Characteristics of bacterial isolates in Swiss farmed and ornamental fish from a retrospective study from 2000 to 2017.

INTRODUCTION: L'aquaculture est un secteur de la production alimentaire en pleine croissance et d'une grande importance économique. Les infections bactériennes constituent une menace importante pour la croissance de l'aquaculture mais également un problème courant chez les poissons d'ornement. Certains agents pathogènes et types de production aquacole seraient associés à une plus forte incidence de certaines maladies. Une description complète des agents pathogènes bactériens responsables de maladies chez les poissons d'élevage et d'ornement en Suisse fait cependant défaut. Nous décrivons dans cette étude 1448 isolats bactériens provenant de 1134 soumissions de poissons d'élevage et de poissons d'ornement en Suisse à un laboratoire de diagnostic entre 2000 et 2017. Une forte saisonnalité a été observée au printemps et en été. Les infections bactériennes chez les poissons de fermes biologiques étaient environ six fois plus fréquentes que dans les exploitations conventionnelles. Flavobacteriaceae, Aeromonas spp. et Yersinia ruckeri sont les isolats qui ont été les plus communément isolés des soumissions des piscicultures. Vibrio spp. ainsi que les espèces motiles d'Aeromonas spp. ont été les principaux isolats mis en évidence chez les poissons d'ornement. Les résultats de cette étude fournissent des hypothèses intéressantes, mais des recherches supplémentaires sont nécessaires pour mieux caractériser les facteurs de risque des maladies bactériennes chez les poissons d'aquaculture et d'aquarium en Suisse.