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Phylogenomics and population genomics of SARS-CoV-2 in Mexico during the pre-vaccination stage reveals variants of interest B.1.1.28.4 and B.1.1.222 or B.1.1.519 and the nucleocapsid mutation S194L associated with symptoms.
Barona-Gómez, Francisco; Delaye, Luis; Díaz-Valenzuela, Erik; Plisson, Fabien; Cruz-Pérez, Arely; Díaz-Sánchez, Mauricio; García-Sepúlveda, Christian A; Sanchez-Flores, Alejandro; Pérez-Abreu, Rafael; Valencia-Valdespino, Francisco J; Vega-Magaña, Natali; Muñoz-Valle, José Francisco; García-González, Octavio Patricio; Bernal-Silva, Sofía; Comas-García, Andreu; Cibrián-Jaramillo, Angélica.
Affiliation
  • Barona-Gómez F; Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Cinvestav-IPN, Irapuato, Guanajuato, Mexico.
  • Delaye L; Departamento de Ingeniería Genética, Unidad Irapuato, Cinvestav-IPN, Irapuato, Guanajuato, México.
  • Díaz-Valenzuela E; Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Cinvestav-IPN, Irapuato, Guanajuato, Mexico.
  • Plisson F; Conacyt - Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Cinvestav-IPN, Irapuato, Guanajuato, México.
  • Cruz-Pérez A; Unidad de Genómica Avanzada (Langebio), Cinvestav-IPN, Irapuato, Guanajuato, Mexico.
  • Díaz-Sánchez M; Molecular Biology Research & Development Department, GrupoT, Irapuato, Guanajuato, México.
  • García-Sepúlveda CA; Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de San Luis Potosí, San Luis, San Luis Potosí, México.
  • Sanchez-Flores A; Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, México.
  • Pérez-Abreu R; Centro de Investigación en Matemáticas AC (Cimat), Sede Aguascalientes, Aguascalientes, México.
  • Valencia-Valdespino FJ; Prothesia, Monterrey, Nuevo Leon, México.
  • Vega-Magaña N; Laboratory for the Diagnosis of Emerging and Reemerging Diseases (LaDEER), University Center for Health Sciences, University of Guadalajara, Guadalajara, Jalisco, México.
  • Muñoz-Valle JF; Institute for Research in Biomedical Sciences, University Center for Health Sciences, University of Guadalajara, Guadalajara, Jalisco, México.
  • García-González OP; Molecular Biology Research & Development Department, GrupoT, Irapuato, Guanajuato, México.
  • Bernal-Silva S; Centro de Investigación en Ciencias de la Salud y Biomedicina, Universidad Autónoma de San Luis Potosí, San Luis, San Luis Potosí, México.
  • Comas-García A; Centro de Investigación en Ciencias de la Salud y Biomedicina, Universidad Autónoma de San Luis Potosí, San Luis, San Luis Potosí, México.
  • Cibrián-Jaramillo A; Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de San Luis Potosí, San Luis, San Luis Potosí, México.
Microb Genom ; 7(11)2021 11.
Article in En | MEDLINE | ID: mdl-34846283
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Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Phylogeny / Coronavirus Nucleocapsid Proteins / SARS-CoV-2 / COVID-19 Type of study: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Limits: Humans Country/Region as subject: Mexico Language: En Journal: Microb Genom Year: 2021 Document type: Article Affiliation country: Mexico Country of publication: United kingdom
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Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Phylogeny / Coronavirus Nucleocapsid Proteins / SARS-CoV-2 / COVID-19 Type of study: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Limits: Humans Country/Region as subject: Mexico Language: En Journal: Microb Genom Year: 2021 Document type: Article Affiliation country: Mexico Country of publication: United kingdom