RSAT::Plants: Motif Discovery Within Clusters of Upstream Sequences in Plant Genomes.

Contreras-Moreira, Bruno; Castro-Mondragon, Jaime A; Rioualen, Claire; Cantalapiedra, Carlos P; van Helden, Jacques

Contreras-Moreira, Bruno; Castro-Mondragon, Jaime A; Rioualen, Claire; Cantalapiedra, Carlos P; van Helden, Jacques.

Afiliación

Contreras-Moreira B; Estación Experimental de Aula Dei-CSIC, Av. Montañana 1.005, 50059, Zaragoza, Spain. bcontreras@eead.csic.es.
Castro-Mondragon JA; Fundación ARAID, calle María de Luna 11, 50018, Zaragoza, Spain. bcontreras@eead.csic.es.
Rioualen C; INSERM, U1090 TAGC, Aix Marseille University, U1090 TAGC, Marseille, 13288, France.
Cantalapiedra CP; INSERM, U1090 TAGC, Aix Marseille University, U1090 TAGC, Marseille, 13288, France.
van Helden J; Estación Experimental de Aula Dei-CSIC, Av. Montañana 1.005, 50059, Zaragoza, Spain.

Methods Mol Biol ; 1482: 279-95, 2016.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27557774

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Genómica/métodos; Elementos Reguladores de la Transcripción/genética; Programas Informáticos; Regulación de la Expresión Génica de las Plantas; Genoma de Planta/genética; Motivos de Nucleótidos/genética; Factores de Transcripción/genética

Palabras clave

Cluster; Co-expression; DNA motif; Position-weight matrix; Upstream sequence

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Biología Computacional / Genómica / Elementos Reguladores de la Transcripción Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: España Pais de publicación: Estados Unidos

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