Expression analysis of tumor-related genes involved in critical regulatory pathways in schwannomas

PURPOSE: Gene expression array analysis is providing key data on the potential candidate genes and biological pathways involved in schwannoma origin and development. In this way we performed expression array studies on tumor-related genes in schwannomas. METHODS: The GE Array Q Series HS-006 (SuperArray, Bethesda, MD, USA) was used to determine the expression levels of 96 genes corresponding to 6 primary biological regulatory pathways in a series of 23 schwannomas. RESULTS: We identified 15 genes down-regulated, primarily corresponding to signal transduction functions, and 26 genes up-regulated, most frequently involving cell adhesion functions. CONCLUSIONS: In addition to the NF2 inactivation (considered as an early step), variations of other biological regulatory pathways might play a key role in schwannoma (AU)

Identificación de alteraciones genéticas en oligodendrogliomas mediante amplificacióndependiente de ligasa de múltiples sondas (MLPA) (multiple ligationdependentprobe amplification) / Identification of genetic alterations by multiple ligation- dependent probe amplification (MLPA) analysis in oligodendrogliomas

La alteración genética más frecuente en oligodendrogliomases la pérdida conjunta de lp/19q. Este eventoya acontece en etapas primarias del desarrollo deestos tumores. Es de gran valor clínico conocersi dichos tumores poseen esta deleción ya que seha correlacionado con un mejor pronóstico de lospacientes. Además de esta alteración. también se haobservado la deleción de CDKN2A y PTEN y la amplificaciónde EGFR; estos cambios parecen asociarse auna mayor agresividad tumoral. Mediante la técnicade MLPA en una misma reacción podemos determinarsi existe pérdida de lp/19q y deleciones/amplificacionesde los genes anteriormente mencionados en el ADNprocedente de muestras tumorales. En este trabajohemos analizado 40 oligodendrogliomas y el kit MLPAP088 para determinar el estado alélico de lp/19q, asícomo el kit MLPA P105 para observar la amplificación/deleción de los genes CDKN2A, PTEN, ERBB2, TP53 yEGFR. Mostraron pérdida de 1p el 45% de los tumores(18/40) y el 65% (26/40) de los oligodendrogliomaspresentaron deleción de las sondas que hibridan en lasregiones de 19q. Para el kit MLPA P105, mostraronduplicación/deleción de EGFR en el 7,5% (3/41) y 35%(14/40) de las muestras, respectivamente. El 60% de loscasos (24/40) mostraron deleción de CDKN2 y ningunamuestra presentó duplicación de las sondas para estegen. El gen ERBB2 se presentó duplicado en el 12,5%de los tumores (5/40) y un único tumor mostró pérdidasde dicho gen. El 30% (12/40) de las muestras presentódeleción para PTEN y el 12,5% (5/40) mostró duplicaciónde dicho gen y, por último, 12,5% de los casos(5/40) presentaron duplicaciones de TP53. Estos resultadosindican que la técnica de MLPA es idónea para laidentificación de las alteraciones moleculares característicasde oligodendrogliomas. Estas alteraciones estaríancontribuyendo a la formación del tumor, siendola anomalía más significativa en oligodendrogliomas la (...) (AU)

Concurrent deletion at 1p/19q is a common signatureof oligodendrogliomas, and it may be identified inlow-grade tumours (grade II) suggesting it representsan early event in the development of these brain neoplasms.Additional non-random changes primarilyinvolve CDKN2A, PTEN and EGFR. Identification ofall of these genetic changes has become an additionalparameter in the evaluation of the clinical patients' prognosis, including good response to conventional chemotherapy.Multiple ligation-dependent probe amplification(MLPA) analysis is a new methodology thatallows an easy identification of the oligodendrogliomas'abnormalities in a single step. No need of the respectiveconstitutional DNA from each patient is anotheradvantage of this method. We used MLPA kits P088and P105 to determine the molecular characteristics ofa series of 40 oligodendrogliomas. Deletions at l p and19q were identified in 45% and 65% of cases, respectively.Alterations of EGFR, CDKN2A, ERBB2, PTENand TP53 were also identified in variable frequenciesamong 7% to 35% of tumours. These findings demonstratethat MLPA is a reliable technique to the detectionof molecular genetic changes in oligodendrogliomas (AU)

Expresión de Oncogenes y Oncosupresores en Meningiomas / Oncogenes and Tumor Suppressor Genes Expression

Los meningiomas son tumores compuestos por células neoplásicas de la capa aracnoide y constituyen aproximadamente el 20% de todos los tumores intracraneales primarios. Hemos estudiado en una serie de meningiomas los niveles de expresión de 96 genes asociados con vías biológicas específicas relacionadas con cáncer. Para ello hemos usado membranas de microarray de expresión validadas por PCR cuantitativa. El estudio se completó con la búsqueda de la pérdida del gen NF2, principal candidato en la génesis de meningiomas, por medio de una amplificación múltipledependiente de ligasa (MLPA). El 78% de las muestras presentó deleción de un alelo del gen NF2. No se encontró ninguna relación significativa entre genes específicos y la pérdida de NF2 encontradas por MLPA. El análisis de expresión por microarray identificó 4 genes con expresión significativamente menor (BAD, BAX, FOS y TNFRSF25) y uno con expresión significativamente mayor (ITGAV) en las muestras de meningioma comparado con las correspondientes expresiones en los controles de meninge no tumoral. La expresión incrementada del gen ITGAV ha sido ya descrita en meningiomas. Por otro lado, la expresión significativamente menor de los genes BAD, BAX, FOS y TNFRSF25, es descrita en este trabajo por primera vez para este tipo tumoral. Estudios específicos para cada gen o sus interacciones aportarán mayor conocimiento sobre los procesos de transformación neoplásica y progresión tumoral en meningiomas

Meningiomas are tumors arising from aracnoid layer cellsand make up 20% of all intracranial tumours. We havestudied in a series of meningiomas the expression levelsof 96 genes associated with specific biological cancer related pathways. We have used expression microarrays validated by quantitative PCR. The study was completed with the search for losses in the NF2 gene, main candidate in the genesis of meningiomas, using multiplex ligase-dependent polymerase amplification (MLPA). 78% of the samples showed deletion for one copy of the NF2 gene. We have not found significant relation between specific genes and the loss of NF2 found by MLPA. The expression analysis by microarray identified 4 genes with significant decreased expression (BAD, BAX, FOS and TNFRSF25) and one with significant increased expression (ITGAV) in the samples of meningioma compared with the corresponding expressions in the controls from non-tumoral cerebral meninges. Increased expression of ITGAV gene has been already described in meningiomas. On the other hand, the significant decreased expression of BAD, BAX, FOS and TNFRSF25 is described in this work for the first time in meningiomas. Specific studies for each gene or its interactions will contribute to a better understanding on the processes of neoplastic transformation and progression in meningiomas

Biología molecular de los glioblastomas / Biology molecular of glioblastomas

La formación de los glioblastomas es muy diversa, pudiendo presentarse de “novo” o provenir de recidivas de astrocitomas que van progresando hacia mayores grados de malignidad. La alteración molecular más frecuente que se encuentra en estos tipos tumorales es la pérdida de heterocigocidad del cromosoma 10en el que se han identificado varios genes supresores de tumores. Las vías genéticas TP53/MDM2/ P14arf yCDK4/RB1/P16ink4 implicadas en división celular, se encuentran desreguladas en la mayoría de los gliomas así como los genes que promueven la división celular, entre ellos EGFR. Por último el aumento de factores decrecimiento y angiogénicos también está involucrado en el desarrollo de estos tipos tumorales. Uno de los objetivos de la biología molecular en tumores de estirpeglial es intentar encontrar marcadores o alteraciones genéticas que permitan abordar mejor la clasificación de los glioblastomas, su evolución y pronóstico así como su tratamiento. La diversidad y la cantidad de las alteraciones moleculares presentes en glioblastomas probablemente sea el motivo por el que todavía no se han encontrado fármacos efectivos para combatirlos. En la actualidad, con la aparición de nuevas técnicas de biología molecular, se puede intentar individualizar y clasificara los pacientes en función de su expresión génica. Esto abre una ventana esperanzadora a la aparición de nuevos fármacos que tengan como diana exclusiva a los genes y/o proteínas alterados de las células tumorales en función de su patrón de expresión génica individualizado para cada tumor. En este artículo revisamos los mecanismos moleculares más frecuentes en la patogénesis de los glioblastomas

Glioblastomas, the most frequent and malignant human brain tumors, may develop de novo (primaryglioblastoma) or by progression from low-grade or anapalsic astrocytoma (secondary glioblastoma). The molecular alteration most frequent in these tumor like types is the loss of heterozygosity on chromosome 10,in wich several genes have been identified as tumors suppressor. The TP53/MDM2/P14arf and CDK4/RB1/P16ink4 genetic pathways involved in cycle control are deregulated in the majority of gliomas as well as genes that promote the cellular division, EGFR. Finally the increase of growth and angiogenics factors is also involved in the development of glioblastomas. One of the objetives of molecular biology in tumors of glial an cestryis to try to find the genetic alterations that allow to approach better the classification of glioblastomas, its evolution prediction and treatment. The new path molecular classification of gliomas should improve the old one, especially being concerned about the oncogenesis and heterogenity of these tumors. It is desirable that this classification had clinical applicability and integrates new molecular findings with some known histological features with prognostic value. In this paper we review the most frequent molecular mechanisms involved in the patogenesis of glioblastomas