DeepSNP: An End-to-End Deep Neural Network with Attention-Based Localization for Breakpoint Detection in Single-Nucleotide Polymorphism Array Genomic Data.

Eghbal-Zadeh, Hamid; Fischer, Lukas; Popitsch, Niko; Kromp, Florian; Taschner-Mandl, Sabine; Gerber, Teresa; Bozsaky, Eva; Ambros, Peter F; Ambros, Inge M; Widmer, Gerhard; Moser, Bernhard A

Eghbal-Zadeh, Hamid; Fischer, Lukas; Popitsch, Niko; Kromp, Florian; Taschner-Mandl, Sabine; Gerber, Teresa; Bozsaky, Eva; Ambros, Peter F; Ambros, Inge M; Widmer, Gerhard; Moser, Bernhard A.

Afiliación

Eghbal-Zadeh H; 1 Institute of Computational Perception, Johannes Kepler University, Linz, Austria.
Fischer L; 2 Software Comptence Center Hagenberg (SCCH), Hagenberg, Austria.
Popitsch N; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Kromp F; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Taschner-Mandl S; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Gerber T; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Bozsaky E; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Ambros PF; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Ambros IM; 3 Children's Cancer Research Insitute (CCRI), Vienna, Austria.
Widmer G; 1 Institute of Computational Perception, Johannes Kepler University, Linz, Austria.
Moser BA; 2 Software Comptence Center Hagenberg (SCCH), Hagenberg, Austria.

J Comput Biol ; 26(6): 572-596, 2019 06.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30585743

Asunto(s)

Genómica/métodos; Polimorfismo de Nucleótido Simple/genética; Algoritmos; Hibridación Genómica Comparativa/métodos; Biología Computacional/métodos; Variaciones en el Número de Copia de ADN/genética; Aprendizaje Profundo; Genoma Humano/genética; Humanos; Redes Neurales de la Computación; Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos/métodos

Palabras clave

SNPa; breakpoint detection; deep neural networks; weak label

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Polimorfismo de Nucleótido Simple / Genómica Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Guideline / Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: J Comput Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Austria Pais de publicación: Estados Unidos

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google