Tissue-Specific Transcription Footprinting Using RNA PoI DamID (RAPID) in <i>Caenorhabditis elegans</i>.

Gómez-Saldivar, Georgina; Osuna-Luque, Jaime; Semple, Jennifer I; Glauser, Dominique A; Jarriault, Sophie; Meister, Peter

Tissue-Specific Transcription Footprinting Using RNA PoI DamID (RAPID) in Caenorhabditis elegans.

Gómez-Saldivar, Georgina; Osuna-Luque, Jaime; Semple, Jennifer I; Glauser, Dominique A; Jarriault, Sophie; Meister, Peter.

Afiliación

Gómez-Saldivar G; Department of Biology, University of Fribourg, Fribourg 1700, Switzerland.
Osuna-Luque J; Cell Fate and Nuclear Organization, Institute of Cell Biology, University of Bern, 3012, Switzerland.
Semple JI; IGBMC, DBSC Dept/INSERM U1258/CNRS UMR7104/Université de Strasbourg, 67400 France.
Glauser DA; Graduate School for Cellular and Biomedical Sciences, University of Bern, 3012, Switzerland.
Jarriault S; Cell Fate and Nuclear Organization, Institute of Cell Biology, University of Bern, 3012, Switzerland.
Meister P; Department of Biology, University of Fribourg, Fribourg 1700, Switzerland dominique.glauser@unifr.ch sophie@igbmc.fr peter.meister@izb.unibe.ch.

Genetics ; 216(4): 931-945, 2020 12.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33037050

Asunto(s)

Proteínas de Caenorhabditis elegans/genética; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/metabolismo; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Huella de Proteína/métodos; RNA-Seq/métodos; Metiltransferasa de ADN de Sitio Específico (Adenina Especifica)/metabolismo; Animales; Blastómeros/metabolismo; Caenorhabditis elegans; Proteínas de Caenorhabditis elegans/metabolismo; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/genética; Perfilación de la Expresión Génica/normas; Células Neuroendocrinas/metabolismo; Especificidad de Órganos; Huella de Proteína/normas; RNA-Seq/normas; Proteínas Recombinantes/genética; Proteínas Recombinantes/metabolismo; Metiltransferasa de ADN de Sitio Específico (Adenina Especifica)/genética

Palabras clave

C. elegans targeted DamID; ONT long read sequencing; RNA polymerase footprinting; single cell type gene expression analysis

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: ARN Polimerasas Dirigidas por ADN / Metiltransferasa de ADN de Sitio Específico (Adenina Especifica) / Perfilación de la Expresión Génica / Huella de Proteína / Proteínas de Caenorhabditis elegans / RNA-Seq Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Genetics Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Suiza Pais de publicación: Estados Unidos

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