Correlación entre el umbral de ciclo de la RPC en tiempo real y la clasificación clínica de la COVID-19 / Correlation between real-time PCR cycle threshold and clinical classification of COVID-19

RESUMEN

INTRODUCCIÓN: El umbral de ciclo (en inglés cycle threshold-Ct) de la reacción de polimerasa en cadena en tiempo real con transcripción reversa (RT-qPCR) indica la concentración relativa de una secuencia de ARN; este valor se ha relacionado con la expresión de cuadros clínicos en infecciones virales. OBJETIVO: Determinar la correlación entre el valor Ct y la clasificación clínica de la COVID-19. MÉTODO: Se realizó un estudio transeccional correlacional; los valores Ct se obtuvieron mediante RT-qPCR dirigida al gen N del SARS-CoV-2 agrupándolos mediante un estimador robusto central y relacionándose con la clasificación clínica de la COVID-19. RESULTADOS: De los 718 casos incluidos en el estudio; 77,7% (558) fueron leves; 21,3% (153) moderados y 1% (7) graves. El valor Ct se agrupó en niveles Ct bajo 18,83 - 30,10 y Ct alto > 30,10. Existió correlación significativa inversa débil (p = 0,002; rho de Spearman = -0,117) entre el valor Ct y la clasificación clínica. Las características sexo, edad menor a 65 años, fiebre, escalofrío, diarrea, anosmia y sobrepeso-obesidad estuvieron asociadas al valor de Ct. CONCLUSIÓN: A menor valor Ct se espera una clasificación de mayor gravedad de la COVID-19; no obstante, debido a que la correlación es débil, su utilidad como predictor de gravedad es limitada.

ABSTRACT

BACKGROUND: The cycle threshold (Ct) of real-time reverse transcription PCR (RT-qPCR) indicates the relative concentration of an RNA sequence, this value has been related to clinical profile in viral infections. AIM: To determine the correlation between the Ct value and the clinical classification of COVID-19. METHOD: A correlational cross-sectional study was carried out, the Ct values were obtained by RT-qPCR directed to the N gene of SARS-CoV-2, grouping them by means of a central robust estimator and related to the clinical classification of COVID-19. RESULTS: Of the 718 cases included in the study; 77.7% (558) were mild; 21.3% (153) moderate and 1% (7) severe. The Ct value was grouped into levels low Ct 18.83-30.10 and high Ct> 30.10. There was a weak inverse significant correlation (p = 0.002; Spearman's rho = -0.117) between the Ct value and the clinical classification. The characteristics sex, age under 65 years, fever, chills, diarrhea, anosmia, and overweightobesity were associated with the Ct value. CONCLUSION: The lower the Ct value, a classification of greater severity of COVID-19 is expected, however, because the correlation is weak, its usefulness as a severity predictor is limited.