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2.
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-214216

RESUMO

The diagnosis of Lyme borreliosis (LB) is based on the epidemiological history, clinical manifestations and microbiological findings in the early disseminated and late phases of the disease. Related to this fact, microbiological diagnostic techniques have recently appeared. Far from facilitating the diagnosis and the clinical-therapeutic management of LB patients, they are generating confusion. Herein, experts and representatives of Spanish Scientific Societies [Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology (SEIMC), Spanish Society of Neurology (SEN), Spanish Society of Immunology (SEI), Spanish Society of Pediatric Infectology (SEIP), Spanish Society of Rheumatology (SER), and Spanish Academy of Dermatology and Venereology (AEDV)] exposed the executive summary after reviewing the epidemiology, clinical spectrum, available diagnostic techniques for the diagnosis of Borrelia burgdorferi infection, therapeutic and prevention options of LB. By consensus, recommendations for microbiological diagnosis are offered together with those supporting the therapeutic management and prophylaxis of infection.(AU)


El diagnóstico de la borreliosis de Lyme (BL) se basa en la historia epidemiológica, las manifestaciones clínicas y los hallazgos microbiológicos de las etapas temprana diseminada y tardía de la enfermedad. En relación a este hecho, han aparecido recientemente técnicas diagnósticas microbiológicas que, lejos de facilitar el diagnóstico y el manejo clínico-terapéutico de los pacientes con BL, están generando confusión. Por ello, los expertos y representantes de las sociedades científicas españolas [Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica (SEIMC), Sociedad Española de Neurología (SEN), Sociedad Española de Inmunología (SEI), Sociedad Española de Infectología Pediátrica (SEIP), Sociedad Española de Reumatología (SER) y Academia Española de Dermatología y Venereología (AEDV)] han presentado el documento de síntesis tras revisar la epidemiología, el espectro clínico, las técnicas disponibles para el diagnóstico de la infección por Borrelia burgdorferi, así como las opciones terapéuticas y preventivas de BL. De manera consensuada, se ofrecen recomendaciones para el diagnóstico microbiológico, así como recomendaciones que respaldan el manejo terapéutico y la profilaxis de la infección.(AU)


Assuntos
Humanos , Doença de Lyme , Consenso , Borrelia burgdorferi , Microbiologia , Espanha , Doenças Transmissíveis
6.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 532-538, dic. 2022. tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-212836

RESUMO

Introducción: En España, al igual que en otros países donde el sarampión endémico ha sido eliminado, es necesario utilizar de forma rutinaria las herramientas diagnósticas que confirmen los casos para su prevención y control de la diseminación. Se describen los diferentes ensayos microbiológicos utilizados para su diagnóstico durante un brote de sarampión en 2019 en la provincia de Guadalajara (España). Métodos: Las pruebas serológicas y moleculares se realizaron en el laboratorio de Microbiología del Hospital Universitario de Guadalajara y en el Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III (Majadahonda, España). Los datos de los pacientes se obtuvieron del sistema epidemiológico de vigilancia. Resultados: Se diagnosticaron de sarampión un total de 43 pacientes por métodos microbiológicos: 29 casos por PCR (exudado faríngeo u orina) junto con IgM específica positiva, 11 pacientes solamente por PCR, y 3 pacientes exclusivamente por presencia de IgM. El genotipo D8 fue identificado en 35 pacientes y el genotipo A en 2 casos descartados como postvacunal. La PCR en suero fue positiva en 11 de 14 pacientes con ausencia de IgM en su primera muestra recogida de suero. Once casos confirmados habían recibido una o 2 dosis de la vacuna. Doce adultos fueron ingresados, todos diagnosticados de hepatitis. Conclusiones: La combinación de pruebas moleculares y la presencia de IgG e IgM específicas son necesarias para un diagnóstico correcto y la clasificación de los pacientes como fallo vacunal (primario o secundario). El genotipado es una herramienta fundamental para la correcta clasificación de los pacientes en el contexto de un programa de eliminación del sarampión.(AU)


Introduction: In Spain, like in other countries where endemic measles has been eliminated, there is a need for available diagnostic tools for confirming any cases in order to prevent and control its transmission. We describe the different microbiological tests used for the diagnosis of measles during an outbreak that occurred in 2019 in the province of Guadalajara (Spain). Methods: Serological and molecular tests were performed at the Microbiology laboratory of the Guadalajara University Hospital and at the National Center for Microbiology of the Carlos III Health Institute (Majadahonda, Spain). Patient data were obtained from the surveillance system. Results: A total of 43 patients had a laboratory diagnosis of measles: 29 cases by PCR (pharyngeal exudate or urine) and positive specific IgM, 11 cases by PCR, and 3 cases only by a positive IgM. Genotype D8 was identified in 35 confirmed cases and genotype A in 2 that were discarded as post-vaccination cases. PCR was positive in the acute sera of 11 out of 14 patients with a negative IgM. Eleven confirmed cases had recieved one or 2 vaccine doses. Twelve adult patients were hospitalizated, all of them with a diagnostic of hepatitis. Conclusions: The combination of molecular tests and the presence of specific IgG and IgM are necessary for a correct diagnosis of measles and also to classify patients with a breakthrough infection or vaccine failures (primary or secondary). Genotyping is essential for the correct classification of the patients in the context of a measles elimination program.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Sarampo , Vírus do Sarampo , Testes Sorológicos , Hepatite , Vacinas , Espanha , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
7.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 539-545, dic. 2022. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-212837

RESUMO

Background: Infections related to non-surgical manipulation of the biliary tract (NSMBT) are common events despite periprocedural antibiotic prophylaxis (PAP). Since June 2017, our local protocol has indicated a 24-h regimen of intravenous piperacillin–tazobactam for this purpose. Objective: We aimed to describe the incidence and characteristics of NSMBT-related paediatric infections, define risk factors for their development, and analyse adherence to our PAP protocol. Materials and methods: Epidemiological, clinical, and microbiological data were collected in consecutive NSMBT procedures performed in paediatric patients (<18 years) in our centre (2010–2019). Results: 113 procedures in 37 patients, median age 4 years (IQR 1–8), were included. Main underlying diseases were biliary atresia (32%) and cancer (14%). Sixty-eight percent had undergone liver transplant and 70% hepaticojejunostomy. In 44 procedures (39%), the intervention was performed during the course of infection and previously prescribed antibiotic treatment was maintained. In the other 69, PAP was specifically indicated for NSMBT; antibiotic adequacy increased from 35% to 100% after June 2017. In total, 32 NSMBT-related infections (28%) occurred, mainly in the first 24h post-procedure (72%); no deaths happened. Causative pathogens were Gram-negative rods (64%), Gram-positive cocci (28%), and Candida spp. (8%). Main related risk factors were hepaticojejunostomy, biliary obstruction, and liver transplant. Conclusions: NSMBT in children entails a significant infection risk, even under antibiotic prophylaxis, being hepaticojejunostomy the main risk factor. Infectious complications mainly occurred immediately after the procedure. After establishing a PAP protocol, 100% of interventions received appropriate prophylaxis, decreasing antibiotic exposure time and potentially, the length of hospital stay.(AU)


Antecedentes: Las infecciones relacionadas con la manipulación no quirúrgica de las vías biliares (MNQVB) son acontecimientos frecuentes, a pesar de la profilaxis antibiótica periprocedimiento (PAP). Desde junio de 2017, nuestro protocolo local indica una pauta de 24 h de piperacilina/tazobactam por vía intravenosa para este fin. Objetivo: El objetivo era describir la incidencia y las características de las infecciones pediátricas relacionadas con la MNQVB, definir los factores de riesgo para su desarrollo y analizar el cumplimiento de nuestro protocolo de PAP. Materiales y métodos: Se recogieron datos epidemiológicos, clínicos y microbiológicos en procedimientos consecutivos de MNQVB realizados en pacientes pediátricos (< 18 años) en nuestro centro (2010-2019). Resultados: Se incluyeron 113 procedimientos en 37 pacientes, con una mediana de edad de 4 años (RIC 1-8). Las principales enfermedades subyacentes fueron atresia biliar (32%) y cáncer (14%). El 68% se había sometido a un trasplante de hígado y el 70% a una hepaticoyeyunostomía. En 44 procedimientos (39%), la intervención se realizó durante el transcurso de la infección y se mantuvo el tratamiento antibiótico recetado previamente. En los otros 69, la PAP estaba indicada específicamente para la MNQVB; la eficacia de los antibióticos aumentó del 35 al 100% después de junio de 2017. En total, se produjeron 32 infecciones relacionadas con la MNQVB (28%), principalmente en las primeras 24 h posteriores al procedimiento (72%); no se produjo ninguna muerte. Los patógenos causantes fueron bacilos gramnegativos (64%), cocos grampositivos (28%) y Candida spp. (8%). Los principales factores de riesgo relacionados fueron la hepaticoyeyunostomía, la obstrucción biliar y el trasplante de hígado.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Criança , Infecções/complicações , Controle de Infecções , Antibioticoprofilaxia , Ductos Biliares , Transplante de Fígado , Colangite , Microbiologia , Doenças Transmissíveis
8.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 546-549, dic. 2022. graf
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-212838

RESUMO

Introduction: A newly identified SARS-CoV-2 variant, VOC202012/01 originating lineage B.1.1.7, recently emerged in the United Kingdom. The rapid spread in the UK of this new variant has caused other countries to be vigilant. Material and methods: We based our initial screening of B.1.1.7 on the dropout of the S gene signal in the TaqPath assay, caused by the 69/70 deletion. Subsequently, we confirmed the B.1.1.7 candidates by whole genome sequencing. Results: We describe the first three imported cases of this variant from London to Madrid, subsequent post-arrival household transmission to three relatives, and the two first cases without epidemiological links to UK. One case required hospitalization. In all cases, drop-out of gene S was correctly associated to the B.1.1.7 variant, as all the corresponding sequences carried the 17 lineage-marker mutations. Conclusion: The first identifications of the SARS-CoV-2 B.1.1.7 variant in Spain indicate the role of independent introductions from the UK coexisting with post-arrival transmission in the community, since the early steps of this new variant in our country.(AU)


Introducción: Recientemente, ha surgido en Reino Unido una nueva variante de SARS-CoV-2, VOC202012/01, que origina el linaje B.1.1.7. Su rápida distribución en Reino Unido ha alertado a otros países a vigilar su presencia. Material y métodos: El rastreo inicial de la variante B.1.1.7 se basó en la ausencia de amplificación del gen S en el ensayo TaqPath, causado por la deleción 69/70. Todos los casos candidatos de corresponder a la variante B.1.1.7 con este criterio fueron posteriormente confirmados por secuenciación de genoma completo. Resultados: Describimos los primeros 3 casos importados de esta variante, desde Londres hasta Madrid, con la posterior transmisión domiciliaria de uno de estos casos a 3 familiares y, adicionalmente, los 2 primeros casos con la variante sin vínculo epidemiológico con Reino Unido. Uno de los casos requirió hospitalización. En todos los casos el criterio de no amplificación del gen S identificó con precisión la variante B.1.1.7, como demostró posteriormente la presencia de las 17 mutaciones marcadoras de este linaje. Conclusión: Las primeras identificaciones de la variante B.1.1.7 de SARS-CoV-2 indican un papel solapante de las introducciones independientes desde Reino Unido, con eventos de transmisión comunitaria, incluso desde los primeros momentos de la presencia de esta variante en nuestro país.(AU)


Assuntos
Humanos , Vírus da SARS , Infecções por Coronavirus , Pandemias , Transmissão de Doença Infecciosa , Espanha , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
9.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 550-556, dic. 2022. ilus, tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-212839

RESUMO

Introducción: Aunque el tratamiento antirretroviral (TAR) del VIH/sida se introdujo en 1987, la mejora en la progresión de la enfermedad y reducción de la mortalidad poblacional no se observó sino hasta 1996, con la combinación de tres o más fármacos. El objetivo fue estimar el beneficio clínico y económico del TAR en España en el periodo de 32 años, comprendido entre 1987 y 2018. Métodos: Se realizó un análisis de coste-beneficio mediante la simulación de Monte Carlo de segundo orden, desde las perspectivas de la sociedad (caso base) y el Sistema Nacional de Salud (SNS). Los nuevos casos de VIH, sida y muertes relacionadas se obtuvieron de los registros SINIVIH y ONUSIDA, con proyecciones poblacionales sin TAR mediante suavizamiento exponencial triple. El gasto en TAR se obtuvo de informes del Plan Nacional del SIDA y estudios de mercado. Resultados: El SNS invirtió 6.185 millones de euros en 32 años. Durante este periodo se evitaron 323.651 muertes por sida, 500.129 casos de sida y 161.417 casos de VIH, con un ahorro total de 41.997 millones de euros. El beneficio neto (ahorros netos) se estima en 35.812 millones de euros (sociedad) y 1.032 millones de euros (SNS). Por cada euro invertido en TAR, se obtuvo un retorno de la inversión de 6,79 € y 1,16 €, respectivamente. Conclusión: La utilización de TAR durante 32 años ha evitado gran número de muertes y casos de sida y VIH, generando significativos ahorros económicos para el SNS. El TAR es una intervención eficiente para el SNS.(AU)


Introduction: Although antiretroviral therapy (ART) for HIV / AIDS was introduced in 1987, improvement in disease progression and reduction in mortality at a population level was not observed until 1996, with the combination of three or more drugs. The objective was to estimate the clinical and economic benefit of ART in Spain in the 32-year period between 1987 and 2018. Methods: A cost-benefit analysis was performed, using a second-order Monte Carlo simulation, from the societal (base case) and the National Health System (NHS) perspectives. New cases of HIV, AIDS and related deaths were obtained from the SINIVIH and UNAIDS registries, with population projections without ART using triple exponential smoothing. Expenditure on ART was obtained from the National AIDS Plan reports and market studies. Results: The NHS invested 6,185 million euros in 32 years. In that period, 323,651 AIDS-related deaths, 500,129 AIDS cases and 161,417 HIV cases were averted, with total savings of 41,997 million euros. The net benefit (net savings) is estimated at 35,812 million euros (societal) and 1,032 million euros (NHS). For every euro invested in ART, a return on investment of € 6.79 and € 1.16 was obtained, respectively. Conclusion: The use of ART over 32 years prevented a large number of deaths and cases of AIDS and HIV, providing significant economic savings for the NHS. ART is an efficient intervention for the NHS.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , HIV , Antirretrovirais , Análise Custo-Benefício , Síndrome de Imunodeficiência Adquirida , Espanha , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
10.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 557-561, dic. 2022. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-212840

RESUMO

Introducción: La infección congénita por CMV (CMVc) es más frecuente en hijos expuestos al. VIH durante la gestación, con tasas reportadas en la era pre-TAR del 2 al 7%. El control de la carga viral de VIH y la recuperación inmunológica asociada al tratamiento antirretroviral (TAR) podrían ser factores que influyan en su transmisión. El objetivo de este trabajo fue describir la epidemiología de la infección CMVc en recién nacidos expuestos al VIH en el Hospital Universitario 12 de Octubre, entre los años 2000-2017. Material y métodos: Estudio observacional y retrospectivo. Se recogieron variables epidemiológicas y clínicas a través de la historia clínica de los sujetos incluidos. Se realizó análisis estadístico con el programa informático SPSS 24.0. Resultados: Se incluyeron 288 pares de madres/hijos. Observamos una tasa de CMVc del 2,1% (IC 95% 0,7-4,9). Conclusiones: La tasa de CMVc fue menor a la comunicada en la era pre-TAR, aunque aún parece superior a la observada en niños no expuestos al VIH.(AU)


Introduction: Congenital citomegalovirus (CMVc) infection is more common in children exposed to HIV during pregnancy, with reported rates in pre-ART era from 2 to 7%. The use of combined antiretroviral treatment (ARTc) could be a determining factor in reducing this risk of CMV transmission. The aim of this study was to describe the epidemiology of CMVc infection in newborns of HIV-infected mothers at Hospital Universitario 12 de Octubre, Madrid, Spain, from 2000 to 2017. Material and methods: An observational and retrospective study was carried out. Epidemiological and clinical variables were collected. Statistical analysis was performed with the SPSS 24.0 computer program. Results: 288 mother–infant pairs were included in the study. We observed a CMVc rate of 2.1% (95% CI 0.9–4.9). Conclusions: The rate of CMVc in HIV-exposed children observed was lower than that reported in pre-ARTc era but seems higher than those described in general population.(AU)


Assuntos
Humanos , Feminino , Recém-Nascido , Toxoplasmose Congênita , Citomegalovirus , Gravidez , HIV , Epidemiologia , Estudos Retrospectivos , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
11.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(10): 568-571, dic. 2022. ilus
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-212842

RESUMO

Introduction: Here, we propose a novel modified Carba NP test for detecting KPC-producing Enterobacterales using imipenem/relebactam. Material and methods: The test performance was evaluated in a random selection of 160 previously molecularly characterized clinical isolates carrying the 110 blaKPC, 1 blaGES, 12 blaVIM, 4 blaIMP, 3 blaNDM and 42 blaOXA-48-like genes. The proposed method relies on the detection of imipenem hydrolysis in an imipenem/relebactam antibiotic solution and subsequent visual interpretation by color change. Results: All class A producing Enterobacterales (111/111) were detected using imipenem/relebactam as no visual appreciation of color change was perceived due to a nule hydrolysis of imipenem in the antibiotic solution. Overall, the assay showed 100% sensitivity (111/111) and specificity (69/69) for detecting class A KPC-producing Enterobacterales. Discussion: The biochemical assay provides very reliable results for detecting KPC-producing Enterobacterales, with a turnaround time of less than 1 hour, minimum handling and no specialized equipment required.(AU)


Introducción: En este manuscrito proponemos un novedoso ensayo basado en el Carba NP test para la detección de Enterobacterales productoras de KPC utilizando imipenem/relebactam. Material y métodos: La evaluación se realizó en una selección aleatoria de 160 aislados clínicos previamente caracterizados molecularmente que portaban los genes 110 blaKPC, 1 blaGES, 12 blaVIM, 4 blaIMP, 3 blaNDM y 42 blaOXA-48-like. El método propuesto se basa en la detección de la hidrólisis de imipenem en una solución de imipenem/relebactam y posteriormente su interpretación mediante un cambio de color. Resultados: El ensayo tiene una sensibilidad (111/111) y una especificidad (69/69) del 100% para detectar Enterobacterales productoras de KPC, de clase A. Discusión: Este ensayo bioquímico proporciona resultados muy fiables para la detección de Enterobacterales productoras de KPC, con un tiempo de respuesta inferior a 1 h, además de una manipulación mínima y sin necesidad de ningún equipamiento especializado.(AU)


Assuntos
Humanos , Imipenem , Hidrólise , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
19.
Nature ; 612(7941): 714-719, 2022 12.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36477531

RESUMO

Molecular phylogenetics of microbial eukaryotes has reshaped the tree of life by establishing broad taxonomic divisions, termed supergroups, that supersede the traditional kingdoms of animals, fungi and plants, and encompass a much greater breadth of eukaryotic diversity1. The vast majority of newly discovered species fall into a small number of known supergroups. Recently, however, a handful of species with no clear relationship to other supergroups have been described2-4, raising questions about the nature and degree of undiscovered diversity, and exposing the limitations of strictly molecular-based exploration. Here we report ten previously undescribed strains of microbial predators isolated through culture that collectively form a diverse new supergroup of eukaryotes, termed Provora. The Provora supergroup is genetically, morphologically and behaviourally distinct from other eukaryotes, and comprises two divergent clades of predators-Nebulidia and Nibbleridia-that are superficially similar to each other, but differ fundamentally in ultrastructure, behaviour and gene content. These predators are globally distributed in marine and freshwater environments, but are numerically rare and have consequently been overlooked by molecular-diversity surveys. In the age of high-throughput analyses, investigation of eukaryotic diversity through culture remains indispensable for the discovery of rare but ecologically and evolutionarily important eukaryotes.


Assuntos
Eucariotos , Cadeia Alimentar , Microbiologia , Filogenia , Organismos Aquáticos/classificação , Organismos Aquáticos/genética , Organismos Aquáticos/ultraestrutura , Biodiversidade , Ecologia , Eucariotos/classificação , Eucariotos/genética , Eucariotos/ultraestrutura , Células Eucarióticas/classificação , Células Eucarióticas/metabolismo , Células Eucarióticas/ultraestrutura , Comportamento Predatório , Especificidade da Espécie
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