Detalhe da pesquisa
1.
Dynamic trans-acting factor colocalization in human cells.
Cell
; 155(3): 713-24, 2013 Oct 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24243024
2.
Personal omics profiling reveals dynamic molecular and medical phenotypes.
Cell
; 148(6): 1293-307, 2012 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22424236
3.
Multiplexed long-read plasmid validation and analysis using OnRamp.
Genome Res
; 33(5): 741-749, 2023 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37156622
4.
Prioritization of regulatory variants with tissue-specific function in the non-coding regions of human genome.
Nucleic Acids Res
; 50(1): e6, 2022 01 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34648033
5.
TRACE: transcription factor footprinting using chromatin accessibility data and DNA sequence.
Genome Res
; 30(7): 1040-1046, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32660981
6.
High-resolution mapping and characterization of open chromatin across the genome.
Cell
; 132(2): 311-22, 2008 Jan 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18243105
7.
Broad noncoding transcription suggests genome surveillance by RNA polymerase V.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(48): 30799-30804, 2020 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33199612
8.
SEMplMe: a tool for integrating DNA methylation effects in transcription factor binding affinity predictions.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 317, 2022 Aug 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35927613
9.
Genome-wide Study of Atrial Fibrillation Identifies Seven Risk Loci and Highlights Biological Pathways and Regulatory Elements Involved in Cardiac Development.
Am J Hum Genet
; 102(1): 103-115, 2018 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29290336
10.
Predicting the effects of SNPs on transcription factor binding affinity.
Bioinformatics
; 36(2): 364-372, 2020 01 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31373606
11.
MapGL: inferring evolutionary gain and loss of short genomic sequence features by phylogenetic maximum parsimony.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 416, 2020 Sep 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32962625
12.
Mining the Unknown: Assigning Function to Noncoding Single Nucleotide Polymorphisms.
Trends Genet
; 33(1): 34-45, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27939749
13.
Regulatory analysis of the C. elegans genome with spatiotemporal resolution.
Nature
; 512(7515): 400-5, 2014 Aug 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25164749
14.
Principles of regulatory information conservation between mouse and human.
Nature
; 515(7527): 371-375, 2014 Nov 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25409826
15.
Comparative analysis of regulatory information and circuits across distant species.
Nature
; 512(7515): 453-6, 2014 Aug 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25164757
16.
Conserved and species-specific transcription factor co-binding patterns drive divergent gene regulation in human and mouse.
Nucleic Acids Res
; 46(4): 1878-1894, 2018 02 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29361190
17.
Predicting functional variants in enhancer and promoter elements using RegulomeDB.
Hum Mutat
; 40(9): 1292-1298, 2019 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31228310
18.
Integration of multiple epigenomic marks improves prediction of variant impact in saturation mutagenesis reporter assay.
Hum Mutat
; 40(9): 1280-1291, 2019 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31106481
19.
Deciphering ENCODE.
Trends Genet
; 32(4): 238-249, 2016 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26962025
20.
Architecture of the human regulatory network derived from ENCODE data.
Nature
; 489(7414): 91-100, 2012 Sep 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22955619