[Contribution of the University Clinical Research Center's laboratoryin the diagnosis of SARS-CoV-2 in Mali]. / Contribution du laboratoire du Centre Universitaire de Recherche Clinique (UCRC) au diagnostic de SRAS-CoV-2 au Mali.

ABSTRACT

INTRODUCTION: The rapid diagnostic capacities of laboratories in Mali have been an essential element in the response to COVID-19. The University Clinical Research center (UCRC) diagnosed the first cases of Mali COVID-19. OBJECTIVE: The objective was to describe the contribution of the UCRC in the diagnosis of Covid-19 and to clinically and epidemiologically characterize the patients tested in the UCRC laboratory. MATERIALS AND METHODS: A cross-sectional study was conducted during eight months of intense activity. The samples were sent from the National Institute of Public Health (INSP) to the UCRC. RESULTS: The UCRC tested 12,406 contacts and suspected samples and confirmed the diagnosis in 1091 patients, or 9%. The most common symptoms were cough (48.78%), headache (34.14%), fatigue / weakness (34.14%), while (33.33%) of the patients were asymptomatic. The sample positivity rate among new cases decreased from May to September 2020, despite almost 230% of the number of samples tested. CONCLUSION: The laboratory played a major role in the response and there may be a low transmission of the virus in the Malian community.

INTRODUCTION: Les capacités de diagnostic rapide des laboratoires au Mali ont été un élément essentiel dans la riposte contre la COVID-19. Le Centre Universitaire de Recherche Clinique (UCRC)a diagnostiqué les premiers cas du Mali. OBJECTIF Etait de décrire l'apport de l'UCRC dans le diagnostic de la Covid-19 et de caractériser cliniquement et épidémiologiquement les patients testés au laboratoire de l'UCRC. MATÉRIELS ET MÉTHODES Une étude transversale a été conduite pendant huit mois d'activité intense. Les échantillons ont été envoyés de l'Institut National de Santé Publique (INSP) à l'UCRC. RÉSULTATS L'UCRC a testé 12 406 échantillons contacts et suspects et a confirmé le diagnostic chez 1091 patients soit 9%. Les symptômes les plus rencontrés ont été la toux (48,78%), les maux de tête (34,14%), la fatigue/faiblesse (34,14%), tandis que (33,33%) des patients étaient asymptomatiques. Le taux de positivité des échantillons a diminué entre mai et août et avec une légère diminution en septembre 2020,avec près de 230% du nombre d'échantillons testés. CONCLUSION: Le laboratoire a joué un grand rôle dans la riposte et il y'aurait une faible transmission du virus dans la communauté Malienne.