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SM-COLSARSPROT: Highly Immunogenic Supramutational Synthetic Peptides Covering the World's Population.
Patarroyo, Manuel A; Patarroyo, Manuel E; Pabón, Laura; Alba, Martha P; Bermudez, Adriana; Rugeles, María Teresa; Díaz-Arevalo, Diana; Zapata-Builes, Wildeman; Zapata, María Isabel; Reyes, César; Suarez, Carlos F; Agudelo, William; López, Carolina; Aza-Conde, Jorge; Melo, Miguel; Escamilla, Luis; Oviedo, Jairo; Guzmán, Fanny; Silva, Yolanda; Forero, Martha; Flórez-Álvarez, Lizdany; Aguilar-Jimenez, Wbeimar; Moreno-Vranich, Armando; Garry, Jason; Avendaño, Catalina.
Affiliation
  • Patarroyo MA; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Patarroyo ME; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Pabón L; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Alba MP; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Bermudez A; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Rugeles MT; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia.
  • Díaz-Arevalo D; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Zapata-Builes W; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia.
  • Zapata MI; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia.
  • Reyes C; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Suarez CF; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Agudelo W; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • López C; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Aza-Conde J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Melo M; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Escamilla L; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Oviedo J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Guzmán F; Núcleo de Biotecnología, Pontificia U. Católica de Valparaíso, Valparaíso, Chile.
  • Silva Y; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Forero M; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Flórez-Álvarez L; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia.
  • Aguilar-Jimenez W; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia.
  • Moreno-Vranich A; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Garry J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia.
  • Avendaño C; Facultad de Ciencias Agropecualrias, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (UDCA), Bogotá, Colombia.
Front Immunol ; 13: 859905, 2022.
Article in En | MEDLINE | ID: mdl-35693819
Fifty ~20-amino acid (aa)-long peptides were selected from functionally relevant SARS-CoV-2 S, M, and E proteins for trial B-21 and another 53 common ones, plus some new ones derived from the virus' main genetic variants for complementary trial C-21. Peptide selection was based on tremendous SARS-CoV-2 genetic variability for analysing them concerning vast human immunogenetic polymorphism for developing the first supramutational, Colombian SARS-protection (SM-COLSARSPROT), peptide mixture. Specific physicochemical rules were followed, i.e., aa predilection for polyproline type II left-handed (PPIIL) formation, replacing ß-branched, aromatic aa, short-chain backbone H-bond-forming residues, π-π interactions (n→π* and π-CH), aa interaction with π systems, and molecular fragments able to interact with them, disrupting PPIIL propensity formation. All these modified structures had PPIIL formation propensity to enable target peptide interaction with human leukocyte antigen-DRß1* (HLA-DRß1*) molecules to mediate antigen presentation and induce an appropriate immune response. Such modified peptides were designed for human use; however, they induced high antibody titres against S, M, and E parental mutant peptides and neutralising antibodies when suitably modified and chemically synthesised for immunising 61 major histocompatibility complex class II (MHCII) DNA genotyped Aotus monkeys (matched with their corresponding HLA-DRß1* molecules), predicted to cover 77.5% to 83.1% of the world's population. Such chemically synthesised peptide mixture represents an extremely pure, stable, reliable, and cheap vaccine for COVID-19 pandemic control, providing a new approach for a logical, rational, and soundly established methodology for other vaccine development.
Subject(s)
Key words

Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Malaria Vaccines / COVID-19 Limits: Humans Language: En Journal: Front Immunol Year: 2022 Document type: Article Affiliation country: Colombia Country of publication: Switzerland

Full text: 1 Collection: 01-internacional Database: MEDLINE Main subject: Malaria Vaccines / COVID-19 Limits: Humans Language: En Journal: Front Immunol Year: 2022 Document type: Article Affiliation country: Colombia Country of publication: Switzerland