RESUMEN
El objetivo del estudio fue describir los niveles de resistencia transmitida de VIH-1 en adultos atendidos en Unidades de Atención Integral de Guatemala. El estudio incluyó registros de 185 pacientes adultos VIH-1 positivo, de reciente diagnóstico sin antecedente de uso de TAR, de noviembre del 2019 a noviembre del 2020. El análisis se realizó en el software DeepChek® v2.0, para la clasificación de la resistencia se siguió el algoritmo de Stanford HIVdb (v9.4 - 07/12/2022). Se encontró 18.4% (IC 95% 13.1 - 24.7%) de resistencia general a alguna familia de ARVs. Se evidenció 15.1% (IC 95% 10.3 - 21.1%) de resistencia individual a la familia de INNTR afectando principalmente a NVP y EFV; 2.2% (IC 95% 0.6 - 5.4%) de resistencia a INTR, mayormente a FTC/3TC; y 2.7% (IC 95% 0.9 - 6.2%) de resistencia intermedia y baja los IP NFV y LPV/r. Tres casos presentaron resistencia múltiple a los INTR + INNTR. Las mutaciones más frecuentemente encontradas fueron K103N (41.2%), M184V/I (8.8%) y M46I (5.9%). La elevada resistencia transmitida del VIH-1 en pacientes atendidos en distintas Unidades de Atención Integral del VIH, demuestra la importancia de analizar periódicamente la tendencia de la resistencia en personas que no han estado expuestas a ARVs, lo cual a su vez es un marcador indirecto de presencia de resistencia adquirida en el país, datos que evidencian la necesidad de acciones e intervenciones prontas y efectivas dado su impacto en la salud pública.
The objective of this study was to describe the levels of transmitted HIV-1 resistance in patients with a recent HIV diagnosis before starting ART, treated in Comprehensive Care Units in Guatemala during the years 2019 and 2020. The study included records of 185 HIV-positive adult patients, recently diagnosed with HIV without a history of ART use. The analysis was carried out in the DeepChek® v2.0 software, the Stanford HIVdb algorithm (v9.4 - 07/12/2022) was followed to classify resistance. 18.4% (95% CI 13.1 - 24.7%) of general resistance to some family of ARVs was found. There was evidence of 15.1% (95% CI 10.3 - 21.1%) of individual resistance to the NNRTI family, mainly affecting NVP and EFV; 2.2% (95% CI 0.6 - 5.4%) resistance to INTR, mostly to FTC/3TC; and 2.7% (95% CI 0.9 - 6.2%) of intermediate and low resistance IP NFV and LPV/r. Three cases presented multiple resistance to NRTIs + NNRTIs. The most frequently found mutations were K103N (41.2%), M184V/I (8.8%) and M46I (5.9%). The high transmitted resistance of HIV-1 in patients treated in different Comprehensive HIV Care Units demonstrates the importance of periodically analyzing the trend of resistance in people who have not been exposed to ARVs, which in turn is an indirect marker. of the presence of acquired resistance in the country, data that demonstrate the need for prompt and effective actions and interventions given its impact on public health.
O objetivo deste estudo foi descrever os níveis de resistência transmitida ao HIV-1 em adultos tratados em Unidades de Cuidados Integrais na Guatemala. O estudo incluiu prontuários de 185 pacientes adultos HIV-1 positivos, recentemente diagnosticados sem histórico de uso de TARV, no período de novembro de 2019 a novembro de 2020. A análise foi realizada no software DeepChek® v2.0, para classificação da resistência, O algoritmo Stanford HIVdb (v9.4 - 07/12/2022) foi seguido. Foi encontrada 18.4% (IC 95% 13.1 - 24.7%) de resistência geral a alguma família de ARVs. Houve evidência de 15.1% (IC 95% 10.3 - 21.1%) de resistência individual à família de NNRTI, afetando principalmente NVP e EFV; 2.2% (IC 95% 0.6 - 5.4%) resistência ao INTR, principalmente ao FTC/3TC; e 2.7% (IC 95% 0.9 - 6.2%) de resistência intermediária e baixa ao IP NFV e LPV/r. Três casos apresentaram resistência múltipla a NRTIs + NNRTIs. As mutações mais frequentemente encontradas foram K103N (41.2%), M184V/I (8.8%) e M46I (5.9%). A elevada resistência transmitida do HIV-1 em pacientes atendidos em diferentes Unidades de Cuidados Integrados ao HIV demonstra a importância de analisar periodicamente a tendência de resistência em pessoas que não foram expostas aos ARVs, o que por sua vez é um marcador indireto da presença de ARVs adquiridos. resistência no país, dados que demonstram a necessidade de ações e intervenções rápidas e eficazes dado o seu impacto na saúde pública.
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Adulto , Adulto Joven , Infecciones por VIH/tratamiento farmacológico , VIH-1/efectos de los fármacos , Farmacorresistencia Viral/efectos de los fármacos , Infecciones por VIH/genética , Vigilancia de la Población , Estudios Transversales , VIH-1/genética , Inhibidores de la Proteasa del VIH/uso terapéutico , Inhibidores de la Proteasa del VIH/farmacología , Inhibidores de la Transcriptasa Inversa/uso terapéutico , Inhibidores de la Transcriptasa Inversa/farmacología , Fármacos Anti-VIH/uso terapéutico , Fármacos Anti-VIH/farmacología , Farmacorresistencia Viral/genética , Guatemala/epidemiología , MutaciónRESUMEN
Introducción. La resistencia de Plasmodium falciparum a diferentes fármacos antipalúdicos es un obstáculo para eliminar la enfermedad. El genotipo resistente de P. falciparum a la artemisinina puede evaluarse examinando los polimorfismos en el dominio de la hélice del gen Pfk13. La Organización Mundial de la Salud recomienda utilizar estas mutaciones como marcadores moleculares para detectar la resistencia a la artemisinina en países donde la malaria por P. falciparum es endémica. Objetivo. Identificar mutaciones relacionadas con la resistencia a artemisinina presentes en el dominio de la hélice del gen k13 de P. falciparum. Materiales y métodos. Mediante la detección pasiva de casos, se recolectaron 51 muestras positivas por microscopía para Plasmodium, provenientes de seis comunidades del distrito de Río Santiago en Condorcanqui, Amazonas. Se realizó la confirmación molecular de la especie mediante PCR en tiempo real y el dominio de la hélice del gen Pfk13 se amplificó y secuenció por electroforesis capilar. Las secuencias obtenidas se compararon con la cepa de referencia 3D7 de fenotipo silvestre. Resultados. Se confirmó un total de 51 muestras positivas para P. falciparum, provenientes de las comunidades de Ayambis, Chapiza, Palometa, Muchinguis, Alianza Progreso y Caterpiza. Después del alineamiento de las secuencias de ADN, se determinó que las muestras no presentaron mutaciones asociadas con resistencia en el gen K13. Discusión. Los resultados obtenidos son coherentes con estudios similares realizados en otros países de Sudamérica, incluyendo Perú. Estos datos proporcionan una línea base para la vigilancia molecular de resistencia a artemisinina en la región Amazonas y refuerzan la eficacia de la terapia combinada con artemisinina en esta área.
Introduction. Resistance of Plasmodium falciparum to different antimalarial drugs is an obstacle to disease elimination. The artemisinin-resistant genotype of P. falciparum can be assessed by examining polymorphisms in the helix domain of the Pfk13 gene. The World Health Organization recommends these mutations as molecular markers to detect artemisinin-resistant in countries where P. falciparum malaria is endemic. Objective. To identify artemisinin resistance-related mutations present in the helix domain of the P. falciparum k13 gene. Materials and methods. We collected a total of 51 samples through passive case detection, positive for Plasmodium by microscopy, from six communities in the district of Río Santiago in Condorcanqui, Amazonas. Molecular species confirmation was performed by real-time PCR and Pfk13 helix domain was amplified and sequenced by capillary electrophoresis. The obtained sequences were compared with the wild type 3D7 reference strain. Results. A total of 51 positive samples were confirmed for P. falciparum from the communities of Ayambis, Chapiza, Palometa, Muchinguis, Alianza Progreso and Caterpiza. DNA sequences alignment showed the absence of resistance-associated mutations in the k13 gene of the collected samples. Discussion. The obtained results are consistent with similar studies conducted in other South American countries, including Perú, so these data provide a baseline for artemisinin- resistance molecular surveillance in the Amazon region and reinforce the efficacy of artemisinin-based combination therapy in this area.
Asunto(s)
Resistencia a Medicamentos , Malaria , Perú , Plasmodium falciparum , Ecosistema AmazónicoRESUMEN
Background and objectives: colonization by extended-spectrum ß-lactamase (ESBL)-producing Klebsiella pneumoniae in Intensive Care Unit (ICU) patients is considered a risk factor for infections, and poses as a source of spreading these strains in hospital facilities. This study aimed to perform the genetic characterization of ESBL-producing K. pneumoniae isolates recovered from surveillance swabs in an ICU in northeastern Brazil. Methods: the isolates were recovered between 2018-2019 from the nasal, axillary, and rectal sites of 24 patients admitted to the ICU. Bacterial identification was performed by traditional biochemical tests. Antimicrobial susceptibility was assessed by disk diffusion, and ESBL phenotype was detected by double-disc synergy test. Polymerase chain reaction (PCR) for blaCTX-M, blaSHV, and blaTEM genes, PFGE, and MLST were carried out in representative isolates. Results: a total of 27 isolates were recovered from 18 patients (75%). The ESBL production was detected in 85% of isolates. Resistance to ciprofloxacin, sulfamethoxazole/trimethoprim and most of the ß-lactams tested was recurrent, except for carbapenems. The blaSHV, blaTEM, and blaCTX-M genes were found in high frequency, and the CTX-M-(1, 2 and 9) groups were identified. Seven sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855, and ST3827) were described, most of them considered high-risk. Conclusion: these findings emphasize the potential threat of well-established high-risk clones in an ICU, and highlight the importance of monitoring these clones to prevent infections.(AU)
Justificativa e objetivos: a colonização por Klebsiella pneumoniae produtora de ß-lactamase de espectro estendido (ESBL) em pacientes de Unidade de Terapia Intensiva (UTI) é considerada um fator de risco para infecções, e representa uma fonte de disseminação dessas cepas em instalações hospitalares. Este estudo objetivou realizar a caracterização genética de isolados de K. pneumoniae produtores de ESBL recuperados de swabs de vigilância em uma UTI no Nordeste do Brasil. Métodos: os isolados foram recuperados entre 2018-2019 dos sítios nasal, axilar e retal de 24 pacientes internados na UTI. A identificação bacteriana foi realizada por testes bioquímicos tradicionais. A suscetibilidade antimicrobiana foi avaliada por disco-difusão, e o fenótipo ESBL foi detectado pelo teste de sinergia de duplo-disco. Polymerase chain reaction (PCR) para os genes blaCTX-M, blaSHV e blaTEM, PFGE e MLST foram realizados em isolados representativos. Resultados: foram recuperados 27 isolados de 18 pacientes (75%). A produção de ESBL foi detectada em 85% dos isolados. A resistência à ciprofloxacina, sulfametoxazol/trimetoprima e à maioria dos ß-lactâmicos testados foi recorrente, exceto para os carbapenêmicos. Os genes blaSHV, blaTEM e blaCTX-M foram encontrados em alta frequência, e os grupos CTX-M-(1, 2 e 9) foram identificados. Sete sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855 e ST3827) foram descritos, a maioria deles considerados de alto risco. Conclusão: esses achados enfatizam a ameaça potencial de clones de alto risco bem estabelecidos em uma UTI, e destacam a importância do monitoramento desses clones para prevenir infecções.(AU)
Justificación y objetivos: la colonización por Klebsiella pneumoniae productora de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) se considera un factor de riesgo para infecciones, y se presenta como una fuente de propagación de estas cepas en instalaciones hospitalarias. Este estudio tuvo como objetivo realizar la caracterización genética de aislamientos de K. pneumoniae productores de BLEE recuperados de hisopos de vigilancia en una UCI en el noreste de Brasil. Métodos: los aislamientos se recuperaron entre 2018-2019 de sitios nasales, axilares y rectales de 24 pacientes ingresados en la UCI. La identificación bacteriana se realizó mediante pruebas bioquímicas tradicionales. La susceptibilidad antimicrobiana se evaluó mediante difusión en disco, y el fenotipo BLEE se detectó mediante la prueba de sinergia de doble-disco. La polymerase chain reaction (PCR) para los genes blaCTX-M, blaSHV y blaTEM, PFGE y MLST se llevaron a cabo en aislamientos representativos. Resultados: se recuperaron 27 aislamientos de 18 pacientes (75%). La producción de ESBL se detectó en 85% de los aislamientos. La resistencia a ciprofloxacino, sulfametoxazol/trimetoprima y a la mayoría de los ß-lactámicos evaluados fue recurrente, excepto a los carbapenémicos. Los genes blaSHV, blaTEM y blaCTX-M se encontraron en alta frecuencia, y se identificaron los grupos CTX-M-(1, 2 y 9). Se describieron siete sequence types (ST11, ST14, ST17, ST395, ST709, ST855 y ST3827), la mayoría consideradas de alto riesgo. Conclusión: estos hallazgos enfatizan la amenaza potencial de los clones de alto riesgo bien establecidos en una UCI, y resaltan la importancia de monitorear estos clones para prevenir infecciones.(AU)
Asunto(s)
Humanos , beta-Lactamasas , Células Clonales , Unidades de Cuidados Intensivos , Klebsiella pneumoniae/genética , Resistencia a Medicamentos , Infección Hospitalaria/prevención & controlRESUMEN
Introducción. La resistencia antibiótica es una de las mayores amenazas para la salud global. Una de las estrategias para su control, es la vigilancia microbiológica. Objetivo. Describir la variación de la prevalencia de cepas multidrogoresistentes (MDR) de las bacterias más frecuentemente aisladas en muestras clínicas de pacientes atendidos en un hospital de tercer nivel de una ciudad de altura en el Perú, y determinar los factores asociados a su aislamiento. Además, evaluar la prevalencia de otros fenotipos de resistencia. Métodos. Se realizó un estudio observacional transversal a partir de una cohorte histórica de aislamientos entre los años 2012 y 2019. Resultados. La prevalencia general de cepas MDR fue 74,1%, observándose una tendencia a la disminución de la prevalencia anual de cepas de MDR en cinco de las nueve bacterias analizadas. Los factores asociados a cepas MDR se correspondían con los descritos previamente: sexo masculino, edad mayor a 75 años y hospitalización en servicios de cuidados intensivos. Además, se observó un incremento en la prevalencia de otros fenotipos de resistencia. Conclusión. Se encontró una alta prevalencia de cepas MDR en todas las bacterias evaluadas, asociadas a factores previamente descritos.
Introduction. Antibiotic resistance is one of the greatest threats to global health. One of the strategies for its control is microbiological surveillance. Objective. To describe the variation of the prevalence of multidrug resistant strains (MDR) of the most frequently isolated bacteria in clinical samples of patients treated at a tertiary care hospital in a high-altitude city in Perú and the factors associated with its isolation. Also, to assess the prevalence of other resistance phenotypes. Results. The general prevalence of MDR strains was 74,1%, observing a downward trend in the annual prevalence of MDR strains in five of the nine bacteria included. The factors associated with MDR strains corresponded to those previously described: male sex, age over 75 years, and hospitalization in intensive care services. In addition, an increase in the annual prevalence of other resistance mechanisms was evidenced. Conclusions. A high prevalence of MDR strains was found in all the bacteria evaluated, associated with previously described factors.
RESUMEN
La epilepsia refractaria tanto generalizada como focal, es una patología sumamente incapacitante, para el tratamiento de la misma se ha establecido a la callosotomía desde hace décadas como primera línea quirúrgica para su control, la cual puede presentar efectos secundarios importantes como síndrome de desconexión y pérdida de memoria, sin embargo, existen pacientes que no responden a la callosotomía y necesitan nuevas líneas de tratamiento, buscando en la estimulación de nervio vago una respuesta a su condición. Descripción del caso de estudio. Se presenta el caso de paciente masculino de 24 años de edad con antecedente patológico de convulsiones tipo tónico clónicas generalizadas confirmadas por video electroencefalograma de 24 horas, de predominio nocturno de 13 años de evolución, es sometido a 2 regímenes farmacológicos antiepilépticos diferentes en un período de 7 años de duración, posteriormente diagnosticado con epilepsia refractaria, por lo que se realiza callosotomía sin control de su cuadro clínico, el mismo año se realiza estimulación de nervio vago, presentando resultados favorables en su evolución. Conclusión. Luego de evidenciar el presente caso de estudio se concluye que el tratamiento de epilepsia refractaria con la colocación de un estimulador de nervio vago izquierdo asociado a un correcto régimen FAE es una alternativa muy eficaz para considerar en estos pacientes.
Refractory epilepsy, both generalized and focal, is an extremely disabling pathology. For its treatment, callosotomy has been established for decades as the first surgical line for its control, which can present important side effects such as disconnection and loss syndrome. by heart, however, there are patients who do not respond to callosotomy and need new lines of treatment, looking for an answer to their condition in vagus nerve stimulation. Description of the case study. We present the case of a 24-year-old male patient with a pathological history of generalized tonic-clonic seizures confirmed by a 24-hour video electroencephalogram, predominantly nocturnal for 13 years, undergoing 2 different antiepileptic pharmacological mechanisms over a period of 7 years in duration, later diagnosed with refractory epilepsy, for which callosotomy was performed without control of its clinical picture, the same year vagus nerve stimulation was performed, presenting favorable results in its evolution. Conclution. After evidencing the present case study, it is concluded that the treatment of refractory epilepsy with the placement of a left vagus nerve stimulator associated with a correct AED regimen is a very effective alternative to consider in these patients.
A epilepsia refratária, tanto generalizada quanto focal, é uma patologia extremamente incapacitante. Para seu tratamento, a calosotomia se estabeleceu há décadas como a primeira linha cirúrgica para seu controle, que pode apresentar importantes efeitos colaterais como desconexão e síndrome de perda., há pacientes que não respondem à calosotomia e precisam de novas linhas de tratamento, buscando resposta para sua condição na estimulação do nervo vago. Descrição do estudo de caso. Apresentamos o caso de um doente do sexo masculino, 24 anos, com antecedentes patológicos de crises tónico-clónicas generalizadas confirmadas por videoeletroencefalograma de 24 horas, predominantemente nocturnas há 13 anos, submetido a 2 mecanismos farmacológicos antiepilépticos diferentes ao longo de 7 anos de duração, posteriormente diagnosticada com epilepsia refratária, para a qual foi realizada calosotomia sem controle de seu quadro clínico, no mesmo ano foi realizada estimulação do nervo vago, apresentando resultados favoráveis em sua evolução. Conclusão. Depois de evidenciar o presente estudo de caso, conclui-se que o tratamento da epilepsia refratária com a colocação de um estimulador de nervo vago esquerdo associado a um esquema correto de DEA é uma alternativa muito eficaz a ser considerada nesses pacientes.
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Adulto , ElectroencefalografíaRESUMEN
Abstract Background: The emergence of multidrug-resistant NDM-1-producing enterobacteriaceae strains has become a threat to inpatients, especially to immunosuppressed ones, such as kidney transplant recipients. NDM-1 is a carbapenemase that makes gram-negative bacteria resistant to many types of antibiotics. The incidence of carbapenemase-producing enterobacteria infection in solid organ transplant recipients is around 3 to 10%, with a mortality rate of up to 30%. Methods: We present a case series of 4 patients with NDM-1-producing enterobacteria isolated in urine cultures or rectal swabs. We also conducted a cross-sectional study 30 days after patient identification, collecting surveillance cultures (rectal swab) from all inpatients to assess the extent of spread of this resistance mechanism; a total of 101 patients were included. Results: Two patients were adequately treated with negative control cultures. The other two patients were not treated because they were asymptomatic and had subsequent negative urine cultures. No new colonization was identified in the cross-sectional screening, and no new cases of urinary NDM-1 infection were recorded after a 4-year follow-up. Conclusion: Surveillance for infections caused by multidrug-resistant strains in hospitals treating immunosuppressed patients should be continued and prompt action should be taken in cases of outbreaks of multidrug-resistant infections.
Resumo Histórico: O surgimento de cepas multirresistentes de enterobacteriaceae produtoras de NDM-1 tornou-se uma ameaça para pacientes hospitalizados, especialmente para os imunossuprimidos, como os receptores de transplante renal. NDM-1 é uma carbapenemase que torna as bactérias gram-negativas resistentes a muitos tipos de antibióticos. A incidência de infecção por enterobactérias produtoras de carbapenemas em receptores de transplante de órgãos sólidos é de cerca de 3 a 10%, com uma taxa de mortalidade de até 30%. Métodos: Apresentamos uma série de casos de 4 pacientes com enterobactérias produtoras de NDM-1 isoladas em culturas de urina ou esfregaços retais. Também realizamos um estudo transversal 30 dias após a identificação do paciente, coletando culturas de vigilância (esfregaço retal) de todos os pacientes internados para avaliar a extensão de disseminação deste mecanismo de resistência; foram incluídos um total de 101 pacientes. Resultados: Dois pacientes foram tratados adequadamente com culturas de controle negativo. Os outros dois pacientes não foram tratados porque eram assintomáticos e tiveram culturas de urina negativas subsequentes. Não foi identificada nenhuma nova colonização na triagem transversal, e não foram registrados novos casos de infecção urinária por NDM-1 após um acompanhamento de 4 anos. Conclusão: A vigilância de infecções causadas por cepas multirresistentes em hospitais que tratam pacientes imunossuprimidos deve ser continuada e devem ser tomadas medidas imediatas em casos de surtos desses tipos de infecções.
RESUMEN
ABSTRACT Objective. Colistin is an antibiotic of last resort for treating serious Gram-negative bacterial infections. However, the misuse of colistin, especially as an animal growth promoter, has contributed to increasing antimicrobial resistance, mediated mainly through plasmid transfer of the mcr-1 gene. This study assessed the prevalence of phenotypic and molecular colistin resistance in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Ecuador in healthy humans and their chickens and pigs. Methods. Fecal samples were collected from humans and their chickens and pigs in two rural coastal and Amazon regions between April and August 2020. Gram-negative bacteria were isolated and identified using conventional techniques. Phenotypic resistance was determined using the broth microdilution technique, and the mcr-1 gene was detected using conventional polymerase chain reaction. Results. A total of 438 fecal samples were obtained from 137 humans, 147 pigs and 154 chickens. The prevalence of E. coli isolates was 86.3% (378/438) and K. pneumoniae, 37.4% (164/438). Overall, the mcr-1 gene was found in 90% (340/378) of E. coli isolates, with higher prevalences found in isolates from coastal regions (96.5%, 191/198), humans (95.6%, 111/116) and chickens (91.8%, 123/134); for K. pneumoniae, the gene was found in 19.5% (32/164) of isolates, with equal distribution between regions and hosts. Only four isolates, two E. coli and two K. pneumoniae, showed phenotypic resistance: mcr-1 was present in both E. coli strains but absent in the K. pneumoniae strains. Conclusions. Despite a low prevalence of phenotypic resistance to colistin, the high prevalence of the mcr-1 gene in E. coli is of concern. Ecuador's ban on using colistin in animal husbandry must be enforced, and continual monitoring of the situation should be implemented.
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RESUMO Objetivo. A colistina é um antibiótico de último recurso para o tratamento de infecções graves por bactérias Gram-negativas. Entretanto, o uso indevido da colistina, principalmente como promotor de crescimento animal, tem contribuído para o aumento da resistência a antimicrobianos, principalmente por transferência horizontal do gene mcr-1 mediada por plasmídeos. Este estudo avaliou a prevalência de resistência fenotípica e molecular à colistina em Escherichia coli e Klebsiella pneumoniae no Equador em humanos hígidos e em galinhas e porcos por eles criados. Métodos. Entre abril e agosto de 2020, foram coletadas amostras de fezes de habitantes de duas regiões litorâneas e amazônicas do Equador e de galinhas e porcos por eles criados. Bactérias Gram-negativas foram isoladas e identificadas por meio de técnicas convencionais. A resistência fenotípica foi determinada pela técnica de microdiluição em caldo, e o gene mcr-1 foi detectado por reação em cadeia da polimerase convencional. Resultados. Foram obtidas 438 amostras fecais de 137 humanos, 147 suínos e 154 galinhas. A prevalência de isolados de E. coli foi de 86,3% (378/438), e de K. pneumoniae, 37,4% (164/438). Em geral, o gene mcr-1 foi encontrado em 90% (340/378) dos isolados de E. coli, com maiores prevalências encontradas em isolados de regiões litorâneas (96,5%, 191/198), humanos (95,6%, 111/116) e galinhas (91,8%, 123/134); para K. pneumoniae, o gene foi encontrado em 19,5% (32/164) dos isolados, com igual distribuição entre regiões e hospedeiros. Somente quatro isolados, dois de E. coli e dois de K. pneumoniae, demonstraram resistência fenotípica: o gene mcr-1 estava presente em ambas as cepas de E. coli, mas ausente nas de K. pneumoniae. Conclusões. Apesar da baixa prevalência de resistência fenotípica à colistina, a alta prevalência do gene mcr-1 em E. coli é preocupante. É preciso fiscalizar a proibição ao uso agropecuário de colistina no Equador e implementar o monitoramento contínuo da situação.
RESUMEN
Candida auris has been recognized as an emerging multidrug-resistant pathogen with a significant public health burden, causing cases of invasive infection and colonization due to its persistence on inanimate surfaces, ability to colonize skin of some patients, and high transmissibility in healthcare settings. The first sporadic report of the isolation of this species from the ear canal of a patient in Asia was in 2009 and reports from other regions of the world soon followed. However, it was not until 2015 that global epidemiological alerts were communicated as a result of an increasing number of reports of invasive infections caused by C. auris in several countries. Colombia was soon added to this list in 2016 after an unusual increase in the number of C. haemulonii isolates was reported, later confirmed as C. auris. Since the issuing of a national alert by the Colombian National Institute of Health together with the Ministry of Health in 2016, the number of cases reported reached over 2,000 by 2022. Colombian isolates have not shown pan resistance to available antifungals, unlike C. auris strains reported in other regions of the world, which leaves patients in Colombia with therapeutic options for these infections. However, increasing fluconazole resistance is being observed. Whole-genome sequencing of Colombian C. auris isolates has enhanced molecular epidemiological data, grouping Colombian isolates in clade IV together with other South American isolates. Data from Colombia showed that public health authorities, scientific community, and the general public need to be aware of fungal diseases as they present an often-deadly threat to patients.
Candida auris ha sido reconocido como un agente patógeno multirresistente emergente con una carga significativa en la salud pública. Genera casos de infección invasiva y colonización debido a su persistencia en superficies inanimadas, su capacidad para colonizar fácilmente la piel de algunos pacientes y su alta transmisibilidad en el ambiente hospitalario. El primer reporte esporádico de esta especie fue en Asia en el 2009 cuando se realizó su aislamiento a partir del conducto auditivo de un paciente, y pronto le siguieron reportes en otras regiones del mundo. Sin embargo, no fue hasta 2015 que se conocieron las alertas epidemiológicas a nivel mundial debido a un aumento en el número de casos de infecciones causadas por C. auris en varios países. Colombia se sumó a la lista en 2016 luego de un aumento inusual en el número de aislamientos de C. haemulonii informados, que luego se confirmaron como C. auris. Desde que el Instituto Nacional de Salud junto con el Ministerio de Salud emitieron la Alerta Nacional en el 2016, el número de casos reportados superó los 2.000 en el 2022. Los aislamientos colombianos no han mostrado resistencia generalizada a los antifúngicos disponibles, contrario a lo reportado para cepas de C. auris en algunas regiones del mundo, por lo que los pacientes en Colombia aún cuentan con opciones terapéuticas para estas infecciones. No obstante, se ha observado un aumento en la resistencia al fluconazol. La secuenciación del genoma completo agrupó los aislamientos colombianos en el Ciado IV, junto con otros sudamericanos de C. auris, y aportó al conocimiento de los datos epidemiológicos moleculares de esta especie. Los datos de Colombia evidencian que las autoridades de salud pública, la comunidad científica y el público en general deben ser conscientes de las enfermedades fúngicas, ya que a menudo representan una amenaza mortal para los pacientes.
Asunto(s)
Candida auris , Resistencia a Medicamentos , Colombia , Secuenciación Completa del Genoma , Hongos , InfeccionesRESUMEN
ABSTRACT Aim: This study investigated how Colombian dentists with different academic levels indicate antibiotics with therapeutic purposes in endodontics. Materials and method: A cross-sectional survey was conducted among 559 dentists in the form of an online questionnaire. Results: Three hundred and twenty questionnaires were answered (57.2%). There were significant differences among respondents. For irreversible pulpitis, 140 dentists (43.7%) said they prescribe antibiotics (57.5% of general practitioners, 20.1% of specialists and 38.9% of those with Master's and/or PhD degrees), while for symptomatic apical periodontitis, 183 (57.2%) did so (74.1% of general practitioners, 28.4% of specialists and 50.0% of those with Master's and/or PhD degrees) (p < 0.05). Amoxicillin was the most frequently prescribed antibiotic, and its association with clavulanic acid was the most often cited for acute periradicular abscess with systemic involvement. Conclusions: The greatest misunderstandings in prescribing antibiotics occurred among general practitioners. Considering all clinical conditions that do not require antibiotics, 60% of general practitioners and 34% of specialists, on average, indicated antibiotics.
RESUMO Objetivo: Este estudo investigou como dentistas colombianos com diferentes níveis acadêmicos indicaram antibióticos com fins terapêuticos em Endodontia. Materiais e método: Realizou-se um levantamento transversal com 559 dentistas. Foi enviado um questionário online. Resultados: Foram respondidos 320 questionários (57,2%). Houve diferenças significativas entre os profissionais com diferentes níveis de formação. Para pulpite irreversível, 140 (43,7%) dentistas afirmaram indicar antibióticos (57,5% clínicos gerais, 20,1% especialistas e 38,9% com mestrado e/ou doutorado), enquanto para periodontite apical sintomática, 183 (57,2%) prescrevem estes medicamentos (74,1% clínicos, 28,4% especialistas e 50,0% com mestrado e doutorado) (p < 0,05). A amoxicilina foi a mais indicada entre os profissionais, e sua associação com ácido clavulânico foi a mais referida para abscesso perirradicular agudo com acometimento sistêmico. Conclusões: Os maiores equívocos na prescrição de antibióticos ocorreram com os clínicos gerais. Considerando todas as condições clínicas que não requerem antibióticos, 60% dos clínicos gerais e 34% dos especialistas, em média, indicaram estes medicamentos.
RESUMEN
Abstract Objective To estimate the frequency of Staphylococcus aureus and cephalosporin nonsusceptible bacteria colonization in patients with proximal femoral fracture during preoperative hospitalization. Methods Prevalence and incidence assessment in 63 hospitalized patients over 1 year. The median time of pretreatment hospitalization was 12 days. Samples were collected from the nostrils, groin skin and anal mucosa during the pretreatment hospitalization and were tested by the disc-diffusion technique. Results The hospital colonization incidence and the prevalence of positive results were 14.3 and 44.4% for S. aureus; 3.2 and 6.4% for meticillin-resistant S. aureus; 28.6 and 85.7% for meticillin-resistant coagulase-negative Staphylococcus; 28.6 and 61.9% for cefazolin nonsusceptible Enterobacteriaceae (KFNSE); and 20.6 and 28.6% for cefuroxime nonsusceptible Enterobacteriaceae (CXNSE). In addition, factors such as to the duration of the pretreatment hospitalization period, being non-walker before fracture, antimicrobial use, American Society of Anesthesiologists (ASA) 4 surgical risk, and previous hospitalization, were related to an increase in the incidence of hospital acquisition and prevalence of colonization by the evaluated strains. The prevalence of colonization by KFNSE was three times higher than by CXNSE on admission, and twice as high at the time of fracture treatment. Conclusion There was a high incidence of hospital colonization and prevalence of colonization by all strains studied, which may guide the indication of prophylactic measures for infection.
Resumo Objetivo Estimar a frequência da colonização por Staphylococcus aureus e as bactérias não suscetíveis à cefalosporina, em pacientes com fratura proximal do fêmur durante a internação pré-operatória. Métodos Avaliação da prevalência e incidência em 63 pacientes hospitalizados ao longo de um ano. O tempo médio de internação pré-tratamento foi de 12 dias. As amostras foram coletadas das narinas, pele da virilha e mucosa anal, durante a internação prévia ao tratamento e testadas pela técnica de disco-difusão. Resultados A incidência da colonização hospitalar e a prevalência de resultados positivos foram de 14,3% e 44,4% para Staphylococcus aureus; 3,2% e 6,4% para S. aureus resistente à meticilina; 28,6% e 85,7% para Staphylococcus coagulase-negativo resistente à meticilina; 28,6% e 61,9% para Enterobacteriaceae não suscetível à cefazolina (KFNSE); e 20,6% e 28,6% para Enterobacteriaceae não suscetível à cefuroxima (CXNSE). Além da duração do período de internação pré-tratamento, os pacientes não deambularam previamente à ocorrência da fratura e nem fizeram uso de antimicrobiano. Além disso, a duração do período de internação pré-tratamento cirúrgico, ser não-deambulador antes da fratura, uso de antimicrobianos, risco cirúrgico IV pela American Society of Anesthesiologists (ASA) e internação anterior, estiveram relacionados a um aumento na incidência de aquisição hospitalar e prevalência de colonização pelas cepas avaliadas. A prevalência de colonização pela KFNSE foi três vezes maior do que pela CXNSE na admissão e duas vezes maior no momento do tratamento da fratura. Conclusão Observou-se uma alta incidência da colonização hospitalar e prevalência da colonização por todas as cepas estudadas, o que pode orientar a indicação de medidas profiláticas contra a infecção.
Asunto(s)
Humanos , Infecciones Estafilocócicas/diagnóstico , Portador Sano , Infección Hospitalaria/diagnóstico , Infecciones por Enterobacteriaceae , Fracturas del Fémur , AntiinfecciososRESUMEN
Objetivo Evaluar el conocimiento en el uso de Medicamentos de Uso Veterinario (MUV) de los productores ganaderos y personal involucrado en Bogotá y municipios aledaños. Métodos Se realizó un estudio de corte transversal a través de entrevistas a operarios y productores ganaderos de una muestra de 30 hatos lecheros localizados en 15 municipios cerca de Bogotá, Cundinamarca. Resultados Se identificó la implementación de prácticas para la administración de MUV, incluyendo parámetros que influencian su administración y conocimientos en las personas que los prescriben y administran. Se encontró que los medicamentos de mayor frecuencia fueron los antimicrobianos con 60,7%, entre los cuales se destaca el uso de penicilina y oxitetraciclina. Los MUV inyectables (parenterales) fueron las formas más frecuentes de aplicación con un 64,7%. Se identificaron 251 MUV en los hatos lecheros, de los cuales el 81,3% están compuestos por principios activos que requieren tiempo de retiro en leche y carne. Se destaca el rol del mayordomo en el cuidado animal a nivel diagnóstico y administración del tratamiento. Conclusión El presente estudio sugiere que el uso de MUV es implementado empíricamente en producciones lecheras y podría contribuir a mediano y largo plazo a la emergencia de cepas con resistencia a MUV.
Objective To evaluate the knowledge in the antibiotic stewardship practices in livestock producers and associated staff from Bogotá and neighboring municipalities. Methods A cross-sectional study was performed through interviews for livestock producers and staff in a sample of 30 dairy farms located in 15 municipalities near Bogota, Cundinamarca. We evaluated practice administration of veterinary drugs and knowledge in antibiotic stewardship by farm livestock managers in charge who prescribe and administer veterinary drugs. Results The most common veterinary drugs were antimicrobials with 60.7% such as penicillin and oxytetracycline. The injectable veterinary drugs (parenteral) were the most frequently used with 64.7%. We identified 251 veterinary drugs in the dairy farms where 81.3% of active compounds require withdrawal time in the milk and meat. The butler role in animal care was highlighted at diagnostic level and treatment compliance. Conclusion This study suggests that recommendations for veterinary drug stewardship remain empirically implemented in dairy farms which might lead to the future emergence of multidrug-resistant strains in the long and middle term.
RESUMEN
Introducción: Los programas de Optimización de Antimicrobianos (PROA) en Instituciones Sanitarias son una estrategia implementada en diversos países. El estudio: Nuestro objetivo fue realizar una encuesta electrónica en los establecimientos de salud que cuentan con servicios de hospitalización en el Perú. Hallazgos: Ciento setenta establecimientos (38.4%) respondieron la encuesta entre MINSA (90%), ESSALUD (4.2%), FFAA PNP (2.9%) y Privados (2.9%). Solo 49 (28.8%) contaba con PROA funcionando dentro de su institución. El 83.7% contaban con una Resolución directoral que respalda sus funciones y el 38.8% referían contar con un plan de actividades PROA. Los problemas más frecuentemente identificados son la falta de recursos humanos capacitados (24.6%), la falta de capacitación y asistencia técnica (13.1%) y la falla en la prescripción de antibióticos (11.5%). Conclusión: Es prioritario seguir fortaleciendo los PROA en hospitales en el corto plazo con actividades que estimulen el uso racional de antimicrobianos.
Background: The Antimicrobial Optimization Programs (PROA in Spanish) in Health Institutions are a strategy implemented in different countries. The study: Our objective was to carry out an electronic survey in health establishments that have hospitalization services in Peru. Findings: One hundred seventy establishments (38.4%) responded to the survey between MINSA (90%), ESSALUD (4.2%), Armed Forces PNP (2.9%) and Private (2.9%). Only 49 (28.8%) had PROA working within their institution. 83.7% had a Director Resolution that supported their functions and 38.8% reported having a PROA activity plan. The most frequent problems identified are the lack of trained human resources (24.6%), the lack of training and technical assistance (13.1%) and the failure to prescribe antibiotics (11.5%). Conclusion: It is a priority to continue strengthening the PROA in hospitals in the short term with activities that stimulate the rational use of antimicrobials.
RESUMEN
Introduction: Praziquantel (PZQ) is the only commercially available drug for schistosomiasis. The current shortage of alternative effective drugs and the lack of successful preventive measures enhance its value. The increase in the prevalence of PZQ resistance under sustained drug pressure is, therefore, an upcoming issue. Objective: To overcome the tolerance to PZQ using nanotechnology after laboratory induction of a Schistosoma mansoni isolate with reduced sensitivity to the drug during the intramolluscan phase. Materials and methods: Shedding snails were treated with PZQ doses of 200 mg/kg twice/ week followed by an interval of one week and then repeated twice in the same manner. The success of inducing reduced sensitivity was confirmed in vitro via the reduction of cercarial response to PZQ regarding their swimming activity and death percentage at different examination times. Results: Oral treatment with a single PZQ dose of 500 mg/kg in mice infected with cercariae with reduced sensitivity to PZQ revealed a non-significant reduction (35.1%) of total worm burden compared to non-treated control mice. Orally inoculated PZQ- encapsulated niosomes against S. mansoni with reduced sensitivity to PZQ successfully regained the pathogen's sensitivity to PZQ as evidenced by measuring different parameters in comparison to the non-treated infected animals with parasites with reduced sensitivity to PZQ. The mean total worm load was 1.33 ± 0.52 with a statistically significant reduction of 94.09% and complete eradication of male worms. We obtained a remarkable increase in the percentage reduction of tissue egg counts in the liver and intestine (97.68% and 98.56%, respectively) associated with a massive increase in dead eggs and the complete absence of immature stages. Conclusion: PZQ-encapsulated niosomes restored the drug sensitivity against laboratory- induced S. mansoni adult worms with reduced sensitivity to PZQ.
Introducción. El prazicuantel es el único fármaco disponible comercialmente para la esquistosomiasis. La escasez actual de medicamentos alternativos y la falta de medidas preventivas eficaces aumentan su valor. La creciente prevalencia de la resistencia al prazicuantel bajo una presión prolongada del fármaco es, por tanto, un tema emergente. Objetivos. Superar la tolerancia al prazicuantel mediante nanotecnología después de la inducción en laboratorio de un aislamiento de Schistosoma mansoni con sensibilidad reducida al fármaco durante la fase intramolusco. Materiales y métodos. Los caracoles que liberaban cercarias se trataron con prazicuantel en dosis de 200 mg/kg dos veces por semana, seguidas de un intervalo de una semana, y luego se repitieron dos veces de la misma manera. La inducción exitosa de la sensibilidad reducida se confirmó in vitro mediante la reducción de la reacción de las cercarias al prazicuantel con respecto a su actividad de natación y el porcentaje de muerte en diferentes momentos de examen. El éxito en inducir una menor sensibilidad se confirmó in vitro mediante la reducción de la reacción de las cercarias al prazicuantel. Resultados. El tratamiento oral con una dosis única de prazicuantel de 500 mg/kg en ratones infectados con cercarias con sensibilidad reducida al prazicuantel, reveló una reducción no significativa (35,1 %) de la carga total de gusanos en comparación con los ratones de control no tratados. Los niosomas encapsulados en prazicuantel inoculados por vía oral contra S. mansoni con sensibilidad reducida al prazicuantel, permitieron reestablecer con éxito la sensibilidad del patógeno al medicamento, como lo demostró la medición de diferentes parámetros en comparación con los animales infectados no tratados con parásitos con sensibilidad reducida a prazicuantel. La carga media total de gusanos fue de 1,33 ± 0,52, con una reducción estadísticamente significativa del 94,09 %, y la erradicación completa de los gusanos machos adultos. Se obtuvo un aumento notable en el porcentaje de reducción del recuento de huevos en el tejido del hígado y el intestino (97,68 % y 98,56 %, respectivamente), asociado con un aumento masivo de huevos muertos y ausencia total de estadios inmaduros. Conclusión. Los niosomas encapsulados en prazicuantel restauraron la sensibilidad al fármaco contra gusanos adultos de S. mansoni con sensibilidad reducida al prazicuantel inducida en el laboratorio.
Asunto(s)
Praziquantel , Schistosoma mansoni , Resistencia a Medicamentos , LiposomasRESUMEN
Introducción: La infección por Helicobacter pylori (H. pylori) afecta a más del 50% de la población mundial. El aumento en las resistencias antibióticas es la principal causa del fracaso del tratamiento. El objetivo principal fue analizar el éxito erradicador tras la aplicación de las nuevas recomendaciones de tratamiento ESPGHAN e introducción de la PCR como técnica de diagnóstico directo, describir la evolución del patrón local de resistencias antibióticas y valorar el coste-efectividad de la aplicación de la PCR aislada o en conjunto con el cultivo como estrategia diagnóstica. Pacientes y métodos: Estudio descriptivo retrospectivo del total de aislamientos microbiológicos de H. pylori entre 2013-2019 en nuestro centro, mediante comparación del porcentaje de resistencias y éxito erradicador entre los periodos 2013-2016 y 2017-2019. Estudio de coste-efectividad de las pruebas de diagnóstico directo, comparando 3 opciones distintas: cultivo y PCR, solo cultivo, y solo PCR. Resultados: Se incluyó a 192 pacientes, 98 fueron detectados por cultivo (2013-2016) y 94 por cultivo o PCR (2017-2019). Se instauró tratamiento antibiótico en 153 pacientes, 90 en el primer periodo (pautas ESPGHAN 2011: porcentaje erradicación 62,2%), 63 en el segundo (pautas ESPGHAN 2017: porcentaje erradicación: 73%). Se observó un aumento en las resistencias a claritromicina, pasando de un 16,3% (n=16) en el primer periodo a un 53,2% (n=48) entre 2017-2019 (98% detectadas por PCR, 60% por cultivo). No hubo diferencias en el resto de resistencias antibióticas. La solicitud aislada de la PCR presentó una ratio de análisis de coste-efectividad (CEAR) de 71,91, en comparación con un 92,16 del cultivo y un 96,35 del cultivo y la PCR de forma conjunta. (AU)
Introduction: Helicobacter pylori (H. pylori) infection affects more than 50% of the world population. Increased antibiotic resistance is the main cause of treatment failure. The main objective was to analyze the eradication success after the application of the new ESPGHAN treatment recommendations and the introduction of PCR as a direct diagnosis technique, describe the evolution of the local pattern of antibiotic resistance, and assess the cost-effectiveness of PCR application, isolated or in conjunction with culture as a diagnostic strategy. Patients and methods: retrospective descriptive study of all microbiological isolates of H. pylori in 2013-2019 in our center, by comparing the percentage of resistance and eradication success between the periods 2013-2016 and 2017-2019. Cost-effectiveness study of direct diagnostic tests, comparing 3 different options: culture and PCR; only culture; PCR only. Results: 192 patients were included, 98 were detected by culture (2013-2016) and 94 by culture and / or PCR (2017-2019). Antibiotic treatment was established in 153 patients, 90 in the first period (2011 ESPGHAN guidelines: eradication percentage 62.2%), 63 in the second (2017 ESPGHAN guidelines: eradication percentage: 73%). An increase in resistance to clarithromycin was observed, going from 16.3% (n=16) in the first period, to 53.2% (n=48) in 2017-2019 (98% detected by PCR, 60% by culture). There were no differences in the rest of antibiotic resistances. The isolated PCR application presented a cost-effectiveness analysis ratio (CEAR) of 71.91, compared to 92.16 for the culture and 96.35 for the culture and PCR combined. (AU)
Asunto(s)
Humanos , Preescolar , Niño , Adolescente , Ciencias de la Salud , Helicobacter pylori , Resistencia a Medicamentos , Insuficiencia del Tratamiento , Análisis Costo-BeneficioRESUMEN
INTRODUCTION: Helicobacter pylori infection affects more than 50% of the world population. Increased antibiotic resistance is the main cause of treatment failure. The main objective was to analyze the eradication success after the application of the new ESPGHAN treatment recommendations and the introduction of PCR as a direct diagnosis technique, describe the evolution of the local pattern of antibiotic resistance, and assess the cost-effectiveness of PCR application, isolated or in conjunction with culture as a diagnostic strategy. PATIENTS AND METHODS: Retrospective descriptive study of all microbiological isolates of Helicobacter pylori in 2013-2019 in our center, by comparing the percentage of resistance and eradication success between the periods 2013-2016 and 2017-2019. Cost-effectiveness study of direct diagnostic tests, comparing 3 different options: culture and PCR; only culture; PCR only. RESULTS: 192 patients were included, 98 were detected by culture (2013-2016) and 94 by culture and/or PCR (2017-2019). Antibiotic treatment was established in 153 patients, 90 in the first period (2011 ESPGHAN guidelines: eradication percentage 62.2%), 63 in the second (2017 ESPGHAN guidelines: eradication percentage: 73%). An increase in resistance to clarithromycin was observed, going from 16.3% (n=16) in the first period, to 53.2% (n=48) in 2017-2019 (98% detected by PCR, 60% by culture). There were no differences in the rest of antibiotic resistances. The isolated PCR application presented a cost-effectiveness analysis ratio (CEAR) of 71.91, compared to 92.16 for the culture and 96.35 for the culture and PCR combined. CONCLUSIONS: The application of the ESPGHAN 2017 guidelines achieved greater eradication success, although less than that observed in previous publications, without reaching the target of at least 90%. An increase in resistance to macrolides was observed, without being able to discriminate whether it is a real increase or a greater diagnostic sensitivity of molecular techniques, with the isolated request for PCR being the most cost-effective strategy.
Asunto(s)
Infecciones por Helicobacter , Helicobacter pylori , Antibacterianos/farmacología , Antibacterianos/uso terapéutico , Farmacorresistencia Bacteriana , Infecciones por Helicobacter/diagnóstico , Infecciones por Helicobacter/tratamiento farmacológico , Infecciones por Helicobacter/microbiología , Helicobacter pylori/genética , Humanos , Reacción en Cadena de la Polimerasa , Estudios RetrospectivosRESUMEN
La tuberculosis continúa siendo un problema de salud pública. Al respecto, se realizó un estudio no experimental de corte transversal, con el objetivo de caracterizar clínica y epidemiológica-mente el estado de la TB resistente a medicamentos de primera línea en la ciudad de Durán, desde enero 2015 hasta diciembre 2019. Los datos incluidos en los documentos de la matriz del programa de tuberculosis resistente. De 1111 casos nuevos de tuberculosis reportados en el cantón Durán durante el período estudiado, 45 de estos presentaron resistencia a medicamentos de primera línea. El 88,89% tuvo resistencia a rifampicina, el 33,33% de los pacientes se dispen-sarizaron en 2019. Los valores de chi cuadrado de Pearson no mostraron asociación estadística-mente significativa entre las variables investigadas (p>0,05). Entre los involucrados predominó el grupo de edades de 20 a 39 años, el sexo masculino, la tuberculosis pulmonar, infectados con VIH/sida, resistencia clasificada como primaria, los que abandonaron el seguimiento al trata-miento y la no manifestación de reacciones adversas a los medicamentos. No se observó mortali-dad entre los casos nuevos, predominando entre aquellos con recaída, el género masculino y los que tuvieron tuberculosis extrapulmonar.
Tuberculosis is a disease that continues to be a public health problem. In this regard, a non-expe-rimental cross-sectional study was carried out to characterize clinically and epidemiologically the status of TB resistant to first-line drugs in the city of Durán, from January 2015 to December 2019. The data included in the resistant tuberculosis program matrix documents. 1111 new cases of tuberculosis were reported in the Duran canton during the study period, 45 of these ones presented resistance to first-line drugs. 88.89% had rifampicin resistance, 33.33% of the patients were dispensed in 2019. Pearson's chi-square values did not show a statistically significant asso-ciation between the investigated variables (p> 0.05). Among the study population, it was predo-minated the age group between 20 and 39, male sex, pulmonary tuberculosis, infected with HIV / AIDS, resistance classified as primary, those who abandoned the follow-up to treatment and the non-manifestation of adverse drug reactions. No mortality was observed among new cases, predominantly among those ones with relapse, the male gender and those ones who had extra-pulmonary tuberculosis
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Adulto , Pacientes , Tuberculosis , Resistencia a Medicamentos , Terapéutica , Factores Epidemiológicos , VIHRESUMEN
O câncer de cólon é uma das principais causas de morte por câncer em todo mundo e aproximadamente 50% dos pacientes desenvolvem metástases hepáticas durante o curso da doença. Ainda que a ressecção cirúrgica proporcione sobrevida de 5 anos ao redor de 40%, a maior parte dos pacientes apresenta doença irressecável ao diagnóstico. Neste caso, o cenário é devastador devido à resistência das células tumorais ao tratamento padrão com quimioterapia e/ou anticorpo monoclonal. Apesar dos avanços alcançados pelo rastreamento genômico das metástases, o conhecimento sobre o envolvimento de transcritos e proteínas específicas na atividade de sinalização e recrutamento de populações imunes ainda é limitado nessa doença. Considerando o grande potencial de descoberta e inovação que pode ser alcançado, este projeto propôs o desenvolvimento de uma meta-análise de dados públicos para a exploração de metástases hepáticas e a caracterização proteômica de metástases hepáticas inicialmente irressecáveis em busca de alvos promissores que possam ser explorados em novas opções terapêuticas. As principais etapas metodológicas incluem (1) desenvolvimento de um modelo de integração de dados para a obtenção, processamento e análise de aproximadamente 3.5 mil amostras de RNA-seq, microarray e proteômica de metástases hepáticas inicialmente ressecáveis, tumores primários do cólon e tecidos não-neoplásicos, (2) rastreamento por espectrometria de massas de 30 biópsias pareadas, sendo 15 de metástases hepáticas inicialmente irressecáveis e 15 de tecidos não-neoplásicos adjacentes, (3) investigação de potenciais moduladores da sinalização oncogênica associada à resistência à terapia e (4) exploração dos resultados em um conjunto independente com aproximadamente 138 mil células obtidas por single-cell RNA-seq em busca de associações entre alvos, vias de sinalização e populações imunes. Após a análise de espectrometria de massas e integração de dados da metaanálise, das 46 proteínas diferencialmente reguladas entre metástases hepáticas inicialmente irressecáveis e tecidos não-neoplásicos, TGFB1, CDH2, APOA1, TNFR2, EGFR, MDH2, ITIH2, YWHAZ, PCBP1, TOP2A e ENO1 (todas com aumento de regulação nas metástases) e CXCL14, PLA2G2A e CAV1 (com diminuição de regulação nas metástases) prosseguiram na análise. Dessas, PLA2G2A e CAV1 não foram estatisticamente confirmadas após comparação com cinco estudos independentes. Também foi identificada a ativação nas metástases de importantes vias como JAK-STAT (z-score=3,18), VEGF (z-score=2,67), WNT (z-score=3,22), PI3K (z-score=3,99), MAPK (z-score=2,85), EGFR (z-score=2,49) e NFkB (zscore=4,11). Em seguida observamos pela análise de single-cell RNA-seq que a presença de TGFB1, TNFR2 e EGFR estava associada a maior polarização de neutrófilos e células Tregs em metástases hepáticas, sugerindo uma participação desses alvos no recrutamento dessas populações imunes ou em conjunto durante o desenvolvimento, estabelecimento dessas células no fígado e progressão da doença. Tanto TGFB1 (p=0,01) quanto TNFR2 (p=0,048) foram associados a pior sobrevida global em pacientes metastáticos e apresentaram AUC=0,95 na separação entre câncer primário no cólon e metástases no fígado. Especificamente sobre a comparação entre metástases inicialmente ressecáveis e irressecáveis, apesar de termos identificado alguns alvos com mais de 10-fold de diferença (YWHAZ, AHNAK, HNRNPH1, PCBP1 e TGFB1) apenas TGFB1 prosseguiu em todas as análises, porém, esses resultados sugerem a exploração posterior desses candidatos em novos estudos. Quando buscamos por alvos relacionados à resistência à terapia, nossa estratégia selecionou 32 proteínas diferencialmente reguladas nas metástases resistentes, com envolvimento de CDH2 (p=0,002), CXCL14 (p=0,05), SERPINA1 (p=0,012) e LRGR (p=0,049) com pior sobrevida global em pacientes metastáticos. Nesses tumores também foi observada uma tendência de ativação das vias TGF-ß e TNF-α, já descritas na literatura devido a participação no desenvolvimento e progressão de metástases, além de favorer um perfil de resistência às células tumorais. Por meio de uma análise de deconvolução também observamos maior presença de células Tregs em pacientes resistentes. Essa relação entre Tregs/LGR5 também já foi associada a pior prognóstico em outros tipos de cânceres e suportam uma participação de ambos em um possível mecanismo de resistência desses tumores. Com base nos resultados obtidos, acreditamos oferecer um conjunto de dados inéditos que podem modificar o prognóstico e diagnóstico das metástases hepáticas, bem como contribuir para que os pacientes tenham novas opções terapêuticas com melhora na sobrevida
Colon cancer is one of the leading causes of cancer death worldwide and approximately 50% of patients develop liver metastases during the course of the disease. Although surgical resection provides a 5-year survival rate of around 40%, most patients have unresectable disease at diagnosis. In this case, the scenario is devastating due to the resistance of tumor cells to standard treatment with chemotherapy and/or monoclonal antibody. Despite the advances achieved by genomic tracking of metastases, the involvement of specific transcripts and proteins in the signaling activity and recruitment of immune populations is still limited in this disease. Considering the great potential for discovery and innovation that can be achieved, this project proposed the development of a meta-analysis for the exploration of liver metastases and the proteomic characterization of initially unresectable liver metastases in search of promising targets that can be explored in new therapeutics options. Key methodological steps include (1) development of a data integration model for obtaining, processing and analyzing approximately 3,500 RNA-seq, microarray and proteomic samples from initially resectable liver metastases, primary colon tumors and non-neoplastic tissues, (2) mass spectrometry screening of 30 paired biopsies, 15 from initially unresectable liver metastases and 15 from adjacent non-neoplastic tissues, (3) investigation of potential modulators of oncogenic signaling associated with therapy resistance, and (4) exploration of the results in an independent pool of approximately 138,000 cells obtained by single-cell RNA-seq in search of associations between targets, signaling pathways and immune populations. After mass spectrometry analysis and integration of metaanalysis data, of the 46 differentially regulated proteins between initially unresectable liver metastases and non-neoplastic tissues, TGFB1, CDH2, APOA1, TNFR2, EGFR, MDH2, ITIH2, YWHAZ, PCBP1, TOP2A and ENO1 (all with upregulation in metastases) and CXCL14, PLA2G2A and CAV1 (with downregulation in metastases) continued in the analysis. Of these, PLA2G2A and CAV1 were not statistically confirmed after comparison with five independent studies. We identified activation of important pathways such as JAK-STAT (zscore=3.18), VEGF (z-score=2.67), WNT (z-score=3.22), PI3K (z-score=3.99), MAPK (z- score=2.85), EGFR (z-score=2.49) and NFkB (z-score=4.11). Then we observed by single-cell RNA-seq analysis that the presence of TGFB1, TNFR2 and EGFR was associated with greater polarization of neutrophils and Treg cells in liver metastases, suggesting a participation of these targets in the recruitment of these immune populations or together during development, establishment of these cells in the liver and disease progression. Both TGFB1 (p=0.01) and TNFR2 (p=0.048) were associated with worse overall survival in patients with metastatic disease and had AUC=0.95 separating primary colon cancer from liver metastases. Specifically, regarding the comparison between initially resectable and unresectable metastases, although we identified some targets with more than 10-fold difference (YWHAZ, AHNAK, HNRNPH1, PCBP1 and TGFB1) only TGFB1 continued in all analyses, however, these results suggest the exploration of these candidates in further studies. When looking for targets related to therapy resistance, our strategy selected 32 proteins differentially regulated in resistant metastases, with involvement of CDH2 (p=0.002), CXCL14 (p=0.05), SERPINA1 (p=0.012) and LRGR (p=0.049) with poor overall survival in metastatic patients. In these tumors, a tendency of activation of the TGF-ß and TNF-α pathways was also observed, already described in the literature due to their participation in the development and progression of metastases, in addition to favoring a resistance profile to tumor cells. By means of a deconvolution analysis, we also observed a greater presence of Treg cells in resistant patients. This relationship between Tregs/LGR5 has also been associated with a worse prognosis in other types of cancers and supports the participation of both in a possible mechanism of resistance in these tumors. Based on the results obtained, we believe to offer a set of unpublished data that can modify the prognosis and diagnosis of liver metastases, as well as contribute to patients having new therapeutic options with improved survival
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Persona de Mediana Edad , Anciano , Anciano de 80 o más Años , Neoplasias del Colon , Proteómica , Pronóstico , Metástasis de la NeoplasiaRESUMEN
ABSTRACT Objective: Multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) is a life-threatening infectious disease. Treatment requires multiple antimicrobial agents used for extended periods of time. The present study sought to evaluate the treatment success rate of bedaquiline-based regimens in MDR-TB patients. Methods: This was a systematic review and meta-analysis of studies published up to March 15, 2021. The pooled treatment success rates and 95% CIs were assessed with the fixed-effect model or the random-effects model. Values of p < 0.05 were considered significant for publication bias. Results: A total of 2,679 articles were retrieved by database searching. Of those, 29 met the inclusion criteria. Of those, 25 were observational studies (including a total of 3,536 patients) and 4 were experimental studies (including a total of 440 patients). The pooled treatment success rate was 74.7% (95% CI, 69.8-79.0) in the observational studies and 86.1% (95% CI, 76.8-92.1; p = 0.00; I2 = 75%) in the experimental studies. There was no evidence of publication bias (p > 0.05). Conclusions: In patients with MDR-TB receiving bedaquiline, culture conversion and treatment success rates are high even in cases of extensive resistance.
RESUMO Objetivo: A tuberculose multirresistente (MDR-TB, do inglês multidrug-resistant tuberculosis) é uma doença infecciosa potencialmente fatal. O tratamento exige múltiplos agentes antimicrobianos usados durante longos períodos. O presente estudo buscou avaliar a taxa de sucesso de esquemas terapêuticos com bedaquilina em pacientes com MDR-TB. Métodos: Trata-se de uma revisão sistemática e meta-análise de estudos publicados até 15 de março de 2021. As taxas combinadas de sucesso do tratamento e os IC95% foram avaliados por meio do modelo de efeito fixo ou do modelo de efeitos aleatórios. Valores de p < 0,05 foram considerados significativos para viés de publicação. Resultados: Por meio de buscas eletrônicas em bancos de dados, foram recuperados 2.679 artigos. Destes, 29 preencheram os critérios de inclusão. Destes, 25 eram estudos observacionais (com um total de 3.536 pacientes) e 4 eram estudos experimentais (com um total de 440 pacientes). A taxa combinada de sucesso do tratamento foi de 74,7% (IC95%: 69,8-79,0) nos estudos observacionais e de 86,1% (IC95%: 76,8-92,1; p = 0,00; I2 = 75%) nos estudos experimentais. Não foram encontradas evidências de viés de publicação (p > 0,05). Conclusões: Em pacientes com MDR-TB tratados com bedaquilina, as taxas de conversão da cultura e sucesso do tratamento são altas mesmo em casos de resistência extensa.
RESUMEN
Introducción: Entre las infecciones asociadas con la atención en salud, las relacionadas con dispositivos constituyen la patología más común en los pacientes que ingresan al servicio de cuidados intensivos. Objetivos: Determinar la distribución de las infecciones asociadas con dispositivos, su perfil microbiológico y resistencia bacteriana en las unidades de cuidados intensivos del departamento de Casanare, Colombia entre 2019 y 2020. Materiales y métodos: Estudio observacional retrospectivo de corte transversal. La población de estudio fueron 93 pacientes admitidos entre enero de 2019 y diciembre de 2020 en dos unidades de cuidados intensivos del depar-tamento de Casanare. La información fue suministrada por la Secretaría de Salud Departamental, a través de los reportes de los laboratorios clínicos por medio del programa WHONET 5.6. Resultados: Las infecciones del torrente sanguíneo asociadas con el uso de catéter fueron las más frecuentes, con un 84 % (n: 78); seguidas de las infecciones sintomáticas de las vías urinarias asociadas con catéter, con un 12 % (n: 11), y en menor proporción las neumonías asociadas con ventilador mecánico, en un 4 % (n: 4). Las bacterias gramnegativas presentaron mayor frecuencia (61 %; n: 14) en relación con las grampositivas (39 %; n: 9). Conclusión: Las infecciones más frecuentes en los servicios analizados fueron las del torrente sanguíneo asociadas con el catéter y Pseudomonas aeruginosa fue el microrganismo más prevalente en los tres tipos de infección; mien-tras que el Enterococcus faecium fue resistente a una variedad de antibióticos. Tales resultados, al ser comparados con estudios realizados en varios países, demostraron que la distribución de estas infecciones es variable. Palabras clave: infecciones oportunistas; unidad de cuidados intensivos; dispositivos de acceso vascular; neumonía asociada al ventilador; infecciones relacionadas con catéteres; agentes antibacterianos; resistencia a medicamentos.
Introduction: Among health care associated infections, device associated infections are the most common pathology in patients admitted to the intensive care service. Objectives: To determine the distribution of device-associated infections, their microbiological profile and bacterial resistance, in the intensive care units of the Department of Casanare between 2019 and 2020. Materials and methods: An observational, retrospective, cross-sectional study was carried out. The study population was 93 patients admitted between January 2019 and December 2020 in two Inten-sive Care Units of the Department of Casanare. The information was provided by the Departmental Health Secretariat through the reports of the Clinical Laboratories through the WHONET 5.6 program. Results: Catheter-associated bloodstream infections were the most frequent with 84% (n: 78), fo-llowed by catheter-associated symptomatic urinary tract infections with 12% (n: 11) and associated pneumonia to a lesser extent 4% mechanical ventilator (n: 4). Gram negative bacteria had a higher frequency 61% (n: 14) compared to Gram positive ones 39% (n: 9). Conclusion: The infection associated with devices, the most frequent in the analyzed services were the infections of the blood stream associated with the catheter and P. aeruginosa was the most preva-lent microorganism in the three types of infection. E. faecium presented resistance to a variety of an-tibiotics, results that when compared with studies carried out in several countries worldwide showed that the distribution of these infections is variable.
Introdução: Entre as infecções associadas aos cuidados de saúde, as infecções associadas a dispositi-vos são a patologia mais comum em pacientes internados em terapia intensiva. Objetivo: Determinar a distribuição de infecções associadas a dispositivos, seu perfil microbiológico e resistência bacteriana em unidades de terapia intensiva no departamento de Casanare, Colômbia entre 2019 e 2020. Materiais e métodos: Estudo retrospectivo observacional transversal. A população do estudo foi de 93 pacientes admitidos entre janeiro de 2019 e dezembro de 2020 em duas unidades de terapia in-tensiva no departamento de Casanare. As informações foram fornecidas pela Secretaria de Saúde do Departamento, através de informes de laboratório clínico utilizando o programa WHONET 5.6. Resultado: As infecções da corrente sanguínea associadas a cateteres foram as mais frequentes com 84% (n: 78), seguidas pelas infecções do trato urinário sintomáticas associadas a cateteres com 12% (n: 11), e em menor grau as pneumonias associadas a ventiladores mecânicos com 4% (n: 4). As bac-térias gram-negativas eram mais frequentes (61%; n: 14) do que as gram-positivas (39%; n: 9). Conclusão: As infecções mais frequentes nos serviços analisados foram infecções associadas a cate-teres e Pseudomonas aeruginosa foi o microrganismo mais prevalente nos três tipos de infecção, en-quanto Enterococcus faecium era resistente a uma variedade de antibióticos. Tais resultados, quando comparados com estudos realizados em vários países, demonstraram que a distribuição dessas infe-cções é variável.
Asunto(s)
Infecciones Oportunistas , Resistencia a Medicamentos , Neumonía Asociada al Ventilador , Infecciones Relacionadas con Catéteres , Dispositivos de Acceso Vascular , Unidades de Cuidados Intensivos , AntibacterianosRESUMEN
Background: Antibiotic resistance is considered to be the next worldwide epidemic. Urinary tract infections (UTI) are the second most common cause of infection, which also has the highest resistance frequency. Nevertheless, in high Andean regions, little is known about the antibiotic resistance. Objectives: Determine the antimicrobial resistance patterns of the enterobacteriaceae family isolated from urinary tract infections of a Peruvian Andean region. Material and Methods: Aretrospective cross-sectional review of 1717 records from the microbiology service of a private health institution from Puno - Peru, was done between the years 2014 and 2017. Antibiotic resistance by uropathogens was studied among different age groups. Statistical analysis included Chi2 test with a p<0.05. Poisson regression was used to calculate the prevalence ratio (PR) with a 95% confidence interval. Results: There was a wide distribution of antibiotic resistance among all the antibiotics, mainly in Escherichia coli and Proteus spp. The elderly had the highest prevalence of antibiotic resistance. As age increased, resistance to all drugs also increased (p<0.01). Furthermore, the elderly had a risk probabilityofresistanceof1.22,1.42,1.20and1.32topenicillins, cephalosporins, quinolones and other antibiotics respectively. Conclusion: The antimicrobial resistance patterns of the Peruvian Andean region were lower than national and international patterns.
Introducción: La resistencia a antibióticos es considerada la próxima epidemia mundial. Las infecciones del tracto urinario (ITU) son la segunda causa más común de infecciones y la que presenta mayor frecuencia de resistencia. Sin embargo, poco se ha reportado en regiones altos-andinas. Objetivo: Evaluar los patrones de resistencia antimicrobiana de la familia enterobacteriaceae aisladas de infecciones del tracto urinario de pacientes ambulatorios de una región altoandina peruana y sus factores asociados. Material y Métodos: Estudio transversal analítico retrospectivo, a partir de 1717 registros del Servicio de Microbiología de una institución de salud en la región Puno Perú, entre los años 2014 al 2017. Se estudió la resistencia a antibióticos según uropatógeno en diferentes grupos etarios. Se empleó la prueba de Chi2 de Pearson y un modelo de regresión de Poisson para calcular la razón de prevalencias (RP). En todos los análisis se consideró un valor de p<0.05 como significativo y se estimaron intervalos de confianza al 95%. Resultados: Se presentó una amplia distribución de resistencia en todos los fármacos evaluados, siendo mayor en Escherichia coli y Proteus spp. El grupo etario, ≥ 60 años, presentó la mayor prevalencia de resistencia bacteriana. A medida que la edad aumentaba, la resistencia a todos los fármacos estudiados también aumentó (p <0.01). Así mismo, los pacientes ≥ 60 años presentaron mayor probabilidad de presentar resistencia bacteriana a penicilinas, cefalosporinas y quinolonas. Conclusión: El patrón de resistencia a los antibióticos utilizados en ITUs en la zona altoandina peruana incrementa con la edad.