Detalhe da pesquisa
1.
Deep learning for the PSIPRED Protein Analysis Workbench.
Nucleic Acids Res
; 2024 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38747351
2.
Genome3D: integrating a collaborative data pipeline to expand the depth and breadth of consensus protein structure annotation.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D314-D319, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31733063
3.
The PSIPRED Protein Analysis Workbench: 20 years on.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W402-W407, 2019 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31251384
4.
Learning a functional grammar of protein domains using natural language word embedding techniques.
Proteins
; 88(4): 616-624, 2020 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31703152
5.
Improved protein contact predictions with the MetaPSICOV2 server in CASP12.
Proteins
; 86 Suppl 1: 78-83, 2018 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28901583
6.
EigenTHREADER: analogous protein fold recognition by efficient contact map threading.
Bioinformatics
; 33(17): 2684-2690, 2017 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28419258
7.
Genome3D: exploiting structure to help users understand their sequences.
Nucleic Acids Res
; 43(Database issue): D382-6, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25348407
8.
A large-scale evaluation of computational protein function prediction.
Nat Methods
; 10(3): 221-7, 2013 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23353650
9.
Scalable web services for the PSIPRED Protein Analysis Workbench.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W349-57, 2013 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23748958
10.
Genome3D: a UK collaborative project to annotate genomic sequences with predicted 3D structures based on SCOP and CATH domains.
Nucleic Acids Res
; 41(Database issue): D499-507, 2013 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23203986
11.
Protein function prediction by massive integration of evolutionary analyses and multiple data sources.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 3: S1, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23514099
12.
PSICOV: precise structural contact prediction using sparse inverse covariance estimation on large multiple sequence alignments.
Bioinformatics
; 28(2): 184-90, 2012 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22101153
13.
The Genome3D Consortium for Structural Annotations of Selected Model Organisms.
Methods Mol Biol
; 2165: 27-67, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32621218
14.
Predictions of Backbone Dynamics in Intrinsically Disordered Proteins Using De Novo Fragment-Based Protein Structure Predictions.
Sci Rep
; 7(1): 6999, 2017 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28765603
15.
Gene3D: structural assignments for the biologist and bioinformaticist alike.
Nucleic Acids Res
; 31(1): 469-73, 2003 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12520054
16.
Evolution of protein superfamilies and bacterial genome size.
J Mol Biol
; 336(4): 871-87, 2004 Feb 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15095866
17.
The CATH extended protein-family database: providing structural annotations for genome sequences.
Protein Sci
; 11(2): 233-44, 2002 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-11790833
18.
Gene3D: structural assignment for whole genes and genomes using the CATH domain structure database.
Genome Res
; 12(3): 503-14, 2002 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-11875040
19.
The CATH protein family database: a resource for structural and functional annotation of genomes.
Proteomics
; 2(1): 11-21, 2002 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-11788987