Exploring the enzymatic repertoires of Bacteria and Archaea and their associations with metabolic maps.

The evolution, survival, and adaptation of microbes are consequences of gene duplication, acquisition, and divergence in response to environmental challenges. In this context, enzymes play a central role in the evolution of organisms, because they are fundamental in cell metabolism. Here, we analyzed the enzymatic repertoire in 6,467 microbial genomes, including their abundances, and their associations with metabolic maps. We found that the enzymes follow a power-law distribution, in relation to the genome sizes. Therefore, we evaluated the total proportion enzymatic classes in relation to the genomes, identifying a descending-order proportion: transferases (EC:2.-), hydrolases (EC:3.-), oxidoreductases (EC:1.-), ligases (EC:6.-), lyases (EC:4.-), isomerases (EC:5.-), and translocases (EC:7-.). In addition, we identified a preferential use of enzymatic classes in metabolism pathways for xenobiotics, cofactors and vitamins, carbohydrates, amino acids, glycans, and energy. Therefore, this analysis provides clues about the functional constraints associated with the enzymatic repertoire of functions in Bacteria and Archaea.

Prediction of DNA-Binding Transcription Factors in Bacteria and Archaea Genomes.

DNA-binding transcription factors (TFs) play a central role in the gene expression of all organisms, from viruses to humans, including bacteria and archaea. The role of these proteins is the fate of gene expression in the context of environmental challenges. Because thousands of genomes have been sequenced to date, predictions of the encoded proteins are validated through the use of bioinformatics tools to obtain the necessary experimental, posterior knowledge. In this chapter, we describe three approaches to identify TFs in protein sequences. The first approach integrates the results of sequence comparisons and PFAM assignments, using as reference a manually curated collection of TFs. The second approach considers the prediction of DNA-binding structures, such as the classical helix-turn-helix (HTH); and the third approach considers a deep learning model. We suggest that all approaches must be considered together to increase the possibility of identifying new TFs in bacterial and archaeal genomes.

Assessing the oncolytic potential of rotavirus on mouse myeloma cell line Sp2/0-Ag14. / Evaluación del potencial oncolítico del rotavirus en la línea celular Sp2/0-Ag14 de mieloma de ratón

INTRODUCTION: Cancer is the second leading cause of death in the United States, surpassed only by cardiovascular disease. However, cancer has now overtaken cardiovascular disease as the main cause of death in 12 countries in Western Europe. The burden of cancer is posing a major challenge to health care systems worldwide and demanding improvements in methods for cancer prevention, diagnosis, and treatment. Alternative and complementary strategies for orthodox surgery, radiotherapy, and chemotherapy need to be developed. OBJECTIVE: To determine the oncolytic potential of tumor cell-adapted rotavirus in terms of their ability to infect and lysate murine myeloma Sp2/0-Ag14 cells. MATERIALS AND METHODS: We inoculated rotaviruses Wt1-5, WWM, TRUYO, ECwt-O, and WTEW in Sp2/0-Ag14 cells and we examined their infectious effects by immunocytochemistry, immunofluorescence, flow cytometry, and DNA fragmentation assays. RESULTS: Rotavirus infection involved the participation of some heat shock proteins, of protein disulfide isomerase (PDI), and integrin ß3. We detected the accumulation of viral antigens within the virus-inoculated cells and in the culture medium in all the rotavirus isolates examined. The rotavirus-induced cell death mechanism in Sp2/0-Ag14 cells involved changes in cell membrane permeability, chromatin condensation, and DNA fragmentation, which were compatible with cytotoxicity and apoptosis. CONCLUSIONS: The ability of the rotavirus isolates Wt1-5, WWM, TRUYO, ECwt-O, and WTEW to infect and cause cell death of Sp2/0-Ag14 cells through mechanisms that are compatible with virus-induced apoptosis makes them potential candidates as oncolytic agents.

Introducción. El cáncer es la segunda causa de muerte en los Estados Unidos, solamente superado por la enfermedad cardiovascular. Sin embargo, el cáncer aventaja a la enfermedad cardiovascular como primera causa de muerte en doce países de Europa occidental. Se requieren mejores métodos de prevención, diagnóstico y tratamiento para afrontar el gran desafío que el cáncer representa mundialmente para los sistemas de salud, y se necesita desarrollar estrategias alternativas y complementarias a la cirugía, la radioterapia y la quimioterapia convencionales. Objetivo. Evaluar el potencial oncolítico de rotavirus adaptados a células tumorales por su capacidad para infectar y lisar células Sp2/0-Ag14 de mieloma de ratón. Materiales and métodos. Los aislamientos de rotavirus Wt1-5, WWM, TRUYO, ECwt-O y WTEW se inocularon en células Sp2/0-Ag14 y se examinaron sus efectos infecciosos mediante inmunocitoquímica, inmunofluorescencia, citometría de flujo y ensayos de fragmentación del ADN. Resultados. La infección con los rotavirus Wt1-5, WWM, TRUYO, ECwt-O y WTEW implicó la participación de algunas proteínas de choque térmico, la proteína disulfuro isomerasa y la integrina ß3. La acumulación de antígenos virales intracelulares y extracelulares se detectó en todos los virus utilizados. Los mecanismos de muerte inducidos por los rotavirus en células Sp2/0-Ag14 indujeron cambios en la permeabilidad de la membrana celular, la condensación de cromatina y la fragmentación de ADN, los cuales fueron compatibles con citotoxicidad y apoptosis. Conclusiones. La capacidad de los rotavirus estudiados para infectar y causar la muerte de células Sp2/0-Ag14 mediante mecanismos compatibles con la apoptosis inducida viralmente los convierte en candidatos potenciales para ser utilizados como agentes oncolíticos.

Induction of Cell Death in the Human Acute Lymphoblastic Leukemia Cell Line Reh by Infection with Rotavirus Isolate Wt1-5.

Cancer is a major health problem that poses a great challenge to health care systems worldwide. Tools for cancer treatment have rapidly advanced in recent years, resulting in therapeutic strategies which are alternative and complementary to conventional treatment. To identify the cell surface receptors used by a tumor cell-adapted rotavirus and the cell death markers induced by its infection, we use Wt1-5, a rotavirus isolate recently adapted to tumor cells, to infect the human acute lymphoblastic leukemia cell line, Reh. The expression of cell surface receptors used by Wt1-5 was determined using flow cytometry and an antibody blocking assay to test for their implication in virus infection. Viral antigens and cell death markers induced by rotavirus infection were followed by flow cytometric analysis. The present study showed that rotavirus Wt1-5 was able to use cell surface proteins such as heat shock proteins (HSPs) 90, 70, 60 and 40, Hsc70, PDI and integrin ß3. Rotavirus Wt1-5 induced cytotoxic effects including changes in cell membrane permeability, alteration of mitochondrial membrane potential, DNA fragmentation and activation of cell death signaling. Wt1-5 deserves to be further studied as a candidate oncolytic agent due to its ability to induce apoptosis in lymphoblastic leukemia-derived cells.

Evaluation of the Abundance of DNA-Binding Transcription Factors in Prokaryotes.

The ability of bacteria and archaea to modulate metabolic process, defensive response, and pathogenic capabilities depend on their repertoire of genes and capacity to regulate the expression of them. Transcription factors (TFs) have fundamental roles in controlling these processes. TFs are proteins dedicated to favor and/or impede the activity of the RNA polymerase. In prokaryotes these proteins have been grouped into families that can be found in most of the different taxonomic divisions. In this work, the association between the expansion patterns of 111 protein regulatory families was systematically evaluated in 1351 non-redundant prokaryotic genomes. This analysis provides insights into the functional and evolutionary constraints imposed on different classes of regulatory factors in bacterial and archaeal organisms. Based on their distribution, we found a relationship between the contents of some TF families and genome size. For example, nine TF families that represent 43.7% of the complete collection of TFs are closely associated with genome size; i.e., in large genomes, members of these families are also abundant, but when a genome is small, such TF family sizes are decreased. In contrast, almost 102 families (56.3% of the collection) do not exhibit or show only a low correlation with the genome size, suggesting that a large proportion of duplication or gene loss events occur independently of the genome size and that various yet-unexplored questions about the evolution of these TF families remain. In addition, we identified a group of families that have a similar distribution pattern across Bacteria and Archaea, suggesting common functional and probable coevolution processes, and a group of families universally distributed among all the genomes. Finally, a specific association between the TF families and their additional domains was identified, suggesting that the families sense specific signals or make specific protein-protein contacts to achieve the regulatory roles.

PPARγ Agonists as an Anti-Inflammatory Treatment Inhibiting Rotavirus Infection of Small Intestinal Villi.

Rotavirus infection has been reported to induce an inflammatory response in the host cell accompanied by the increased expression or activation of some cellular molecules including ROS, NF-κB, and COX-2. PPARγ stimulation and N-acetylcysteine (NAC) treatment have been found to interfere with viral infections including rotavirus infection. Small intestinal villi isolated from in vivo infected mice with rotavirus ECwt were analyzed for the percentage of ECwt-infected cells, the presence of rotavirus antigens, and infectious virion yield following treatment with pioglitazone. Isolated villi were also infected in vitro and treated with PPARγ agonists (PGZ, TZD, RGZ, DHA, and ALA), all-trans retinoic acid (ATRA), and NAC. After treatments, the expression of cellular proteins including PPARγ, NF-κB, PDI, Hsc70, and COX-2 was analyzed using immunochemistry, ELISA, immunofluorescence, and Western blotting. The results showed that rotavirus infection led to an increased accumulation of the cellular proteins studied and ROS. The virus infection-induced accumulation of the cellular proteins studied and ROS was reduced upon pioglitazone treatment, causing also a concomitant reduction of the infectious virion yield. We hypothesized that rotavirus infection is benefiting from the induction of a host cell proinflammatory response and that the interference of the inflammatory pathways involved leads to decreased infection.

Experimental Adaptation of Rotaviruses to Tumor Cell Lines.

A number of viruses show a naturally extended tropism for tumor cells whereas other viruses have been genetically modified or adapted to infect tumor cells. Oncolytic viruses have become a promising tool for treating some cancers by inducing cell lysis or immune response to tumor cells. In the present work, rotavirus strains TRF-41 (G5) (porcine), RRV (G3) (simian), UK (G6-P5) (bovine), Ym (G11-P9) (porcine), ECwt (murine), Wa (G1-P8), Wi61 (G9) and M69 (G8) (human), and five wild-type human rotavirus isolates were passaged multiple times in different human tumor cell lines and then combined in five different ways before additional multiple passages in tumor cell lines. Cell death caused by the tumor cell-adapted isolates was characterized using Hoechst, propidium iodide, 7-AAD, Annexin V, TUNEL, and anti-poly-(ADP ribose) polymerase (PARP) and -phospho-histone H2A.X antibodies. Multiple passages of the combined rotaviruses in tumor cell lines led to a successful infection of these cells, suggesting a gain-of-function by the acquisition of greater infectious capacity as compared with that of the parental rotaviruses. The electropherotype profiles suggest that unique tumor cell-adapted isolates were derived from reassortment of parental rotaviruses. Infection produced by such rotavirus isolates induced chromatin modifications compatible with apoptotic cell death.

Vasodilatación mediada por flujo en niños con sobrepeso / Flow mediated vasodilation in overweight children

Introducción: El conocimiento actual sugiere que la enfermedad cardiovascular se origina y progresa desde la infancia y la adolescencia. La disfunción endotelial es un evento temprano y crucial en la aterosclerosis. Pacientes y Método: Estudio prospectivo que comparó la vasodilatación mediada por flujo (VMF) en niños con sobrepeso y niños de peso normal. Para medir la VMF se utilizó transductor adecuado de ultrasonido y el método estándar. Resultados: Ochenta y dos niños fueron incluidos; 49 eran casos (sobrepeso) y 33 controles. Los valores de VMF oscilaron entre -6 y 56% (promedio 11,1%) en niños con sobrepeso y de 0 a 29,6% (promedio 16,6%) en niños control (p < 0,05). Se presentó vasoconstricción paradójica en el 34,7% de los niños con sobrepeso y en ninguno de los controles (p < 0,05). Se encontró una asociación significativa entre vasoconstricción paradójica con obesidad central e hipertensión. Conclusión: Los resultados de este estudio muestran que la VMF es menor en niños con sobrepeso en comparación con los niños eutróficos, por lo que es más probable que exista disfunción endotelial en ellos.

Introduction: Present knowledge suggests that cardiovascular disease originates and progresses from childhood and adolescence. Endothelial dysfunction is an early and crucial event in atherosclerosis. Patients and Method: Prospective study that compares Flow Mediated Vasodilation (FMV) in children with overweight (OWC) and normal weight children. An ultrasound transducer a standard method were used to measure FMD. Results: The study included 82 children, of whom 49 were cases (OWC) and 33 controls. FMV values ranged from -6 to 56% (x = 11.1%) in OW, and from 0 to 29.6% (x = 16.6%) in control children (P<.005). Paradoxical vasoconstriction was found in 34.7% in OWC as compared to nil in controls (P<.005). A significant association was found between vasoconstriction and central obesity and hypertension. Conclusion: The results of this study show that FMV is lower in obese compared to normal children; thus they are more likely to have endothelial dysfunction.

[Flow mediated vasodilation in overweight children]. / Vasodilatación mediada por flujo en niños con sobrepeso.

INTRODUCTION: Present knowledge suggests that cardiovascular disease originates and progresses from childhood and adolescence. Endothelial dysfunction is an early and crucial event in atherosclerosis. PATIENTS AND METHOD: Prospective study that compares Flow Mediated Vasodilation (FMV) in children with overweight (OWC) and normal weight children. An ultrasound transducer a standard method were used to measure FMD. RESULTS: The study included 82 children, of whom 49 were cases (OWC) and 33 controls. FMV values ranged from -6 to 56% (x=11.1%) in OW, and from 0 to 29.6% (x=16.6%) in control children (P<.005). Paradoxical vasoconstriction was found in 34.7% in OWC as compared to nil in controls (P<.005). A significant association was found between vasoconstriction and central obesity and hypertension. CONCLUSION: The results of this study show that FMV is lower in obese compared to normal children; thus they are more likely to have endothelial dysfunction.

N-Acetylcysteine treatment of rotavirus-associated diarrhea in children.

Rotaviruses are the leading cause of severe, acute, and dehydrating diarrhea affecting children under 5 years of age worldwide. Despite an important reduction in rotavirus-caused deaths as a consequence of the rotavirus vaccine, alternative or complementary strategies for preventing or treating rotavirus-associated diarrhea are needed mainly in the poorest countries. We describe the cases of four rotavirus-unvaccinated 12-13-month-old girls and a 5-year-old boy who developed rotavirus-associated diarrhea confirmed by enzyme-linked immunosorbent assay, Western blotting, and immunochemistry analyses. After the first day of diarrheal episodes, three of the five patients were immediately administered oral N-acetylcysteine (NAC) 60 mg/kg daily, divided into three equal doses every 8 hours. The other two patients did not receive NAC and served as controls. Administration of NAC resulted in a decreased number of diarrheal episodes, excretion of fecal rotavirus antigen, and resolution of symptoms after 2 days of treatment. Our results suggest that NAC treatment after the first diarrheal episode could be an efficient strategy for treating rotavirus-affected children and preventing the associated severe life-threatening accompanying dehydration.

Impacto del entrenamiento visual en las vergencias de pacientes présbitas / Impact of visual training in presbyopic patients’ convergences

El motivo del disconfort en pacientes présbitas puede deberse a una disfunción en las habilidades de vergencia, que no compensan de forma eficiente la posición fórica en visión cercana. Objetivo: determinar el impacto del entrenamiento visual en los rangos de vergencias de pacientes présbitas. Materiales y métodos: se incluyeron 54 sujetos présbitas corregidos. Se formaron dos grupos de 27 pacientes; el grupo de intervención se sometió a un programa de entrenamiento de vergencias durante diez semanas. Se midieron los rangos de vergencias fusionales negativas y positivas, la relación acomodación-convergencia acomodativa, la distancia en centímetros del punto próximo de convergencia y las forias lateral y vertical en visión cercana con el método de Von Graefe y el grado de disconfort visual. Resultados: la pueba t de Student confirmó que existe significancia (p < 0,005) en el grupo de intervención entre: a) el valor del disconfort inicial y el valor final y b) los valores de ruptura y recobro de la vergencia positiva. La media inicial de los valores de ruptura fue de 19,70 dioptrías prismáticas y la final de 26,07 y de 4,48 a 13,33 dioptrías prismáticas en el recobro. El valor de la media del punto próximo de convergencia inicial en el grupo de intervención fue de 15,63 centímetros y el final de 6,28 centímetros. La variación en la media del AC/A inicial y final del grupo de intervención fue de 1,1 dioptrías prismáticas. Conclusiones: el entrenamiento visual tiene impacto sobre las vergencias positivas, normaliza el punto próximo de convergencia y disminuye el disconfort visual.

The reason for the discomfort in presbyopic patients may be due to dysfunction in the skills of convergence, which may not efficiently compensate for the phoric position in near vision. Objective: To determine the impact of visual training in the ranges of convergences of presbyopic patients. Materials and methods: 54 subjects with presbyopic correction. Groups of 27 patients were formed. The intervention group underwent a convergence training program for ten weeks. Negative and positive convergence fusions, the accommodation-convergence ratio, the distance in centimeters from the next point of convergence and lateral and vertical phorias for near vision were measured using the Von Graefe method and the degree of visual discomfort. Results: The student test confirmed that there is significance (p <0.005) in the intervention group between: a) the value of the initial discomfort and the final value, and b) the values of breakdown and recovery of the positive convergence. The mean values of rupture were 19.70 prism diopters initially, and 26.07 at the end, and 4.48 to 13.33 prism diopters in the recovery. The value of the near point of convergence measured in the initial intervention group was 15.63 centimeters and in at the end it was 6.28 centimeters. The variation in initial and final AC/A measurement of the intervention group was 1.1 prism diopters. Conclusions: The visual training has a positive impact on convergences, normalizes the near point of convergence and reduces visual discomfort.

La gastroenterología pediátrica en Colombia / Pediatric gastroenterology in Colombia

Los antecedentes, la historia y la práctica de la gastroenterología pediátrica en Latinoamérica y otros países ya ha sido relatada previamente. Son pocos los estudios colombianos que muestran la estadística de las principales entidades digestivas que afectan a los niños colombianos. Las principales universidades públicas del país cuentan con la asignatura de gastroenterología pediátrica dentro de su pensum académico. Tres sociedades agremian a la mayoría de los gastroenterólogos pediatras colombianos: dos nacionales y una internacional. Cuatro congresos colombianos, han sido realizados en nuestro país. Cuatro libros y un suplemento del Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition han sido editados por gastroenterólogos pediatras del país, así como algunos artículos a manera de artículos originales, revisiones de tema y resúmenes de trabajos libres han sido publicados en revistas internacionales.

The background, history and practice of pediatric gastroenterology in Latin America and other countries has been reported previously. Few studies about colombian statistics showing the main entities that affect the digestive colombian children. The main public universities in the country have the subject of pediatric gastroenterology in their academic curriculum. There are three societies for pediatric gastroenterology in Colombia: two domestic and one international. Four colombian congress have been made in our country. Four books and a supplement of the Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition has been edited by the nation's pediatric gastroenterologists and a few ítems by way of original articles, reviews the subject and free abstracts have been published in international journals.

Prótesis de cuerpo vertebral JR: dispositivo modular, anatómico y expandible, con función de jaula y placa diseñada ad hoc para estabilizar la columna después de corpectomía / Prótese do corpo vertebral JR: dispositivo modular, anatômico e expansível, com função de jaula e placa desenhada ad hoc para estabilizar a coluna depois da corpectomia / JR vertebral body prosthesis: a modular, anatomical and expandable device, with cage function and plate dual designed ad hoc for spine stabilization after corpectomy

Debido a los resultados clínicos no satisfactorios con instrumentaciones posteriores en los casos de tumor vertebral y a las carencias económicas de nuestros pacientes para adquirir los sistemas disponibles en el mercado, fue diseñada una prótesis de cuerpo vertebral para estabilizar la columna después de una corpectomía. Objetivo: describir las características estructurales y funcionales de la prótesis JR, las pruebas biomecánicas en cadáver y la técnica quirúrgica en el paciente. Métodos: primeramente fue realizado un estudio anatómico detallado de los cuerpos vertebrales. Se obtuvo el diseño de un dispositivo modular, anatómico y expandible. Sus componentes una vez ensamblados hacen un implante con función dual de jaula y placa lateral expandibles. Posteriormente se efectuó un ensayo de propiedades biomecánicas en cadáver y se implantó un dispositivo en un paciente con metástasis en cuerpo vertebral. Resultados: las radiografías que le fueron tomadas al cadáver, posterior a la colocación del implante, no mostraron pérdida de la fijación. Al levantar el cadáver se generaron momentos de flexión en sentido lateral con brazos de palanca de 80 cm de largo, por lo que la prótesis fue demandada en su punto más vulnerable con una fuerza de aproximadamente 588 N. Con la rotación, flexión y extensión forzadas, la estabilidad se conservó y no se visualizó movimiento del implante. Se colocó el dispositivo en una mujer de 50 años con cáncer metastásico de tiroides que afectaba L3. El dolor mejoró en el postoperatorio inmediato, así como su función motora que le permitió caminar con una columna estable e indolora por siete años. No se observó fracaso del implante. Conclusión: la función dual de jaula y placa integrada en la prótesis de cuerpo vertebral establece una ventaja mecánica comparada con la función de la jaula y de la placa separadamente, ya que el diseño de la prótesis permite aplicar fuerza axial y fijación lateral al mismo...

Devido aos resultados clínicos não satisfatórios com instrumentações posteriores nos casos de tumor vertebral e às carências econômicas dos nossos pacientes para adquirir os sistemas disponíveis no mercado, foi desenhada uma prótese de corpo vertebral para estabilizar a coluna depois de uma corpectomia. Objetivo: descrever as características estruturais e funcionais da prótese JR, as provas biomecânicas no cadáver e a técnica cirúrgica no paciente. Métodos: primeiro foi realizado um estudo anatômico detalhado dos corpos vertebrais. Obteve-se o desenho de um dispositivo modular, anatômico e expansível. Seus componentes uma vez ensamblados fazem um implante com função dual de jaula e placa lateral expansível. Posteriormente, realizou-se um ensaio de propriedades biomecânicas em cadáver e se implantou um dispositivo num paciente com metástase no corpo vertebral. Resultados: as radiografias que foram tiradas do cadáver, posterior à colocação do implante não mostraram perda da fixação. Ao levantar o cadáver se geraram momentos de flexão no sentido lateral com braços de palanca de 80 cm de longitude, neste caso a prótese foi desafiada no seu ponto mais vulnerável com uma força de aproximadamente 588 N. Com a rotação, flexão e extensão forçadas, a estabilidade se conservou e não foram visualizados movimentos do implante. Colocou-se o dispositivo numa mulher de 50 anos com câncer metastático de tiroides que afeitava L3. A dor melhorou nos pós-operatório imediato, assim como sua função motora, a qual permitiu que a paciente caminhasse com uma coluna estável e indolor por sete anos. Não se observou fracasso do implante. Conclusão: a função dual de jaula e placa integrada na prótese de corpo vertebral estabelece uma vantagem mecânica comparada com a função de jaula e placa separadamente, uma vez que o desenho da prótese permite aplicar força axial e fixação lateral ao mesmo tempo, por meio de um só implante. Os resultados da colocação...

Due to the unsatisfactory results obtained with posterior instrumentations in cases of vertebral tumors and to the economical limitations of our patients for acquiring the systems available in the market, a vertebral body prosthesis to stabilize the spine after corpectomy was designed. Objective: to describe the structural and functional characteristics of the JR prosthesis, the biomechanical assays in cadaver and the surgical technique on the patient. Methods: firstly, it was performed a detailed anatomical study of the vertebral bodies. A design of a modular, anatomical and expandable device was obtained. Its components once assembled make an implant with expandable cage and plate dual function. Afterwards, a biomechanical assay was performed in a cadaver and the device was implanted in a patient with vertebral body metastasis. Results: the radiographs extracted from the cadaver after implant location did not show loss of fixation. When the cadaver was raised, flexion moments were generated laterally with levers 80 cm long; therefore, the prosthesis was demanded in its most vulnerable point with a force of approximately 588 N. With rotation, flexion and extensions forced, stability was preserved and no movement was observed. The device was implanted in a 50-year-old woman with metastatic thyroid cancer affecting L3. Pain improved in the postoperative immediate, as well as its motor function, which allowed her to walk with a stable and painless spine for seven years. No implant failure was observed. Conclusion: the dual cage function and plate integrated in a single device offers a mechanical advantage, compared with the cages and plates used separately, since the prosthesis design permits to apply a distraction axial force with lateral fixation at the same time, through one implant. The results of the implant placement in the patient were satisfactory.

Bronquioalveolitis alérgica extrínseca: reporte de un caso de difícil diagnóstico / Bronchioalveolitis extrinsic allergic: a case report of difficult diagnosis

Bronquioalveolitis alérgica extrínseca, conocida también como Neumonitis por hipersensibilidad, se refiere a la inflamación de los pulmones causada por repetidas inhalaciones de sustancias extrañas, tales como: polvos organicos, hongos o moho. El sistema inmunológico reacciona ante éstas sustancias llamadas antigenos, formando anticuerpos. La reacción antígeno-anticuerpo produce una neumonitis inflamatoria aguda (reacción de hipersensibilidad), la cual con el tiempo puede desarrollar una enfermedad pulmonar crónica, disminuyendo la capacidad de los pulmones de tomar el oxígeno del ambiente y eliminar dióxido de carbono. Se presenta el caso de un preescolar masculino de cinco años, procedente del llano (Edo. Apure), que habita en zona campestre húmeda cercana a riachuelo, convive con animales: ganado vacuno, aves de corral (pollos y gallinas), y perros. Tosedor desde el primer año de edad, tratado de manera empírica con tomas de kerosene en "infundia" de gallina en cada episodio de tos, con relativa mejoría. Es ingresado por presentar de cuatro días de evolución tos y leve dificulad respiratoria, además de fiebre en los últimos dos días. Llamó la atención de la radiología de tórax, la presencia de un patrón alvéolointersticial bilateral difuso, por lo cual se pensó en primera instancia en una enfermedad instersticial de tipo micronodular bilateral de probable etiología infecciosa: TBC vs. Micosis pulmonar, o una probable Neumonía Lipoidea, por lo cual se inician estudios. Se realizan pruebas de inmunidad celular, negativas para histoplasmosis y paracoccidiosis; PPD 13 mm. Pruebas de inmunidad humoral: serológia para hongos, cultivo micológico de sangre y contenido gástrico negativos, entre otras. Se solicitan antígenos aviarios en sangre. Para tuberculosis existían datos sugerentes dados por PPD (+), engrosamiento hilial bilateral en Rx simple de tórax, no corroborado en TAC de tórax, además de una prueba terapéutica negativa. Luego de los resultados iniciales.

[Identification of antigens of Colombian Giardia duodenalis isolates recognized by total IgG and subclasses]. / Identificación de antígenos de aislamientos colombianos de Giardia duodenalis reconocidos por IgG total y subclases.

Antigen profiles were described for Giardia duodenalis cysts and trophozoites that are recognized by IgG and its anti-G. dudodenalis subclasses (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4). Antigens were identified by Western blot from G. duodenalis cyst and trophozoite isolates. Cysts and trophozoites were each subjected to protein separation by SDS-PAGE. The proteins were then transferred to nitrocellulose membranes by electroimmunoblot, and their antigenicity was determined by exposing them to sera from patients with confirmed diagnosis of G. duodenalis infection. The antigen-antibody reaction was revealed by specific alkaline phosphatase antibody conjugates against IgG, IgG2, IgG3, IgG4: bands were visualized by addition of the substrate 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-phosphate and the stain nitro blue tetrazolium. The bands were read and analyzed by linear regression using Quantity One software. Thirty two antigens were simultaneously recognized by total IgG anti-G. duodenalis in the cyst and trophozoite stages. The antigens varied in molecular weight from 22 to 185 kDa. Nineteen antigens were identified by both IgG, and IgG3 anti-G duodenalis, with molecular weights ranging from 42 to 180 kDa. IgG2 and IgG4 did not identify any antigen in either stage. The antigens of molecular weights 27, 30, 31, 33, 45, 49, 57, 78, 89 and 170 kDa are shared with G. duodenalis isolates from other geographical regions of Colombia. The recognition of cyst and trophozoite antigens of Colombian G. duodenalis isolates by IgG, IgG1 and IgG3 anti-G. duodenalis suggested that they are involved in the induction of the host immune response.

[Identification of cyst and trophozoite antigens from Colombian Giardia duodenalis isolates recognized by IgA]. / Identificación de antígenos de quistes y trofozoítos de aislamientos colombianos de Giardia duodenalis reconocidos por IgA.

Little is known about the role of IgA in the immune response against Giardia duodenalis infection. The current study identified the antigens of Colombian G. duodenalis isolates which stimulate the production of IgA anti-G. dudoenalis. Cyst and trophozoite stage proteins were separated by SDS-PAGE and their antigenicity was determined by Western blot. Without 2-mercapto ethanol (2-ME), the protein profile of the cyst stage showed 24 proteins within a molecular weight range of 23-270 kDa; with 2-ME, 35 polypeptides ranging from 22 to 241 kDa were distinguished. The trophozoite stage protein profile without 2-ME was formed by 16 proteins within the range of 24-270 kDa; with 2-ME, 45 proteins were present between 18 and 241 kDa. The identification of 20 and 29 antigens from the cyst and trophozoite stage, respectively, suggested that G. duodenalis stimulates a specific humoral immune response in the human host. The antigens of 31, 57, 110, 133, and 170 kDa recognized by anti-G duodenalis IgA in both cysts and trophozoites corresponded with G. duodenalis isolates from other geographic regions, whereas those of 35, 38, 43, 45, 49, 52, 60, 62, 65, 72, 82, 99, 145, 155, and 185 kDa seemed specific to Colombian isolates. This indicated that antigens of 57, 65, 145, and 170 kDa, recognized by anti-G. duodenalis IgA antibodies in cysts (with frequencies between 82% and 96%) and trophozoites (with frequencies between 86% and 97%) can be considered identification markers for G. duodenalis infections.

Identificación de antígenos de aislamientos colombianos de Giardia dudenalis reconocidos por IgG total y subclases / Antigen identification of Giardia duodenalis Colombian isolates recognized by total IgG and it subclasses

Se conocen investigaciones realizadas sobre la respuesta inmune humoral en giardiosis. Sin embargo, estudios sobre perfiles de antígenos de quistes y de trofozoítos de Giardia duodenalis reconocidos por IgG y subclases (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) anti-G. duodenalis no se han realizado en la misma magnitud. Con el fin de determinar los antígenos de los aislamientos colombianos de G. duodenalis reconocidos por IgG y sus subclases anti-G. duodenalis, se utilizó la metodología de Western blot. Quistes y trofozoítos del parásito, independientemente, se sometieron a separación de proteínas mediante SDS-PAGE. Las proteínas separadas fueron transferidas a membrana de nitrocelulosa mediante inmunoelectrotransferencia y su antigenicidad determinada confrontando éstas con IgG y sus subclases anti-G. Duodenalis presentes en el suero de pacientes con giardiosis comprobada parasitológicamente. La unión antígeno-anticuerpo se detectó con conjugados anti-inmunoglobulina específicos unidos a fosfatasa alcalina, la cual permitió evidenciar los polipéptidos antigénicos cuando se adicionó el sustrato 5-bromo-4-cloro-3-indolil-fosfato/azul de nitrotetrazolio. Se leyeron y analizaron las bandas mediante análisis de regresión lineal, utilizando el programa Quantity One(c). Se reconocieron 32 antígenos, simultáneamente en quistes y trofozoítos de aislamientos colombianos del parásito por IgG total anti-G. duodenalis, que oscilaron entre 22-185 kDa y 19 en un rango de 42 a 180 kDa, reconocidos tanto por IgG1 como por IgG3 anti-G. duodenalis. Las IgG2 e IgG4 anti-parásito no reconocieron antígenos en ninguno de los dos estadios. Los antígenos de 27, 30, 31, 33, 45, 49, 57, 78, 89 y 170 kDa son compartidos con aislamientos de G. duodenalis circulantes en otras regiones geográficas. El reconocimiento de antígenos de quistes y trofozoítos de los aislamientos colombianos de G. duodenalis por IgG, IgG1 e IgG3 anti-G. duodenalis de pacientes infectados sugiere que los antígenos del par sito originan respuesta inmune humoral en el hospedero.

Identificación de antígenos de quistes y trofozoitos de aislamientos colombianos de Giardia duodenalis reconocidos por IgA / Cyst and trophozoite antigen identification in Colombian Giardia duodenalis isolates recognized by IgA

Se conoce poco acerca del papel de la IgA en la respuesta inmune de la giardiosis. El propósito de este trabajo fue identificar los antígenos estimuladores de la producción de IgA anti-Giardia duodenalis de aislamientos colombianos del par sito. Se realizó separación de proteínas de quistes y trofozoítos mediante SDS-PAGE y su antigenicidad se determinó por electroinmunotransferencia. El perfil de proteínas de quistes mostró 24 proteínas en un rango de 23-270 kDa sin 2-mercaptoetanol (2-ME) y 35 polipéptidos en un rango de 22-241 kDa con 2-ME. Los trofozoítos revelaron 16 proteínas en un rango de 24-270 kDa sin 2-ME y 45 proteínas en un rango de 18-241 kDa con 2-ME. La identificación de 20 y 29 antígenos en quistes y trofozoítos de G. duodenalis, respectivamente, permite sugerir que los aislamientos colombianos de G. duodenalis pueden inducir una respuesta inmune humoral específica en el hospedero. Los antígenos de 31, 57, 110, 133 y 170 kDa reconocidos por IgA anti-Giardia simultáneamente en quistes y trofozoítos son compartidos con aislamientos de Giardia circulantes en otras regiones geográficas mientras que los de 35, 38, 43, 45, 49, 52, 60, 62, 65, 72, 82, 99, 145, 155 y 185 kDa son específicos de los aislamientos colombianos. Esto sugiere que los antígenos de 57, 65, 145 y 170 kDa, reconocidos por IgA anti-G. duodenalis en quistes (frecuencias entre 82 por ciento y 98 por ciento) y trofozoítos (frecuencias entre 86 por ciento y 97 por ciento), podrían ser los más indicativos de infección.

Traumatismo torácico: incidencia, causas y complicaciones en el Hospital Central de San Cristobal Dr. José María Vargas: período enero 1998-diciembre 2002 / Thoracic trauma: causes complications incidence in the Central Hospital of San Cristobal Dr. José María Vargas period january 1998-december 2002

En este trabajo se presenta una revisión de 5 años (1998-2002) de los pacientes con diagnóstico de traumatismo, ingresados al servicio de Cirugía General del Hospital Dr. José María Vargas de San Cristobal, estado Táchira, cuyo propósito fue determinar y asociar causas y complicaciones más frecuentes, tipo de tratamiento y mortalidad e incidencia anual de los casos estudiados. Para tal fin, se diseño un estudio descriptivo, transversal y retrospectivo, el cual reporto un total de 97 pacientes, 81 casos del sexo masculino (83,50 por ciento) y 16 casos del sexo femenino (16,50 por ciento). El grupo etáreo más afectado fue el de 21 a 30 años (62,26 por ciento). En la mayoría de los casos el traumatismo torácico fue penetrante (48,45 por ciento) y los agentes causales más frecuentes fueron: accidentes de tránsito con 34 casos (35,05 por ciento), caídas de grandes alturas con 30 casos (30,92 por ciento) y arrollamiento 14 casos (14,43 por ciento). Se presentaron complicaciones propias del traumatismo torácico representadas por lesiones de la pared torácica, con mayor frecuencia de fracturas costales (43,29 por ciento), lesiones de la cavidad pleural, predominando el hemoneumotorax (7,21 por ciento), lesiones pulmonares que destacan la contusión pulmonar (6,18 por ciento) y lesión diafragmática (2,06 por ciento). En la mayoría de los pacientes el tratamiento fue médico de sostén (77,31 por ciento). sólo 17 casos ameritó procedimiento quirúrgico de toracotomía con manejo en UCI 2 casos (2,06 por ciento) ameritaron laparotomía exploradora. Se reportaron dos muertes por traumatismo torácico que ameritaron ingreso a la unidad de cuidados intensivos, en el período estudiado en nuestro hospital. El mayor número de casos ocurrió en el año 2002. En la relación causas y complicaciones del trauma torácico, se demuestra que cualquier mecanismo de producción puede originar complicaciones asociadas siendo imperante el conocimiento del mecanismo de lesión, para disertar sobre lesiones específicas y de enorme importancia en su manejo inicial

Serodiagnóstico de giardiosis: identificación de inmunoglobulina G anti-Giardia duodenalis en suero mediante ELISA / Serodiagnosis of giardiasis: identification of immnunoglobulin G anti-Giardia duodenal in sera by ELISA

El diagnóstico de la infección por Giardia duodenalis se basa en la identificación de quistes o trofozoítos en materia fecal, alcanzado una sensibilidad máxima de 85 por ciento en muestras seriadas, debido a la excreción intermitente de quistes. Aunque la determinación de anticuerpos no permite diferenciar entre una infección pasada y una reciente, sí podría ayudar en el diagnóstico diferencial. El presente estudio tuvo como objetivo estandarizar y evaluar una prueba inmunoenzimática (ELISA) para la detección de anticuerpos tipo IgG anti-Giardia duodenalis en sueros de pacientes con la infección. La preparación del antígeno se hizo a partir de trofozoitos cultivados que, inicialmente, fueron obtenidos del intestino de gerbils (Meriones unguiculatus) infectados experimentalmente con quistes purificados a partir de muestras positivas de materia fecal humana. Para la estandarización y evaluación de la prueba, se emplearon 60 sueros de pacientes con giardiosis comprobada parasitológicamnte ( muestra positivas) y 47 sueros de cordon umbilical recién cortado (muestras negativas). Como conjugado, se utilizó anti-IgG humana ligada a osfatasa alcalina. La concentración óptima de antígeno de trofozoito de G. duodenalis fue de 15µg/ml y las diluciones óptimas de suero y conjugado fueron de 1:25 y 1:400, respectivamente. El valor del punto de corte (absorbancia) fue 0,300. Los parámetros de la prueba fueron: sensibilidad, 98,3 por ciento (intevalo de confianza de 95 por ciento (IC 95 por ciento): 89,9 por ciento - 99,9 por ciento); especificidad, 95,7 por ciento (IC 95 por ciento: 84,3 por ciento - 99,3 por ciento); valor predictivo positivo, 96,7 por ciento (IC 95 por ciento: 87,6 por ciento - 99,4 por ciento), y el valor predictivo negativo, 97, 8 por ciento (IC 95 por ciento: 87,0 por ciento - 99,9 por ciento). La prueba de ELISA descrita contribuirá a mejorar el diagnóstico de giardiosis y podrá ser empleada para estudios epidemiológicos de seroprevalencia