Caracterização da resistência transmitida e variabilidade genética do HIV-1 em pacientes recém-diagnosticados no centro de testagem e aconselhamento de Fortaleza

RESUMO

A terapia antirretroviraltemporobjetivodiminuiramorbidadeemortalidadedaspessoascomHIV/AIDS,melhorandoaqualidadeeaexpectativadevida. Paradoxalmente, o tratamento irregular pode favorecer a seleçãode variantes resistentes, representandouma das principais causas de falha terapêutica. Tais cepas resistentes podem ser transmitidas a outros indivíduos(resistência transmitida), predispondo àfalha precoce do tratamento inaugural. Ostestesderesistência,principalmenteagenotipagem,permitemadetecçãodemutaçõesdogenomaviral.OobjetivodesteestudofoicaracterizarasmutaçõesderesistênciatransmitidadoHIV-1aosantirretroviraisempacientesrecém-diagnosticadosnoCentro de Testagem e Aconselhamento (CTA) de Fortaleza.Duranteoperíododeoutubrode2013asetembrode2014,foramrecrutadospacientescomtestereagente para oHIVrealizadono CTA. Foram colhidas amostras para realizaçãode quantificação da cargaviral(AbbottRealTime),contagemdelinfócitos CD4+(FACSCaliburBD)egenotipagemHIV-1(TruGeneSiemens).As sequências genéticasforam alinhadas pelo programa MEGA eBioEdit. Ossubtipos do vírus HIV-1 foram determinados e identificados empregando análises no banco de dados do REGA HIV Subtyping Tool. A análisedas mutações de resistência aos antirretrovirais foi realizada utilizando o algoritmo da Universidade de Stanford(HIVdbProgram)e as mutaçõesderesistênciatransmitidaforamidentificadasempregandoaCalibraçãodeResistênciaPopulacional.Foram obtidas amostras biológicas de 108 pacientes, sendo que em 105delas foi possível realizar a reação de sequenciamentoea avaliação quantoàpresençademutaçõesderesistênciaassociadasaos antirretrovirais...

ABSTRACT

Antiretroviral therapy aims to reduce morbidity and mortality of people with HIV / AIDS, improving the quality and life expectancy. Paradoxically, the irregular treatment may favor the selection of resistant variants, representing a major cause of treatment failure. Such resistant strains can be transmitted to other individuals (transmitted resistance) predisposing to early failure of the inaugural treatment. Resistance tests, particularly genotyping, allow mutation detection in the viral genome. Theaim of this study was to characterize the transmitted resistance HIV-1 mutations to antiretroviral drugs in newly diagnosed patients in the Counseling and Testing Center (CTC) in Fortaleza. During the period October 2013 to September 2014, patients with reagent test for HIV were recruited at CTC. Samples for viral load quantitation (Abbott RealTime), CD4 lymphocytes count (BD FACSCalibur) and HIV-1 genotyping (TRUGENE Siemens), were collected. Genetic sequences were aligned by MEGA and BioEdit program. Thesubtypes of HIV-1 were determined and identified using analysis in REGA HIV subtyping Tool database. The analysis of the antiretroviral resistance mutation was performed using the algorithm of Stanford University (HIVdb Program) and transmitted mutation resistance was identified using the CalibratedPopulationResistance (CPR). Biological samples were obtained from 108 patients, among which in 105 was possible to perform the sequencing reaction and evaluation for the presence of mutations to conferantiretroviral drugresistance...