Building promoter aware transcriptional regulatory networks using siRNA perturbation and deepCAGE.

Vitezic, Morana; Lassmann, Timo; Forrest, Alistair R R; Suzuki, Masanori; Tomaru, Yasuhiro; Kawai, Jun; Carninci, Piero; Suzuki, Harukazu; Hayashizaki, Yoshihide; Daub, Carsten O

Vitezic, Morana; Lassmann, Timo; Forrest, Alistair R R; Suzuki, Masanori; Tomaru, Yasuhiro; Kawai, Jun; Carninci, Piero; Suzuki, Harukazu; Hayashizaki, Yoshihide; Daub, Carsten O.

Afiliación

Vitezic M; Omics Science Center, RIKEN Yokohama Institute, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama 230-0045, Japan. mvitezic@gsc.riken.jp

Nucleic Acids Res ; 38(22): 8141-8, 2010 Dec.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-20724440

Asunto(s)

Redes Reguladoras de Genes; Regiones Promotoras Genéticas; Factores de Transcripción/metabolismo; Transcripción Genética; Sitios de Unión; Línea Celular Tumoral; Perfilación de la Expresión Génica; Técnicas de Silenciamiento del Gen; Humanos; Factores Reguladores del Interferón/antagonistas & inhibidores; Factores Reguladores del Interferón/genética; Factores Reguladores del Interferón/metabolismo; Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos; Proteínas Proto-Oncogénicas/antagonistas & inhibidores; Proteínas Proto-Oncogénicas/genética; Proteínas Proto-Oncogénicas/metabolismo; ARN Interferente Pequeño; Análisis de Secuencia de ADN; Transactivadores/antagonistas & inhibidores; Transactivadores/genética; Transactivadores/metabolismo

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Factores de Transcripción / Transcripción Genética / Regiones Promotoras Genéticas / Redes Reguladoras de Genes Límite: Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Año: 2010 Tipo del documento: Article País de afiliación: Japón

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