Análisis de la demanda de detección de SARS-CoV-2 en un área de salud de España / Analysis of the demand for detection of SARS-CoV-2 in a health area of Spain

RESUMEN

INTRODUCCIÓN: Desde el descubrimiento del virus SARSCoV-2 la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) se ha convertido en el método fundamental para el diagnóstico de la enfermedad en su fase aguda. El objetivo es describir la serie basada en la demanda de determinaciones de RT-PCR recibidas en un Servicio de Microbiología en un hospital de tercer nivel de referencia durante tres meses desde el inicio de la epidemia por SARS-CoV-2. MATERIAL Y MÉTODOS: Se realizó un análisis retrospectivo del total de las RT-PCR solicitadas en el servicio de microbiología analizado desde el 25 de febrero de 2020 al 26 de mayo de 2020 (90 días). Se agruparon por semanas epidemiológicas y servicio peticionario. Se realizó un análisis descriptivo por edad, género y número de solicitudes por paciente. Se consideró significativo un nivel de confianza del 95% (p < 0.05). RESULTADOS: Se recibieron un total de 27.106 de solicitudes que correspondían a 22.037 pacientes. Edad mediana 53,7 (RIC 40,9-71,7) años, mujeres 61,3%. Proporción de pacientes con alguna RT-PCR positiva 14%. Del total de peticiones de RT-PCR fueron positivas 3.710. La rentabilidad máxima fue la semana epidemiológica 13, con un 39,0%. El servicio peticionario que más RT-PCR ha solicitado de forma global ha sido atención primaria con 15.953 solicitudes. Pacientes con 3 o más RT-PCR 565, de ellos, 19 pacientes presentaron un resultado positivo tras haber sido negativos. CONCLUSIONES: Las solicitudes han ido aumentando en función de la evolución de la epidemia. La RT-PCR posee un elevado rendimiento diagnóstico en las fases de mayor contagiosidad y/o transmisibilidad del virus

ABSTRACT

INTRODUCTION: Since the discovery of the SARS-CoV-2 virus, the polymerase chain reaction technique (RT-PCR) has become the fundamental method for diagnosing the disease in its acute phase. The objective is to describe the demand-based series of RT-PCR determinations received at a Microbiology Service at a third-level reference hospital for a health area for three months spanning from the onset of the epidemic by SARS-CoV-2. METHODS: A retrospective analysis of the total of the RT-PCR requested in the Microbiology Service analyzed from 02/25/2020 to 05/26/2020 (90 days) has been carried out. They have been grouped by epidemiological weeks and by the petitioner service. A descriptive analysis was carried out by age, gender and number of requests for each patient. In the tests carried out, a confidence level of 95% (p <0.05) was considered significant. RESULTS: A total of 27,106 requests was received corresponding to 22,037 patients. Median age 53.7 (RIC 40.9-71.7) years, women 61.3%. Proportion of patients with any positive RT-PCR 14%. Of the total requests for RT-PCR, positive 3,710. Week 13 had the highest diagnosis performance (39.0%). The primary care has been the service thar has made the most requests (15,953). Patients with 3 or more RT-PCR 565, of them, 19 patients had a positive result after previously having a negative one. CONCLUSIONS: Requests have been increasing depending on the evolution of the epidemic. The RT-PCR has a high diagnostic performance in the phases of highest contagiousness and / or transmissibility of the virus