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The polarity and specificity of SARS-CoV2 -specific T lymphocyte responses determine disease susceptibility
Jean-Eudes FAHRNER; Agathe CARRIER; - Lyon COVID study group; Eric DE SOUSA; Damien DRUBAY; Agathe DUBUISSON; Arthur GERAUD; Anne-Gaëlle GOUBET; Gladys FERRERE; Yacine HADDAD; Imran LAHMAR; Marine MAZZENGA; Clea MELENOTTE; Marion PICARD; Cassandra THELEMAQUE; Luigi CERBONE; Joana R. LÉRIAS; Ariane LAPARRA; Alice BERNARD; Benoît KLOECKNER; Marianne GAZZANO; François-Xavier DANLOS; Safae TERRISSE; Carolina ALVES COSTA SILVA; Eugenie PIZZATO; Caroline FLAMENT; Pierre LY; Eric TARTOUR; Lydia MEZIANI; Abdelhakim AHMED-BELKACEM; Makoto MIYARA; Guy Gorochov; Fabrice BARLESI; Caroline PRADON; Emmanuelle GALLOIS; Fanny POMMERET; Emeline COLOMBA; Pernelle LAVAUD; Eric DEUTSCH; Bertrand GACHOT; Jean-Philippe SPANO; Mansouria Merad; Florian SCOTTE; Aurélien MARABELLE; Frank GRISCELLI; Jean-Yves BLAY; Jean-Charles SORIA; Fabrice ANDRE; Mathieu Chevalier; Sophie CAILLAT-ZUCMAN; Florence FENOLLAR; Bernard LA SCOLA; Guido KROEMER; Markus MAEURER; Lisa DEROSA; Laurence ZITVOGEL.
Affiliation
  • Jean-Eudes FAHRNER; Université Paris-Saclay, Le Kremlin-Bicêtre, France. Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France. Tran
  • Agathe CARRIER; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • - Lyon COVID study group; -
  • Eric DE SOUSA; ImmunoTherapy/ImmunoSurgery, Champalimaud Foundation, Lisboa, Portugal.
  • Damien DRUBAY; Gustave Roussy, Villejuif, France Département de Biostatistique et d'Epidémiologie, Gustave Roussy, Université Paris-Saclay, Villejuif, France.
  • Agathe DUBUISSON; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Arthur GERAUD; Gustave Roussy, Villejuif, France Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France. Département d'Innovation Thérapeutique et d'Essais Précoc
  • Anne-Gaëlle GOUBET; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Méd
  • Gladys FERRERE; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Yacine HADDAD; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Imran LAHMAR; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Méd
  • Marine MAZZENGA; Gustave Roussy, Villejuif, France 3Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Clea MELENOTTE; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Marion PICARD; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Cassandra THELEMAQUE; Gustave Roussy, Villejuif, France 3Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Luigi CERBONE; Gustave Roussy, Villejuif, France 9Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Joana R. LÉRIAS; ImmunoTherapy/ImmunoSurgery, Champalimaud Foundation, Lisboa, Portugal.
  • Ariane LAPARRA; Gustave Roussy, Villejuif, France 9Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France. Département d'Innovation Thérapeutique et d'Essais Préco
  • Alice BERNARD; Gustave Roussy, Villejuif, France Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France. Département d'Innovation Thérapeutique et d'Essais Précoc
  • Benoît KLOECKNER; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Marianne GAZZANO; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • François-Xavier DANLOS; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. Gustave Roussy, Villejuif, France3Institut National de la Santé et de la Recherche Mé
  • Safae TERRISSE; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Carolina ALVES COSTA SILVA; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Méd
  • Eugenie PIZZATO; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Caroline FLAMENT; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Pierre LY; Gustave Roussy, Villejuif, France 3Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, UMR1015, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Eric TARTOUR; Department of Immunology, Hôpital Européen Georges Pompidou, AP-HP, Paris, France. 15PARCC, INSERM U970
  • Lydia MEZIANI; Gustave Roussy, Villejuif, France
  • Abdelhakim AHMED-BELKACEM; Univ Paris Est Creteil, INSERM U955, IMRB, Creteil, France
  • Makoto MIYARA; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Assistance Publi
  • Guy Gorochov; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U1135, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Assistance Publi
  • Fabrice BARLESI; Gustave Roussy, Villejuif, France Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France. Aix Marseille University, CNRS, INSERM, CRCM, Marseille,
  • Caroline PRADON; Gustave Roussy, Villejuif, France Centre de ressources biologiques, ET-EXTRA, Gustave Roussy, Villejuif, France. 20Département de Biologie Médicale et Pathologi
  • Emmanuelle GALLOIS; Gustave Roussy, Villejuif, France Département de Biologie Médicale et Pathologie Médicales, service de microbiologie, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Fanny POMMERET; Gustave Roussy, Villejuif, France Département Interdisciplinaire d'Organisation des Parcours Patients, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Emeline COLOMBA; Gustave Roussy, Villejuif, France Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Pernelle LAVAUD; Gustave Roussy, Villejuif, France Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Eric DEUTSCH; Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U1030, Gustave Roussy, Villejuif, France. Département de Radiothéra
  • Bertrand GACHOT; Gustave Roussy, Villejuif, France Service de Pathologie Infectieuse, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Jean-Philippe SPANO; Department of Medical Oncology, Pitié-Salpêtrière Hospital, APHP, Sorbonne Université, Paris, France
  • Mansouria Merad; Service de médecine aiguë d'urgence en cancérologie, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Florian SCOTTE; Gustave Roussy, Villejuif, France Département Interdisciplinaire d'Organisation des Parcours Patients, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Aurélien MARABELLE; Département d'Oncologie Médicale, Gustave Roussy, Villejuif, France. Département d'Innovation Thérapeutique et d'Essais Précoces (DITEP), Gustave Roussy, Villej
  • Frank GRISCELLI; Gustave Roussy, Villejuif, France Département de Biologie Médicale et Pathologie Médicales, service de microbiologie, Gustave Roussy, Villejuif, France.
  • Jean-Yves BLAY; Centre Léon Bérard, Lyon, France. Université Claude Bernard, Lyon, France.34Unicancer, Paris, France
  • Jean-Charles SORIA; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. 2Gustave Roussy, Villejuif, France
  • Fabrice ANDRE; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. 2Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Mé
  • Mathieu Chevalier; INSERM UMR 976, Institut de recherche Saint-Louis, Université de Paris, Paris, France
  • Sophie CAILLAT-ZUCMAN; Laboratory of Immunology, AP-HP, Hôpital Saint Louis, INSERM UMR1149, Université de Paris, Paris, France
  • Florence FENOLLAR; Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection, Marseille, France
  • Bernard LA SCOLA; Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection, Marseille, France.
  • Guido KROEMER; Centre de Recherche des Cordeliers, Equipe labelisee par la Ligue contre le cancer, Universite de Paris, Sorbonne Universite, Inserm U1138, Institut Universitai
  • Markus MAEURER; 13ImmunoTherapy/ImmunoSurgery, Champalimaud Foundation, Lisboa, Portugal. 45Medizinische Klinik, Johannes Gutenberg University Mainz, Germany. 46Division of Inf
  • Lisa DEROSA; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. 2Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Mé
  • Laurence ZITVOGEL; Université Paris-Saclay, Faculté de Médecine, Le Kremlin-Bicêtre, France. Gustave Roussy, Villejuif, France Institut National de la Santé et de la Recherche Méd
Preprint in En | PREPRINT-MEDRXIV | ID: ppmedrxiv-21258477
ABSTRACT
Optimal vaccination and immunotherapy against coronavirus disease COVID-19 relies on the in-depth comprehension of immune responses determining the individual susceptibility to be infected by SARS-CoV-2 and to develop severe disease. We characterized the polarity and specificity of circulating SARS-CoV-2-specific T cell responses against whole virus lysates or 186 unique peptides derived from the SARS-CoV-2 or SARS-CoV-1 ORFeome on 296 cancer-bearing and 86 cancer-free individuals who were either from the pre-COVID-19 era (67 individuals) or contemporary COVID-19-free (237 individuals) or who developed COVID-19 (78 individuals) in 2020/21. The ratio between the prototypic T helper 1 (TH1) cytokine, interleukin-2, and the prototypic T helper 2 (TH2) cytokine, interleukin-5 (IL-5), released from SARS-CoV-2-specific memory T cells measured in early 2020, among SARS-CoV-2-negative persons, was associated with the susceptibility of these individuals to develop PCR-detectable SARS-CoV-2 infection in late 2020 or 2021. Of note, T cells from individuals who recovered after SARS-CoV-2 re-infection spontaneously produced elevated levels of IL-5 and secreted the immunosuppressive TH2 cytokine interleukin-10 in response to SARS-CoV-2 lysate, suggesting that TH2 responses to SARS-CoV-2 are inadequate. Moreover, individuals susceptible to SARS-CoV-2 infection exhibited a deficit in the TH1 peptide repertoire affecting the highly mutated receptor binding domain (RBD) amino acids (331-525) of the spike protein. Finally, current vaccines successfully triggered anti-RBD specific TH1 responses in 88% healthy subjects that were negative prior to immunization. These findings indicate that COVID-19 protection relies on TH1 cell immunity against SARS-CoV-2 S1-RBD which in turn likely drives the phylogenetic escape of the virus. The next generation of COVID-19 vaccines should elicit high-avidity TH1 (rather than TH2)-like T cell responses against the RBD domain of current and emerging viral variants.
License
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Full text: 1 Collection: 09-preprints Database: PREPRINT-MEDRXIV Language: En Year: 2021 Document type: Preprint
Full text: 1 Collection: 09-preprints Database: PREPRINT-MEDRXIV Language: En Year: 2021 Document type: Preprint