Modelo computacional interactivo, semi-automatizado y de código abierto aplicado a la vigilancia de virus respiratorios / Interactive, semi-automatized and open source computational model applied to respiratory viruses surveillance

Resumen Las infecciones respiratorias agudas (IRA) causadas por virus son una importante causa de morbilidad y mortalidad en el mundo, afectando principalmente a niños y adultos mayores. Se asocian a un alto número de consultas y hospitalizaciones, a una significativa sobrecarga del sistema de salud y a un alto costo económico. La vigilancia de virus respiratorios tiene el potencial de ayudar a optimizar la respuesta sanitaria, garantizar la disponibilidad de recursos humanos, racionalizar los recursos y disminuir los costos asociados a la atención en salud. Con el objetivo de optimizar la recolección y visualización de los datos de nuestro actual sistema de vigilancia de virus respiratorios, se diseñó una plataforma basada en R y sus paquetes Shiny, que permite la creación de una interfase web interactiva y amigable para la recolección, análisis y publicación de los datos. Se ingresaron a esta plataforma los datos de la red de vigilancia metropolitana de virus respiratorios disponibles desde 2006. En esta plataforma, el investigador demora menos de un minuto en registrar los datos. El análisis y publicación es inmediato, llegando a cualquier usuario con un dispositivo conectado a Internet, quien puede elegir las variables a consultar. Con un costo muy bajo, en poco tiempo y utilizando el lenguaje de programación R, se logró crear un sistema simple e interactivo, disminuyendo el tiempo de carga y análisis de datos de forma considerable, posiblemente aumentando el impacto y la disponibilidad de esta vigilancia.

Abstract Acute respiratory infections (ARI) are an important cause of morbidity and mortality worldwide, affecting mainly children and the elderly. They are associated with a high economic burden, increased number of medical visits and hospitalizations. The surveillance of the circulation of respiratory viruses can reduce the health care associated costs, and to optimize the health response. A platform based on R and its package Shiny was designed, to create an interactive and friendly web interface for gathering, analysis and publication of the data. The data from the Chilean metropolitan respiratory viruses surveillance network, available since 2006, was uploaded into the platform. Using this platform, the researcher spends less than 1 minute to upload the data, and the analysis and publication is immediate, available to be seen by any user with a device connected to Internet, who can choose the variables to be displayed. With a very low cost, in a short time, and using the R programming language, it was possible to create a simple, and interactive platform, considerably decreasing the upload and analysis time, and increasing the impact and availability of this surveillance.

Use of webQDA software on qualitative nursing research: an experience report / Uso del software webQDA en investigación cualitativa en enfermería: reporte de experiencia / Uso do software webQDA na pesquisa qualitativa em enfermagem: relato de experiência

ABSTRACT Objectives: to report the user experience of the webQDA software in the support of qualitative data analysis about health literacy of older adults. Methods: quasi-experimental research developed from January 2014 to January 2015, with 118 older adults, all of whom were interviewed to assess the level of health literacy. Interviews were carried out before and after four educational interventions, according to Freire's method named Culture Circle. The interviews were transcribed and entered in the software, which highlighted the analytical categories. Results: the systems of sources, interpretative encoding and questioning of the data available in the software allowed the construction of three categories for the literacy levels and four categories for their dimensions. Final considerations: We concluded that the webQDA software enables the structured encoding of qualitative materials, ensuring faster and effective management of data with systematization and analytical transparency.

RESUMEN Objetivos: relatar la experiencia con la utilización del software webQDA como base al análisis de los datos cualitativos sobre literacidad en salud de ancianos. Métodos: investigación cuasiexperimental realizada en el período de enero de 2014 a enero de 2015, en la cual participaron 118 ancianos mediante entrevistas para evaluar el nivel de literacidad en salud. Se realizaron entrevistas antes y después de cuatro intervenciones educativas, de acuerdo con el método problematizador freireano titulado Círculo de Cultura. Se transcribieron las entrevistas y las insertaron en el software, lo que permitió obtener las categorías analíticas. Resultados: los sistemas de fuentes, de codificación interpretativa y de cuestionamiento de los datos disponibles en el software permitieron elaborar tres categorías sobre los niveles de literacidad y cuatro categorías sobre sus dimensiones. Consideraciones finales: Se concluyó que el software webQDA permite la codificación estructurada de los materiales cualitativos, lo que promueve una gestión más rápida y eficaz de los datos a partir de la sistematización y transparencia analítica.

RESUMO Objetivos: relatar a experiência de uso do software webQDA no apoio à análise dos dados qualitativos acerca do letramento em saúde de idosos. Métodos: pesquisa quase experimental desenvolvida no período de janeiro de 2014 a janeiro de 2015, com 118 idosos, os quais foram entrevistados para avaliar o nível de letramento em saúde. Foram realizadas entrevistas antes e após quatro intervenções educativas, segundo o método problematizador freireano denominado Círculo de Cultura. As entrevistas foram transcritas e inseridas no software, o que permitiu evidenciar as categorias analíticas. Resultados: os sistemas de fontes, codificação interpretativa e questionamento dos dados disponíveis no software permitiram a construção de três categorias para os níveis do letramento e de quatro categorias para as suas dimensões. Considerações finais: Conclui-se que o software webQDA permite a codificação estruturada dos materiais qualitativos, assegurando gestão mais rápida e eficaz dos dados a partir da sistematização e transparência analítica.

Criação e implementação de um banco de dados cirúrgico totalmente informatizado baseado nas ferramentas Google: experiência inicial em cirurgia cardiovascular / Design and implementation of a fully electronic surgery database based on Google tools: an initial experience in cardiovascular surgery

RESUMO Objetivo: descrever de maneira prática e detalhada a criação de uma plataforma totalmente informatizada para coleta, armazenamento e análise de dados, inicialmente proposta para cirurgia cardiovascular, com interfaces reprodutíveis e aplicáveis a outras especialidades cirúrgicas, bem como, apresentar a experiência inicial de trabalho com esta ferramenta e os resultados preliminares obtidos após sua implementação em um hospital universitário terciário brasileiro. Métodos: a plataforma foi desenvolvida com base nas ferramentas Google, gratuitas, de fácil utilização e amplamente acessíveis. Desde o início desta iniciativa, em maio de 2015, até a análise preliminar, em fevereiro de 2017, dados de 271 pacientes, consecutivos, submetidos à cirurgia cardiovascular foram prospectivamente recordados e analisados. Resultados: a iniciativa foi implementada com pleno sucesso, com 100% dos pacientes incluídos e sem perda de qualquer variável em um banco de dados composto por mais de 500 variáveis. As complicações pós-operatórias imediatas mais frequentes foram: fibrilação atrial (22,5%), broncopneumonia (10,7%), delirium (10,3%), insuficiência renal aguda (10%), acidente vascular encefálico (5%) e morte (7%). Comparando-se as taxas de mortalidade no primeiro e segundo anos da iniciativa, uma redução de 10,8% para 4% (p=0,042), respectivamente, foi evidenciada. Conclusão: a nova proposta de coleta e armazenamento de dados apresentada neste trabalho mostrou-se plenamente factível e efetiva. Por serem gratuitas, de fácil manuseio e universalmente acessíveis, estas ferramentas podem ser úteis a outras especialidades cirúrgicas que desejem desenvolver métodos de avaliação de sucesso e complicações pós-operatórios, bem como, programas de melhoria de qualidade.

ABSTRACT Objective: to describe, in a practical and step-by-step manner, the construction of a fully electronic platform for data collection, storage, and analysis, initially proposed for cardiovascular surgery, with interfaces that are reproducible and applicable to other surgical specialties, as well as to present the initial work experience with this instrument in cardiac surgery and the preliminary results obtained after its implementation in a Brazilian tertiary university hospital. Methods: the platform was developed based on Google tools, which are free, easy to use, and widely accessible. From the beginning of this initiative, in May 2015, to the preliminary analysis, in February 2017, data from 271 consecutive patients submitted to cardiovascular surgery were prospectively recorded and preliminarily analyzed. Results: the initiative was implemented with full success, with 100% of patients included and without loss of any variable, in a database composed of more than 500 variables. The most frequent immediate postoperative complications were: atrial fibrillation (22.5%), bronchopneumonia (10.7%), delirium (10.3%), acute renal failure (10%), stroke (5%), and death (7%). Comparing mortality rates in the first and second years of the initiative, a reduction from 10.8% to 4% (p=0.042), respectively, was evidenced. Conclusion: the new proposal of data collection and storage presented in this work was fully feasible and effective. It may be useful to other surgical specialties that wish to develop methods to evaluate success and postoperative complication rates, as well as quality improvement programs.

Desarrollo de las consultas oculoplastia y cirujía implanto-refractiva del Sistema alas BQO / Development of the consultations oculoplasty and implanto-refractive surgery of System alas BQO

En la actualidad, la gestión de la información en las consultas oftalmológicas de Oculoplastia y Cirugía Implanto-Refractiva se realiza de forma manual. Esto ha provocado duplicidad de datos, acumulación de la información y deterioro de registros médicos, incidiendo como una vulnerabilidad a la hora de procesar la información. La presente investigación tiene como meta, la informatización de los procesos correspondientes a estas consultas, guiada durante todo el ciclo de vida por el Proceso Unificado de Desarrollo (RUP), con el propósito de garantizar un medio para el almacenamiento seguro de la información y de su procesamiento. Se utiliza Visual Paradigm como herramienta de modelado. Para la implementación de las funcionalidades se emplea la plataforma .NET mediante el lenguaje de programación C#, auxiliado por el Framework 2.0 y Postgres SQL como gestor de bases de datos. Como resultado de su implementación se espera proporcionar al usuario una forma viable de gestionar la información en las consultas oftalmológicas, brindado una mayor confiabilidad y seguridad tanto al personal de la institución como a los pacientes que requieren de dichos servicios. Por otra parte, los especialistas contarán con una Historia Clínica Electrónica única, que permitirá el seguimiento de la salud del paciente y la disponibilidad de la información para que puedan ser examinados los diagnósticos emitidos de estos con anterioridad(AU)

Currently, the information management in the ophthalmological queries of Oculoplasty and Refractive Implant Surgery is performed manually. This has resulted in duplication of data, accumulation of information and deterioration of the medical records, becoming an invulnerability when processing of information occurs. The present research is intended to the computerization of the processes of this consultations, guided throughout the life cycle by the Rational Unified Process (RUP), in order to guarantee a means for the safe storage and processing of the information. The Visual Paradigm is employed as a modeling tool. For the implementation of the functionalities we used the platform .NET, through the programming language C#, helped by the Framework 2.0 and the Postgres SQL as a database manager. As a result from its implementation, it is expected to provide the user with a viable way of managing the information on the eye care consultations, providing also a better reliability and safety to both, the institution staff and the patients requiring that system. Moreover, the specialists will have a single electronic health record that will allow monitoring the patient´s health and the availability of the information so that the latest diagnoses can be examined. better reliability and safety to both, the institution staff and the patients requiring that system. Moreover, the specialists will have a single electronic health record that will allow monitoring the patient´s health and the availability of the information so that the latest diagnoses can be examined(AU)

Avaliação computacional de enfisema pulmonar em TC: comparação entre um sistema desenvolvido localmente e um sistema de uso livre / Computer-assisted evaluation of pulmonary emphysema in CT scans: comparison between a locally developed system and a freeware system

OBJETIVO: Apresentar um sistema de visão computacional em imagens de TCAR, desenvolvido localmente e denominado SIStema para a Detecção e a quantificação de Enfisema Pulmonar (SISDEP). Comparar esse sistema a um sistema computacional de acesso livre. MÉTODOS: Foram utilizadas 33 imagens de TCAR de 11 pacientes com DPOC com cortes tomográficos em ápice, hilo e base. O SISDEP foi comparado a Osiris Medical Imaging Software Program quanto à segmentação do parênquima pulmonar; precisão das medidas da área de secção transversal dos pulmões em mm², densidade pulmonar média (DPM), porcentagem da relative area (RA, área relativa) dos voxels com densidade < -950 unidades hounsfield (ra -950), valores de 15º percentil de baixa atenuação (perc15) e visualização das áreas hiperaeradas por máscara colorida. RESULTADOS: Os dois sistemas realizaram uma segmentação pulmonar eficiente; porém o SISDEP o fez de modo automático e mais rápido. Na comparação das medidas de área de secção dos pulmões, DPM, Perc15 e RA -950, houve alta correlação (r² = 0,99; 0,99; 0,99; e 1,00, respectivamente) entre os dois sistemas. A ferramenta de máscara colorida do SISDEP permitiu excelente visualização das áreas hiperaeradas, discriminado-as das áreas normais. CONCLUSÕES: O SISDEP se mostrou eficiente na segmentação dos pulmões e na extração de dados quantitativos da aeração pulmonar com excelente correlação com o sistema Osiris. O SISDEP constitui uma promissora ferramenta computacional para a avaliação diagnóstica e o acompanhamento da evolução do enfisema em imagens de TCAR de pacientes com DPOC.

OBJECTIVE: To present a locally developed system of computer vision for use with HRCT images, designated SIStema para a Detecção e a quantificação de Enfisema Pulmonar (SISDEP, System to Detect and Quantify Pulmonary Emphysema), and to compare this system with a freeware system tool. METHODS: Thirty-three HRCT images scanned at the apex, hilum and base of the lungs of 11 patients with COPD were analyzed. The SISDEP was compared with the Osiris Medical Imaging Software Program regarding lung parenchyma segmentation, precision of the measurement of the cross-sectional area of the lungs in mm², mean lung density (MLD), relative area (RA) of the lung occupied by voxels with attenuation values < -950 hounsfield units (ra -950), 15th percentile point (perc15) and visualization of hyperinflated areas using a color mask. RESULTS: Although both computational systems were efficient in segmenting the lungs, the SISDEP performed this task automatically and more rapidly. There were significant correlations between the two systems in terms of the results obtained for lung cross-sectional area, MLD, RA -950 and Perc15 (r² = 0.99, 0.99, 0.99 and 1.00, respectively). The color mask tool of the SISDEP allowed excellent visualization of hyperinflated areas, discriminating them from normal areas. CONCLUSIONS: The SISDEP was efficient in segmenting the lungs and quantifying lung hyperinflation, presenting an excellent correlation with the Osiris system. The SISDEP constitutes a promising computational tool for diagnosing and assessing the progression of emphysema in HRCT images of COPD patients.

Desarrollo del sistema integrado de información del ministerio de Salud: manual de orientación del usuario. modulo de medio ambiente. producción de servicios / Develop of the integrated system of information of the Ministry of health: manual of the user´s orientation. module of environment. production of services

Proporciona información sobre las diferentes actividades que se pueden realizar con el software implementado por el Ministerio de Salud (MINSA), para la Dirección del Medio ambiente. En este software se puede llevar el control de las empresas controladas por el MINSA para su funcionamiento, en el además se puede registrar los datos básicos como: Nombre de la Institución/Negocio, Tipo de Institución/negocio, Municipio, dirección y nombre del propietario o responsable entre otros