Potencial uso biomarcador de los retrotransposones en el adenocarcinoma de pulmón / Potential use of retrotransposons as a biomarker in lung adenocarcinoma

RESUMEN

HIPÓTESIS Y OBJETIVO: partiendo de la hipótesis de que la reprogramación de los transposones en el cáncer nos puede orientar sobre su desarrollo, en este trabajo se pretende determinar qué transposones podrían servir de biomarcadores con futuros propósitos diagnósticos y pronósticos. Material y métodos: a partir de muestras congeladas de biopsias de adenocarcinoma de pulmón, se ha secuenciado ARN total del tejido tumoral y sano adyacente de ocho pacientes intervenidos en el Hospital Regional de Málaga. Se han analizado con un flujo de trabajo bioinformático específico que cuantifica y proporciona la expresión diferencial de los transposones cuando se compara el tejido sano y tumoral de cada paciente. Resultados: en este trabajo prospectivo, el nivel de transposición global no cambia entre el pulmón sano y el adenocarcinoma. Se han identificado siete transposones con expresión diferencial significativa: cinco se sobreexpresan en las células del adenocarcinoma y los otros dos se sobreexpresan en las células sanas del pulmón. Todos los que son de la clase de retrovirus endógenos humanos (HERV) tienen un gran potencial como biomarcador al reprogramarse de la misma forma en todos los pacientes. Conclusión: el nivel de transposición en el cáncer de pulmón no está desregulado, sino reprogramado, y los transposones afectados por la reprogramación podrían considerarse biomarcadores en potencia

ABSTRACT

HYPOTHESIS AND OBJECTIVE: transposon reprogramming can be related to cancer development. The aim of this study is to determine the role of transposons in lung cancer and evaluate the posible role of transposon as a diagnostic and pronostic biomarkers in lung cáncer. MATERIAL AND METHODS: total RNA from lung adenocarcinome was sequenced. We analized RNA from tumor and adyacent healthy tissue from eight patients. By using a specific software the differential expression of the transposons in healthy and tumor tissue was analyzed in each patient. RESULTS: this prospective study shows that in our population, the overall transposition level does not change between the healthy and lung adenocarcinoma tissue. Seven transposons with significative differential expression have been found. Five were upregulated in adenocarcinoma cells, and the other two were upregulated in healthy lung cells. Those that belong to the human endogenous retroviruses (HERV) class show a high biomarker potential since they are reprogrammed in the same way in all patients. CONCLUSION: the transposition level in lung cancer is not deregulated but reprogrammed. Transposons affected by the reprogramming may be considered as potential biomarkers