Ensemble-based enzyme design can recapitulate the effects of laboratory directed evolution in silico.

Broom, Aron; Rakotoharisoa, Rojo V; Thompson, Michael C; Zarifi, Niayesh; Nguyen, Erin; Mukhametzhanov, Nurzhan; Liu, Lin; Fraser, James S; Chica, Roberto A

Broom, Aron; Rakotoharisoa, Rojo V; Thompson, Michael C; Zarifi, Niayesh; Nguyen, Erin; Mukhametzhanov, Nurzhan; Liu, Lin; Fraser, James S; Chica, Roberto A.

Afiliación

Broom A; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Rakotoharisoa RV; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Thompson MC; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.
Zarifi N; Department of Chemistry and Chemical Biology, University of California, Merced, Merced, CA, 95343, USA.
Nguyen E; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Mukhametzhanov N; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Liu L; Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, University of Ottawa, 10 Marie Curie, Ottawa, ON, K1N 6N5, Canada.
Fraser JS; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.
Chica RA; Department of Bioengineering and Therapeutic Science, University of California, San Francisco, San Francisco, CA, 94158, USA.

Nat Commun ; 11(1): 4808, 2020 09 23.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32968058

Asunto(s)

Simulación por Computador; Evolución Molecular Dirigida/métodos; Enzimas/química; Evolución Química; Liasas/química; Catálisis; Dominio Catalítico; Cristalografía por Rayos X; Estabilidad de Enzimas; Enzimas/genética; Enzimas/metabolismo; Cinética; Liasas/genética; Liasas/metabolismo; Simulación de Dinámica Molecular; Mutación; Conformación Proteica; Ingeniería de Proteínas

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Simulación por Computador / Evolución Molecular Dirigida / Evolución Química / Enzimas / Liasas Idioma: En Revista: Nat Commun Asunto de la revista: BIOLOGIA / CIENCIA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá Pais de publicación: Reino Unido

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