Separating the Wheat from the Chaff: The Use of Upstream Regulator Analysis to Identify True Differential Expression of Single Genes within Transcriptomic Datasets.

Hadwen, Jeremiah; Schock, Sarah; Farooq, Faraz; MacKenzie, Alex; Plaza-Diaz, Julio

Hadwen, Jeremiah; Schock, Sarah; Farooq, Faraz; MacKenzie, Alex; Plaza-Diaz, Julio.

Afiliación

Hadwen J; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.
Schock S; Children's Hospital of Eastern Ontario Research Institute, Ottawa, ON K1H8L1, Canada.
Farooq F; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.
MacKenzie A; Children's Hospital of Eastern Ontario Research Institute, Ottawa, ON K1H8L1, Canada.
Plaza-Diaz J; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.

Int J Mol Sci ; 22(12)2021 Jun 11.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34208365

Asunto(s)

Bases de Datos Genéticas; Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos/genética; Transcriptoma/genética; Animales; Línea Celular Tumoral; Regulación hacia Abajo/efectos de los fármacos; Regulación hacia Abajo/genética; Redes Reguladoras de Genes/efectos de los fármacos; Masculino; Ratones Endogámicos C57BL; Reproducibilidad de los Resultados; Tiroxina/farmacología; Transcriptoma/efectos de los fármacos

Palabras clave

differential expression analysis; drug repurposing; rare disease; transcriptomics

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Secuencias Reguladoras de Ácidos Nucleicos / Bases de Datos Genéticas / Transcriptoma Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá Pais de publicación: Suiza

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