Insights into the evolutionary forces that shape the codon usage in the viral genome segments encoding intrinsically disordered protein regions.

Kumar, Naveen; Kaushik, Rahul; Tennakoon, Chandana; Uversky, Vladimir N; Longhi, Sonia; Zhang, Kam Y J; Bhatia, Sandeep

Kumar, Naveen; Kaushik, Rahul; Tennakoon, Chandana; Uversky, Vladimir N; Longhi, Sonia; Zhang, Kam Y J; Bhatia, Sandeep.

Afiliación

Kumar N; Diagnostic & Vaccine Group, ICAR-National Institute of High Security Animal Diseases, Bhopal 462022, India.
Kaushik R; Laboratory for Structural Bioinformatics, Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN, 1-7-22 Suehiro, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan.
Tennakoon C; The Pirbright Institute, Woking GU24 0NF, UK.
Uversky VN; Department of Molecular Medicine, Morsani College of Medicine, University of South Florida, Tampa, FL 33612, USA.
Longhi S; Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Federal Research Center 'Pushchino Scientific Center for Biological Research of the Russian Academy of Sciences', Moscow region, Pushchino 142290, Russia.
Zhang KYJ; Aix-Marseille Université and CNRS, Laboratoire Architecture et Fonction des Macromolecules Biologiques (AFMB), UMR 7257, Marseille, France.
Bhatia S; Laboratory for Structural Bioinformatics, Center for Biosystems Dynamics Research, RIKEN, 1-7-22 Suehiro, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan.

Brief Bioinform ; 22(5)2021 09 02.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33866372

Asunto(s)

Uso de Codones/genética; Evolución Molecular; Genoma Viral/genética; Proteínas Intrínsecamente Desordenadas/genética; Proteínas Virales/genética; Algoritmos; Biología Computacional/métodos; Islas de CpG/genética; Proteínas Intrínsecamente Desordenadas/metabolismo; Mutación; Biosíntesis de Proteínas/genética; Procesamiento Proteico-Postraduccional; Proteoma/genética; Proteoma/metabolismo; Proteómica/métodos; ARN de Transferencia/genética; ARN de Transferencia/metabolismo; Reproducibilidad de los Resultados; Selección Genética; Proteínas Virales/metabolismo

Palabras clave

CpG contents; disorder prediction algorithms; evolutionary forces; intrinsically disordered regions; translation adaptation; viral proteome

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Virales / Genoma Viral / Evolución Molecular / Proteínas Intrínsecamente Desordenadas / Uso de Codones Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: India Pais de publicación: Reino Unido

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