Reckoning a fungal metabolite, Pyranonigrin A as a potential Main protease (M<sup>pro</sup>) inhibitor of novel SARS-CoV-2 virus identified using docking and molecular dynamics simulation.

Rao, Priyashi; Shukla, Arpit; Parmar, Paritosh; Rawal, Rakesh M; Patel, Baldev; Saraf, Meenu; Goswami, Dweipayan

Reckoning a fungal metabolite, Pyranonigrin A as a potential Main protease (M^pro) inhibitor of novel SARS-CoV-2 virus identified using docking and molecular dynamics simulation.

Rao, Priyashi; Shukla, Arpit; Parmar, Paritosh; Rawal, Rakesh M; Patel, Baldev; Saraf, Meenu; Goswami, Dweipayan.

Afiliación

Rao P; Department of Biochemistry & Forensic Science, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Shukla A; Department of Microbiology & Biotechnology, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Parmar P; Department of Microbiology & Biotechnology, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Rawal RM; Department of Biochemistry & Forensic Science, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Patel B; Department of Microbiology & Biotechnology, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Saraf M; Department of Microbiology & Biotechnology, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India.
Goswami D; Department of Microbiology & Biotechnology, University School of Sciences, Gujarat University, Ahmedabad 380009, Gujarat, India. Electronic address: dweipayan.goswami@gujaratuniversity.ac.in.

Biophys Chem ; 264: 106425, 2020 09.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32663708

Asunto(s)

Antivirales/química; Betacoronavirus/enzimología; Inhibidores de Proteasas/química; Pironas/química; Pirroles/química; Proteínas no Estructurales Virales/antagonistas & inhibidores; Betacoronavirus/patogenicidad; Sitios de Unión; Proteasas 3C de Coronavirus; Cristalografía por Rayos X; Cisteína Endopeptidasas/química; Cisteína Endopeptidasas/genética; Cisteína Endopeptidasas/metabolismo; Descubrimiento de Drogas; Expresión Génica; Enlace de Hidrógeno; Simulación del Acoplamiento Molecular; Simulación de Dinámica Molecular; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Conformación Proteica en Lámina beta; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; SARS-CoV-2; Homología de Secuencia de Aminoácido; Termodinámica; Proteínas no Estructurales Virales/química; Proteínas no Estructurales Virales/genética; Proteínas no Estructurales Virales/metabolismo

Palabras clave

Docking; Fungal metabolites; Main protease (M(pro)); Molecular dynamics simulation; SARS-CoV-2 novel corona virus

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Antivirales / Inhibidores de Proteasas / Pironas / Pirroles / Proteínas no Estructurales Virales / Betacoronavirus Idioma: En Revista: Biophys Chem Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: India Pais de publicación: Países Bajos

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