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Taxonogenomic description of four new Clostridium species isolated from human gut: 'Clostridium amazonitimonense', 'Clostridium merdae', 'Clostridium massilidielmoense' and 'Clostridium nigeriense'.
Alou, M T; Ndongo, S; Frégère, L; Labas, N; Andrieu, C; Richez, M; Couderc, C; Baudoin, J-P; Abrahão, J; Brah, S; Diallo, A; Sokhna, C; Cassir, N; La Scola, B; Cadoret, F; Raoult, D.
Afiliación
  • Alou MT; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Ndongo S; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Frégère L; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Labas N; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Andrieu C; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Richez M; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Couderc C; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Baudoin JP; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Abrahão J; Laboratório de Vírus, Departamento de Microbiologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil.
  • Brah S; Hopital National de Niamey, BP 247, Niamey, Niger.
  • Diallo A; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Sokhna C; Campus Commun UCAD-IRD of Hann, Route des pères Maristes, Hann Maristes, BP 1386, CP 18524, Dakar, Senegal.
  • Cassir N; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • La Scola B; Campus Commun UCAD-IRD of Hann, Route des pères Maristes, Hann Maristes, BP 1386, CP 18524, Dakar, Senegal.
  • Cadoret F; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
  • Raoult D; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.
New Microbes New Infect ; 21: 128-139, 2018 Jan.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29348922
Culturomics investigates microbial diversity of the human microbiome by combining diversified culture conditions, matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry and 16S rRNA gene identification. The present study allowed identification of four putative new Clostridium sensu stricto species: 'Clostridium amazonitimonense' strain LF2T, 'Clostridium massilidielmoense' strain MT26T, 'Clostridium nigeriense' strain Marseille-P2414T and 'Clostridium merdae' strain Marseille-P2953T, which we describe using the concept of taxonogenomics. We describe the main characteristics of each bacterium and present their complete genome sequence and annotation.
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: New Microbes New Infect Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Reino Unido

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: New Microbes New Infect Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia Pais de publicación: Reino Unido