Mustache: multi-scale detection of chromatin loops from Hi-C and Micro-C maps using scale-space representation.

Roayaei Ardakany, Abbas; Gezer, Halil Tuvan; Lonardi, Stefano; Ay, Ferhat

Roayaei Ardakany, Abbas; Gezer, Halil Tuvan; Lonardi, Stefano; Ay, Ferhat.

Afiliación

Roayaei Ardakany A; Centers for Autoimmunity and Cancer Immunotherapy, La Jolla Institute for Immunology, La Jolla, 92037, CA, USA.
Gezer HT; Computer Science and Engineering, University of California, Riverside, Riverside, 92521, CA, USA.
Lonardi S; Centers for Autoimmunity and Cancer Immunotherapy, La Jolla Institute for Immunology, La Jolla, 92037, CA, USA.
Ay F; Computer Science and Engineering, Sabanci University, Tuzla, Istanbul, 34956, Turkey.

Genome Biol ; 21(1): 256, 2020 09 30.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32998764

Asunto(s)

Inteligencia Artificial; Cromatina; Genómica/métodos; Programas Informáticos; Conformación de Ácido Nucleico

Palabras clave

CTCF; ChIA-PET; Chromatin loops; Cohesin; Contact maps; Genome architecture; Hi-C; HiChIP; Micro-C; Promoter-enhancer interactions

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Inteligencia Artificial / Cromatina / Genómica Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Evaluation_studies Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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