Virtual screening based on molecular docking of lysosomotropic compounds as therapeutic agents for COVID-19 / Triagem virtual baseada no encaixe molecular de compostos lisossomotrópicos como agentes terapêuticos para COVID-19
J. Health Biol. Sci. (Online)
; 10(1): 1-12, 01/jan./2022. tab, ilus
Artigo
em Inglês
| LILACS
| ID: biblio-1378476
Biblioteca responsável:
BR1780.2
ABSTRACT
Objective:
Analyze lysosomotropic agents and their action on COVID-19 targets using the molecular docking technique.Methods:
Molecular docking analyses of these lysosomotropic agents were performed, namely of fluoxetine, imipramine, chloroquine, verapamil, tamoxifen, amitriptyline, and chlorpromazine against important targets for the pathogenesis of SARS-CoV-2.Results:
The results revealed that the inhibitors bind to distinct regions of Mpro COVID-19, with variations in RMSD values from 1.325 to 1.962 Å and binding free energy of -5.2 to -4.3 kcal/mol. Furthermore, the analysis of the second target showed that all inhibitors bonded at the same site as the enzyme, and the interaction resulted in an RMSD variation of 0.735 to 1.562 Å and binding free energy ranging from -6.0 to -8.7 kcal/mol.Conclusion:
Therefore, this study allows proposing the use of these lysosomotropic compounds. However, these computer simulations are just an initial step toward conceiving new projects for the development of antiviral molecules.RESUMO
Objetivo:
aAnalisar agentes lisossomotrópicos e sua ação em alvos de COVID-19 usando a técnica de docking molecular.Métodos:
Foram realizadas análises de docagem molecular destes agentes lisossomotrópicos, nomeadamente de fluoxetina, imipramina, cloroquina, verapamil, tamoxifeno, amitriptilina e clorpromazina contra alvos importantes para a patogenia do SARS-CoV-2.Resultados:
Os resultados revelaram que os inibidores se ligam a regiões distintas do Mpro COVID-19, com variações nos valores de RMSD de 1.325 a 1.962 Å e energia livre de ligação de -5,2 a -4,3 kcal/mol. Além disso, a análise do segundo alvo mostrou que todos os inibidores se ligaram no mesmo sítio da enzima, e a interação resultante em uma variação de RMSD de 0,735 a 1.562 Å e energia livre de ligação variando de -6,0 a -8,7 kcal/mol.Conclusão:
Portanto, este estudo permite propor o uso desses compostos lisossomotrópicos. No entanto, essas simulações em computador são apenas um passo inicial para a concepção de novos projetos para o desenvolvimento de moléculas antivirais.
Texto completo:
Disponível
Coleções:
Bases de dados internacionais
Contexto em Saúde:
ODS3 - Saúde e Bem-Estar
/
ODS3 - Meta 3.3 Acabar com as doenças tropicais negligenciadas e combater as doenças transmissíveis
Problema de saúde:
Meta 3.4: Reduzir as mortes prematuras devido doenças não transmissíveis
/
Pneumonía
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
SARS-CoV-2
/
COVID-19
Tipo de estudo:
Estudo diagnóstico
/
Estudo de rastreamento
Idioma:
Inglês
Revista:
J. Health Biol. Sci. (Online)
Assunto da revista:
Cincias da Sa£de
/
Disciplinas das Cincias Biol¢gicas
Ano de publicação:
2022
Tipo de documento:
Artigo
País de afiliação:
Brasil
Instituição/País de afiliação:
Christus University Center (UNICHRISTUS)/BR
/
Christus University Center (UNICHRISTUS),/BR
/
Federal University of Ceará/BR
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University of Ceará, Limoeiro do Norte, Ceará/BR