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Highly divergent cattle hepacivirus N in Southern Brazil.
Da Silva, M S; Weber, M N; Baumbach, L F; Cibulski, S P; Budaszewski, R F; Mósena, A C S; Canova, R; Varela, A P M; Mayer, F Q; Canal, Cláudio W.
Affiliation
  • Da Silva MS; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Weber MN; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Baumbach LF; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Cibulski SP; Departamento de Biotecnologia, Universidade Federal da Paraíba (UFPB), João Pessoa, Paraíba, Brazil.
  • Budaszewski RF; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Mósena ACS; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Canova R; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Varela APM; Laboratório de Biologia Molecular-Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor (IPVDF), Fundação Estadual de Pesquisa Agropecuária, Eldorado do Sul, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Mayer FQ; Laboratório de Biologia Molecular-Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor (IPVDF), Fundação Estadual de Pesquisa Agropecuária, Eldorado do Sul, Rio Grande do Sul, Brazil.
  • Canal CW; Laboratório de Virologia, Faculdade de Veterinária (FAVET), Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil. claudio.canal@ufrgs.br.
Arch Virol ; 164(12): 3133-3136, 2019 Dec.
Article in En | MEDLINE | ID: mdl-31563979
ABSTRACT
The genus Hepacivirus includes 14 species (Hepacivirus A-N). In this study, we determined a partial genome sequence of a highly divergent bovine hepacivirus (hepacivirus N, HNV) isolate from cattle in Southern Brazil. Previously described HNV isolates have shared 80-99.7% nucleotide sequence identity in the NS3 coding region. However, the sequence determined in this study had 72.6% to 73.8% nucleotide sequence identity to known HNV NS3 sequences. This high divergence could be seen in a phylogenetic tree, suggesting that it represents a new genotype of HNV. These data expand our knowledge concerning the genetic variability and evolution of hepaciviruses.
Subject(s)
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Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Cattle Diseases / Hepatitis C / Hepacivirus / Evolution, Molecular Limits: Animals Country/Region as subject: America do sul / Brasil Language: En Journal: Arch Virol Year: 2019 Document type: Article Affiliation country:
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Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Cattle Diseases / Hepatitis C / Hepacivirus / Evolution, Molecular Limits: Animals Country/Region as subject: America do sul / Brasil Language: En Journal: Arch Virol Year: 2019 Document type: Article Affiliation country: