A simple double differential centrifugation-wash procedure to rapidly obtain bacterial identification and direct antimicrobial susceptibility testing from positive blood cultures / Método sencillo basado en una doble centrifugación diferencial para obtener una identificación bacteriana y sensibilidad a antibióticos rápida a partir de hemocultivos positivos

ABSTRACT

Introduction: This study proposes a simple and rapid method for both bacterial identification and direct antimicrobial susceptibility testing (AST) by using MALDI-TOF and a double differential centrifugation-wash procedure from positive blood cultures. Methods: Fifty-two positive blood cultures (37 gramnegative bacilli and 15 grampositive cocci) were studied by two methods for identification and AST a reference method, and the rapid MALDI-TOF method obtaining a purified pellet by using a double differential centrifugation procedure. Results: A total of 1101 MIC values (mg/l) were interpreted according to EUCAST clinical breakpoints and compared using the two methods simultaneously. Discrepancies in 81 MIC values (7.35%) were detected. By analyzing standard parameters, we obtained 98.28% essential agreement and 92.65% categorical agreement considering all isolates tested. Conclusion: This method provides rapid bacterial identification and AST, offering definitive results 24–48h earlier than the conventional method (p<0.001) and improving the turnaround time in blood culture diagnostics, especially in laboratories without 24-h on-call.(AU)

RESUMEN

Introducción: Este trabajo propone un método sencillo, rápido y barato de identificación bacteriana y sensibilidad antibiótica utilizando MALDI-TOF y una doble centrifugación diferencial a partir de hemocultivo positivo. Métodos: Se estudiaron 52 hemocultivos positivos (37 bacilos gramnegativos y 15 cocos grampositivos). Se compararon 2 métodos: un método convencional de identificación y determinación de sensibilidad a antibióticos automatizada partiendo de colonia crecida, y un método rápido utilizando MALDI-TOF, caracterizado por la obtención de un pellet purificado procedente de un hemocultivo positivo, mediante un procedimiento basado en una doble centrifugación diferencial. Resultados: Se analizaron y compararon 1.101 valores de CMI (mg/l) de acuerdo con los criterios establecidos por EUCAST y obtenidos por ambos métodos. Se detectaron discrepancias en 81 valores de CMI (7,35%). Considerando todos los aislados, la concordancia esencial fue del 98,28% y la concordancia categórica del 92,65%. Conclusión: Este método proporciona resultados de identificación y sensibilidad a antibióticos definitivos 24-48h antes que un método convencional (p<0,001), mejorando el tiempo de respuesta en el diagnóstico microbiológico de bacteriemias, especialmente en laboratorios sin servicio de guardias de 24h.(AU)