Factores relevantes sobre el ensayo RT-PCR para la detección de SARS-CoV-2, virus causante del COVID-19 / Relevant factors about the RT-PCR assay for the detection of SARS-CoV-2, virus that causes COVID-19

RESUMEN

La disponibilidad de la secuencia de SARS-CoV-2 desde enero de 2020, permitió la implementación de ensayos de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa en tiempo real para la detección de este virus. Diversos tipos de muestra, reactivos y condiciones han sido estandarizados en diferentes países para utilizar este ensayo como prueba confirmativa de pacientes con COVID-19, siguiendo las indicaciones establecidas por la OMS en virtud de su alta sensibilidad y especificidad. Las condiciones generales para obtener resultados confiables de su aplicación implican detalles como la obtención de ácidos nucleicos en cantidad y pureza adecuadas de muestras que indiquen inequívocamente la presencia del virus en el paciente, incluso en etapas tempranas de la infección. El presente artículo presenta técnicas y procedimientos empleados por diferentes protocolos disponibles para la detección de SARS-CoV-2 mediante ensayos RT-PCR, efectuando comparaciones de parámetros de desempeño que permiten reconocer estrategias que pueden ser utilizadas en la mejora de este tipo de pruebas diagnósticas

ABSTRACT

The availability of the SARS-CoV-2 sequence since January 2020, allowed the implementation of real-time reverse transcription polymerase chain reaction assays for the detection of this virus. Various types of samples, reagents and conditions have been standardized in different countries to use this assay as a confirmatory test for patients with COVID-19, following the indications established by the WHO due to its high sensitivity and specificity. The general conditions for obtaining reliable results from its application involve details such as obtaining nucleic acids in adequate quantity and purity from samples that unequivocally indicate the presence of the virus in the patient, even in the early stages of infection. This article presents techniques and procedures used by different protocols available for the detection of SARS-CoV-2 by means of RT-PCR tests, making comparisons of performance parameters that allow to recognize strategies that can be used in the improvement of this type of diagnostic tests