RODAN: a fully convolutional architecture for basecalling nanopore RNA sequencing data.

Neumann, Don; Reddy, Anireddy S N; Ben-Hur, Asa

Neumann, Don; Reddy, Anireddy S N; Ben-Hur, Asa.

Afiliación

Neumann D; Department of Computer Science, Colorado State University, 1873 Campus Delivery, Fort Collins, CO, 80523-1873, USA.
Reddy ASN; Department of Biology, Colorado State University, 1878 Campus Delivery, Fort Collins, CO, 80523-1878, USA.
Ben-Hur A; Department of Computer Science, Colorado State University, 1873 Campus Delivery, Fort Collins, CO, 80523-1873, USA. asa@colostate.edu.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 142, 2022 Apr 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35443610

Asunto(s)

Secuenciación de Nanoporos; Nanoporos; ADN; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; ARN; Análisis de Secuencia de ADN; Análisis de Secuencia de ARN

Palabras clave

Convolutional networks; Long read sequencing; Oxford nanopore; RNA basecalling

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Nanoporos / Secuenciación de Nanoporos Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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