Variant Effect Prediction Analysis Using Resources Available at Gramene Database.

Naithani, Sushma; Geniza, Matthew; Jaiswal, Pankaj

Naithani, Sushma; Geniza, Matthew; Jaiswal, Pankaj.

Afiliación

Naithani S; Department of Botany and Plant Pathology, Oregon State University, 2082 Cordley Hall, Corvallis, OR, 97331-2902, USA.
Geniza M; Department of Botany and Plant Pathology, Oregon State University, 2082 Cordley Hall, Corvallis, OR, 97331-2902, USA.
Jaiswal P; Molecular and Cellular Biology Graduate Program, Oregon State University, Corvallis, OR, 97331-2902, USA.

Methods Mol Biol ; 1533: 279-297, 2017.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27987178

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Productos Agrícolas/genética; Bases de Datos Genéticas; Genómica; Plantas/genética; Navegador Web; Variación Genética; Genómica/métodos; Programas Informáticos; Interfaz Usuario-Computador

Palabras clave

Ensembl plant genomes; Genomic variation; Genotype data; Gramene; Gramene Ensembl Genome Browser; Indels; Nucleotide variation; SNP; VEP; Variant effect predictor

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Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Plantas / Productos Agrícolas / Biología Computacional / Genómica / Bases de Datos Genéticas / Navegador Web Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Estados Unidos

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