Estudio proteomico diferencial entre liquidos pleurales secundarios a cáncer de pulmón versus mesotelioma / Differential proteomic study between pleural fluid secondary to lung cancer versus mesothelioma

RESUMEN

Objetivo: Encontrar perfiles proteicos en líquido pleural que diferencien derrames pleurales secundarios a cáncer de pulmón (CP) versus mesotelioma pleural maligno (MPM).Metodología: Recogimos líquidos pleurales de 60 pacientes de tres grupos diferentes MPM (N = 20), CP (N = 20) y derrames pleurales benignos (N = 20). Realizamos un análisis con proteómica diferencial con ITRAQ 4 plex (Applied Biosystem). Realizamos la identificación y cuantificación relativa de las proteínas con el programa Proteome Discoverer 1.4 (Termofisher Scientific). Construimos diagramas de Venn con las proteínas sobre/infra-expresadas en cada grupo. Realizamos una validación interna/externa mediante ELISA (Myobiosorce) añadiendo 25 muestras de CP y 14 de MPM.Resultados: Encontramos sobreexpresión de Pi3K en los derrames pleurales neoplásicos (16,86 +/- 25,83 ng/ml en CP; 20,66 +/- 17,26 ng/ml en MPM vs 5,92 +/- 0,99 ng/ml en controles). Hubo sobreexpresión de SPRM en MPM (30.702 +/- 30.310,53 ng/ml en el grupo MPM vs 10.404 +/- 10.157,72 ng/ml en el grupo CP vs 8.498 + /- 3.437,18 ng/ml en controles). Existió sobreexpresión de RhoB en CP (4,46 +/- 1,65 mg/ml en CP vs 1,65 +/- 2,65 mg/ml en MPM vs 0,92 +/- 1,6 mg/ml en controles). También encontramos sobreexpresión de PDGFR-alfa en derrames pleurales benignos (74,12 +/- 22,57 ng/ml en controles vs 43,05 +/- 23,96 ng/ml en CP vs 36,12 +/- 21,51 ng/ml en MPM).Conclusión: Existe un perfil diferencial proteico entre los derrames secundarios a CP (sobreexpresión de RhoB) y a MPM (sobrexpresión de SPRM). La sobrexpresión de Pi3K indica asociación a derrames pleurales malignos y la de PDGFR-alfa a derrames benignos. (AU)

ABSTRACT

Objetivo: Find protein profiles in pleural fluid that differentiate pleural effusions secondary to lung cancer (LC) versus malignant pleural mesothelioma (MPM).Metodología: We collected pleural fluids from 60 patients from three different groups MPM (N = 20), CP (N = 20), and benign pleural effusions (N = 20). We performed differential proteomics analysis with ITRAQ 4 plex (Applied Biosystem). We performed the identification and relative quantification of the proteins with the Proteome Discoverer 1.4 program (Termofisher Scientific). We built Venn diagrams with the over/under-expressed proteins in each group. We performed an internal/external validation using ELISA (Myobiosorce) adding 25 CP and 14 MPM samples.Resultados: We found Pi3K overexpression in neoplastic pleural effusions (16.86 +/- 25.83 ng/ml in PC; 20.66 +/- 17.26 ng/ml in MPM vs 5.92 +/- 0.99 ng/ml in controls). There was overexpression of SPRM in MPM (30,702 +/- 30,310.53 ng/ml in the MPM group vs 10,404 +/- 10,157.72 ng/ml in the CP group vs 8,498 +/- 3,437.18 ng/ml in controls). There was overexpression of RhoB in CP (4.46 +/- 1.65 mg/ml in CP vs 1.65 +/- 2.65 mg/ml in MPM vs 0.92 +/- 1.6 mg/ml in controls). We also found overexpression of PDGFR-alpha in benign pleural effusions (74.12 +/- 22.57 ng/ml in controls vs 43.05 +/- 23.96 ng/ml in PC vs 36.12 +/- 21.51 ng/ml in MPM ).Conclusión: There is a differential protein profile between effusions secondary to CP (RhoB overexpression) and MPM (SPRM overexpression). Pi3K overexpression indicates association with malignant pleural effusions and PDGFR-alpha overexpression with benign effusions. (AU)