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2.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 353-358, Ago - Sep 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-207357

RESUMO

Background: Chlamydia trachomatis is considered a public health problem due to the high prevalence in sexually active women and men. The distribution of genital Chlamydia genotypes among Mexican men is unknown. Objective: To assess the prevalence of Chlamydia genotypes in men with infertile women as sexual partners. Methods: A total of 659 urine samples were collected from men whose sexual partners were infertile women; the identifying Chlamydia infection was by means of a real-time nucleic acid amplification test (qPCR). OmpA gene PCR-RFLP and sequencing were used to confirm the genotypes of C. trachomatis. The association of genotypes with age, spermatic parameters and gynecological data of sexual partners was further analyzed. Results: Forty-nine urine samples were positive infection (7.4%). The Chlamydia infection was significantly associated with teratozoospermia, azoospermia, hypospermia, and oligozoospermia. Five genotypes (F 51%; 12.2% to D; 12.2% to E; 6.1% to L2 and 4.1% Ia) were correctly identified. None genotypes identified in this comparative study were positively associated with changes in some of the spermatic values because all of them typically produce some considerable damage to these cells. Conclusions: The F genotype was the most frequent genotype identified in infertile men from Mexico City and all genotypes play an important role in the seminal alteration of Mexican men whose female partners are infertile.(AU)


Antecedentes: Chlamydia trachomatis se considera un problema de salud pública debido a la alta prevalencia en mujeres y hombres sexualmente activos. Se desconoce la distribución de los genotipos genitales de Chlamydia entre los hombres mexicanos.Objetivo: Evaluar la prevalencia de los genotipos de Chlamydia en hombres con mujeres infértiles como parejas sexuales. Métodos: Se recogieron 659 muestras de orina de hombres cuyas parejas sexuales eran mujeres infértiles; la identificación de la infección por Chlamydia se realizó mediante una prueba de amplificación de ácido nucleico en tiempo real (qPCR). Se utilizaron la PCR-RFLP y la secuenciación del gen OmpA para confirmar los genotipos de C. trachomatis. Se analizó en mayor profundidad la asociación de los genotipos con la edad, los parámetros espermáticos y los datos ginecológicos de las parejas sexuales. Resultados: Cuarenta y nueve muestras de orina dieron positivo para la infección (7,4 %). La infección por Chlamydia se asoció significativamente con la teratozoospermia, la azoospermia, la hipospermia y la oligozoospermia. Se identificaron correctamente cinco genotipos (F 51 %; 12,2 % para D; 12,2 % para E; 6,1 % para L2 y 4,1 % Ia). Ninguno de los genotipos identificados en este estudio comparativo se asoció positivamente con cambios en algunos de los valores espermáticos porque todos ellos suelen producir algún daño considerable en estas células. Conclusiones: El genotipo F fue el más frecuente identificado en hombres infértiles de Ciudad de México y todos los genotipos desempeñan un papel importante en la alteración seminal de los hombres mexicanos cuyas parejas femeninas son infértiles.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Parceiros Sexuais , Chlamydia trachomatis , Genótipo , Urinálise , Teratozoospermia , Azoospermia , Infertilidade Masculina , Infertilidade Feminina , Microbiologia , Doenças Transmissíveis , México
3.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 359-366, Ago - Sep 2022. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-207358

RESUMO

Introducción: Las infecciones por Chlamydia trachomatis (CT) son un problema de salud pública por su alta incidencia y consecuencias sobre la salud reproductiva. Nuestro objetivo es describir las características sociodemográficas, conductuales y clínicas de los pacientes con infección por CT para adaptar las intervenciones preventivas a los grupos con mayor riesgo. Métodos: Serie de casos prospectiva de todos los pacientes diagnosticados de CT entre septiembre del 2016 a enero del 2019 en las consultas de referencia para infecciones de transmisión sexual (ITS) de Osakidetza en Bizkaia.Resultados: Aceptaron participar 847 pacientes (88,2%): 41% mujeres, 33,8% varones heterosexuales y 25% hombres que tenían sexo con hombres (HSH); 33% eran inmigrantes y 26% menores de 25 años (33% entre las mujeres). Un 20% utilizaba siempre preservativo. Un 36% había tenido ITS anteriormente y 28% tenía otra ITS simultánea. El 55% de las infecciones fueron asintomáticas (70% entre las mujeres). El recto fue la localización más frecuente entre los HSH (69,5%), seguida de la uretra (31,4%) y la faringe (14,5%). En las mujeres, la infección afectó principalmente el cérvix (86,5% de los casos), seguido del recto (17,6%) y la faringe (13,8%). Se estudió a los contactos del 58% de los pacientes. La tasa de reinfección a las cuatro semanas fue del 17% entre aquellos con criterios para realizar un test de cura.Conclusión: Estos resultados justifican la implantación de cribados oportunistas en mujeres menores de 25 años e inmigrantes jóvenes de ambos sexos, con toma de muestras genitales y extra-genitales, y el establecimiento de guías apropiadas para la notificación de contactos.(AU)


Background: Chlamydia trachomatis (CT) infections are a public health problem because of its high incidence and consequences on reproductive health. Our aim is to describe the socio-demographic, behavioral and clinical characteristics of patients with CT infection in order to adapt preventive interventions for the highest risk groups. Methods: Prospective case series of all patients diagnosed with CT between September 2016 and January 2019 in the reference STI clinics of Osakidetza (Basque Health Service) in Bizkaia (Spain). Results: 847 patients (88.2%) agreed to participate: 41% women, 33.8% heterosexual men and 25% men who has sex with men (MSM); 33% were immigrants and 26% were under the age of 25 (33% of the women). Only 20% systematically used condoms. 36% had previously had STI and 28% had simultaneously another STI. 55% of the infections were asymptomatic (70% among women). In MSM, the rectum was affected in 69.5% of cases, the urethra in 31.4%, and the pharynx in 14.5%. The cervix was affected in 86.5% of the women, the rectum in 17.6%, and the pharynx in 13.8%. A contact study was only carried out in 58% of cases. The reinfection rate at 4 weeks was 17% among those with criteria to perform a test of cure. Conclusion: Our results justify implement opportunistic screening in women under the age of 25 and young immigrants of both sexes, by taking genital and extragenital samples, as well as developing appropriate guidelines for the notification and follow-up of contacts.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Chlamydia trachomatis , Infecções Sexualmente Transmissíveis , Epidemiologia , Saúde Reprodutiva , Minorias Sexuais e de Gênero , Mulheres , Estudos Prospectivos , Microbiologia , Doenças Transmissíveis
4.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 367-370, Ago - Sep 2022. ilus, tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-207359

RESUMO

Introducción: El objetivo fue realizar la validación clínica del sistema molecular AMR Direct Flow Chip® para la detección de genes de resistencia a antimicrobianos partiendo de aislados bacterianos en cultivo, así como de hisopos de muestras nasales o rectales. Métodos: El ensayo AMR es una PCR multiplex seguida de hibridación reversa tipo dot blot en arrays de ADN completamente automatizada mediante la plataforma HS24, con un tiempo de realización de 3h. Se realizó la validación preclínica con 104 cepas bacterianas caracterizadas y posteriormente se analizaron 210 muestras de hisopos nasales o rectales. Resultados: La sensibilidad y la especificidad del ensayo preclínico fueron del 100%, identificando correctamente las 104 cepas. En la validación clínica, la sensibilidad fue del 100% y la especificidad fue del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales. Conclusiones: El sistema AMR Direct Flow Chip® es un sistema rápido y eficaz para la detección de microorganismos multirresistentes a partir de muestras rectales y nasales.(AU)


Introduction The main objective of this work is to carry out the clinical validation of the trial with the AMR Direct Flow Chip® starting from either nasal swabs, rectal swabs directly or from isolated strains to detect antibiotic resistance genes. Methods: We developed the preclinical validation of the assay with 104 known bacterial isolates. A total of 210 nasal or rectal swab samples were analyzed. The AMR assay is based on multiplex PCR followed by reverse dot blot hybridization on DNA arrays fully automated by using the HS24 platform. The completion time of the full analysis is 3 hours. Results :Both the sensitivity and specificity of the preclinical assay were 100%, with the 104 samples correctly identified. In the clinical validation, the sensitivity was 100% and the specificity was between 100% in rectal swabs and 97% in nasal swabs. Conclusions: The AMR Direct Flow Chip® is a rapid and effective assay for the detection of multidrug-resistant microorganisms from nasal and rectal swab samples.(AU)


Assuntos
Técnicas de Diagnóstico Molecular , Resistência a Múltiplos Medicamentos , Epidemiologia Molecular , Anti-Infecciosos , Sensibilidade e Especificidade , Microbiologia , Doenças Transmissíveis
5.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 371-376, Ago - Sep 2022. tab
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-207360

RESUMO

Introduction: Acquisition of reduced susceptibility to biocides may contribute to the dissemination of high-risk (HR) clones of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (CP-Kp). The aim of this study was (a) to determinate the activity of biocides against CP-Kp, and (b) to analyse the relationship between biocide activity and the presence of efflux pumps. Methods: The minimal inhibitory concentrations (MICs) of 6 biocides (sodium hypochlorite, chlorhexidine digluconate, benzalkonium chloride, povidone-iodine, ethanol and triclosan) were determined in triplicate at 25°C and 37°C in Mueller-Hinton broth (MHB) and M9 minimum medium, against 17 CP-Kp isolates representing different clones (HR and no-HR), sequence-types (STs) and carbapenemases. Efflux pumps genes were detected by whole genome sequencing (MiSeq). Results: Median MICs were slightly higher at 37°C than at 25°C (p≤0.05), except for benzalkonium chloride, triclosan and ethanol. MIC medians were much higher in MHB than in M9, except for triclosan. No significant differences were observed in the median MICs, regarding the type of clone, ST or carbapenemase; cepA, acrAB, kpnEF and oqxAB genes were detected in all isolates, whereas qacE and qacA were not detected; smvAR, and qacΔE genes were detected in 94% and 47% of isolates, respectively. Conclusions: Triclosan, chlorhexidine digluconate, benzalkonium chloride and ethanol were the most active biocides. The activity of some biocides is affected by temperature and growth media, suggesting that standardised procedures for biocide susceptibility testing based on MIC determination are required. This activity, in terms of MICs, are not related to the type of clone, ST, carbapenemase or the presence of the efflux pump genes.(AU)


Introducción: La adquisición de sensibilidad reducida a los biocidas puede contribuir a la diseminación de clones de alto riesgo (HR) de Klebsiella pneumoniae productor de carbapenemasa (Kp-PC). El objetivo de este trabajo fue: (a) determinar la actividad de varios biocidas frente a Kp-PC, y (b) analizar la relación de dicha actividad con la presencia de genes codificantes de bombas de expulsión. Métodos: Las concentraciones mínimas inhibitorias (CMI) de 6 biocidas (hipoclorito de sodio, digluconato de clorhexidina, cloruro de benzalconio, povidona yodada, etanol y triclosán) se determinaron por triplicado a 25 y 37°C, tanto en caldo Mueller-Hinton (MHB) como en medio mínimo M9, frente a 17 aislados de Kp-PC representativos de diferentes clones (HR y no HR), secuenciotipos (ST) y carbapenemasas. Los genes de bombas de expulsión se detectaron mediante secuenciación masiva del genoma completo (MiSeq). Resultados: Las medianas de las CMI fueron ligeramente superiores a 37°C que a 25°C, excepto para cloruro de benzalconio, etanol y triclosán. Las medianas de las CMI fueron considerablemente superiores en MHB que en M9, excepto para triclosán; cepA, acrAB, kpnEF y oqxAB se detectaron en todos los aislados, mientras que qacE y qacA no se detectaron; smvAR y qacΔE se detectaron en el 94% y en el 47% de los aislados, respectivamente. Conclusiones: La actividad de algunos biocidas se afecta por la temperatura y el medio de crecimiento. Esta actividad, en términos de CMI, no se relaciona con el tipo de clon, ST, carbapenemasa, ni con la presencia de genes que codifican bombas de expulsión.(AU)


Assuntos
Técnicas In Vitro , Klebsiella pneumoniae/genética , Klebsiella pneumoniae/patogenicidade , Proteínas de Bactérias , Compostos de Benzalcônio/farmacologia , Enterobacteriáceas Resistentes a Carbapenêmicos , Desinfetantes/farmacologia , Triclosan , beta-Lactamases , Doenças Transmissíveis , Microbiologia , Etanol
6.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 377-380, Ago - Sep 2022. tab
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-207361

RESUMO

Objective: The aim of this study was to investigate the prevalence of Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae (NG) in women with pelvic inflammatory disease (PID) and the usefulness and cost-effectiveness of a rapid molecular test for the diagnosis and clinical management of PID. Methods: This observational study included 75 patients with mild-to-moderate PID (n=33), severe PID (n=29) and non-specific lower abdominal pain (NSAP) (n=13). CT/NG infections were analyzed using a standard and a rapid test. A cost analysis was carried out. Results: Samples of 19 patients (25.3%) were CT/NG positive. Concordance between rapid and standard tests was 100%. No significant differences were observed in the incidence of CT/NG in mild-to-moderate compared to severe PID. Costs differed according only to disease severity. Conclusions: Rapid molecular tests could help with the diagnosis of PID in sexually active women in clinical settings in which a standard technique is not available.(AU)


Objetivo: El objetivo de este estudio fue investigar la prevalencia de Chlamydia trachomatis (CT) y Neisseria gonorrhoeae (NG) en mujeres con enfermedad inflamatoria pélvica (EIP) y la utilidad y costo-efectividad de una prueba molecular rápida para el diagnóstico y manejo clínico de la EIP. Métodos: Este estudio observacional incluyó a 75 pacientes con EIP leve a moderada (n=33), EIP grave (n=29) y dolor abdominal bajo inespecífico (n=13). Las infecciones por CT/NG se detectaron mediante una prueba estándar y una prueba rápida. Se realizó un análisis de costes. Resultados: Las muestras de 19 pacientes (25,3%) fueron positivas para CT/NG. La concordancia entre las pruebas rápida y estándar fue del 100%. No se observaron diferencias significativas en la incidencia de CT/NG en la EIP leve a moderada en comparación con la grave. Los costes difirieron solo según la gravedad de la enfermedad. Conclusiones: Las pruebas moleculares rápidas podrían ayudar en el diagnóstico de la EIP en mujeres sexualmente activas en entornos clínicos en los que no se dispone de una técnica estándar.(AU)


Assuntos
Humanos , Feminino , Chlamydia trachomatis/genética , Infecções por Chlamydia/complicações , Infecções por Chlamydia/diagnóstico , Infecções por Chlamydia/epidemiologia , Neisseria gonorrhoeae/genética , Incidência , Doença Inflamatória Pélvica/diagnóstico , Doença Inflamatória Pélvica/epidemiologia , Análise Custo-Benefício , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
7.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 381-384, Ago - Sep 2022. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-207362

RESUMO

Introducción: El objetivo de este estudio es la caracterización de cepas de Streptococcus pyogenes con fenotipo mucoide y su comparación con las cepas no mucoides aisladas entre abril y agosto de 2016. Material y métodos: Se llevó a cabo la caracterización y el estudio de sensibilidad antimicrobiana de todos los aislados. Se determinó el tipo emm y se analizaron los genes de exotoxinas speA, speB, speC, speF, speG, speH, speJ, speZ y ssa. Se recogieron datos clínicos y demográficos. Resultados: De 96 aislados analizados, el 47% presentaron un fenotipo mucoide, y de estos últimos, el 95,5% presentaron los genes speA-speB-speF-speG-ssa y genotipo emm3. La principal manifestación clínica entre todos los pacientes fue faringoamigdalitis (77,1%) que evolucionó a escarlatina en el 67,5% de los casos. Conclusión: Se describe la circulación de una cepa de aspecto mucoide con perfil de toxinas speA-speB-speF-speG-ssa y genotipo emm3.1 considerado de los más frecuentes y más virulentos de SGA.(AU)


Introduction: The objective of this study is to characterize Streptococcus pyogenes isolates with a mucoid phenotype and to compare them with non-mucoid isolates obtained between April and August 2016. Material and methods: Identification and antimicrobial susceptibility were performed in all isolates. The emm type and exotoxin genes speA, speB, speC, speF, speG, speH, speJ, speZ and ssa were analyzed. Clinical and demographic data were collected. Results: From 96 isolates analyzed, 47% had a mucoid phenotype and 95.5% of them presented speA-speB-speF-speG-ssa genes and emm3 genotype. The main clinical manifestation was pharyngotonsillitis (77.1%) evolving to scarlet fever in 67.5% of the cases. Conclusion: This study describes the circulation of a mucoid phenotype strain with a speA-speB-speF-speG-ssa toxin profile and emm3.1 genotype considered one of the most frequent and virulent of SGA.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Infecções Estreptocócicas , Antígenos de Bactérias/genética , Fenótipo , Streptococcus pyogenes/genética , Centros de Atenção Terciária , Escarlatina , Fatores de Virulência , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
8.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 385-387, Ago - Sep 2022. tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-207363

RESUMO

La identificación proteómica de micobacterias no tuberculosas (MNTs) mediante MALDI-TOF presenta una mayor complejidad debido a la especial composición de su pared celular, que complica la extracción de proteínas. Un total de 106 aislamientos pertenecientes a diferentes especies de MNTs procedentes de muestras clínicas del Complejo Asistencial Universitario de León recogidas durante los años 2019 y 2020 se han identificado por un método proteómico abreviado (MALDI-TOF Biotyper Bruker®) desarrollado en nuestro laboratorio. La identificación se ha comparado con la realizada en paralelo en el Centro de Referencia de Majadahonda. Se analizaron un total de 22 especies diferentes de MNTs obteniendo una concordancia del 91,5%. Las nueve discrepancias detectadas se dieron entre especies pertenecientes al mismo grupo taxonómico. En el 67,92% de las identificaciones el score fue superior a 1,8. En el tiempo de procesamiento se obtuvo un ahorro aproximado de 24 minutos con respecto al recomendado por el fabricante.(AU)


Proteomic techniques relaying upon mass spectrometry (MALDI_TOF) applied to nontuberculous mycobacteria (NTM) identification, constitute a difficult goal. Cell wall structure features complicates the protein extraction procedure. A total of 106 isolates belonging to a variety of MNTs species isolated from clinical samples taken at the Complejo Asistencial Universitario de León for a two years period (2019-20) were identified following a simplified method (MALDI-TOF Biotyper Bruker®) developped in our laboratory. The resultant identification was compared to a parallel one ruled on the Centro de Referencia de Majadahonda. A total of 22 different MNTs species were tested, obtaining an agreement of 91,5%. Only 9 minor discrepancies between species belonging to the same taxonomic group of MNTs were detected. The score obtained in the 67.92% of the cases was higher than 1.8. A time-saving of 24 minutes compared to the manufacturer‘s proceeding was achieved.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Micobactérias não Tuberculosas/classificação , Micobactérias não Tuberculosas/genética , Parede Celular , Manejo de Espécimes , Proteômica/métodos , Técnicas de Laboratório Clínico , Proteoma , Complexo Mycobacterium avium , Espectrometria de Massas , Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz , Doenças Transmissíveis , Microbiologia
9.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(7): 388-395, Ago - Sep 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-207364

RESUMO

Objective:Calculate the efficiency of the EmERGE Pathway of Care for medically stable people living with HIV at the Hospital Clínic-IDIBAPS, Barcelona, Spain. Methods: 546 study participants were followed between 1st July 2016 and 30th October 2019 across three HIV outpatient clinics, but the virtual clinic was closed during the second year. Unit costs were calculated, linked to mean use outpatient services per patient year, one-year before and after the implementation of EmERGE. Costs were combined with primary and secondary outcomes. Results:Annual costs across HIV-outpatient services increased by 8%: €1073 (95%CI €999–€1157) to €1158 (95%CI €1084–€1238). Annual cost of ARVs was €7,557; total annual costs increased by 1% from €8430 (95%CI €8356–8514) to €8515 (95%CI €8441–8595). Annual cost for 433 participants managed in face-to-face (F2F) clinics decreased by 5% from €958 (95%CI 905–1018) to €904 (95%CI 863–945); participants transferred from virtual to F2F outpatient clinics (V2F) increased their annual cost by a factor of 2.2, from €115 (95%CI 94–139) to €251 (95%CI 219–290). No substantive changes were observed in primary and secondary outcomes. Conclusion: EmERGE Pathway is an efficient and acceptable intervention. Increases in costs were caused by internal structural changes. The cost reduction observed in F2F clinics were off-set by the transfer of participants from the virtual to the F2F clinics due to the closure of the virtual clinic during the second year of the Study. Greater efficiencies are likely to be achieved by extending the use of the Pathway to other PLHIV.(AU)


Objetivo: Calcular la eficiencia de la vía asistencial EmERGE para personas clínicamente estables que viven con VIH en el Hospital Clínic-IDIBAPS, en Barcelona, España. Métodos: Se realizó un seguimiento a 546 participantes del estudio, entre el 1 de julio de 2016 y el 30 de octubre de 2019, en tres clínicas ambulatorias de VIH, pero la clínica virtual se cerró durante el segundo año. Se calcularon los costes unitarios, vinculados al uso medio de los servicios ambulatorios por paciente al año, un año antes y después de la implementación de EmERGE. Los costes se combinaron con criterios de valoración principales y secundarios. Resultados: Los costes anuales en los servicios ambulatorios para el VIH aumentaron un 8%: 1.073 € (IC 95%: 999-1.157 €) a 1.158 € (IC 95%: 1.084-1.238 €). El coste anual de los fármacos antirretrovirales (ARV) fue de 7.557 €; los costes anuales totales aumentaron en un 1%, de 8.430 € (IC 95%: 8.356-8.514 €) a 8.515 € (IC 95%: 8.441-8.595 €).El coste anual para 433 participantes que recibieron tratamiento en clínicas presenciales (face to face, F2F) disminuyó en un 5%, de 958 € (IC 95%: 905-1.018 €) a 904 € (IC 95%: 863-945 €); los participantes transferidos de clínicas ambulatorias virtuales (V2F) a F2F aumentaron su coste anual en un factor de 2,2, de 115 € (IC 95%: 94-139 €) a 251 € (IC 95%: 219-290 €). No se observaron cambios sustanciales en los criterios de valoración principales y secundarios. Conclusión: La vía EmERGE es un tratamiento eficaz y aceptable. Los aumentos de los costes fueron el resultado de cambios estructurales internos. La reducción de costes observada en las clínicas F2F se compensó con la transferencia de participantes de las clínicas virtuales a las F2F debido al cierre de la clínica virtual durante el segundo año del estudio. Es probable que se logre una mayor eficiencia si se amplía el uso de la vía a otras personas que viven con VIH (PVVIH).(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , HIV , Análise Custo-Eficiência , Espanha , Instituições de Assistência Ambulatorial , Assistência Ambulatorial , Continuidade da Assistência ao Paciente , Infecções por HIV/terapia , Microbiologia , Doenças Transmissíveis
17.
Microbiology (Reading) ; 168(7)2022 07.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35904846
18.
Rev. esp. med. legal ; 48(3)Julio - Setiembre 2022. tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-207281

RESUMO

Introducción: en la actualidad, la falta de métodos cuantitativos fiables ha llevado a distintas líneas de investigación a buscar un modelo que prediga el intervalo post mortem (IPM). El tanatomicrobioma, presente desde el momento de la muerte, parece sufrir cambios predecibles y que siguen una correlación con el IPM.Materiales y métodosse ha analizado experimentalmente el comportamiento del tanatomicrobioma en la región del intestino delgado posterior y del colon ascendente durante las primeras 24 h de descomposición en Mus musculus. Para ello, se ha llevado a cabo una aproximación molecular basada en el análisis del gen ribosomal 16S (ARNr 16S) mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE) y, seguidamente un análisis de la alfa y beta diversidad.Resultadoslos resultados basados en el análisis de los índices de diversidad ecológica reflejaron cambios estadísticamente significativos antes de las 12 h, y un descenso de la diversidad a partir de esas 12 h postmortem, siendo este estadísticamente significativo en las 2 regiones intestinales analizadas. Por otro lado, el estudio comparativo de las comunidades microbianas mostró que cambian estructurada y diferenciablemente desde el momento de la muerte, alejándose en similitud de las mostradas en vida (IPM 0 h).Discusiónestos resultados coinciden con el descenso de la diversidad sugerido a largo plazo por distintos autores. Sin embargo, en las condiciones del estudio, se ha visto que este descenso no se inicia hasta las 12 h. Conclusión como conclusión, se han podido establecer, según los cambios en la diversidad bacteriana, fases de la dinámica bacteriana durante la descomposición que podrían ayudar a mejorar los modelos de correlación microbiana para la estimación del IPM. (AU)


Introduction: Currently, the lack of reliable quantitative methods has led different research lines to find a model that predicts the postmortem interval (PMI). The thanatomicrobiome, present from the moment of death, has been shown to change in predictable ways, allowing a correlation with PMI.Materials and methodsIn this study, the shifts of the thanatomicrobiome in the region of the posterior small intestine and the ascending colon in Mus musculus during the first 24 hrs of decomposition have been analyzed experimentally. For this purpose, a molecular approach based on the analysis of the 16S ribosomal gene (16S rRNA) and a denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was adopted, followed by analyses of the ecological diversity indices Alpha and beta diversity.ResultsThe results based on the analysis of the ecological diversity indices reflected statistically significant changes before 12 hrs, and a decrease in diversity after 12 hrs postmortem, this being statistically significant in the two intestinal regions analyzed. Moreover, the comparative study of microbial communities indicated distinct and structured changes from the moment of death, with shifts in the degree of similarity from the composition detected in life (PMI 0 hrs).DiscussionThese results agree with other studies demonstrating a decrease in microbial diversity. However, under the conditions of the study, this decrease does not begin until 12 hrs after death. Conclusions: In conclusion, by examining the dynamics of bacterial diversity our study has identified phases during decomposition that could help to improve microbial correlation models for PMI estimation. (AU)


Assuntos
Camundongos , Camundongos , Microbiologia , Medicina Legal/métodos , Medicina Legal/tendências , Mudanças Depois da Morte , Microbioma Gastrointestinal
20.
Enferm. infecc. microbiol. clín. (Ed. impr.) ; 40(6): 289-295, Jun-Jul, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | IBECS | ID: ibc-206890

RESUMO

Objectives: To assess the efficacy and safety of hydroxychloroquine (HCQ) compared with no treatment in healthcare workers with mild SARS-CoV-2 infection. Methods: Prospective, non-randomized study. All health professionals with confirmed COVID-19 between April 7 and May 6, 2020, non-requiring initial hospitalization were asked to participate. Patients who accepted treatment were given HCQ for five days (loading dose of 400mg q12h the first day followed by200mg q12h). Control group included patients with contraindications for HCQ or who rejected treatment. Study outcomes were negative conversion and viral dynamics of SARS-CoV-2, symptoms duration and disease progression. Result: Overall, 142 patients were enrolled: 87 in treatment group and 55 in control group. The median age was 37 years and 75% were female, with few comorbidities. There were no significant differences in time to negative conversion of PCR between both groups. The only significant difference in the probability of negative conversion of PCR was observed at day 21 (18.7%, 95%CI 2.0–35.4). The decrease of SARS-CoV-2 viral load during follow-up was similar in both groups. A non significant reduction in duration of some symptoms in HCQ group was observed. Two patients with HCQ and 4 without treatment developed pneumonia. No patients required admission to the Intensive Care Unit or died. About 50% of patients presented mild side effects of HCQ, mainly diarrhea. Conclusions: Our study failed to show a substantial benefit of HCQ in viral dynamics and in resolution of clinical symptoms in health care workers with mild COVID-19.(AU)


Objetivos: Evaluar la eficacia y seguridad de hidroxicloroquina (HCQ), en comparación con la ausencia de tratamiento en los profesionales sanitarios con infección leve por SARS-CoV-2. Métodos: Estudio prospectivo y no aleatorio. Se solicitó su participación a todos los profesionales sanitarios con diagnóstico confirmado de COVID-19, entre el 7 de abril y el 6 de mayo de 2020, que no requirieron hospitalización inicial. Los pacientes que aceptaron el tratamiento recibieron HCQ durante cinco días (dosis de carga de 400 mg cada 12 h el primer día, y a continuación 200 mg cada 12 h). El grupo control incluyó pacientes con contraindicaciones de HCQ, o que rechazaron el tratamiento. Los resultados del estudio fueron conversión negativa y dinámica viral de SARS-CoV-2, duración de los síntomas y progresión de la enfermedad. Resultados: En total se incluyeron 142 pacientes: 87 en el grupo de tratamiento, y 55 en el grupo control. La edad media fue de 37 años, y el 75% fueron mujeres, con pocas comorbilidades. No existieron diferencias significativas en cuanto al tiempo transcurrido hasta la conversión negativa de la PCR entre ambos grupos. La única diferencia significativa en cuanto a la probabilidad de negativización de la PCR se observó el día 21 (18,7%, IC 95% 2-35,4). El descenso de la carga viral de SARS-CoV-2 durante el seguimiento fue similar en ambos grupos. Se observó una reducción no significativa de la duración de algunos síntomas en el grupo HCQ. Dos pacientes con HCQ y cuatro sin tratamiento desarrollaron neumonía. Ningún paciente requirió ingreso en la Unidad de Cuidados Intensivos, ni hubo fallecidos. Cerca del 50% de los pacientes presentó efectos secundarios leves de HCQ, principalmente diarrea. Conclusiones: Nuestro estudio no reflejó un beneficio sustancial de HCQ, en cuanto a dinámica viral y resolución de los síntomas clínicos en los profesionales sanitarios con infección leve por COVID-19.(AU)


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Infecções por Coronavirus/tratamento farmacológico , Betacoronavirus , Vírus da SARS , Pessoal de Saúde , Hidroxicloroquina/efeitos adversos , Hidroxicloroquina/uso terapêutico , Doenças Transmissíveis , Estudos Prospectivos , Microbiologia
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