Vipie: web pipeline for parallel characterization of viral populations from multiple NGS samples.

Lin, Jake; Kramna, Lenka; Autio, Reija; Hyöty, Heikki; Nykter, Matti; Cinek, Ondrej

Lin, Jake; Kramna, Lenka; Autio, Reija; Hyöty, Heikki; Nykter, Matti; Cinek, Ondrej.

Afiliación

Lin J; BioMediTech and Faculty of Medicine and Life Sciences, University of Tampere, PB 100, FI-33014, Tampere, Finland.
Kramna L; Department of Pediatrics, 2nd Faculty of Medicine, Charles University and University Hospital Motol, V Úvalu 84, 150 06, Praha 5, Czech Republic.
Autio R; School of Social Sciences, University of Tampere, Kalevantie 4, 33100, Tampere, Finland.
Hyöty H; BioMediTech and Faculty of Medicine and Life Sciences, University of Tampere, PB 100, FI-33014, Tampere, Finland. heikki.hyoty@uta.fi.
Nykter M; Fimlab Laboratories, Pirkanmaa Hospital District, Tampere, Finland. heikki.hyoty@uta.fi.
Cinek O; BioMediTech and Faculty of Medicine and Life Sciences, University of Tampere, PB 100, FI-33014, Tampere, Finland. matti.nykter@uta.fi.

BMC Genomics ; 18(1): 378, 2017 05 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28506246

Asunto(s)

Genómica/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Internet; Programas Informáticos; Virus/genética; Variación Genética; Humanos; Microbiota/genética

Palabras clave

Assembly; Metagenomics; NGS analysis; Parallel processing; Viral dark matter; Viromes; Virus; Visualization

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Virus / Programas Informáticos / Internet / Genómica / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Guideline Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Finlandia Pais de publicación: Reino Unido

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