Detalhe da pesquisa
1.
Expanding FTMap for Fragment-Based Identification of Pharmacophore Regions in Ligand Binding Sites.
J Chem Inf Model
; 64(6): 2084-2100, 2024 Mar 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38456842
2.
Mapping of antibody epitopes based on docking and homology modeling.
Proteins
; 91(2): 171-182, 2023 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36088633
3.
High Accuracy Prediction of PROTAC Complex Structures.
J Am Chem Soc
; 145(13): 7123-7135, 2023 04 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36961978
4.
Exploring the structural origins of cryptic sites on proteins.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 115(15): E3416-E3425, 2018 04 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29581267
5.
ClusPro in rounds 38 to 45 of CAPRI: Toward combining template-based methods with free docking.
Proteins
; 88(8): 1082-1090, 2020 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32142178
6.
Benchmark Sets for Binding Hot Spot Identification in Fragment-Based Ligand Discovery.
J Chem Inf Model
; 60(12): 6612-6623, 2020 12 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33291870
7.
Template-based modeling by ClusPro in CASP13 and the potential for using co-evolutionary information in docking.
Proteins
; 87(12): 1241-1248, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31444975
8.
Blind prediction of homo- and hetero-protein complexes: The CASP13-CAPRI experiment.
Proteins
; 87(12): 1200-1221, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31612567
9.
ClusPro PeptiDock: efficient global docking of peptide recognition motifs using FFT.
Bioinformatics
; 33(20): 3299-3301, 2017 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28430871
10.
Protein-ligand docking using FFT based sampling: D3R case study.
J Comput Aided Mol Des
; 32(1): 225-230, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29101520
11.
New additions to the ClusPro server motivated by CAPRI.
Proteins
; 85(3): 435-444, 2017 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27936493
12.
How proteins bind macrocycles.
Nat Chem Biol
; 10(9): 723-31, 2014 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25038790
13.
Organization of the human mitochondrial transcription initiation complex.
Nucleic Acids Res
; 42(6): 4100-12, 2014 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24413562
14.
Where does amantadine bind to the influenza virus M2 proton channel?
Trends Biochem Sci
; 35(9): 471-5, 2010 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20382026
15.
FTFlex: accounting for binding site flexibility to improve fragment-based identification of druggable hot spots.
Bioinformatics
; 29(9): 1218-9, 2013 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23476022
16.
Stimulators of translation identified during a small molecule screening campaign.
Anal Biochem
; 447: 6-14, 2014 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24513115
17.
Docking server for the identification of heparin binding sites on proteins.
J Chem Inf Model
; 54(7): 2068-78, 2014 Jul 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24974889
18.
Computational mapping reveals dramatic effect of Hoogsteen breathing on duplex DNA reactivity with formaldehyde.
Nucleic Acids Res
; 40(16): 7644-52, 2012 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22705795
19.
FTMAP: extended protein mapping with user-selected probe molecules.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W271-5, 2012 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22589414
20.
Structural conservation of druggable hot spots in protein-protein interfaces.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(33): 13528-33, 2011 Aug 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21808046