2019 to May 2020 being evaluated. The objective of this study was to evaluate the quality of milk produced in dairy properties in the region west Paraná, classified as good or bad based on the results of the Somatic Cell Count (SCC) and through sampling (n = 10) to evaluate the resistance profile of enterobacteria and Staphylococcus spp. isolated from milk samples, in addition to the presence of the mecA gene in strains of Staphylococcus spp. resistant to oxacillin. There were significant differences between the good and bad properties for the levels of lactose, SCC (cell/mL), and Standard Plate Count (SPC) (CFU/mL). The strains of Staphylococcus spp. showed differences in the percentage of resistance in relation to the good and bad properties for antibiotics: tetracycline, ciprofloxacin, oxacillin, amikacin, clindamycin, gentamycin, and erythromycin. The mecA gene was not detected in any of the coagulase-negative Staphylococcus isolates that showed resistance to oxacillin. For enterobacteria, the isolated species differed in relation to the classification of properties, with predominance for Escherichia coli (40%) for properties classified as bad and Hafnia alvei (40%) for those classified as good. The percentage of antibiotic resistance compared to enterobacteria isolates was higher in properties classified as good. Monitoring through microbial culture and antibiogram is extremely important, favoring the correct choice for the treatment of animals with a reduced selection of resistant strains.(AU)

O leite e seus derivados são alimentos altamente consumidos em todo mundo, com importância nutricional reconhecida. A busca pela produção de produtos com qualidade superior é constante. Para o presente trabalho foram selecionadas 26 propriedades produtoras de leite, sendo avaliado um total de 506 amostras de leite colhidas durante o período de outubro de 2019 a maio de 2020. O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade do leite produzido em propriedades leiteiras da região oeste do Paraná, classificadas como boas ou ruins com base nos resultados da Contagem de Células Somáticas (CCS) e por meio de amostragem (n=10) avaliar o perfil de resistência das enterobactérias e Staphylococcus spp. isolados das amostras de leite, além da presença do gene mecA em cepas de Staphylococcus spp. resistentes à oxacilina. Houve diferenças significativas entre as propriedades boas e ruins para os teores de lactose, CCS (cél./mL) e Contagem Padrão em Placas (CPP) (UFC/mL). As cepas de Staphylococcus spp. apresentaram diferenças no percentual de resistência em relação às propriedades boas e ruins para os antibióticos: tetraciclina, ciprofloxacina, oxacilina, amicacina, clindamicina, gentamicina e eritromicina. Não foi detectada a presença do gene mecA em nenhum dos isolados de Staphylococcus coagulase negativa que apresentaram perfil de resistência à oxacilina. Para as enterobactérias as espécies isoladas diferiram em relação à classificação das propriedades, com predomínio para Escherichia coli (40%) para as propriedades classificadas como ruins e Hafnia alvei (40%) para as classificadas como boas. O percentual de resistência aos antibióticos frente aos isolados de enterobactérias foi maior nas propriedades classificadas como boas. É extremamente importante o monitoramento por meio de cultura microbiana e antibiograma, favorecendo a correta escolha para o tratamento dos animais com redução da seleção de cepas resistentes.(AU)

Detection of Salmonella spp. in eggs for human consumption from poultry farms in municipalities of Alagoas State, Brazil / Detecção de Salmonella spp. em ovos destinados ao consumo humano de propriedades familiares avícolas em municípios do Estado de Alagoas, Brasiil

Salmonellosis is a disease that worries poultry farmers and can seriously impact the food safety of the population that consumes products of animal origin. The present study sought to detect the presence of Salmonella spp. in eggs intended for consumption from family poultry farms in municipalities of Alagoas State. The study was carried out from eight farms, where the sample from each farm was obtained by making pools of shell and internal contents of six randomly selected eggs. The pools were submitted to microbiological culture and the colonies were characterized and evaluated by means of laboratory tests. To this end, 50% (4/8) of the shell samples and 75% (6/8) of the internal contents of the eggs were positive for Salmonella spp. In addition, Klebsiella pneumoniae 12.5% (1/8) and Proteus spp. 25% (2/8) were found in the shell samples, and Yersinia spp. 12.5% (1/8) in the internal contents of the eggs. Salmonella spp. and other enterobacteria were confirmed to occur in eggs intended for consumption. The way the birds were raised did not seem to have a significant influence on the results obtained, and the presence of passerines on the farms may have contributed to the existence of bacteria there. Being aware of the risk to public health that some of these bacteria can present, it is necessary to take decisions that support the small producer in search of food safety for all.(AU)

A Salmonelose é uma doença que preocupa os criadores de aves e pode impactar seriamente a segurança alimentar da população que consome produtos de origem animal. O presente estudo buscou detectar a presença de Salmonella spp. em ovos destinados ao consumo provindos de aviculturas familiares de municípios do Estado de Alagoas. O estudo foi realizado a partir de oito granjas, onde a amostra de cada uma delas foi obtida pela confecção de pools de casca e de conteúdo interno de seis ovos selecionados aleatoriamente. Os pools foram submetidos a cultivo microbiológico e as colônias caracterizadas e avaliadas por meio de testes laboratoriais. Para tanto, 50% (4/8) das amostras de casca e 75% (6/8) das amostras de conteúdo interno dos ovos foram positivos para Salmonella spp. Além disso, também fora constatada a presença de Klebsiella pneumoniae12.5% (1/8) e Proteus spp. 25% (2/8) nas amostras de casca, e a presença de Yersinia spp. 12.5% (1/8) no conteúdo interno dos ovos. Foi confirmada a ocorrência de Salmonella spp. e outras enterobactérias em ovos destinados ao consumo. O modo de criação das aves não parece ter influenciado significativamente nos resultados obtidos e a presença de passeriformes nas granjas podem ter contribuído com a existência das bactérias no local. Tendo ciência do risco à saúde pública que algumas dessas bactérias podem apresentar, se faz necessária a tomada de decisões que apoiem o pequeno produtor em busca de uma segurança alimentar para todos.(AU)

Contamination and antimicrobial resistance profile of Escherichia coli in chicken carcasses from public markets in Maranhão / Contaminação e perfil de resistência antimicrobiana de Escherichia coliem carcaças de frango de mercados públicos maranhenses

Contamination of chicken meat sold in public markets is a public health concern. The objective of this study was to identify contamination and evaluate the antimicrobial resistance profile of Escherichia coli in chicken carcasses from public markets in the North Mesoregion of Maranhão. A total of 160 freshly slaughtered chicken carcasses were collected in 16 markets in six municipalities in the microregions of Itapecuru-Mirim and São Luís. The samples were analyzed for the presence of E. coli using counting thermotolerant coliforms and classified according to the ANVISA microbiological standard. Of all the samples, 134 (83.75%) were considered unacceptable for consumption, according to Brazilian health legislation. Bacteria were isolated from the positive samples, and 50 isolates were tested for susceptibility to 15 antimicrobial principles using the disc diffusion method. The results confirm the presence of E. coli, with counts ranging from 101 to 108 NMP/g. The isolates showed resistance to neomycin (49/50, 98%), streptomycin (48/50, 96%), sulfonamides (47/50, 94%), nitrofurantoin (45/50, 90%), cefazolin (43/50, 86%), and tetracycline (43/50, 86%). No antibiotic was effective against the isolates, which were resistant to more than 3 antimicrobial classes considered resistant to multiple drugs (MDR). Therefore, chicken meat sold in public markets in Maranhão presents unsatisfactory conditions for consumption and risk of transmission of E. coli with an MDR profile.(AU)

A contaminação da carne de frango comercializada em mercados públicos é uma preocupação de saúde pública. Nesse sentido, objetivou-se avaliar a contaminação e perfil de resistência antimicrobianas de Escherichia colidas carcaças de frango de mercados públicos da Mesorregião Norte do Maranhão. Foram coletadas 160 amostras de carcaças de frango recém--abatidas e comercializadas em 16 mercados de seis municípios das microrregiões de Itapecuru-mirim e São Luís. As amostras foram analisadas quanto à presença de E.coli por meio da contagem de coliformes termotolerantes e classificadas segundo o padrão microbiológico da ANVISA. A bactéria foi isolada de amostras positivas. Testou-se 50 isolados quanto à suscetibili-dade a 15 princípios antimicrobianos, seguindo o método de Difusão em Disco.Os resultados confirmam a presença de E.coli com contagens de 101 a 108 NMP/g. De todas as amostras 134 (83,75%) foram consideradas inaceitáveis para consumo, con-forme legislação brasileira sanitária. Os isolados mostraram alto índice de resistência atimicrobiana aos princípios neomicina (49/98%), streptomicina (48/96%), sulfanomidas (47/94%), nitrofurantoína (45/90%), cefazolina (43/86%) e tetraciclina (43/86%). Nenhum antibiótico foi eficaz contra os isolados, sendo resistente a mais de 3 classes antimicrobianas considerados resistente a múltipla a drogas (MDR). A carne de frango comercializada nos mercados públicos maranhenses apresenta con-dições insatisfatórias para consumo e risco de transmissão de E. coli com perfil MDR.(AU)

Physicochemical, microbiological and parasitological analysis of water for human consumption in a quilombola community in Alagoas / Análise físico-química, microbiológica e parasitológica da água para consumo humano em comunidade quilombola em Alagoas

Water is the indispensable natural resource for all living beings. For human consumption, it must be potable, so as not to pose a risk to health, and can be used for ingestion, food preparation and personal hygiene. Knowing this importance, this study aimed to carry out physical-chemical, microbiological and parasitological analyzes of water for human consumption in a quilombola community of Santa Luzia do Norte in Alagoas. A cross-sectional, experimental and quantitative study was carried out between January and December 2019. The physical-chemical parameters of residual chlorine, turbidity, fluoride, fluoridation, color and pH were analyzed, microbiological analyses were based on the research of total and thermotolerant coliforms (E. coli) and parasitological analyses were performed based on the research of protozoa and intestinal helminths. Some physical-chemical parameters (turbidity and pH) were observed outside the limits required by the Ministry of Health, and the presence of total coliforms in some of the analyzed samples (17.85%), characterizing this community at risk related to waterborne diseases. The samples analyzed did not present infecting forms of parasitic species. Regarding the variables evaluated, the results found showed that the lack of adequate basic sanitation affects the quality of water used for human consumption by the quilombola population of Santa Luzia do Norte-AL.(AU)

A água é o recurso natural indispensável a todos os seres vivos. Para consumo humano, deve ser potável, de modo a não oferecer risco à saúde, podendo ser usada para ingestão, preparação de alimentos e higiene pessoal. Sabendo dessa importância, este estudo teve como objetivo realizar análises físico-químicas, microbiológicas e parasitológicas da água para consumo humano em uma comunidade quilombola de Alagoas. Foi realizado um estudo transversal, do tipo experimental e quantitativo, realizado na comunidade quilombola de Santa Luzia do Norte-AL, entre janeiro a dezembro de 2019. Foram analisados os parâmetros físico-químico de cloro residual, turbidez, fluoreto, fluoretação, cor e pH, as análises microbiológicas foram baseadas na pesquisa de coliformes totais e termotolerantes (E. coli) e as análise parasitológicas foram realizadas com base na pesquisa de protozoários e helmintos intestinais. E a pesquisa de protozoários oportunistas pelo método de Ziehl-Neelsen modificado. Foi observado alguns parâmetros físico-químicos (turbidez e pH) fora dos limites exigidos pelo Ministério da Saúde, e a presença de coliformes totais em algumas das amostras analisadas (17,85%), caracterizando esta comunidade em situação de risco relacionado às doenças de veiculação hídrica. As amostras analisadas não apresentaram formas infectantes das espécies parasitárias. Em relação às variáveis avaliadas, os resultados encontrados demonstraram que a falta de saneamento básico adequado afeta a qualidade da água utilizada para consumo humano pela população quilombola de Santa Luzia do Norte-AL.(AU)

Caracterización clínica-microbiológica y factores de riesgo de las bacteriemias por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido en el hospital universitario / Clinical-microbiological characterization and risk factors of bacteremia caused by extended-spectrum beta-lactamase-producing enterobacteria at the university hospital

INTRODUCCIÓN: Las infecciones del torrente sanguíneo se asocian con alta morbi- mortalidad, siendo frecuentemente causadas por enterobacterias, y cuando éstas producen ß-lactamasas de espectro extendido (BLEEs), la morbi-mortalidad, duración internación y costos sanitarios son aún mayores. OBJETIVO: Caracterizar los episodios de bacteriemia por enterobacterias en el Hospital Universitario en un período de 2 años. METODOLOGÍA: Estudio observacional, analítico, casos controles (1:1), con recolección de datos retrospectiva. Población: pacientes ≥18 años atendidos en el Hospital Universitario en período 01/01/2014 - 30/11/2015, con hemocultivo positivo por enterobacteria. Recolección datos clínicos-epidemiológicos: revisión registros médicos. Estudio microbiológico: Identificación y susceptibilidad - equipo automatizado Vitek® 2 system (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France). Sensibilidad a fosfomicina: disco-difusión (E. coli) y dilución en agar (resto de las enterobacterias). Ceftazidime-avibactam: disco-difusión. Aislamientos BLEE+ según Vitek: confirmación y caracterización de BLEE: reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación. Investigación mecanismos transferibles de resistencia a quinolonas (TMQR) qnrB y aac(6')-Ib-cr: PCR. Caracterización molecular enterobacterias BLEE más prevalentes: MultiLocus Sequence Typing (MLST) y Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Análisis casos y controles: I)Factores de riesgo bacteriemia BLEE: Casos - pacientes con bacteriemia por enterobacteria BLEE(+). Controles - pacientes con bacteriemia por enterobacteria BLEE (-) sensible a cefalosporinas tercera generación. II) Factores de riesgo mortalidad intrahospitalaria: Casos - pacientes con mortalidad hospitalaria por cualquier causa. Controles ­ pacientes egresados vivos. Análisis estadístico: paquete estadístico IBM SPSS Statistics 23. Análisis casos y controles: cálculo de odd ratios (OR) e intervalo de confianza al 95% (IC95%). Variables con p ≤0.05 en análisis univariado incluídas en análisis multivariado (regresión logística). Proyecto aprobado por Comité Ética del Hospital de Clínicas y financiado por ANII (FMV_3_2016_1_126580, Fondo María Viña ­ 2016). RESULTADOS: Principales resultados microbiológicos: 174 episodios de bacteriemia y 178 enterobacterias recuperadas, con confirmación molecular de producción BLEE en 41 enterobacterias (23%): 29 Klebsiella pneumoniae, 7 Escherichia coli, 2 Serratia marcescens, 1 Enterobacter cloacae, 1 Citrobacter freundii y 1 Morganella morganii. E. coli enterobacteria más recuperada (n=69), pero K. pneumoniae la enterobacteria BLEE más prevalente (56 aislamientos y 29/56 BLEE+), seguida de E. coli (7/69). Distribución de las enterobacterias BLEE+ según enzima detectada: CTX- M-15: 32 aislamientos, CTX-M-15 + CTX- M-14: 3 aislamientos, CTX-M-2: 3, CTX-M-8: 2, SHV-5: 1. Susceptibilidad enterobacterias BLEE: meropenem 100%, ceftazidime-avibactam 100%, fosfomicina 100%, imipenem 98%, ertapenem 97,6%, colistin 92,7%, amikacina 85,4%, gentamicina 36,6%, tigeciclina 29,3%, piperacilina-tazobactam 26,8%, trimetoprim-sulfametoxazol 19,5%, ciprofloxacina 12,2%. Detección de mecansimos transferibles de resistencia a quinolonas (TMQR) en 33/41 aislamientos (80,5%): aac(6')-Ib-cr: 22 aislamientos, qnrB: 2 aislamientos, y aac(6')-Ib-cr + qnrB: 9 aislamientos. Detección de secuenciotipos "exitosos" en principales enterobacterias BLEE: E. coli ST 73 (1), ST 95(1) y ST 38 (2) y ST 258 en K. pneumoniae (12/29=41,4%). También detección ST 258 en un aislamiento de K. pneumoniae BLEE (-). Principales resultados clínicos ­ epidemiológicos: Se revisaron 98 registros médicos; 60 bacteriemias nosocomiales, 29 comunitarias, 8 asociadas a los cuidados de la salud, 1 sin dato. 41 BLEE(+) y 57 BLEE(-). 80 pacientes vivos al egreso, 17 fallecidos y 1 sin dato. Factores de riesgo bacteriemia BLEE(+) (análisis multivariado) : presencia de dispositivo médico a permanencia previo (p 0,001, OR 55,2, IC 95%5,5-553) ) y bacteriemia no comunitaria (p 0,008 OR 17,4 IC95% 2,1-143). Factores de riesgo mortalidad intrahospitalaria (análisis multivariado): enfermedad hematooncológica o neoplásica (OR 4,687 IC95% 1,207-18,200) y score qPitt ≥2 (OR 10,332 IC95% 2,639-40,442). Antibioticoterapia empírica activa in vitro para la bacteriemia: 10/29(34,5%) en pacientes BLEE(+) y 36/40 BLEE(-) (90%). Se encontró asociación entre bacteriemia BLEE + y recibir antibioticoterapia empírica inactiva (p<0,0001) ; siendo el riesgo de recibir antibioticoterapia empírica inactiva 17 veces mayor en bacteriemias BLEE(+) respecto a BLEE(-). Se encontró que la mediana de la duración de la hospitalización a partir del episodio de bacteriemia es más prolongada en casos BLEE+ que en los controles BLEE- (22,5 versus 14 días, p=0,006). CONCLUSIONES: Enterobacteria BLEE más prevalente K. pneumoniae, y dentro de ella alta prevalencia del clon exitoso de alto riesgo ST 258. Predominio de CTX-M-15, y alta prevalencia (> 80%) de TMQR en aislamientos BLEE. Presencia de BLEE aumenta significativamente el riesgo de recibir antibioticoterapia empírica inactiva. Necesidad de mantener vigilancia de perfiles de susceptibilidad y clones circulantes y considerar posibles factores de riesgo al momento se seleccionar antibioticoterapia empírica.

BACKGROUND: Bloodstream infections are associated with high morbidity and mortality, being frequently caused by Enterobacteriaceae, and when they produce extended spectrum ß-lactamases (ESBL), morbidity, mortality and healthcare costs are even higher. OBJECTIVE: We aimed to characterize Enterobacteriaceae bacteremia episodes at the "Hospital de Clínicas", in a 2 years period. METHODS: Observational, analytical study, case-controls (1: 1), with retrospective data collection. Population: ≥18 years old patients attended at the "Hospital de Clínicas" between 01/01/2014 and 11/30/2015, with Enterobacteriaceae recovered from blood culture. Collection of clinical-epidemiological data: review of medical records. Microbiological study: identification and susceptibility: automated system Vitek® 2 (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France). Susceptibility to fosfomycin: disc-diffusion (E. coli) and agar dilution (others Enterobacterales). Ceftazidime-avibactam: disc-diffusion. ESBL (+) isolates according to Vitek: ESBL confirmation and characterization by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequencing. Investigation of transferable mechanisms of quinolone resistance (TMQR) qnrB and aac (6 ')- Ib-cr: PCR. Molecular characterization of the most prevalent ESBL enterobacterales: MultiLocus Sequence Typing (MLST) and Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Case-control analysis: I) ESBL bacteremia risk factors: Cases - patients with bacteremia by an ESBL-producing enterobacteria. Controls - patients with third generation cephalosporin susceptible enterobacteria, not ESBL-producing. II) In-hospital mortality risk factors: Cases - patients with in-hospital mortality from any cause. Controls - patients discharged alive. Statistical analysis: IBM SPSS Statistics 23 statistical package. Case-control analysis: calculation of odd ratios (OR) and 95% confidence interval (95% CI). Variables with p ≤0.05 in univariate analysis were included in multivariate analysis (logistic regression). Project approved by the Hospital de Clinicas Ethics Committee and financed by ANII (FMV_3_2016_1_126580, María Viña Fund - 2016). RESULTS: Main microbiological results: 174 bacteremia episodes and 178 enterobacterales recovered. ESBL production confirmated in 41 isolates (23%): 29 Klebsiella pneumoniae, 7 Escherichia coli, 2 Serratia marcescens, 1 Enterobacter cloacae, 1 Citrobacter freundii y 1 Morganella morganii.E. coli was the most recovered enterobacteria (n = 69), but K. pneumoniae was the most prevalent ESBL producing specie (56 isolates and 29/56 ESBL +), followed by E. coli (7/69). Distribution of ESBL producing enterobacterales according to enzyme detected: CTX- M-15: 32 isolates, CTX-M-15 + CTX-M-14: 3 isoaltes, CTX-M-2: 3, CTX-M-8: 2, SHV-5: 1. Antibiotic susceptibility in ESBL producers: meropenem 100%, ceftazidime-avibactam 100%, fosfomycin 100%, imipenem 98%, ertapenem 97,6%, colistin 92,7%, amikacin 85,4%, gentamicin 36,6%, tigecycline 29,3%, piperacillin-tazobactam 26,8%, trimethroprim sulfamethoxazole 19,5%, ciprofloxacin 12,2%. Detection of TMQR in 33/41 isolates (80.5%): aac(6')-Ib-cr: 22 isolates, qnrB: 2 isolates, and aac(6')Ib-cr + qnrb: 9 isolates. We detected "successful" sequence types within E. coli ESBL producing: ST 73 (1 isolate), ST 95 (1) and ST 38 (2) and a high prevalence of ST 258 among K. pneumoniae isolates (12/29 = 41.4%). ST 258 was also detected in one ESBL(-) K. pneumoniae isolate. Main clinical-epidemiological results: 98 medical records were reviewed; 60 bacteremia episodes were classified as nosomial, 29 as community acquired, 8 health care associated, and for one episode, data was insufficient for its classification. 41 were ESBL(+) and 57 ESBL(-). 80 patients alive at discharge, 17 deceased and 1 without data. Risk factors for ESBL bacteremia according to multivariate analysis were: use of medical device prior to hospitalization (OR = 50.226, 95% CI 4.367 - 577.721) and non-community bacteremia (OR 12.052, 95% CI 1.350-107.605). In-hospital mortality risk factors (multivariate analysis): hemato-oncological or neoplasic disease (OR 4,687 95% CI 1,207-18,200) and qPitt score ≥2 (OR 10,332 95% CI 2,639-40,442). The empirical antibiotic therapy was active according to the susceptibility test in 10/29 (34,5%) patients with ESBL (+) bacteremia and in 36/40 patients with ESBL (-) (90%). Presence of ESBL was found to be associated with inactive empirical antibiotic therapy (p<0.0001), and risk for receiving inactive empirical antibiotic therapy was 17 times higher in ESBL (+) compared to ESBL (-). The mean length of hospital stay after the onset of bacteraemia was longer in the cases of ESBL producers than in the cases of non-ESBL producers ( 22,5 vs. 14 days; P=0.006). CONCLUSIONS: K. pneumoniae was the most prevalent ESBL producing specie, and within it we found a high prevalence of the successful high-risk clone ST258. CTX-M-15 was the main ESBL detected and we found high prevalence (80%) of TMQR among ESBL(+). Presence of ESBL significantly increases the risk of receiving inactive empirical antibiotic therapy. Need to maintain surveillance of susceptibility profiles and circulating clones and to take into account possible risk factors when selecting empirical antibiotic therapy.

Use of MALDI-TOF for identification and surveillance of gramnegative bacteria in captive wild psittacines / Uso do MALDI-TOF para identificação e monitoramento de bactérias Gram negativas em psitacídeos cativos

Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.

Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.

Use of MALDI-TOF for identification and surveillance of gram-negative bacteria in captive wild psittacines

Abstract Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.

Resumo Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.

Use of MALDI-TOF for identification and surveillance of gram-negative bacteria in captive wild psittacines / Uso do MALDI-TOF para identificação e monitoramento de bactérias Gram-negativas em psitacídeos cativos

Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.

Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.

Prevalencia de infección del tracto urinario y perfil de susceptibilidad antimicrobiana en Enterobacterias

Resumen Las Infecciones del Tracto Urinario (ITU), constituyen uno de los principales motivos de consulta en el ámbito de atención primaria, debido al aumento de la resistencia antibacteriana. Objetivo . Caracterizar la prevalencia de infección del tracto urinario y el perfil de susceptibilidad antimicrobiana in vitro en Enterobacterias en los pacientes de la provincia de Santa Elena - Ecuador. Método . Esta investigación fue descriptiva de diseño documental. La población fue de 827 registros de urocultivos, recopilados de la base de datos del laboratorio de microbiología del Centro de Especialidades IESS La Libertad, en el período comprendido desde agosto 2019 hasta marzo de 2020. Los datos fueron procesados mediante estadística descriptiva, análisis de frecuencia y chi cuadrado. Resultados . De este estudio indican que la prevalencia de ITU fue 22,1%; los principales agentes etiológicos fueron: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) y Proteus mirabilis (3,9%). La ITU y la infección por E. coli fueron estadísticamente mayores en mujeres y adultos mayores. La mayor frecuencia de resistencia de E. coli fue para ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) y sulfametoxazol trimetoprima (61,5%); en Klebsiella oxytoca fue ampicilina (80,0%), sulfametoxazol trimetoprima (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) y ciprofloxacina (40,0%). Mientras que en Klebsiella pneumoniae se halló una resistencia del (100%) para ampicilina y cefalotina, amoxicilina y ácido clavulánico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusiones. La E. coli continúa siendo el microorganismo más frecuente en ITU. El tratamiento empírico de ITU debería incluir amikacina, nitrofurantoina y piperacilina tazobactam.

Abstract Urinary Tract Infections (UTI) are one of the main reasons for consultation in the primary care setting, due to the increase in antibacterial resistance. Objective . To characterize the prevalence of urinary tract infection and the in vitro antimicrobial susceptibility profile of Enterobacteriaceae in patients in the province of Santa Elena - Ecuador. Method. This was a descriptive research of documentary design. The population was 827 urine culture records, collected from the database of the microbiology laboratory of the Centro de Especialidades IESS La Libertad, in the period from August 2019 to March 2020. The data were processed using descriptive statistics, frequency analysis and chi-square. Results . From this study indicate that the prevalence of UTI was 22.1%; the main etiological agents were: E. coli (76.0%), Klebsiella oxytoca (6.5%), Klebsiella pneumoniae (5.8%) and Proteus mirabilis (3.9%). UTI and E. coli infection were statistically higher in women and older adults. The highest frequency of E. coli resistance was for nalidixic acid (81.2%), ampicillin (79.9%), ciprofloxacin (72.6%) and trimethoprim sulfamethoxazole (61.5%); in Klebsiella oxytoca it was ampicillin (80.0%), trimethoprim sulfamethoxazole (70.0%), nalidixic acid (60.0%) and ciprofloxacin (40.0%). While in Klebsiella pneumoniae, 100% resistance was found for ampicillin and cephalothin, amoxicillin and clavulanic acid (66.7%), ciprofloxacin (55.6%), nalidixic acid (44.4%), meropenem and imipenem (11.1%). Conclusions . E. coli continues to be the most frequent microorganism in UTI. Empirical treatment of UTI should include amikacin, nitrofurantoin and piperacillin tazobactam.

Resumo As infecções do trato urinário (IU) são um dos principais motivos de consulta no âmbito dos cuidados primários, devido ao aumento da resistência antibacteriana. Objetivo . Caracterizar a prevalência da infecção do trato urinário e o perfil de suscetibilidade antimicrobiana in vitro de Enterobacteriaceae em pacientes da província de Santa Elena - Equador. Método . Esta foi uma pesquisa descritiva do projeto documental. A população era de 827 registros de cultura de urina, coletados do banco de dados do laboratório de microbiologia do Centro de Especialidades IESS La Libertad, no período de agosto de 2019 a março de 2020. Os dados foram processados utilizando estatísticas descritivas, análise de freqüência e qui-quadrado. Resultados. Deste estudo indicam que a prevalência de UTI foi de 22,1%; os principais agentes etiológicos foram: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) e Proteus mirabilis (3,9%). A infecção por UTI e E. coli foi estatisticamente maior nas mulheres e nos adultos mais velhos. A maior freqüência de resistência do E. coli foi para o ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) e trimetoprim sulfametoxazol (61,5%); em Klebsiella oxytoca era ampicilina (80,0%), trimetoprim sulfametoxazol (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) e ciprofloxacina (40,0%). Enquanto em Klebsiella pneumoniae, foi encontrada 100% de resistência para ampicilina e cefalotina, amoxicilina e ácido clavulânico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusões . A E. coli continua sendo o microorganismo mais freqüente na UTI. O tratamento empírico da UTI deve incluir amikacina, nitrofurantoína e piperacilina tazobactam.