Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil
Braz. j. microbiol
; 48(4): 612-614, Oct.-Dec. 2017. tab
Artigo
em Inglês
| LILACS
| ID: biblio-889174
Biblioteca responsável:
BR1.1
ABSTRACT
ABSTRACT Here, we show the draft genome sequence of Streptomyces sp. F1, a strain isolated from soil with great potential for secretion of hydrolytic enzymes used to deconstruct cellulosic biomass. The draft genome assembly of Streptomyces sp. strain F1 has 69 contigs with a total genome size of 8,142,296 bp and G + C 72.65%. Preliminary genome analysis identified 175 proteins as Carbohydrate-Active Enzymes, being 85 glycoside hydrolases organized in 33 distinct families. This draft genome information provides new insights on the key genes encoding hydrolytic enzymes involved in biomass deconstruction employed by soil bacteria.
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Disponível
Coleções:
Bases de dados internacionais
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
Microbiologia do Solo
/
Streptomyces
/
Proteínas de Bactérias
/
Genoma Bacteriano
/
Glicosídeo Hidrolases
País/Região como assunto:
América do Sul
/
Brasil
Idioma:
Inglês
Revista:
Braz. j. microbiol
Assunto da revista:
Microbiologia
Ano de publicação:
2017
Tipo de documento:
Artigo
País de afiliação:
Brasil
Instituição/País de afiliação:
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais/BR
