Mineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagas / Text mining of scientific texts aimed at identifying bioactive components with potential therapeutic for the treatment of dengue, malaria and Chagas disease

RESUMO

As doenças negligenciadas, como a dengue, malária e doença de Chagas, entre outras, queprevalecem em países menos desenvolvidos e em ambientes cercados por condições depobreza, afetam um sexto da população mundial, matando cerca de três mil pessoas a cada diano mundo. Porém, pouco investimento tem sido feito em pesquisas sobre essas doenças com ofim de obter fármacos menos agressivos aos seres humanos e com ações mais eficazes. Osfármacos existentes utilizados atualmente em tratamentos para essas doenças datam de 30, 40ou até 50 anos atrás.Existe um grande volume de trabalhos científicos disponibilizados em bibliotecas digitais quearmazenam artigos voltados à descrição da biologia, imunologia e genética dos parasitas quecausam estas doenças. Esses trabalhos podem ser acessados através de técnicas paramineração de textos, em busca de compostos bioativos ainda não completamente exploradosque venham contribuir para o desenvolvimento de novos tratamentos contra essas doenças.Com esse fim, neste trabalho é apresentada uma metodologia organizada a partir do workflowWIMBAT que utiliza métodos e técnicas de mineração de textos para possibilitar a extraçãode termos que descrevam tais compostos a partir de informações obtidas em bancos de dadosbiológicos, culminando com a construção de grafos para possibilitar a análise de associaçõesentre os compostos identificados e a sua função aos agentes causadores destas doenças...

ABSTRACT

Neglected diseases such as Dengue, Malaria and Chagas disease among others are prevalentin less developed countries and in environments surrounded by poverty, affecting one-sixth ofthe world population, killing about 3000 people each day worldwide. However, a smallinvestment has been made in research on these diseases to obtain less aggressive drugs tohumans and accomplish most effective actions and thus, the existing drugs used in treatmentsdate back 30, 40 or even 50 years back.There is a large volume of scientific papers available in digital libraries that store articlesrelated to the description of the biology, immunology and genetics of the parasites that causethese diseases and can be accessed through text mining techniques, aiming the search ofbioactive compounds not properly exploitedyet that might contribute to the development ofnew treatments against these diseases.To this end, this thesis presents the workflow based methodology called WIMBAT that usesmethods and text mining techniques to enable the extraction of terms describing suchcompounds from information obtained from biological databases, ending within theconstruction of graphs that enable the specialistthe associations analysis between theidentified compounds and their function to the causative agents of these diseases...