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Primer reporte de un begomovirus presente en maracuyá amarillo [Passiflora edulis f. flavicarpa (Degener)] en Valle del Cauca, Colombia / First report of a begomovirus presents in yellow passionfruit [Passiflora edulis f. flavicarpa (Degene)] in Valle del Cauca, Colombia
Vaca-Vaca, Juan Carlos; Carrasco-Lozano, Emerson Clovis; Rodríguez-Rodríguez, Mónica; Betancur-Perez, Jhon Fredy; López-López, Karina.
Affiliation
  • Vaca-Vaca, Juan Carlos; Universidad Nacional de Colombia. Palmira. CO
  • Carrasco-Lozano, Emerson Clovis; Universidad Nacional de Colombia. Palmira. CO
  • Rodríguez-Rodríguez, Mónica; Universidad Nacional de Colombia. Palmira. CO
  • Betancur-Perez, Jhon Fredy; Universidad Nacional de Colombia. Palmira. CO
  • López-López, Karina; Universidad Nacional de Colombia. Palmira. CO
Rev. colomb. biotecnol ; 18(2): 56-65, jul.-dic. 2016. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-959840
Responsible library: CO332
RESUMEN
El maracuyá amarillo es un cultivo de importancia económica para el Valle del Cauca, pero en los últimos años ha presentado una reducción de hasta un 80% en la producción debido a problemas virales. El objetivo del presente trabajo fue detectar y caracterizar parcialmente begomovirus que podrían estar afectando los cultivos de maracuyá amarillo localizados en dos zonas productoras del Valle del Cauca (La Unión y Palmira). Se colectaron hojas de maracuyá con síntomas típicos de enfermedad viral, se purificó su DNA genómico y se detectó la presencia de begomovirus bipartitas mediante PCR empleando cebadores específicos para el componente A y B, respectivamente. Cinco fragmentos de DNA correspondientes al genoma geminiviral A y B, fueron clonados, secuenciados y analizados con herramientas bioinformáticas. Los resultados evidencian por primera vez en Colombia de la presencia de un begomovirus en maracuyá amarillo. El análisis de la secuencias de nucleótidos indica que este begomovirus está más relacionado con el virus del mosaico enano del frijol, un geminivirus que afecta frijol en Colombia, y no con el virus de la distorsión severa de la hoja de maracuyá, el cual se reportó afectando maracuyá amarillo en Brasil. A la fecha, este resultado constituiría el primer reporte de un begomovirus (perteneciente a la familia Geminiviridae) que afecta maracuyá amarillo en Colombia y que podría ser diferente de otros begomovirus previamente reportados a nivel mundial afectando este cultivo.
ABSTRACT
The yellow passion fruit is a crop of economic importance to the Valle del Cauca, but in recent years has been a reduction of up to 80% in production due to viral problems. The aim of this study was to detect and characterize partially begomovirus that could be affecting crops of yellow passionfruit located in two growing areas of the Valle del Cauca (La Union and Palmira). Passionfruit leaves with typical symptoms of viral disease were collected, purified genomic DNA and its bipartite begomovirus were detected by PCR using primers specific for component A and B, respectively. Five DNA fragments corresponding to geminiviral A and B genome were cloned, sequenced and analyzed with bioinformatics tools. The results show for the first time in Colombia the presence of a begomovirus in yellow passionfruit. The analysis of the nucleotide sequences indicates that this begomovirus is more related to bean BDMV, a geminivirus affecting beans in Colombia, not PSLDV, which was reported affecting yellow passionfruit in Brazil. To date, this result would be the first report of a begomovirus (belonging to the family Geminiviridae) affecting yellow passion fruit in Colombia, and that might be different from other begomovirus previously reported worldwide affecting this crop.


Full text: Available Collection: International databases Database: LILACS Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Rev. colomb. biotecnol Journal subject: Biotechnology Year: 2016 Document type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Universidad Nacional de Colombia/CO

Full text: Available Collection: International databases Database: LILACS Country/Region as subject: South America / Colombia Language: Spanish Journal: Rev. colomb. biotecnol Journal subject: Biotechnology Year: 2016 Document type: Article Affiliation country: Colombia Institution/Affiliation country: Universidad Nacional de Colombia/CO
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