Profile hidden Markov model sequence analysis can help remove putative pseudogenes from DNA barcoding and metabarcoding datasets.

Porter, T M; Hajibabaei, M

Porter, T M; Hajibabaei, M.

Afiliación

Porter TM; Department of Integrative Biology and Centre for Biodiversity Genomics, University of Guelph, 50 Stone Road East, Guelph, ON, Canada. terrimporter@gmail.com.
Hajibabaei M; Department of Integrative Biology and Centre for Biodiversity Genomics, University of Guelph, 50 Stone Road East, Guelph, ON, Canada.

BMC Bioinformatics ; 22(1): 256, 2021 May 19.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34011275

Asunto(s)

Código de Barras del ADN Taxonómico; Seudogenes; Núcleo Celular; ADN Mitocondrial; Mitocondrias/genética; Filogenia; Seudogenes/genética; Análisis de Secuencia de ADN

Palabras clave

Bioinformatics; COI mtDNA; DNA barcode; Hidden Markov model; Metabarcode; NuMT; Nuclear encoded mitochondrial sequences; Pseudogene

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Seudogenes / Código de Barras del ADN Taxonómico Tipo de estudio: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá Pais de publicación: Reino Unido

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