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High-Throughput Sequencing of miRNAs Reveals a Tissue Signature in Gastric Cancer and Suggests Novel Potential Biomarkers.
Darnet, Sylvain; Moreira, Fabiano C; Hamoy, Igor G; Burbano, Rommel; Khayat, André; Cruz, Aline; Magalhães, Leandro; Silva, Artur; Santos, Sidney; Demachki, Samia; Assumpção, Monica; Assumpção, Paulo; Ribeiro-Dos-Santos, Ândrea.
Afiliação
  • Darnet S; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Moreira FC; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Área de Ciências Exatas e Tecnológicas, Centro Universitário do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Hamoy IG; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Universidade Federal Rural da Amazônia, Campus de Capanema, PA, Brazil.
  • Burbano R; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Khayat A; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Cruz A; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Magalhães L; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Silva A; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Santos S; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Demachki S; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Instituto de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Assumpção M; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Assumpção P; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
  • Ribeiro-Dos-Santos Â; Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil. ; Núcleo de Pesquisa em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Belém, PA, Brazil.
Bioinform Biol Insights ; 9(Suppl 1): 1-8, 2015.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-26157332
ABSTRACT
Gastric cancer has a high incidence and mortality rate worldwide; however, the use of biomarkers for its clinical diagnosis remains limited. The microRNAs (miRNAs) are biomarkers with the potential to identify the risk and prognosis as well as therapeutic targets. We performed the ultradeep miRnomes sequencing of gastric adenocarcinoma and gastric antrum without tumor samples. We observed that a small set of those samples were responsible for approximately 80% of the total miRNAs expression, which might represent a miRNA tissue signature. Additionally, we identified seven miRNAs exhibiting significant differences, and, of these, hsa-miR-135b and hsa-miR-29c were able to discriminate antrum without tumor from gastric cancer regardless of the histological type. These findings were validated by quantitative real-time polymerase chain reaction. The results revealed that hsa-miR-135b and hsa-miR-29c are potential gastric adenocarcinoma occurrence biomarkers with the ability to identify individuals at a higher risk of developing this cancer, and could even be used as therapeutic targets to allow individualized clinical management.
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinform Biol Insights Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinform Biol Insights Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil