Protein Molecular Dynamics Simulations with Approximate QM: What Can We Learn?

Irle, Stephan; Vuong, Van Q; Elayyan, Mouhmad H; Talipov, Marat R; Abel, Steven M

Irle, Stephan; Vuong, Van Q; Elayyan, Mouhmad H; Talipov, Marat R; Abel, Steven M.

Afiliación

Irle S; Computational Sciences and Engineering Division & Chemical Sciences Division, Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA. irles@ornl.gov.
Vuong VQ; Bredesen Center for Interdisciplinary Research and Graduate Education, The University of Tennessee, Knoxville, TN, USA. irles@ornl.gov.
Elayyan MH; Computational Sciences and Engineering Division & Chemical Sciences Division, Oak Ridge National Laboratory, Oak Ridge, TN, USA.
Talipov MR; Bredesen Center for Interdisciplinary Research and Graduate Education, The University of Tennessee, Knoxville, TN, USA.
Abel SM; Department of Chemical Engineering, Tennessee Tech University, Cookeville, TN, USA.

Methods Mol Biol ; 2114: 149-161, 2020.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32016892

Asunto(s)

Descubrimiento de Drogas/métodos; Proteínas/química; Simulación de Dinámica Molecular; Péptidos/química; Preparaciones Farmacéuticas/química; Teoría Cuántica

Palabras clave

Density-functional tight-binding; Molecular dynamics simulations; Near-linear scaling methods; Neoantigen therapy

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas / Descubrimiento de Drogas Tipo de estudio: Prognostic_studies / Qualitative_research Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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