A simple method for high molecular-weight genomic DNA extraction suitable for long-read sequencing from spores of an obligate biotroph oomycete.

Penouilh-Suzette, Charlotte; Fourré, Sandra; Besnard, Guillaume; Godiard, Laurence; Pecrix, Yann

Penouilh-Suzette, Charlotte; Fourré, Sandra; Besnard, Guillaume; Godiard, Laurence; Pecrix, Yann.

Afiliación

Penouilh-Suzette C; LIPM (Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes), INRAE, CNRS, Université de Toulouse, 24 Chemin de Borde-Rouge, BP 52627, F-31326 Castanet-Tolosan, France. Electronic address: charlotte.penouilh@gmail.com.
Fourré S; GeT-PlaGe, INRAE Auzeville, US 1426, 24 Chemin de Borde-Rouge, BP 52627, F-31326 Castanet-Tolosan, France. Electronic address: sandra.fourre@inrae.fr.
Besnard G; CNRS, Université Paul Sabatier, IRD, UMR 5174 EDB (Laboratoire Évolution et Diversité Biologique), 118 route de Narbonne, F-31062 Toulouse, France. Electronic address: guillaume.besnard@univ-tlse3.fr.
Godiard L; LIPM (Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes), INRAE, CNRS, Université de Toulouse, 24 Chemin de Borde-Rouge, BP 52627, F-31326 Castanet-Tolosan, France. Electronic address: laurence.godiard@inrae.fr.
Pecrix Y; LIPM (Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes), INRAE, CNRS, Université de Toulouse, 24 Chemin de Borde-Rouge, BP 52627, F-31326 Castanet-Tolosan, France; CIRAD, UMR 53 Peuplements Végétaux et Bioagresseurs en Milieu Tropical (PVBMT), Pole de Protection des Plantes, 7 chemin de l'IRAT,

J Microbiol Methods ; 178: 106054, 2020 Sep 12.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32926900

Palabras clave

Downy mildew; High molecular weight genomic DNA; Long-read sequencing; Oomycete; PacBio; Spores

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Idioma: En Revista: J Microbiol Methods Año: 2020 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Países Bajos

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