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Multiplexed reverse transcription real-time polymerase chain reaction for simultaneous detection of Mayaro, Oropouche, and Oropouche-like viruses
Naveca, Felipe Gomes; Nascimento, Valdinete Alves do; Souza, Victor Costa de; Nunes, Bruno Tardelli Diniz; Rodrigues, Daniela Sueli Guerreiro; Vasconcelos, Pedro Fernando da Costa.
Afiliação
  • Naveca, Felipe Gomes; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
  • Nascimento, Valdinete Alves do; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
  • Souza, Victor Costa de; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
  • Nunes, Bruno Tardelli Diniz; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
  • Rodrigues, Daniela Sueli Guerreiro; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
  • Vasconcelos, Pedro Fernando da Costa; Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Manaus. BR
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 112(7): 510-513, July 2017. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS | ID: biblio-841812
Biblioteca responsável: BR1.1
ABSTRACT
ABSTRACT We describe a sensitive method for simultaneous detection of Oropouche and Oropouche-like viruses carrying the Oropouche S segment, as well as the Mayaro virus, using a multiplexed one-step reverse transcription real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR). A chimeric plasmid containing both Mayaro and Oropouche targets was designed and evaluated for the in vitro production of transcribed RNA, which could be easily used as a non-infectious external control. To track false-negative results due to PCR inhibition or equipment malfunction, the MS2 bacteriophage was also included in the multiplex assay as an internal positive control. The specificity of the multiplex assay was evaluated by Primer-Blast analysis against the entire GenBank database, and further against a panel of 17 RNA arboviruses. The results indicated an accurate and highly sensitive assay with amplification efficiency greater than 98% for both targets, and a limit of detection between two and 20 copies per reaction. We believe that the assay described here will provide a tool for Mayaro and Oropouche virus detection, especially in areas where differential diagnosis of Dengue, Zika and Chikungunya viruses should be performed.
Assuntos


Texto completo: Disponível Coleções: Bases de dados internacionais Contexto em Saúde: Doenças Negligenciadas Problema de saúde: Febre de Chikungunya / Dengue / Doenças Negligenciadas Base de dados: LILACS Assunto principal: Orthobunyavirus / Infecções por Bunyaviridae / Infecções por Alphavirus / Alphavirus / Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa Tipo de estudo: Estudo diagnóstico Limite: Humanos Idioma: Inglês Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Assunto da revista: Medicina Tropical / Parasitologia Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Artigo País de afiliação: Brasil Instituição/País de afiliação: Fundação Oswaldo Cruz/BR

Texto completo: Disponível Coleções: Bases de dados internacionais Contexto em Saúde: Doenças Negligenciadas Problema de saúde: Febre de Chikungunya / Dengue / Doenças Negligenciadas Base de dados: LILACS Assunto principal: Orthobunyavirus / Infecções por Bunyaviridae / Infecções por Alphavirus / Alphavirus / Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa Tipo de estudo: Estudo diagnóstico Limite: Humanos Idioma: Inglês Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Assunto da revista: Medicina Tropical / Parasitologia Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Artigo País de afiliação: Brasil Instituição/País de afiliação: Fundação Oswaldo Cruz/BR
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